- Phương pháp luận: Luận án sử dụng phương pháp luận duy vật biện chứng, duy vật lịch sử của chủ nghĩa Mác-Lênin trên cơ sở quan điểm, đường lối của Đảng, chính sách, pháp luật của Nhà nước về quản NSNN từ hoạt động khai thác than.
- Phương pháp phân tích - tổng hợp: Phân tích là một vấn đề cần thiết để giải
thích theo phương pháp truy nguyên để nhận thức quá trình hình thành, phát triển
các hiện tượng, quá trình kinh tế... trong các giai đoạn khác nhau của quá trình phát triển. Điểm kết thúc của sự phân tích là tổng hợp. Nhờ có tổng hợp mới có thể đi từ cái cụ thể, tản mạn,... đến sự khái quát thành các khái niệm, phạm trù lý luận.
Phương pháp này được sử dụng ở Chương 1-Tổng quan tình hình nghiên cứu liên quan đế đề tài, để phân tích lý luận và kinh nghiệm thực tiễn về đối tượng nghiên
cứu, từ đó rút ra những kết quả nghiên cứu và các vấn đề còn là “khoảng trống” cần tiếp tục thực hiện. Phương pháp này cũng được sử dụng ở Chương 2 để phân tích lý luận về quản lý NSNN từ hoạt động khai thác than ở địa phương cấp tỉnh theo hướng PTBV, qua đó hình thành khung lý luận cho đề tài.
- Phương pháp nghiên cứu thống kê - so sánh được sử dụng chủ yếu ở Chương 3 và Chương 4: Đây là phương pháp được sử dụng phổ biến trong nghiên
cứu kinh tế hiện đại. Luận án sử dụng phương pháp thống kê để thu thập số liệu; tiến hành so sánh, đối chiếu giữa các giai đoạn, các khu vực khác nhau để rút ra sự khác nhau giữa những số liệu thống kê. Từ đó, rút ra được những kết luận quan
trọng, tìm ra nguyên nhân, đưa ra giải pháp cho vấn đề mà luận án nghiên cứu.