Các chủng virus cúm khác nhau có thể phân biệt ựược bằng các kháng nguyên của chúng gồm haemagglutinin và neuraminidase bao phủ trên bề mặt của virus. Có 16 kháng nguyên Haemagglutinin (ký hiệu từ H1 - H16) và 9 kháng nguyên Neuraminidase (ký hiệu từ N1 - N9) ựã ựược phát hiện và mỗi phân type (subtype) virus ựược xác ựịnh bằng sự kết hợp cụ thể giữa 2 loại kháng nguyên của virus.
Năm 1980, tổ chức Y tế thế giới ựã ựưa ra một hệ hống phân loại mới cho các virus cúm type Ạ Hệ thống phân loại mới của Tổ chức Y tế thế giới ựược trình bày theo bảng 2.2.
Bảng 2.2: Các phân type virus cúm A
Tên hiện tại Tên trước ựây Tên hiện tại Tên trước ựây
H1 H0, H1, Hsw1 N1 N1
H2 H2 N2 N2
H3 H3, Heq2, Hav7 N3 Nav2
H4 Hav4 N4 Nav4
H5 Hav5 N5 NAv5
H6 Hav6 N6 Nav1
H7 Heq1, Hav1 N7 Neq1
H8 Hav8 N8 Neq2 H9 Hav9 N9 Nav6 H10 Hav2 H11 Hav3 H12 Hav10 H13 H14 H15 H16
Trong mỗi phân type, dựa vào cấu trúc gen người ta lại chia thành các nhánh (clade) virus khác nhau ựể phân biệt. Các nhánh virus này có cấu trúc gen, ựộc lực và khả năng gây bệnh khác nhau ựối với ựộng vật mẫn cảm. Virus cúm A/H5N1 dựa vào sự khác biệt di truyền gen HA khác nhau ựược phân loại thành 10 nhánh từ 0 ựến 9 như nhánh 1, nhánh 2.3.2, 2.3.4, nhánh 7,... (Nguyễn Tùng và cộng sự, 2011).
2.4.8 Danh pháp
để ký hiệu, lưu trữ một cách khoa học và ựầy ựủ các chủng virus cúm phân lập ựược, năm 1980 Tổ chức Y tế thế giới ựã ựưa ra hệ thống phân loại
mới, ựược quy ựịnh cụ thể: chủng virus/loài vật chủ phân lập ựược virus/vị trắ ựịa lý/quy ước chủng của phòng thắ nghiệm/năm phân lập/loại subtype của virus. Vắ dụ virus cúm có ký hiệu A/Ck/Vietnam/HG4/2005/H5N1 ựược hiểu là virus cúm nhóm A, ựược phân lập từ gà (Ck: Chicken), nơi phân lập là ViệtNam, quy ước chủng của phòng thắ nghiệm là HG4 (HG: Hậu Giang), thời gian phân lập năm 2005, subtype H5N1 (Trần Quang Vui và cộng sự, 2010).
