508 296 6 7 8 9 10 bp 212 1 2 3 4 5 bp
thành do liên kết hydro giữa một số phần của phân tử DNA plasmid hay do lực hút tĩnh điện giữa các phần của phân tử với nhau, dạng vòng mở do bị đứt gãy một mạch đơn của chuỗi DNA mạch kép và dạng mạch thẳng khi cả hai mạch DNA đều bị đứt gãy. Dạng siêu xoắn có cấu trúc không gian gọn nên khi điện di chúng thường chạy nhanh nhất, tiếp đến là mạch thẳng và cuối cùng là mạch vòng.
Kết quả điện di ở hình 17 cho thấy sự xuất hiện của một số băng có kích thước lớn hơn là do hiện tượng plasmid tồn tại ở các dạng xoắn và siêu xoắn khác nhau vì vậy có độ di động điện di khác nhau như vẫn thường gặp ở các loại plasmid dạng mạch vòng khác. Chế phẩm plasmid thu được có độ tinh sạch cao, khơng lẫn RNA và có kích thước băng đúng như tính tốn lý thuyết (lớn hơn 3 kb). Trong đó băng chạy trước sáng và rõ nét chứng tỏ lượng DNA plasmid thu được tồn tại ở dạng siêu xoắn nhiều hơn dạng thẳng và rất ít dạng đứt gãy. Những plasmid tái tổ hợp này được tách chiết với lượng lớn và đủ độ tinh sạch để tiến hành xác định trình tự.
Chúng tơi đã tiến hành giải trình tự đoạn gen đích trong vector tái tổ hợp thu được ở trên và so sánh trình tự vừa đọc được với trình tự gốc chuẩn rCRS (mã số J01415.2 trong Ngân hàng gen). Kết quả so sánh trình tự đoạn gen (Hình 18) cho thấy đoạn gen từ vector tái tổ hợp pGEM-T của bố bệnh nhân có độ tương đồng 99,53% so với trình tự chuẩn tương ứng của hệ gen ty thể công bố trên GenBank [44]. Chỉ có một nucleotide (C) vị trí 193 là khơng khớp với nucleotide (A) ở vị trí 8347 (trên genome ty thể hoàn chỉnh), nguyên nhân của sai khác này là do chúng tôi chủ động thay thế nucleotide T bằng G trong mồi MRAGRv khi thiết kế. Ngoài ra, kết quả cũng cho thấy đoạn gen đích của mẫu bố bệnh nhân chứa đầy đủ 2 trình tự lặp lại 9 bp là CCCCCTCTACCCCCTCTA.