Nếu ta lấy khỏch hàng làm tiờu chớ để phõn loại thỡ cú thể phõn cỏc tổ chức khoa học theo cỏc loại hỡnh gồm: (1) tổ chức khoa học cụng ớch; (2) tổ chức khoa học phục vụ sản xuất.
Tổ chức khoa học cụng ớch
Đõy là loại hỡnh tổ chức khoa học mà khỏch hàng là Nhà nƣớc... Hoạt động chớnh của cỏc tổ chức khoa học này thƣờng tập trung vào nghiờn cứu cơ bản, nghiờn cứu về thể chế chớnh sỏch, nghiờn cứu cỏc giải phỏp bảo vệ tài nguyờn thiờn nhiờn và mụi trƣờng. Kết quả nghiờn cứu thƣờng mang tớnh trừu tƣợng, đơn chiếc, cú thể chỉ đƣợc sử dụng một lần, ớt sản phẩm cú ý nghĩa sử dụng cho tiờu dựng, tuy nhiờn lợi ớch của cỏc sản phẩm này mang lại thƣờng vụ cựng lớn do nú đúng vai trũ nhƣ một nguyờn liệu đầu vào cho cỏc sản phẩm hàng húa thị trƣờng khỏc. Với cỏc phõn tớch nhƣ trờn, thỡ việc định giỏ cỏc sản phẩm này cần tớnh đến lợi nhuận mà nú mang lại cho cỏc sản phẩm khỏc, hoặc trong trƣờng hợp khụng thể định giỏ thỡ cần cú đƣợc ỏp dụng cỏc cơ chế trợ cấp, bao cấp của Nhà nƣớc cho cỏc tổ chức khoa học dạng này.
Tổ chức khoa học phục vụ sản xuất
Khỏch hàng của tổ chức này chủ yếu là cỏc doanh nghiệp sản xuất hàng húa. Cỏc doanh nghiệp mua lại kết quả nghiờn cứu để sản xuất, chế biến cỏc mặt hàng thị trƣờng phục vụ trực tiếp đời sống kinh tế xó hội lồi ngƣời. Lợi nhuận thu đƣợc từ việc kinh doanh hàng húa sẽ cú một phần chi trả cho cỏc hoạt động nghiờn cứu do đú cỏc tổ chức khoa học dạng này thƣờng tự chủ trong tài chớnh, sẵn sàng cạnh tranh trờn thị trƣờng để phỏt triển.