(Giếng D1 đến D12 lần lượt là 12 mẫu đậu tương Cúc bóng nghiên cứu)
Từ hình ảnh điện di cho thấy các band sáng đều, DNA ít bị đứt gãy, các mẫu DNA tổng số thu được có chất lượng tương đối tốt. Tuy nhiên, phương pháp điện di kiểm tra DNA tổng số chỉ có thể xác định được độ nguyên vẹn của DNA mà chưa xác định được độ tinh sạch cũng như hàm lượng DNA. Chính vì vậy bước tiếp theo chúng tôi sử dụng máy đo quang phổ kế Biomate 3 để tiến hành xác định nồng độ và độ tinh sạch các mẫu DNA thu được. Kết quả được thể hiện như bảng 3.4
Bảng 3.4. Kết quả đo độ tinh sạch và nồng độ DNA
STT Mẫu nghiên cứu Tỉ số OD260/OD280 Nồng độ DNA (ng/µl)
1 D1 1,83 36,4 2 D2 1,85 37,0 3 D3 1,92 36,5 4 D4 1,86 37,2 5 D5 1,94 36,6 6 D6 1,88 35,7 7 D7 1,91 39,6 8 D8 1,84 35,8 9 D9 1,93 37,3 10 D10 1,81 40,4 11 D11 1,82 39,1 12 D12 1,87 41,6
Từ bảng kết quả cho thấy các mẫu DNA thu được ít lẫn tạp protein hay RNA hoàn toàn đủ điều kiện cho phản ứng PCR.
Tỉ số OD260/OD280 các mẫu nghiên cứu tương đối đồng đều, kết quả dao động từ 1,82 đến 1,94 nằm trong khoảng từ 1,8 đến 2,2 được coi là tinh sạch (tỷ số OD260/OD280 < 1,8 sản phẩm tách chiết chứa nhiều Protein, OD260/OD280 > 2,2 trong sản phẩm chứa nhiều RNA).
Bảng số liệu cũng cho thấy sự tương quan giữa nồng độ DNA với kết quả điện di sản phẩm DNA: Những mẫu có băng sáng đậm rõ có nồng độ DNA cao
hơn (mẫu D7, D9, D10, D11, D12) so với những mẫu có băng sáng mờ (mẫu D6 và D8).
3.2.2. Kết quả khuếch đại các gen chỉ thị rbcL và ITS2
Từ kết quả trên cho thấy các gen chỉ thị đều được khuếch đại thành công. Sản phẩm PCR cho một băng duy nhất, không xuất hiện sản phẩm phụ. Đối chiếu với thang DNA chuẩn của hãng Thermo Scientific, kích thước sản phẩm