Vấn đề cải cách hành chính, Hà Nội đã và đang có nhiều cố gắng nhưng kết quả còn hạn chế, người dân và doanh nghiệp vẫn kêu nhiều. Nguyên nhân chủ yếu, là do bộ máy và cán bộ, công chức còn đuối tầm, không chỉ về năng lực, mà quan trọng hơn là về đạo đức, phẩm chất, thể hiện sự thấp kém trong văn hoá lãnh đạo, quản lý. Nhiều cơ quan, công chức chưa thật lòng quan tâm tới nhu cầu và lợi ích của dân, doanh nghiệp.
Khi đề ra chủ trương và khi giải quyết công việc cán bộ, công chức Hà Nội thường thiên về tìm giải pháp tiện lợi cho công việc quản lý của mình, ít tính đến hệ quả đối với doanh nghiệp. Tính công khai, minh bạch và chế độ trách nhiệm trong thực thi công vụ mặc dù đã được thay đổi và cải tiến nhiều song vẫn còn bất cập, đặc biệt trong quan hệ giải quyết công việc với doanh nghiệp. Cùng với việc luyến tiếc duy trì cơ chế ''xin cho'', thái độ ứng cử của các cơ quan quản lý nhà nước trên địa bàn, kể cả đơn vị dịch vụ công, đối với doanh nghiệp còn nặng tính cách ''ban ơn''; thậm chí một bộ phận không nhỏ còn cửa quyền, sách nhiễu, gây bất bình trong doanh nghiệp, nêu gương xấu cho xã hội. Chính những điều này đã và đang cản trở và tạo ra những sự mất công bằng giữa các doanh nghiệp, tạo cho doanh nghiệp tâm lý lo sợ khi tiếp xúc với các cơ quan quản lý, nhất là khi thực thi chính sách của Nhà nước làm lợi cho doanh nghiệp. Từ đó tác động gián tiếp đến khả năng mở rộng thị trường, quảng bá thương hiệu và tiêu thụ sản phẩm của doanh nghiệp.