Từ những năm 1950 trở đi, sự phát triển của nghề cá đã bắt đầu được Đảng và Nhà nước quan tâm nhiều hơn, cùng với việc xác định được vị thế quan trọng và sự đóng góp to lớn mà nghề cá mang lại cho nền kinh tế nước ta, bên cạnh đó miền Bắc đang bước vào quá trình khôi phục và phát triển kinh tế, các cơ quan quản lý Nhà nước trong ngành này đã được hình thành, đánh dấu bước phát triển lớn của ngành Thủy sản. Từ đó, ngành Thuỷ sản dần phát triển, và trở thành một trong những ngành kinh tế - kỹ thuật có vai trò quan trọng và đóng góp ngày càng lớn cho sự phát triển kinh tế nước ta. Quá trình hình thành và phát triển ấy được chia thành những giai đoạn như sau:
Giai đoạn 1954 - 1960: ngành Thuỷ sản dần dần được chú ý để phát triển và định hướng trở thành một ngành kinh tế - kỹ thuật. Trong khi đó, kinh tế ở miền
Bắc cũng đang bước vào thời kỳ khôi phục và phát triển. Trong thời kỳ này, các tổ chức nghề cá công nghiệp như nhà máy cá hộp Hạ Long, các đoàn tàu đánh cá Hạ Long, Việt - Đức, Việt - Trung được hình thành dưới sự giúp đỡ nhiệt tình của các nước XHCN. Cùng với đó, “phong trào hợp tác hoá nghề cá” được phát động lan rộng trên phạm vi cả nước.
Giai đoạn 1960 - 1980: từng bước phát triển của ngành Thủy sản gắn liền với những biến động của lịch sử đất nước.
- Từ năm 1960 - 1975: Tổng cục Thủy sản ra đời vào năm 1960 là một trong những dấu ấn đánh dấu thời điểm ra đời ngành Thủy sản Việt Nam. Giai đoạn này đất nước ta đang gồng mình với chiến tranh, các cán bộ ngành Thủy sản và ngư dân cùng nhân dân toàn quốc thực hiện nhiệm vụ chiến lược đó là “Xây dựng XHCN ở miền Bắc và đánh thắng giặc Mỹ, giải phóng miền Nam”, cùng với tinh thần thi đua lao động sản xuất “tất cả vì miền Nam ruột thịt”, có thể kể đến công trình “Đường mòn Hồ Chí Minh trên biển” có sự đóng góp không nhỏ của các ngư dân.
- Từ năm 1976 - 1980: ngành Thủy sản bước sang trang mới khi đất nước thống nhất hai miền. Bộ Hải sản ra đời vào năm 1976 được coi là một trong những sự kiện điển hình đánh dấu sự phát triển của ngành. Tuân theo “10 năm Di chúc của Bác Hồ”, ngành Thủy sản đã phát động phong trào “Ao cá Bác Hồ” và đạt thành công trên khắp cả nước, đem lại những kết quả tích cực.
Nền kinh tế nước ta đang bước vào giai đoạn hồi phục sau những hậu quả nặng nề của chiến tranh để lại. Bên cạnh đó, cơ chế quản lý xưa cũ như tiêu thụ bằng cách giao nộp sản phẩm, đánh giá kết quả chỉ dựa vào khối lượng mà không chú trọng đến chất lượng không còn phù hợp với định hướng thị trường nữa. Cơ chế quản lý này khiến cho động lực sản xuất suy giảm, ngành Thủy sản chững lại và giảm sút trầm trọng vào cuối những năm 1970.
Giai đoạn từ 1981 đến nay: Bộ Hải sản được cơ cấu lại thành Bộ Thủy sản vào năm 1981, đánh dấu một thời kỳ phát triển toàn diện trên tất cả lĩnh vực như khai thác, nuôi trồng, chế biến và xuất khẩu, ưu tiên các hoạt động nghiên cứu và áp dụng công nghệ khoa học - kỹ thuật vào sản xuất, mở rộng hợp tác quốc tế để ngày càng hội nhập và phát triển. Cũng trong năm 1981, đứng trước những khó khăn hậu
thời kỳ sa sút, Công ty xuất nhập khẩu thuỷ sản Seaprdex Việt Nam thành lập, cơ chế mới đó là “tự cân đối, tự trạng trải” được Nhà nước cho phép ứng dụng, nhằm nâng cao giá trị sản phẩm, tạo nguồn thu nhập phục vụ mở rộng sản xuất, tạo động lực cho sự phát triển. Đây được xem là bước đi đầu trong quá trình chuyển đổi nền kinh tế, chuyển hướng sang nền kinh tế thị trường theo định hướng XHCN. Việc áp dụng thành công cơ chế mới gắn sản xuất với nhu cầu thị trường đã tạo ra bước ngoặt lớn, quyết định đến sự phát triển của kinh tế thuỷ sản, là bước đệm cho sự phát triển không ngừng của ngành Thủy sản thời gian về sau.
- Năm 1989: Hiệp hội nuôi tôm xuất khẩu được thành lập, tiền thân là Hội Nuôi trồng thủy sản.
- Năm 1992: Hội Nghề cá Việt Nam VINAFA được ra đời.
- Năm 1998: Hiệp hội Chế biến và xuất khẩu thủy sản Việt Nam VASEP được thành lập.
- Tháng 8/2007: Bộ Thủy sản hợp nhất với Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn hình thành nên Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn mới.