Phần 4 Kết quả và thảo luận
4.3.2. Kết quả so sánh trình tự nucleotide của những chủng virus nghiên cứu
Từ kết quả giải trình tự gen, qua phân tích và xử lý tín hiệu trình tự gene thu được bằng phần mềm Bioedit có kích thước 387bp. Chúng tôi tiến hành so sánh trình tự nucleotide của những chủng virus nghiên cứu qua đó thấy được cụ thể hơn mức độ biến đổi thành phần nucleotide cũng như mối quan hệ giữa các chủng virus gây bệnh ở Miền Bắc Việt Nam. Qua kết quả so sánh được trình bày ở hình 4.16 cho thấy các chủng virus Care giải trình tự được đã có sự sai khác về thành phần nucleotide.
Hình 4.16. Các vị trí sai khác nucleotide của gene P giữa những chủng virus nghiên cứu
Ghi chú: Các vị trí nucleotide giống nhau được biểu thị bằng dấu (.); các vị trí có sự sai khác được
Kết quả so sánh trình tự nucleotide cho thấy trình tự gene P (Phosphor) của 3 chủng virus nghiên cứu được giải trình tự gene có sự sai khác tương đối về thành phần nucleotide, số lượng vị trí sự sai khác lần lượt là:
- Chủng CDV1-PHN có 22 vị trí sai khác với chủng CDV19 –RHN lần lượt là: 5, 39, 42, 50, 56, 57, 79, 84, 167, 177,182,213, 229,230, 236, 252, 269, 281, 291, 333, 382, 383. - Chủng CDV1-PHN có 21 vị trí sai khác với chủng CDV28-HHN lần lượt là: 5, 26, 39, 42, 50, 56, 57, 79, 84, 167, 177,182,213, 229,230, 236, 252, 269, 281, 291, 333. - Chủng CDV19-RHN có 3 vị trí sai khác với chủng CDV28-HHN là: 26, 382, 383.
Như vậy, khi so sánh về thành phần nucleotide ở đoạn gene P giữa các chủng này thì thấy Nucleotide của chủng CDV1-PHN và chủng CDV19 –RHN, CDV28-HHN có lần lượt là 21, 22 vị trí sai khác chiếm tỷ lệ 5,42% và 5,68%. Trong khi so sánh trình tự nucleotide giữa chủng CDV-19-RHN với chủng CDV28-HHN có ba vị trí sai khác chỉ chiếm tỷ lệ 0,77% các chủng CDV tổng số nucleotide của đoạn gene P. Điều này sẽ dẫn đến các chủng virus trong cùng một nhánh phát sinh sẽ có ít sự sai khác về trình tự nucleotide.