Phần 4 Kết quả và thảo luận
4.3.6. Kết quả xây dựng cây sinh học phân tử
Sau khi so sánh mức độ tương đồng về nucleotide giữa những chủng virus Care nghiên cứu và dựa vào phần mềm MEGA6 tiến hành xây dựng cây sinh học phân tử để xác định và phân tích nguồn gốc phát sinh của các chủng virus nghiên cứu với việc sử dụng các chủng virus Care tham chiếu được lấy từ ngân hàng gene thế giới.
Kết quả phân tích nguồn gốc phát sinh của các chủng virus Care nghiên cứu dựa trên sự sai khác nucleotide và axit amin ở đoạn gene P được thể hiện trong bảng 4.10, bảng 3.1, 3.2 (phụ lục 3) và hình 4.18.
Từ kết quả phân tích nguồn gốc phát sinh loài theo sự sai khác nuclecotide gene P trong bảng 4.10 và kết quả phân tích nguồn gốc cho thấy: 3 chủng virus Care nghiên cứu nằm trong 2 nhánh phát sinh khác nhau.
Trong đó, 2 chủng virus nằm trong cùng một nhánh phát sinh thuộc genotype Asia 1 lần lượt là: CDV19-RHN và CDV28-HHN nằm trong cùng nhánh phát sinh với các chủng virus Vietnam. HCM 2014.LC 159587, Vietnam. VNUA-CDV-03 LC1139392009; Japan 2012 AB 755426; China 2012. KJ 466106; China 2010 JN896331.
+ Chủng CDV1-PHN nằm trong cùng một nhánh phát sinh với các chủng virus Thailand 2014. MH 496773 thuộc genotype Asia 1.
Như vậy dựa trên kết quả phân tích nguồn gốc phát sinh loài theo sự sai khác nucleotide ở đoạn gen P của 3 chủng virus Care nghiên cứu, nhận thấy 3 chủng virus nghiên cứu nằm trong 2 nhánh phát sinh khác nhau, thuộc genotype Asia 1.
Kết quả nghiên cứu này có sự sai khác so với nghiên cứ của Guo et al.
(2013) đã chỉ ra virus Care gây bệnh trên gấu trúc và chó hoang thuộc genotype Classic. Bên cạnh đó, nghiên cứu của Lan et al. (2009a) đã chỉ ra chủng virus phân lập đầu tiên tại Việt Nam thuộc Genotype Asia1 cùng nhánh phát sinh với 2 chủng CDV19-RHN và CDV28-HHN trong nghiên cứu này. Điều này cho thấy có sự truyền lây bệnh giữa các vùng địa lý khác nhau trong cả nước và sự truyền lây bệnh giữa các quốc gia trên thế giới do có nhiều nguyên nhân khác nhau.
Kết quả nghiên cứu này có ý nghĩa quan trọng trong việc lựa chọn chủng virus để nhập khẩu vacxin hoặc chế tạo kít chẩn đoán, làm kháng nguyên cho chẩn đoán hoặc làm giống để công cường độc đánh giá hiệu quả bảo hộ và kiểm nghiệm vacxin., Kết quả nghiên cứu tạo tiền đề giúp thúc đẩy các nghiên cứu phát triển sản xuất vacxin trong nước từ chính các chủng virus đang lưu hành tại thực địa, từ đó nâng cao hiệu quả phòng bệnh.
Kết quả phân tích nguồn gốc phát sinh của các chủng virus Care nghiên cứu dựa trên sự sai khác nucleotide và axit amin ở đoạn gene P được thể hiện tại hình 4.18.
Asia1
Hình 4.18. Cây sinh học phân tử dựa trên trình tự nucleotide gene P của những chủng virus Care nghiên cứu