Ban Quản lý ATTP làm việc theo chế độ thủ trưởng và chịu sự lãnh đạo, quản lý toàn diện của UBND cấp tỉnh. Trưởng ban là người đứng đầu của cơ quan, chỉ đạo tổ chức thực hiện nhiệm vụ được giao và chịu trách nhiệm cá nhân trước UBND, Chủ tịch UBND cấp tỉnh và trước pháp luật về việc thực hiện chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn của mình và các công việc được UBND, Chủ tịch UBND cấp tỉnh phân công hoặc ủy quyền kể cả khi đã phân công hoặc ủy nhiệm cho Phó trưởng ban. Căn cứ các quy định của pháp luật và phân công của UBND cấp tỉnh, Trưởng ban Quản lý ATTP ban hành quy chế làm việc, chế độ thông tin báo cáo của cơ quan và chỉ đạo, kiểm tra, đôn đốc, hướng dẫn việc thi hành công vụ của cán bộ công chức; tổ chức thực hiện các biện pháp phòng, chống quan liêu, tham nhũng,
thực hành tiết kiệm, chống lãng phí; thực hiện các quy định của pháp luật về dân chủ cơ sở, văn hóa công sở; xử lý cán bộ công chức thuộc quyền Quản lý có hành vi vi phạm; giải quyết kịp thời theo thẩm quyền hoặc kiến nghị cơ quan có thẩm quyền giải quyết khiếu nại, tố cáo. Trưởng ban có trách nhiệm xin ý kiến về những vấn đề vượt quá thẩm quyền và báo cáo công tác trước HĐND và UBND cấp tỉnh khi có yêu cầu; phối hợp với giám đốc, lãnh đạo các cơ quan chuyên môn khác và người đứng đầu tổ chức chính trị - xã hội cùng cấp để giải quyết các vấn đề liên quan đến chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn của mình. Các Phó trưởng ban là người giúp việc cho Trưởng ban, được Trưởng ban phân công phụ trách một số lĩnh vực công tác, chịu trách nhiệm trước Trưởng ban và trước pháp luật về nhiệm vụ được phân công; khi Trưởng ban vắng mặt, một phó Trưởng ban được Trưởng ban ủy nhiệm điều hành các hoạt động của Sở15.
Nhìn chung, là cơ quan thuộc UBND cấp tỉnh thực hiện chức năng quản lý nhà nước trong lĩnh vực ATTP, Ban Quản lý ATTP hoạt động theo chế độ thủ trưởng, với hình thức hoạt động chủ yếu thể hiện thông qua hoạt động điều hành của Trưởng ban, các Phó trưởng, các chức danh được pháp luật quy định (như Trưởng phòng, Thanh tra chuyên ngành, chuyên viên, nhân viên, người lao động được kí hợp đồng,.. ) cũng như hoạt động của Lãnh đạo các Phòng, Ban, đơn vị và đội ngũ cán bộ, công chức, viên chức trực tiếp giải quyết công việc dưới nhiều cách thức khác nhau như: cuộc họp, báo cáo, ban hành văn bản, thanh tra, kiểm tra, xử lý vi phạm hành chính,..hay thông qua các hoạt động tác nghiệp cụ thể như: điều tra, thống kê, kiểm kê, văn thư, đánh giá, kiểm nghiệm, đấu thầu...nhằm góp phần thực hiện tốt chức năng Quản lý nhà nước về ATTP trên địa bàn tỉnh.