Quan sát hình thái tế bào
Tế bào vi tảo được quan sát dưới kính hiển vi quang học ở bội giác khác nhau (X10, X40).
Quan sát đặc điểm tế bào ở các pha tăng trưởng về màu sắc tế bào, kích thước tế bào, sự phân chia tế bào.
Định danh bằng quan sát hình thái
Mẫu vi tảo được chụp dưới kính hiển vi quang học và ảnh điện tử SEM đối chiếu với các mô tả hình thái của Trương Ngọc An [2] để định loại đến chi trong hệ thống phân loại.
Làm sạch vật chất hữu cơ [25]
Chuẩn bị khoảng 10 ml mẫu phụ rót vào bình tam giác thủy tinh 100 ml.
Mẫu tảo silic Chaetoceros sp. được làm sạch chất hữu cơ bằng cách xử lí với dung dịch H2O2 30% và dung dịch HCl 10%, tiếp tục rửa mẫu lần cuối cùng bằng NH4Cl 1%, để khô ở nhiệt độ phòng và cố định mẫu bằng keo Naphrax của Sigma- Aldrich [29]. Quan sát hình dạng mảnh vỏ, đo các kích thước các mảnh vỏ từ các ảnh chụp dưới kính hiển vi quang học hoặc ảnh SEM.
Thêm 1 ml HCl 10 % để loại trừ CaCO3. Thêm vào 2 ml H2SO4 và 10 ml dung dịch KMnO4 bão hòa, sau đó đậy lọ bằng giấy parafilm, thỉnh thoảng lắc nhẹ mẫu.
Sau 24 giờ, bổ sung 10 ml axit oxalic bão hoà, nhỏ từng ml một, lắc nhẹ, bọt khí sẽ xuất hiện và dung dịch mẫu sẽ trong dần lên, nếu mẫu chưa trong, có thể bổ
sung từng ml một dung dịch axit oxalic bão hoà, để yên mẫu trong vài phút, mẫu sẽ trong. Sau đó mẫu sẽ được li tâm 3 lần, mỗi lần 20 phút với tốc độ 3000 vòng/phút.
Nước cất sẽ được dùng để rửa mẫu khi li tâm, cuối cùng các tế bào Tảo Silic sẽ lắng đáy ống li tâm, loại bỏ nước cất để chỉ còn vài ml.