Do sự phát triển mạnh mẽ của thƣơng mại điện tử và nhu cầu đa dạng của khách hàng tại Việt Nam, đã có một số tổ chức phi ngân hàng cung cấp dịch vụ thanh toán trung gian, nhƣ Ví điện tử, cổng thanh toán điện tử để thanh toán giao dịch thƣơng mại điện tử, trả trƣớc hoặc hàng hóa và dịch vụ thiết yếu (MobiVi, Payoo, VNPay, ECPay, M_Service,...). Các dịch vụ này chịu trách nhiệm hỗ trợ các giải pháp thanh toán và dịch vụ của các ngân hàng thƣơng mại. Ngoài việc tham gia vào thị trƣờng thanh toán trung gian, còn có một số nhà cung cấp dịch vụ viễn thông và trò chơi, nhƣ Viettel BankPlus, Game Online (VTC PayGate), các trang web / giao dịch thƣơng mại điện tử (nhƣ Bảo Kim, Ngân Lƣơng,...).
Dịch vụ ví điện tử là dịch vụ thanh toán mới có nhiều tiềm năng và đang đƣợc Trung tâm chuyển mạch thẻ thống nhất hợp tác với các ngân hàng thƣơng mại để phục vụ các giao dịch bán lẻ giá trị thấp, nhƣ: thanh toán cho các giao dịch trên các trang web thƣơng mại điện tử, thanh toán trực tuyến qua điện thoại di động, thanh toán hóa đơn hoặc mua hàng,... Kể từ năm 2008, Ngân hàng Nhà nƣớc đã cho phép 08 tổ chức phi ngân hàng thí điểm cung ứng dịch vụ thanh toán trung gian ví điện tử. Kể từ ngày 15/7/2017, Ngân hàng Nhà nƣớc cấp phép cho 23 tổ chức cung ứng dịch vụ thanh toán trung gian chính thức hoạt động trên thị trƣờng.
Năm 2016, có 12 tổ chức cung cấp cổng thanh toán điện tử với hơn 11,6 triệu giao dịch, trị giá gần 6.294 tỷ đồng. Đối với dịch vụ thu và thanh toán, đã có 12 nhà cung cấp dịch vụ với hơn 8,6 triệu giao dịch, trị giá gần 6.845 tỷ đồng. Dịch vụ chuyển tiền điện tử đƣợc cung cấp bởi 03 tổ chức với gần 1,9 triệu giao dịch. Đối với dịch vụ ví điện tử, đã có 14 nhà cung cấp dịch vụ trong năm 2016. Dựa trên kết quả triển khai dịch vụ ví điện tử, cho thấy dịch vụ ví điện tử đã có sự tăng trƣởng mạnh mẽ trong năm 2016. Tổng số ví điện tử đƣợc phát hành vào cuối năm Năm 2016 đạt 3,8 triệu ví với 126,6 triệu giao dịch, trị giá gần 53.110 tỷ đồng, trung bình là 419.625 đồng mỗi giao dịch. Các đối tác liên quan đến việc cung cấp dịch vụ thanh toán trung gian cũng đƣợc mở rộng. Vào cuối năm 2016, hơn 40 ngân hàng thƣơng mại đã tham gia hợp tác với các nhà cung cấp dịch vụ thanh toán trung gian để thực hiện các dịch vụ. Các tổ chức đƣợc cấp phép cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán cũng tích cực tìm kiếm đối tác và mở rộng phạm vi cung cấp dịch
vụ. Cụ thể, vào cuối năm 2016, đã có 4.193 đơn vị chấp nhận thanh toán qua cổng thông tin điện tử, 437 đơn vị chấp nhận dịch vụ thu thanh toán và 4.226 đơn vị chấp nhận thanh toán cho các dịch vụ sử dụng ví điện tử của UCSC. Đây đƣợc coi là một liên kết quan trọng trong việc mở rộng các đơn vị chấp nhận và thúc đẩy thanh toán điện tử, từ đó mang lại lợi ích thiết thực cho ngân hàng, khách hàng và nhà cung cấp hàng hóa và dịch vụ.