VSV ñất ( gồm vi khuẩn, xạ khuẩn, nấm, tảo, nguyên sinh ñộng vật ñất) giữ vai trò chủ yếu trong quá trình chuyển hoá vật chất trong ñất. Số lượng thành phần của VSV ñất phản ánh ñộ phì nhiêu của ñất và ảnh hưởng trực tiếp
ñến sinh trưởng phát triển của cây.
Thuốc BVTV tác ñộng rất khác nhau ñến quần thể VSV sống trong ñất. Thuốc trừ sâu ở liều thông dụng thường ít ảnh hưởng ñến xấu ñến quần thể VSV ñất, nhiều khi ở liều này, thuốc còn kích thích VSV ñất phát triển. Nhưng ở liều lượng cao, thuốc trừ sâu ảnh hưởng xấu ñến VSV ñất, kéo dài thời gian tác ñộng của thuốc (Raglu & Mac Rae,1967; Tu,1970; Wolfe,1973). Cũng có loại thuốc trừ sâu ở nồng ñộ thấp cũng hạn chế sự gây hại của VSV ñất. [36]
Thuốc trừ bệnh tác ñộng mạnh ñến quần thể VSV ñất. Các VSV có ích như vi khuẩn nitrat và nitrat hoá, vi khuẩn phản nitrat, vi khuẩn cốñịnh ñạm,
vi khuẩn phân giải chitin rất mẫm cảm với thuốc trừ bệnh ( cả thuốc trừ bệnh xông hơi lẫn thông dụng). Nhiều nấm ñối kháng như nấm Trichoderma viride chống chịu ñược nhiều thuốc trừ bệnh (Ruhloff & Burton, 1954; Domsh, 1959; Brown, 1978).
Thuốc trừ cỏ tác ñộng rất khác nhau ñến quần thể VSV ñất, tuỳ theo loại thuốc, liều lượng dùng và nhóm sinh vật. Một số thuốc trừ cỏ chỉ tác
ñộng xấu ñến một số nhóm VSV này nhưng lại ít ảnh hưởng ñến các nhóm VSV khác. Thuốc trừ cỏ tác ñộng chọn lọc thường chỉ kìm hãm tạm thời ñến VSV ñất. Sau một thời gian bị ức chế, hoạt ñộng của sinh vật ñó lại ñược phục hồi, ñôi khi một số loài nào ñó còn phát triển mạnh hơn trước ( Kearney, 1965; Bộ môn Vi sinh – trường ðH Nông nghiệp I Hà Nội, 1970). Nhìn chung, ở liều thuốc trừ cỏ, thuốc không tác ñộng xấu ñến hoạt ñộng của VSV
ñất (Zemaneck, 1971; Fryer & Kirland, 1970; Nguyễn Trần Oánh, 1983). [16]