Xõy dựng cõy phỏt sinh loài [48,55]
5.2.1.Phỏt hiện virus VNNB genotyp 1 từ bệnh nhõn
Để xỏc dịnh vai trũ gõy bệnh của virus VNNB genotyp 1, nghiờn cứu giải trỡnh tự gen cỏc chủng virus VNNB phõn lập từ bệnh nhõn tại thời điểm nghiờn cứu và trong cỏc năm trước đõy được sử dụng cho mục đớch này. Trong tổng số 27 chủng virus VNNB phõn lập trong cỏc năm 1988 – 2007, khi so sỏnh phõn tớch trỡnh tự vựng gen E đó xỏc định 1 chủng virus VNNB phõn lập trong năm 1990 cú ký hiệu 90VN70 thuộc genotyp 1. Như vậy, tỷ
lệ phõn lập được virus VNNB genotyp 1 rất thấp chỉ cú khoảng 3,7 % trong tổng số cỏc chủng phõn lập được từ bệnh nhõn. Kết quả nghiờn cứu này phự hợp với nhận định, virus VNNB genotyp 1 thớch ứng với muỗi, lợn hơn là
được vật liệu di truyền của virus VNNB genotyp 1 và genotyp 3 từ một số
mẫu dịch nóo tủy cho thấy virus VNNB genotyp 1 cú khả năng gõy bệnh [30,42,62].
Hơn thế nữa, nghiờn cứu thử nghiệm trờn chuột ổ và chuột 11 – 13 gam, cho thấy chuột ổ và chuột 11 – 13 gam nhậy cảm với chủng virus VNNB genotyp 1 phõn lập từ người cú ký hiệu 90VN70 khi gõy nhiễm virus cho chuột theo đường tiờm vào nóo, chuột bị ốm liệt sau 3 – 4 ngày gõy nhiễm. Kết quả này một lần nữa cũng được khẳng định khi tiến hành thử nghiệm với cỏc chủng virus VNNB genotyp 1 phõn lập từ muỗi và mỏu lợn. Trờn thực tế
cú một số động vật nhậy cảm với virus VNNB, tuy nhiờn nú cũn phụ thuộc vào đường tiờm, liều lượng và tuổi của động vật thử nghiệm. Nghiờn cứu cho thấy, với chuột trưởng thành, khi tiờm virus VNNB chủng độc lực theo
đường phỳc mạc, chuột khụng bịốm, liệt [38].
Ngược lại, nghiờn cứu so sỏnh độc lực của virus VNNB genotyp 3 với genotyp 4 cũng đó được thực hiện trờn mụ hỡnh động vật thực nghiệm, xỏc
định độc lực của virus VNNB genotyp 4 thấp hơn so với cỏc chủng virus VNNB genotyp 3. Cho đến nay, cỏc chủng virus VNNB genotyp 4 mới được phõn lập từ muỗi, chưa cú cụng bố nào về việc phỏt hiện được virus VNNB genotyp 4 từ bệnh nhõn, cho thấy virus VNNB genotyp 4 ớt cú khả năng gõy bệnh cho người [2,42,50,62].
So sỏnh trỡnh tự nucleotide vựng gen E của cỏc chủng virus VNNB genotyp 3 phõn lập từ bệnh nhõn ở Việt Nam trong cỏc năm 1988 – 2007 cho thấy trong một khoảng thời gian là 20 năm, nhưng sự sai khỏc về
nucleotide giữa cỏc chủng virus VNNB lớn nhất là 7 % giữa 2 chủng bất kỳ
trong cựng một genotyp được chọn để so sỏnh. Như vậy, tốc độ tiến hoỏ cỳa cỏc chủng virus VNNB là rất chậm, khoảng 2 %, phự hợp với cỏc kết quả
Sự xuất hiện virus VNNB genotyp 1 ở khu vực chõu Á lần đầu tiờn được cụng bố ở Nam Triều Tiờn, Nhật Bản vào năm 1994; tiếp đú là cụng bố ở
Việt Nam vào năm 2004. đú là những chủng virus genotyp 1 được phõn lập từ muỗi và lợn. Trong nghiờn cứu gần đõy, phỏt hiện sự cú mặt của vật liệu di truyền virus VNNB genotyp 1 và genotyp 3 trong mẫu dịch nóo tuỷ của bệnh nhõn ở Nhật Bản, nhưng cho đến nay vẫn chưa được phõn lập được virus VNNB genotyp 1 từ bệnh nhõn [19,34,40]. Trong nghiờn cứu này, chủng virus VNNB genotyp 1 lần đầu tiờn được phỏt hiện từ bệnh nhõn ở
Việt Nam năm 1990, khẳng định virus VNNB genotyp 1 cú khả năng gõy bệnh. Như vậy, virus VNNB genotyp 1 xuất hiện ở Việt Nam cú thể từ
những năm 1990, sớm hơn so với cụng bố trước đõy về sự lưu hành virus VNNB genotyp 1 trong những năm đầu của thế kỷ 21 từ muỗi và mỏu lợn ở
miền Bắc Việt Nam [1,42]. Tương tự như vậy, nghiờn cứu dịch tễ học phõn tử cỏc chủng virus VNNB phõn lập ở Trung Quốc trong cỏc năm 1949 – 2005 cũng đó phỏt hiện virus VNNB genotyp 1 lưu hành ở Trung Quốc từ
những năm 1979 từ muỗi. Tuy nhiờn, trong số 135 chủng virus VNNB phõn lập ở Trung Quốc được giải trỡnh tự vựng gen E để xỏc định sự lưu hành của cỏc genotyp, đó phỏt hiện được virus VNNB genotyp 1 từ muỗi và mỏu lợn, nhưng chưa phỏt hiện được virus VNNB genotyp 1 từ bệnh nhõn [62]. Như
vậy, nghiờn cứu dịch tễ học phõn tử của sự xuất hiện virus VNNB ở chõu Á
đối với cỏc chủng virus VNNB phõn lập trong cỏc năm 1949 - 2007 cho thấy: virus VNNB genotyp 1 xuất hiện đầu tiờn ở Trung Quốc (1979), tiếp
đú là ở Việt Nam (1990) và sau đú là Nam Triều Tiờn và Nhật Bản (1994). Như vậy, với sự phỏt hiện được virus VNNB genotyp 1 từ bệnh nhõn Việt Nam năm 1990, sau cụng bố trước đõy ở Thỏi Lan trong cỏc năm 1979
đõy là chủng virus VNNB genotyp 1 duy nhất được phỏt hiện từ bệnh nhõn ở
chõu Á trong khoảng thời gian 1985 – 2007.
Trong những năm gần đõy, cú sự xuất hiện của cỏc genotyp mới ở một số
vựng địa lý, nhưng chưa cú bằng chứng khoa học để giải thớch cho sự mới xuất hiện này. Nghiờn cứu dịch tễ học phõn tử của virus VNNB thường dựa vào kết quả phõn tớch trỡnh tự cỏc vựng gen mó hoỏ cho protein cấu trỳc và phi cấu trỳc như vựng gen E, PreM hoặc NS5 [28,54,62]. Ngược lại, chưa cú cụng bố nào đề cập đến kết quả xỏc định trỡnh tự vựng gen khụng mó hoỏ
đầu UTR’3 của cỏc chủng virus VNNB. Cú giả thiết cho rằng, nghiờn cứu trỡnh tự vựng gen UTR’3 cú thể sẽ gúp phần giải thớch sự mới xuất hiện của cỏc genotyp mới ở một số vựng địa lý.
6. KẾT LUẬN
6.1. Nghiờn cứu dịch tễ phõn tử virus VNNB ở một số vựng của Việt Nam dựa trờn số liệu phõn tớch trỡnh tự vựng gen E của 34 chủng virus VNNB