Nghiờn cứu dịch tễ học phõn tử virus VNNB ở Việt nam cũn hạn chế. Nghiờn cứu trước đõy xỏc định trỡnh tự nucleotit vựng gen C, M của cỏc chủng virus VNNB phõn lập ở miền Bắc và miền Nam trong cỏc năm 1964 – 1988 đó xỏc định cỏc chủng virus VNNB phõn lập trong khoảng thời gian này thuộc nhúm genotyp 3, chỳng cú họ hàng với chủng Nakayama của Nhật Bản và Beijing-1 của Trung Quốc. Tuy nhiờn những chủng virus này tạo thành 2 phõn nhúm nhỏ tỏch biệt giữa cỏc chủng phõn lập ở miền Bắc với cỏc chủng phõn lập ở miền Nam [23]. Một số nghiờn cứu khỏc về sinh học phõn tử của virus VNNB cũng được thực hiện, nhưng chủ yếu là so sỏnh sự
tương đồng về vật liệu di truyền của cỏc cỏc chủng sản xuất vắc-xin với cỏc chủng tự nhiờn như so sỏnh sự tương đồng về nucleotide và axit amin của chủng Nakayama với chủng phõn lập từ bệnh nhõn năm 1993 (cựng nhúm genotyp 3), hoặc phỏt hiện cú sự xuất hiện genotyp 1 ở miền Bắc Việt Nam từ muỗi và lợn trong những năm đầu thế kỷ 21 [42]. Nờn những nghiờn cứu mang tớnh tổng thể về dịch tễ học phõn tử của virus VNNB ở Việt Nam đặc biệt là sự lưu hành của virus VNNB genotyp 1, hoặc giải mó toàn bộ vật liệu di truyền của một chủng virus VNNB phõn lập ở Việt Nam, hoặc xỏc định vai trũ gõy bệnh của virus VNNB genotyp 1 là những nghiờn cứu cần được thực hiện.
Trờn thực tế, việc phõn lập virus từ bệnh nhõn ớt đạt kết quả, hơn nữa virus VNNB genotyp 1 được cho là thớch ứng với muỗi, lợn hơn là người, do vậy để xỏc định sự lưu hành virus VNNB genotyp 1 ở Việt Nam, việc phõn lập virus từ muỗi, lợn là mục tiờu chớnh mang tớnh khả thi để xỏc định sự lưu hành của virus VNNB genotyp 1 [1,5]. Tuy nhiờn, để khẳng định virus VNNB genotyp 1 gõy bệnh, việc phõn lập, giải mó gen cỏc chủng virus VNNB phõn lập từ người là cần thiết, mặc dự việc phõn lập virus VNNB từ
dịch nóo tuỷ bệnh nhõn cú tỷ lệ dương tớnh thấp [6,8,9].
2.2.3. Sự phỏt triển và ứng dụng kỹ thuật sinh học phõn tử trong nghiờn cứu virus VNNB ở Việt Nam