Về xử lý hóa chất quá hạn (đây chính là chất thải theo phân loại của Bộ y tế là chất thải dược phẩm bao gồm dược phẩm quá hạn, dược phẩm bị nhiễm khuẩn, dược phẩm bị đổ, dược phẩm không có nhu cầu sử dụng và thuốc gây độc tế bào, ở đây BVĐKKV Hóc Môn thực hiện theo đúng quy định về quy chế quản lý chất thải y tế (Quyết định số 43/2007/QĐ – BYT ngày 30 tháng 11 năm 2007 của bộ trưởng bộ y tế) – loại hóa chất này được đem đi thiêu hủy cùng với chất thải y tế độc hại khác ở nhiệt độ cao, đảm bảo khả năng tiêu hủy của thuốc.
Về rác thải là những mô tạng, cơ thể con người thì bệnh viện sẽ cho vào những hủ keo thêm chất Formaldehyde vừa đủ. Sau đó sẽ gửi bệnh phẩm xuống bệnh viện lớn của thành phố để xét nghiệm bệnh phẩm và tiêu hủy.
Riêng đối với chất thải y tế và chất thải sinh hoạt sẽ được vận chuyển theo xe riêng, đơn vị khác nhau và đến hai đại điểm khác nhau để xử lý.
Về rác thải y tế sẽ được giữ lạnh tại bệnh viện sau đó Công ty Môi trường Đô thị thành phố sẽ đến vận chuyển đem đi và được xử lý tại lò đốt Bình Hưng Hòa. Chi phí xử lý rác hiện nay của bệnh viện đều được Nhà nước chi trả hoàn toàn. Thời gian vận chuyển xử lý là cách một ngày lấy rác một ngày. Đối với rác thải sinh hoạt thì bệnh viện ký hợp đồng vận chuyển hàng ngày
với công ty Dịch vụ công ích huyện Hóc Môn, chi phí phải trả theo đề án thu phí năm 2008 của Sở Tài nguyên và Môi trường quy định, sẽ được vận chuyển đến bãi rác của thành phố chôn lấp.
Đánh giá hiện trạng và đề xuất các giải pháp quản lý chất thải rắn y tế tại Bệnh viện Đa khoa khu vực Hóc Môn, Tp. HCM
