các ngân hàng tham gia ĐTT
Việc chọn tỷ lệ chiết khấu chưa hợp lý và chưa thống nhất nên mỗi ngân hàng, mỗi cán bộ thẩm định chọn tỷ lệ chiết khấu theo một cách khác nhau. Một số người chọn tỷ lệ chiết khấu là mức chi phí sử dụng vốn bình quân theo cơ cấu vốn nhưng một số người chọn tỷ lệ chiết khấu là lãi vay ngân hàng, số khác chọn tỷ lệ 10% để dễ tính toán và thông dụng do đó gây nhiều tranh cãi, bất đồng về tính hiệu quả dự án, nhất là đối với các dự án ĐTT do các ngân hàng tự thẩm định. Điều này ảnh hưởng đến việc ra quyết định cho vay của mỗi ngân hàng, nhiều dự án đã bị các ngân hàng tham gia từ chối vì lý do này gây khó khăn và mất nhiều thời gian cho quá trình ĐTT (Dự án sản xuất đạm Phú Mỹ, dự án trạm nghiền xi măng Hiệp Phước).
Mặc dù hầu hết các chỉ tiêu và phương pháp thẩm định tiên tiến đã được áp dụng nhưng thực tế là cán bộ thẩm định thường tính toán đầy đủ các chỉ tiêu theo các phương án khác nhau rồi căn cứ vào cảm nhận chủ quan để chọn những chỉ tiêu mà họ cho là phù hợp nhất làm căn cứ đánh giá. Cách làm này gây nhiều bất lợi cho việc đạt được một sự đồng thuận trong việc ra quyết định cho vay của các ngân hàng tham gia bởi trình độ cán bộ ở mỗi ngân hàng tham gia khác nhau có sự khác biệt. Mỗi ngân hàng lại theo đuổi mục tiêu lợi ích và chính sách tín dụng
khác nhau nên để đi đến một quyết định chung cuối cùng giữa các ngân hàng tham gia ĐTT là dự án có khả thi hay không, có cho vay hay không và nếu có thì cho vay thế nào còn gặp nhiều vướng mắc. Điều này gây nhiều bất lợi cho cả bên nhận tài trợ và bên tài trợ.