II. Từ khi có Luật Khuyến khích đầu tư trong nước đến nay
chưa ban hành được danh mục các lĩnh vực công nghệ đáp ứng yêu cầu để được ưu đãi đầu tư quy định tại điều
ứng yêu cầu để được ưu đãi đầu tư quy định tại điều 2 khoản 30 Nghị định 07.
Thứ hai: Thông tư 08/1998/TT-BLĐTBXH của Bộ Lao động Thương binh và xã hội chỉ hướng dẫn cách tính số lao động bình quân năm đã thực hiện, không hướng dẫn cách tính số lao động thu hút bởi dự án chưa hoặc đang triển khai như quy định của Nghị định.
Thứ ba: Thông tư số 09/1998/TT-BTM ngày 18/7/1998 của Bộ Thương Mại quy định thời hạn miễn thuế nhập khẩu theo điều 37- Nghị định 07 "kể từ ngày được cấp giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư" là không đúng quy định tại điều 50 của Nghị định 07.
Thứ tư: Thủ tục hành chính quy định tại Thông tư 09 và Thông tư 43 còn bao gồm cả một số yếu tố không cần thiết. Ví dụ, Thông tư 43 quy định hồ sơ miễn giảm thuế gồm 4 yếu tố trong đó có 2 yếu tố thừa là quyết định
thành lập doanh nghiệp và Giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh và đơn đề nghị được hưởng các mức ưu đãi về thuế. Hai yếu tố đó đã được cơ quan cấp Giấy chứng nhận ưu đãi đầu tư xem xét rồi.
So với thời kỳ thực hiện Nghị định số 29/CP, thời kỳ thực hiện Nghị định 07 có thể nói là một bước ngoặt. Tuy vậy Nghị định 07 vẫn chưa giải quyết dứt điểm được những tồn tại trước đó trong chính sách khuyến khích đầu tư. Nhiều ý kiến cho rằng quốc doanh vẫn được khuyến khích hơn dân doanh, đầu tư mới vẫn được khuyến khích hơn đầu tư mở rộng mặc dù xét về mặt kinh tế đầu tư mở rộng có tác dụng trực tiếp tăng hiệu quả nền kinh tế,tăng quy mô vốn cá biệt (đầu tư mở rộng theo cách hiểu của Nghị định số 29/CP và Nghị định 07 chính là đầu tư chiều sâu, đầu tư cải tiến công nghệ, hợp lý hoá sản xuất, hợp lý hoá quản lý, làm tăng quy mô và chất lượng sản phẩm hàng hoá. Điều này thực ra không mấy khó hiểu vì nhiều quy định đã được Luật KKĐTTN quy định khung, việc thực hiện các chế độ ưu đãi không phải chỉ phụ thuộc duy nhất vào Luật KKĐTTN hay Nghị định hướng dẫn nó mà còn phụ thuộc vào rất nhiều quy định tại các văn bản quy phạm pháp luật khác như Luật đất đai, các Luật thuế, Luật thương mại... thậm chí còn phụ thuộc vào các văn bản quy phạm pháp luật quy định chức năng, nhiệm vụ, tổ chức bộ máy của hệ thống hành pháp.