Bên cạnh những kết quả đạt được vẫn cịn một số tồn tại cần được khắc phục để nâng cao hơn nữa hiệu quả hoạt động kinh doanh NH nĩi chung và hiệu quả hoạt động tín dụng nĩi riêng, cụ thể:
- Tỷ lệ nợ quá hạn giảm dần qua các năm nhưng tỷ lệ này vẫn cịn cao hơn so với tỷ lệ bình quân của của ngành NH, cụ thể: năm 2007 là 9%, năm 2008 là 7,1%, tháng 3/2009 là 6,0%. Tỷ lệ nợ xấu tuy vẫn dưới mức cho phép của NHNN nhưng lại cĩ xu hương tăng dần qua các năm: năm 2007 là 1,5%, năm 2008 là 1,66%, tháng 3/2009 là 2,3%. Hơn nữa, việc xử lý nợ xấu, thu hồi lãi và gốc cịn gặp nhiều khĩ khăn, nguy cơ gia hạn nợ và phát sinh nợ quá lớn, ngay cả đối với một số mĩn nợ chưa đến hạn nhưng chất lượng tín dụng khơng cao.
- Trong thời gian qua, do áp lực cạnh tranh và tạo ra lợi nhuận từ hoạt động tín dụng, các NHTM khi cho vay chỉ chú trọng đến tài sản thế chấp mà khơng phân tích kỹ tính hiệu quả của phương án kinh doanh và kỹ năng, kinh nghiệm kinh doanh của khách hàng vay vốn cho nên cĩ những khách hàng cĩ phương án kinh doanh khơng hiệu quả vẫn được vay, điều này làm phát sinh nợ quá hạn. Cịn những khách hàng cĩ
phương án kinh doanh hiệu quả, cĩ kỹ năng, kinh nghiệm kinh doanh nhưng chưa cĩ tài sản thế chấp thì bị bỏ qua, điều này sẽ làm mất khách hàng tiềm năng của NH.
- Danh mục cho vay chưa thật đa dạng: hoạt động tín dụng là hoạt động truyền thống, mang lại thu nhập chủ yếu cho NHTM nên hiệu quả hoạt động kinh doanh của NH phụ thuộc nhiều vào hoạt động cho vay vốn là hoạt động tiềm ẩn nhiều rủi ro cho NH.