Trên địa bàn huyện hiện nay có có 1 trung tâm Y tế; 1 phòng khám đa khoa huyện và 16 xã, thị trấn đều có trạm y tế xã đã và đang được từng bước xây dựng mới, mua sắm các trang thiết bị y tế hiện đại. Tổng số giường bệnh 14 giường, trong
đó trung tâm y tế 75 giường bệnh, phòng khám đa khoa có 5 giường bệnh, còn lại là các trạm y tế xã thị trấn. Tổng số cán bộ ngành y dược trên địa bàn là 132 người, trong đó có 40 bác sỹ đại học và trên đại học (đạt tỷ lệ 30 bác sỹ trên 10 vạn dân), 50 y sỹ, kỹ thuật viên; 39 y tá, điều dưỡng viên; 3 dược sỹ trung cấp. Hiện tại có 7 xã đã được công nhận đạt chuẩn quốc gia về y tế
Mặc dù trong những năm qua ngành y tế còn gặp nhiều khó khăn về kinh phí, cơ sở vật chất bị hư hỏng, trang thiết bị thiếu và cũ, song toàn ngành đã khắc phục khó khăn hoàn thành tốt nhiệm vụ được giao: Triển khai tốt các chương trình y tế quốc gia, thực hiện khám chữa bệnh miễn phí đối với người nghèo, trẻ em dưới 6 tuổi và đồng bào dân tộc thiểu số; công tác y tế dự phòng được thực hiện khá tốt, nhiều năm không có dịch lớn xảy ra trên địa bàn huyện; công tác tuyên truyền phòng chống các bệnh xã hội, được thực hiện thường xuyên; công tác chăm sóc sức khỏe bà mẹ và trẻ em ngày càng được coi trọng. Năm 2013, Tổ chức tiêm chủng
định kỳ cho trẻ em đảm bảo đủ mũi, an toàn; tổng số lượt khám, chữa bệnh tại Bệnh viện Đa khoa huyện 66.237 lượt đạt 124% kế hoạch; khám tại trạm y tế các xã, thị
trấn 77.964 lượt đạt 104% kế hoạch. Tập trung chỉđạo xã Yên Lạc và thị trấn Giang tiên hoàn thiện hồ sơ đề nghị công nhận xã đạt chuẩn Quốc gia về y tế. năm 2014
tổng số lượt khám chữa bệnh là 166.889 lượt người, có 05 xã được công nhận đạt chuẩn Y tế ( Sơn Cẩm, Yên Ninh, Yên Lạc, Yên Trạch, thị Trấn Đu )