Công tác tồn trữ chất thải bộc lộ nhiều hạn chế, hầu hết chưa đảm bảo tồn trữ đúng theo qui định về quản lý chất thải. Nhiều cơ sở sản xuất tận dụng mặt bằng sản xuất (trong khuôn viên sản xuất) hoặc tận dụng mặt bằng nhà xưởng để lưu trữ chất thải chờ chuyển giao xử lý. Rất ít cơ sở sản xuất có khu vực riêng, đảm bảo an toàn đúng qui định về quản lý chất thải nguy hại. Một phần là o các cơ sở sản xuất xây dựng trước đây không có qui hoạch khu chứa chất thải nguy hại, các khuôn viên nhà máy đều đã được bố trí sử dụng hết công năng để sản xuất và lưu chứa hàng hóa và đều quan trọng trên hết ý thức của các cơ sở sản xuất về công tác quản lý chất thải chưa đặt nặng. Vì vậy công tác tồn trữ chất thải nguy hại tại các cơ sở sản xuất hiện nay phần lớn diễn ra chưa đúng qui định về kỹ thuật, an toàn trong phòng chống cháy nổ và ứng phó sự cố khi có rò rỉ chất thải xảy ra ông tác lưu chứa chủ yếu sắp xếp sao cho gọn gàng chứ chưa theo qui định về quản lý chất thải nguy hại.
Một bộ phận nhỏ các chủ nguồn thải đã ý thức về việc lưu trữ CTRCNNH tại nguồn thải. Tuy nhiên mức độ còn rất hạn chế về số lượng cơ sở thực hiện cũng như chưa đạt yêu cầu về trang thiết bị lưu giữ. Các thiết bị, th ng lưu giữ chất thải tự chế hoặc sử dụng lại các thùng chứa nguyên liệu cũ có thể tích từ vài chục lít đến vài ngàn lít. Vật liệu th ng lưu giữ rất khác nhau, nhưng chủ yếu là plastic và kim loại.
Các thiết bị lưu chứa chưa đảm bảo đúng theo qui định về mặt kỹ thuật như thiếu các thông tin về CTRCNNH, việc dán nhãn trên các thùng chứa còn hạn chế, các thông tin cơ bản về chất thải nguy hại như: ghi mã số, ngày bắt đầu lưu chứa, tính chất của chất thải (dễ cháy, dễ nổ, ăn m n, ) trên các thiết bị, thùng chứa chất thải nguy hại thông thường chưa được các cơ sở sản xuất quan tâm thực hiện một cách đầy đủ trên các bao bì chứa CTNH.