Nộp đơn quốc gia
Một lựa chọn là tìm kiếm sự bảo hộ một cách độc lập ở các quốc gia riêng biệt bằng cách trực tiếp nộp đơn tới các Cơ quan SHTT/SHCN quốc gia. Mỗi một đơn có thể sẽ phải được dịch sang ngôn ngữ theo quy định, mà thường là ngôn ngữ của quốc gia đó. Bạn sẽ phải nộp lệ phí đơn quốc gia, đặc biệt trong trường hợp đối với bằng độc quyền sáng chế, bạn có thể cần phải ủy thác cho luật sư hoặc đại diện SHCN - người sẽ giúp bạn đảm bảo rằng đơn thỏa mãn các yêu cầu quốc gia. Nếu bạn vẫn đang ở trong giai đoạn đánh giá khả năng thương mại của sáng chế hoặc vẫn đang khai thác các thị trường xuất khẩu tiềm năng hoặc chuyển quyền sử dụng cho đối tác, thì quy trình quốc gia này trở nên đặc biệt tốn kém và phức tạp, nhất là khi bạn muốn có sự bảo hộ ở nhiều nước. Trong trường hợp này, các điều kiện thuận lợi được đề xuất bởi hệ thống quản lý của WIPO về bảo hộ quốc tế đối với sáng chế, nhãn hiệu và kiểu dáng sẽ đưa ra một lựa chọn đơn giản và thường ít tốn kém hơn.
Nộp đơn khu vực
Một số nước đã xây dựng các thỏa thuận khu vực cho việc đạt được sự bảo hộ quyền SHTT trên toàn khu vực chỉ với một đơn. Các cơ quan SHTT khu vực bao gồm:
Cơ quan Sáng chế châu Âu (cho các văn bằng bảo hộ sáng chế châu Âu): http://www.european-patent-office.org
Cơ quan Hài hòa hóa thị trường nội địa (cho các nhãn hiệu cộng đồng ở châu Âu, và trong tương lai là cả kiểu dáng công nghiệp): http://oami.eu.int/
Cơ quan SHCN khu vực châu Phi (ARIPO, cơ quan SHTT khu vực dành cho các nước châu Phi nói tiếng Anh, cho sáng chế, nhãn hiệu và kiểu dáng công nghiệp): http://aripo.wipo.net/
Cơ quan SHTT châu Phi (OAPI, cơ quan SHTT khu vực dành cho các nước châu Phi nói tiếng Pháp cho sáng chế, nhãn hiệu, kiểu dáng công nghiệp, và trong tương lai cho cả chỉ dẫn địa lý và thiết kế bố trí mạch tích hợp): http://oapi.wipo.net
Cơ quan Patent Âu Á (để bảo hộ các sáng chế ở các nước thuộc Cộng đồng các quốc gia độc lập): http://www.eapo.org
Cơ quan Nhãn hiệu Benelux và Cơ quan Kiểu dáng Benelux (để bảo hộ nhãn hiệu và kiểu dáng công nghiệp ở Bỉ, Hà Lan và Luxembua): http://www.bmb-bbm.org/ và http://www.bbtm-bbdm.org/
Cơ quan Patent của Hội đồng Hợp tác dành cho các quốc gia Ả rập vùng Vịnh (cho sáng chế): http://www.gulf-patent-office.org.sa/