Vào những năm cuối của thập kỷ 90, công cuộc đổi mới cơ chế quản lý kinh tế đất nƣớc đã diễn ra một cách sâu sắc và toàn diện. Để phù hợp với cơ chế quản lý kinh tế mới, cơ chế quản lý tài chính tiền tệ đã có sự thay đổi, đặc biệt là các vấn đề có liên quan đến chức năng, nhiệm vụ của ngành Tài chính và Ngân hàng. Hệ thống Ngân hàng đƣợc tổ chức lại thành 2 cấp: Ngân hàng Nhà nƣớc thực hiện chức năng quản lý Nhà nƣớc trên lĩnh vực tiền tệ - tín dụng, các Ngân hàng thƣơng mại thực hiện chức năng kinh doanh tiền tệ tín dụng. Nhiệm vụ quản lý quỹ NSNN đƣợc chuyển giao từ Ngân hàng Nhà nƣớc sang Bộ Tài chính để hệ thống Tài chính trực tiếp thực hiện chức năng quản lý và điều hành quỹ NSNN.
Quan điểm thành lập hệ thống Kho bạc Nhà nƣớc trực thuộc Bộ Tài chính để quản lý quỹ NSNN và tài sản Quốc gia đã đƣợc Hội đồng Bộ trƣởng (nay là Chính phủ) quyết định tại Nghị định số 155/HĐBT ngày 15/10/1988 về chức năng, nhiệm vụ và tổ chức bộ máy của Bộ Tài chính.
Trên cơ sở kinh nghiệm đã tích luỹ đƣợc trong những năm hoạt động của Ngân khố Quốc gia, qua tham khảo kinh nghiệm tổ chức Kho bạc, kế toán Nhà nƣớc của Pháp và một số nƣớc, đặc biệt là kết quả làm thí điểm Kho bạc Nhà nƣớc ở hai tỉnh Kiên Giang và An Giang, Bộ Tài chính đã trình Hội đồng Bộ trƣởng đề án thành lập Kho bạc Nhà nƣớc trực thuộc Bộ Tài chính. Ngày 04//01/1990 Hội đồng Bộ trƣởng đã ký Quyết định số 07/HĐBT về việc thành lập hệ thống Kho bạc Nhà nƣớc trực thuộc Bộ Tài chính. Ngày 21/3/1990 Bộ trƣỏng Bộ Tài chính đã ban hành quyết định số 185/TC/QĐ/TCCB về việc thành lập Chi cục Kho bạc Nhà nƣớc trực thuộc Cục Kho bạc Nhà nƣớc.
Từ thực tế 5 năm hoạt động và phát triển để tiếp tục khẳng định vai trò vị trí của Kho bạc Nhà nƣớc trong nền kinh tế, đồng thời tạo môi trƣờng pháp lý thuận
42
lợi cho Kho bạc Nhà nƣớc hoạt động, ngày 05/04/1995 Chính phủ đã ban hành Nghị định số 25/CP quy định nhiệm vụ, quyền hạn, tổ chức bộ máy Kho bạc Nhà nƣớc trực thuộc Bộ Tài chính. Thực hiện Nghị định số 145/1999/ NĐ - CP ngày 20/9/1999 của Chính phủ về tổ chức lại Tổng cục Đầu tƣ phát triển thuộc Bộ Tài chính và Quyết định số 145/1999/QĐ/TC ngày 26/11/1999 của Bộ trƣởng Bộ Tài chính về nhiệm vụ và tổ chức bộ máy TTVĐT thuộc hệ thống Kho bạc Nhà nƣớc. Kể từ ngày 01/01/2000, hệ thống Kho bạc Nhà nƣớc đƣợc giao thêm nhiệm vụ: kiểm soát thanh toán, kế toán, quyết toán vốn đầu tƣ, vốn sự nghiệp có tính chất đầu tƣ và xây dựng thuộc nguồn vốn NSNN các cấp.
Hiện nay, hệ thống Kho bạc Nhà nƣớc huyện Ba Vì hoạt động theo Quyết định 108/2009/QĐ-TTg ngày 26/8/2009 của Thủ tƣớng Chính phủ quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Kho bạc nhà nƣớc trực thuộc Bộ Tài chính thì Kho bạc nhà nƣớc có nhiệm vụ giúp Bộ trƣởng Bộ Tài chính quản lý Nhà nƣớc về quỹ ngân sách Nhà nƣớc, các quỹ tài chính Nhà nƣớc và các quỹ khác của Nhà nƣớc đƣợc giao quản lý; quản lý ngân quỹ; tổng kế toán Nhà nƣớc; thực hiện việc huy động vốn cho ngân sách Nhà nƣớc và cho đầu tƣ phát triển thông qua hình thức phát hành trái phiếu Chính phủ theo quy định của pháp luật.