61 gcaagtcgag cggacagatg ggagcttgct ccctgatgtt agcggcggac gggtgagtaa 121 cacgtgggta acctgcctgt aagactggga taactccggg aaaccggggc taataccgga 181 tggttgtttg aaccgcatgg ttcagacata aaaggtggct tcggctacca cttacagatg 241 gacccgcggc gcattagcta gttggtgagg taacggctca ccaaggcaac gatgcgtagc 301 cgacctgaga gggtgatcgg ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag 361 gcagcagtag ggaatcttcc gcaatggacg aaagtctgac ggagcaacgc cgcgtgagtg 421 atgaaggttt tcggatcgta aagctctgtt gttagggaag aacaagtgcc gttcaaatag 481 ggcggcacct tgacggtacc taaccagaaa gccacggcta actacgtgcc agcagccgcg 541 gtaatacgta ggtggcaagc gttgtccgga attattgggc gtaaagggct cgcaggcggt 601 ttcttaagtc tgatgtgaaa gcccccggct caaccgggga gggtcattgg aaactgggga 661 acttgagtgc agaagaggag agtggaattc cacgtgtagc ggtgaaatgc gtagagatgt 721 ggaggaacac cagtggcgaa ggcgactctc tggtctgtaa ctgacgctga ggagcgaaag 781 cgtggggagc gaacaggatt agataccctg gtagtccacg ccgtaaacga tgagtgctaa 841 gtgttagggg gtttccgccc cttagtgctg cagctaacgc attaagcact ccgcctgggg 901 agtacggtcg caagactgaa actcaaagga attgacgggg gcccgcacaa gcggtggagc 961 atgtggttta attcgaagca acgcgaagaa ccttaccagg tcttgacatc ctctgacaat 1021 cctagagata ggacgtcccc ttcgggggca gagtgacagg tggtgcatgg ttgtcgtcag 1081 ctcgtgtcgt gagatgttgg gttaagtccc gcaacgagcg caacccttga tcttagttgc 1141 cagcattcag ttgggcactc taaggtgact gccggtgaca aaccggagga aggtggggat 1201 gacgtcaaat catcatgccc cttatgacct gggctacaca cgtgctacaa tggacagaac 1261 aaagggcagc gaaaccgcga ggttaagcca atcccacaaa tctgttctca gttcggatcg 1321 cagtctgcaa ctcgactgcg tgaagctgga atcgctagta atcgcggatc agcatgccgc 1381 ggtgaatacg ttcccgggcc ttgtacacac cgcccgtcac accacgagag tttgtaacac
Hình 3.28.Trình tự nucleotit 16S rARN của chủng vi khuẩn HN16
Bảng 3.29. Mức độ tương đồng gen 16S chủngvi khuẩn HN16với trình tự của các chủng trên GenBank
Mã Thông tin chủng % tương đồng
AY775778.1 Bacillus subtilis BFAS 100
HQ236379.1 Bacillus subtilis SL9-9 100
EU257436.1 Bacillus subtilis C8-4 99
AB501113.1 Bacillus subtilis A97 99
FJ528074.1 Bacillus sp. BM2 99
Kết quả hình 3.28và bảng 3.29cho thấy chủng HN16 có độ tương đồng 100 % so với chủng Bacillus subtilis. Vì vậy, chủng vi khuẩn HN16 được ký hiệu là
Bacillus subtilis HN16.
K16 70Viện Sinh thái và Tài nguyên sinh vật
Đối với nấm mốc sử dụng trình tự gen 28S rARN là phổ biến hiện nay,Gen này có mặt trong tất cả các tế bào, chứa vùng bảo thủ cao và vùng biến đổi cho phép phân biệt giữa các loài khác nhau trong giới nấm mốc rất dễ dàng.Hình 3.29trình bày kết quả điện di sản phẩm tách chiết ADN tổng số từ chủng HN18trên agaroza 0,8 %. Kết quả kiểm tra trên máy đo quang phổ cũng cho thấy ADN tổng số tách chiết được có độ tinh sạch cao (A260/280 = 1,85 - 1,91), mẫu ADN có thể sử dụng làm khuôn để thực hiện phản ứng PCR đặc hiệu nhất.
M HN18
Hình 3.29.Điện di đồ sản phẩm PCR chủng nấm mốc HN18
(M: marker)
Trình tự gen 28S rARN của chủng HN18 được thể hiện ở hình 3.30.