Trong giai đoạn 2009 - 2013, khó khăn lớn nhất mà Công ty sẽ phải đương đầu đó là phải kinh doanh trong điều kiện thiếu vốn để đầu tư phát triển mạng lưới cấp nước mới và thay thế một số tuyến ống đã quá cũ. Để giải quyết vấn đề này, Công ty cần có một chiến lược hoạt động đúng đắn và một hệ thống tổng thể các giải pháp kinh tế kỹ thuật và quản lý.
Trong tình trạng thiếu vốn, chiến lược hoạt động định hướng vào hiệu quả công việc là cách làm thích hợp nhất để giải quyết vấn đề. Các chỉ tiêu quan trọng
phản ánh hiệu quả công việc bao gồm: tỷ lệ tổn thất nước sạch, tỷ suất lợi nhuận, tỷ
suất đầu tư, năng suất lao động... Như vậy, toàn bộ hoạt động sản xuất kinh doanh của Công ty cần được đánh giá thông qua các chỉ tiêu phản ánh hiệu quả để từ đó tìm ra những phần công việc cần được ưu tiên làm trước với cách thức triển khai tối ưu (chi phí ít nhất nhưng mang lại lợi ích nhiều nhất). Đây là vừa là yêu cầu vừa là giải pháp không chỉ đối với các Công ty nước sạch mà với tất cả các doanh nghiệp. Tuy nhiên, việc áp dụng giải pháp này đối với các doanh nghiệp nước sạch cũng khác với các doanh nghiệp khác do các đặc thù kinh doanh. Vì không phải cạnh tranh và nghiên cứu cải tiến sản phẩm nên các Công ty nước sạch không phải mất chi phí cho các hoạt động tiếp thị, quảng cáo hàng hoá hay nghiên cứu phát triển sản phẩm mới. Tuy nhiên, yêu cầu về việc cung ứng nước sạch ổn định lại được đặt lên hàng đầu. Để giải quyết vấn đề này trong điều kiện nguồn vốn có hạn thì các doanh nghiệp kinh doanh nước sạch phải giải quyết triệt để bài toán đầu tư hiệu quả, sử dụng tối ưu các nguồn vốn hiện có. Nếu không, các doanh nghiệp sẽ rơi vào tính trạng nợ nần do đầu tư không đúng trọng điểm. Việc tính toán hiệu quả đầu tư của Công ty nước sạch cũng đơn giản hơn các doanh nghiệp khác do hiện nay các Công ty này ít bị rủi ro được tạo ra từ thị trường hoặc đối thủ cạnh tranh.