Việc ứng dụng công nghệ mới vào sản xuất kinh doanh cũng đòi hỏi ngày càng cao chất lượng của các KTVNB. KTVNB không chỉ có kiến thức tài chính kế toán, đồng thời lại phải có kiến thức vững chắc về nhiều hệ thống công nghệ thông tin khác nhau, am hiểu nhiều hệ ERP đang được sử dụng rộng rãi trên thế giới. Hiện nay tại thị trường Việt Nam, nguồn nhân lực để phục vụ cho công việc này hạn chế. Nếu chọn người có chuyên môn về kế toán thì chuyên môn công nghệ thông tin không nắm vững và không kiểm soát được các điểm yếu về công nghệ thông tin của doanh nghiệp. Nếu chọn người có kinh nghiệm, chuyên môn về công nghệ thông tin thì lại gặp khó khăn về nghiệp vụ kế toán, tài chính. Do đó, cần phải tăng cường xây
dựng đội ngũ kiểm toán, tăng cường đào tạo nhằm đáp ứng nhu cầu của sự phát triển của KTNB hiện đại.
Công tác đào tạo cần được chú trọng. Điều này có nghĩa là các kiểm toán viên phải được tham gia cập nhật các khoá đào tạo nghiệp vụ mới trong doanh nghiệp để không bị lạc hậu so với nhân viên nghiệp vụ, đồng thời phải liên tục cập nhật các thông tin về pháp luật, các văn bản mới trong ngành và các kiến thức cơ bản khác về máy tính. Có thể kết hợp với các công ty kiểm toán, đặc biệt là các công ty có kinh nghiệm trong kiểm toán môi trường xử lý điện tử hoặc công ty tư vấn có kinh nghiệm về tư vấn triển khai ERP trong quá trình đào tạo để đạt hiệu quả như mong muốn.
Bên cạnh đó, KTVNB cần phải có sự kết hợp chặt chẽ với các đơn vị kiểm toán độc lập bên ngoài để học hỏi các phương pháp, quy trình kiểm toán hiệu quả của kiểm toán độc lập, nhận các báo cáo kiểm toán độc lập để nắm rõ tình hình thực tế của doanh nghiệp; ngược lại kiểm toán độc lập có thể tiếp cận các số liệu, chứng từ, báo cáo,…của KTNB để phục vụ công tác kiểm toán của mình. Sự phối hợp này sẽ tránh sự trùng lặp công việc kiểm toán, hỗ trợ cho các bên khi thực hiện kiểm toán.