Để quản lý có hiệu quả hoạt động dịch vụ chứng khoán của các công ty chứng khoán, nhà nước ta đã xây dựng hệ thống chính sách thuế làm cơ sở pháp lý thực hiện quản lý nhà nước đối với hoạt động dịch vụ chứng khoán của các công ty chứng khoán, chính sách thuế tạo đà cho sự phát triển thị trường chứng khoán, và giúp hoạt động quản lý nhà nước trên lĩnh vực này được thực hiện một cách có hệ thống và có hiệu lực, cụ thể:
- Năm 2004, Ủy ban chứng khoán Nhà nước đề nghị Bộ tài chính ban hành Thông tư hướng dẫn riêng về chính sách thuế áp dụng cho công ty chứng khoán.
Theo đại diện của ủy ban chứng khoán Nhà nước, có hai nội dung cần được xác định rõ là thuế VAT và thuế thu nhập doanh nghiệp. Đối với thuế VAT, theo Luật thuế sửa đổi, bổ sung về thuế giá trị gia tăng thì hoạt động kinh doanh chứng khoán không chịu thuế GTGT. Điều này đã hỗ trợ cho sự phát triển của thị trường chứng khoán, khi các tổ chức hoạt động trên thị trường chứng khoán không phải đóng cho nhà nước một phần thu nhập của
mình, khuyến khích họ hoạt động có hiệu quả, gia tăng thu nhập cho cả nhà phát hành và nhà đầu tư.
Đối với thuế thu nhập doanh nghiệp, Các công ty đã được cấp phép kinh doanh từ năm 2003 trở về trước, sẽ áp dụng theo Luật thuế thu nhập doanh nghiệp mới, song Ủy ban chứng khoán Nhà nước cần làm đầu mối kiến nghị Bộ tài chính xử lý cụ thể. Riêng với các công ty được cấp phép kinh doanh sau ngày 1/1/2004 thì áp dụng Luật thuế thu nhập doanh nghiệp mới với điều khoản ưu đãi đã được ghi trong giấy phép kinh doanh.
- Chính sách thuế không những phải đảm đảm bảo cân đối với mọi ngành nghề kinh tế, mà còn phải hoàn thiện không cần văn bản bổ sung, sửa đổi, đồng thời ưu đãi thuế phải ứng dụng mọi loại hình kinh doanh chứng khoán.
- Chính sách phí và lệ phí cần ưu đãi hơn cho kinh doanh CK : Phí cơ bản mà các tổ chức cá nhân phải trả Theo đề nghị của Uỷ ban chứng khoán Nhà nước (UBCKNN), ngoài các ưu đãi về phí và lệ phí đang áp dụng hiện hành đối với các hoạt động kinh doanh chứng khoán tại Việt Nam, cần có chính sách ưu đãi hơn nữa đối với các tổ chức, cá nhân tham gia thị trường dưới góc độ nhà đầu tư.
Phí và lệ phí bao gồm các khoản thu phí, lệ phí thuộc ngân sách Nhà nước và các khoản phí thuộc doanh thu của doanh nghiệp tham gia kinh doanh chứng khoán.
Có thể giảm mức thu lệ phí thuộc ngân sách Nhà nước đối với việc áp dụng khi cấp giấy phép hoạt động cho công ty chứng khoán (0,2% vốn pháp định), lệ phí cấp giấy phép hành nghề (1 triệu đồng/giấy phép) và chỉ thu một mức phí cố định theo số tuyệt đối.
Đối với các khoản thu phí thuộc doanh thu của các công ty chứng khoán, chỉ quy định một số loại phí cơ bản theo mức phí tối đa (khung phí),
các công ty dựa trên cơ sở thực tiễn của thị trường để định ra mức thu phí cụ thể có khả năng cạnh tranh giữa các công ty.
Cần giảm phí giao dịch (hoa hồng môi giới) theo 3 hướng: mức phí tối thiểu để hạn chế các giao dịch nhỏ và không kinh tế. Đối với công ty chứng khoán, đặt ra mức phí tối thiểu là một cách tốt hơn nhiều so với việc từ chối thực hiện những giao dịch nhỏ.
Mức phí theo tỷ lệ giá trị giao dịch để tránh cho người đầu tư nhỏ không phải chịu cùng mức phí với người đầu tư lớn, nhất là trong giai đoạn cần khuyến khích giao dịch như hiện nay, khi thị trường phát triển thì có thể chuyển qua thu phí theo mức cố định.
Các khoản thu phí thuộc doanh thu, các công ty chứng khoán đều phải đưa ra mức phí hoa hồng môi giới cạnh tranh trên cơ sở mức trần là 0,5% trị giá giao dịch cổ phiếu. Các loại phí khác như phí tư vấn phát hành và niêm yết hiện đều do các bên tham gia tự thỏa thuận.