phân tích trình tự chuỗi adn

Ngày tải lên: 03/04/2014, 08:20

... NGUYÊN LÝ CỦA CÁC PHƯƠNG PHÁP PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ GEN PHƯƠNG PHÁP SANGER PHƯƠNG PHÁP MAXAM-GILBERT  PHƯƠNG PHÁP PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ GEN TỰ ĐỘNG HĨA HỌC/ PHẢN ỨNG CHUỖI (DÂY CHUYỀN) POLYMERASE ... sánh nhiều trình tự  EMBL-Bank: Ngân hàng EMBL gọi CSDL trình tự nucleotide EMBL, đóng góp vào nguồn trình tự nucleotide sơ cấp châu Âu  EMBL CDS: CSDL trình tự nucleotide trình tự mã hóa (CDS ... Mutation Checker Đánh giá độ trính xác trình tự, phát đột biến Pepstats/Pepwindow/Pepinfo Chương trình phân tích trình tự protein PromoterWise So sánh hai trình tự DNA cho phép đảo ngược đổi vị trí,...

Ngày tải lên: 25/05/2015, 16:00

... tích trình tự gen lumbrokinase Gen mã hóa lumbrokinase plasmid tái tổ hợp phân tích trình tự máy ABI-3130 Trình tự nucleotide gen mã hóa lumbrokinase trình bày hình so sánh với số trình tự gen ... gel trình bày hình 3, cho thấy gen thu có kích thước khoảng 700 bp Để kết luận đoạn gen tách từ giun quế gen mã hóa lumbrokinase chúng tơi tiến hành phân tích trình tự nucleotide gen 3.2 Phân tích ... bào để tách chiết DNA plasmid tái tổ hợp Trình tự nucleotide gen xác định theo phương pháp Sanger máy ABI 3130 Phân tích trình tự nucleotide thực chương trình BioEdit Kết thảo luận 3.1 Tạo dòng...

Ngày tải lên: 11/03/2014, 06:21

... liệu trình tự thô đợc chuyển đến AutoAssemble software 1.40 (applied Biosystem) GeneBuilder (Applied Maths), trình tự liên tục gen PheS đợc xác định Trình tự liên tục ny đợc nhập vo chơng trình ... axit phương pháp phân tích trình tự gene pheS Maths), gi¸ trị tơng đồng loi v phân loại đợc tạo dựa vo phơng pháp neighbourjoining v maximumparsimony (Saitou v cs., 1987) Trình tự chủng ny đợc ... vμ thêm 45 l dung dịch SAM, 10 l XTerm Giải trình tự đợc thực nhờ máy ABI PRISM 3100 (Applied Biosystem) 2.2.2 Phản ứng PCR 2.2.3 Phân tích trình tự gen pheS v xác định loi Mồi PheS-21-F (5-C...

Ngày tải lên: 19/03/2014, 13:20

... tắc phương pháp giải trình tự theo Sanger Giải trình tự đoạn oligonucleotide theo phương pháp enzyme học Các phương pháp cải biên từ phương pháp Sanger  Xác định trình tự máy tự động: Trong kĩ ... Gilbert) Dựa vào thủy giải đặc trưng phân tử DNA cần xác định trình tự phương pháp hóa học Trước hết DNA đánh dấu P32 đầu Sau đó, chúng chia thành năm phân đoạn, phân đoạn xử lí với chất hóa học ... dideoxynucleotide Dựa vào tổng hợp nhờ enzyme DNA polymerase mạch bổ sung cho trình tự DNA mạch đơn cần xác định trình tự Sử dụng loại nucleotide thơng thường + dideoxynucleotide Dideoxynucleotide...

Ngày tải lên: 04/07/2014, 03:20

... cs (1999) 2.4 Phương pháp giải trình tự gen: Giải trình tự nucleotit thực theo bước sau: Sản phẩm sau PCR làm Pre-sequence kít: gồm m l ADN- PCR cần xác định trình tự, 0,5 m l exonuclease III (10 ... gen hormone sinh trưởng Trong vùng exon II, trình tự nucleotit có đột biến điểm nucleotit vị trí 507, 555 556 tạo nên thay đổi trình tự axit amin phân tử Protein mà gen mã hố từ tạo nên đa hình ... giải trình tự gen hormone sinh trưởng từ giống lợn nội cho thấy vị trí 506-509 có thay C/T vị trí 507 tạo hai ba mã hố (GCG GTG) tạo axit amin Alanine (GTG) thay cho valine (GCG) trình tự axít...

Ngày tải lên: 11/07/2014, 20:21

Ngày tải lên: 24/07/2014, 17:22

... tổ hợp enzym giới hạn EcoRI Giải trình trình tự chuỗi nucleotit xử lý số liệu: Chuỗi ADN chứa gen 16S- ARNr nột phần plasmid giải trình tự máy giải trình tự tự động ABI 377 PRISM (Perkin- Elmer) ... nucleotid Trong báo này, vị trí phân loại chủng Ps7-1 trình bày sở phân tích trình tự nucleotid gen 16S-ARN ribosom (16S-ARNr) I NGUYÊN LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP Vi sinh vật: Chủng phân lập Ps7-1 có nguồn ... mồi ngược M13R (5’CAGGAAACAGCTATGAC3’) dùng giải trình tự chuỗi cố định vectơ nằm gần hai đầu biên ADN tái tổ hợp cần giải trình Trong trình giải trình, mồi khác ký hiệu Seq16SF (5’CAGTGGGGAATATTGGACAAT...

Ngày tải lên: 26/07/2014, 14:21

... Các tốn phân tích trình tự là: tìm kiếm trình tự tƣơng đồng sở liệu; hàng trình tự; chuyển đổi trình tự Mục tiêu phân tích trình tự là: Xác định gien chức gien Xác định lặp lại trình tự Xác định ... TỐN PHÂN TÍCH MỐI QUAN HỆ GIỮA CÁC TRÌNH TỰ 2.1 Bài tốn phân tích mối quan hệ hai trình tự 2.1.1 Giới thiệu tốn Bài tốn phân tích mối quan hệ hai trình tự tốn so sánh trình tự chưa biết với trình ... EST, hay gọi nhãn xác định trình tự biểu hiện, thực chất đoạn trình tự ngắn đƣợc trích từ trình tự ADN biết Các trình tự ADN ngẫu nhiên (có thể trình tự đầy đủ hay trình tự phần EST) đƣợc xác định...

Ngày tải lên: 05/10/2014, 22:55

... thang 100 bp 3.2.1.2 Phân tích trình tự vùng ITS Trình tự ITS 25 mẫu ngải (xem thêm phụ lục C) phân tích với 25 trình tự ITS GenBank Như vậy, tổng cộng có 53 trình tự ITS phân tích, gồm 50 mẫu nhóm ... Kb 3.2.2.2 Phân tích trình tự vùng trnK - matK Trình tự trnK - matK 19 mẫu thực nghiệm phân tích với 20 mẫu trình tự trnK - matK GenBank Như vậy, tổng cộng có 39 trình tự trnK phân tích, gồm 36 ... pc 2.1 2.3.7.2 Phân tích trình tự dựng phát sinh lồi dựa vào trình tự ITS matK Trình tự 25 mẫu ngải, 25 lồi thuộc nhóm lồi thuộc nhóm ngồi (Bảng 2.1) so sánh với Phân tích trình tự dựng phát sinh...

Ngày tải lên: 12/05/2015, 21:56

... phát vạch điện di kỹ thuật phóng xạ ký tự ghi, từ vạch giải trình tự đoạn ADN Ngày nay, phương pháp xác định trình tự gen chủ yếu thực máy giải trình tự tự động Nguyên tắc ban đầu hai phương pháp ... cần phân tích qua ống dẫn đến đầu dò MS Tại diễn trình ion, ion sinh tập trung gia tốc hệ quang học ion để đưa vào phân tích khối Tại phân tích khối, tứ cực thứ chọn ion mẹ có m/z xác định, phân ... mẫu lựa chọn phân tích trình tự gen GLA mẫu có hoạt độ enzyme thấp (

Ngày tải lên: 18/05/2015, 23:29

... vụ cho việc giải trình tự • Giải trình tự DNA vùng D-loop Sau giải trình tự DNA ty thể mẫu cần giám định, trình tự so sánh với phần mềm SeqScape2.5, so sánh thơng qua trình tự chuẩn Anderson ... camera phân tích chương trình phần mềm  Ưu điểm kỹ thuật pyrosequencing tính linh hoạt cao kết cặp primer, phân tích nhiều đột biến, liệu thơng tin trình tự tập hợp đầy đủ  Hệ thống giải trình tự ... trình tự tự động khác mẫu DNA điện di ống thuỷ tinh nhỏ gọi ống mao dẫn (capillary)  Vì ống mỏng lượng nhiệt tỏa trình điện di nên việc đọc trình tự diễn nhanh, kỹ thuật cho phép đọc trình tự...

Ngày tải lên: 22/04/2016, 23:31

... trạng xác lập HĐLĐ nước ta lý khác mà dường chủ thể chưa nhận thức đầy đủ vấn đề Trong thực tế, trình thương lượng, đàm phán hợp đồng hai bên khơng có có thường khơng thực với ý nghĩa đích thực ... Trước thực HĐLĐ thức bên có thỏa thuận việc làm thử, thời gian thử việc quyền nghĩa vụ hai bên trình thử việc Việc giao kết HĐLĐ sở để hình thành quan hệ lao động bên có vai trò quan trọng Mọi...

Ngày tải lên: 16/05/2016, 07:26

... lượng ADN khn cho phản ứng PCR giải trình tự Error! Bookmark not defined Bảng 2.7 Chu trình nhiệt cho phản ứng PCR giải trình tự Error! Bookmark not defined Bảng 3.1 Đặc điểm 26 mẫu giải trình tự ... Đoạn trình tự exon đột biến c.[178 C>T] ; [0], p.P60S Error! Bookmark not defined Hình 3.8 Đoạn trình tự exon có đột biến 5'UTR -12 G>A Error! Bookmark not defined Hình 3.9 Đoạn trình tự exon ... –galactosidase A phân tích trình tự gen GLA bệnh nhân phì đại tim” Đề tài khơng mang ý nghĩa khoa học mà có ý nghĩa thực tiễn y học điều trị bệnh phì đại tim MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Phân tích rối loạn...

Ngày tải lên: 09/09/2016, 11:54

... giải trình tự 3.4 Xác định phân tích trình tự gen mã hóa Flavonol synthase Chúng tơi xác định trình tự gen FLS gắn với vector pJET 1.2 Sau phân tích trình tự, khẳng định chắn đoạn cDNA 35 phân ... tím; FLS CX: trình tự gen FLS phân lập từ mẫu chè Trung du xanh; Trình tự nucleotide thay đổi làm thay đổi trình tự amino acid ( ); Trình tự nucleotide thay đổi khơng làm thay đổi trình tự amino ... P Q * Hình 3.6 Kết phân tích trình tự gen FLS phân lập từ mẫu chè xanh chè tím FLS: Trình tự gen FLS từ chè cơng bố Genbank với mã số DQ198089.1; FLS CT: trình tự gen FLS phân lập từ mẫu chè...

Ngày tải lên: 20/03/2017, 01:22

... ứng giải trình tự Sanger [92] Ở đây, mồi giải trình tự gắn phóng xạ phản ứng tạo đoạn trình tự bổ sung với khn DNA Các đoạn trình tự phân tách gel polyacrylamide chụp ảnh phóng xạ Trình tự xác ... đại trình tự hệ gen ty thể kỹ thuật PCR 23 2.3.5 Giải trình tự máy ABI 3500 24 Footer Page of 126 Header Page of 126 2.3.6 Xử lí kết giải trình tự 25 2.3.7 Phân tích trình ... chủng loại phát sinh sử dụng trình tự hồn chỉnh phân tích theo phương pháp Bayesian 47 Hình 3.12 Cây chủng loại phát sinh sử dụng trình tự D loop phân tích theo phương pháp Bayesian...

Ngày tải lên: 09/05/2017, 20:41

... (http://www.dna-dragon.com/) Trình tự cuối thu đƣợc trình tự hồn chỉnh ty thể Trình tự đƣợc lƣu dƣới dạng file FASTA 2.3.7 Phân tích trình tự Với đoạn trình tự thu đƣợc, chúng tơi tiến hành phân tích số nhƣ phần ... trình tự trình tự lợn Ỉ so với trình tự giống lợn khác a So sánh trình tự D loop Phần trình tự D loop cho thấy nhiều điểm khác biệt trình tự Đa phần khác biệt đơn nucleaotide Với đoạn trình tự ... đại trình tự hệ gen ty thể kỹ thuật PCR 23 2.3.5 Giải trình tự máy ABI 3500 24 2.3.6 Xử lí kết giải trình tự 25 2.3.7 Phân tích trình tự 26 2.3.8 Phân tích...

Ngày tải lên: 27/08/2017, 18:35

... trình tự (DTCS-Quick Start Master Mix) hãng Beckman Coulter tiến hành phân tích máy giải trình tự CEQ8000 Phân tích trình tự Trình tự nucleotid vùng D-loop ty thể mẫu bò H’mơng so sánh với trình tự ... đoạn trình tự ADN phân tích (530 bp) Trong số 26 mẫu bò H’mơng phân tích có 14 kiểu di truyền ty thể xác định, kết trình bày Hình Hình 1: Đa dạng trình tự vùng D-loop ty thể 67 mẫu bò phân tích ... phẩm PCR Đoạn trình tự có vị trí từ nucleotid 15813 đến 16343 tồn trình tự ADN ty thể cơng bố Anderson cs (1982) với mã truy nhập ngân hàng gen Quốc tế V00654 So sánh phân tích trình tự vùng D-loop...

Ngày tải lên: 19/12/2015, 21:36

... định trình tự ADN tự động ALFExpress Hãng Pharmacia Phân tích kết tiến hành với chương trình PC/Gene II KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN: Chúng tiến hành nghiên cứu 10 chủng B thuringiensis var kurstaki phân ... chắn điều này, cần xác định trình tự đoạn ADN gắn vào vectơ II.4 Xác định trình tự nucleotid đoạn ADN đặc hiệu gen cry 1Ab Kết hình cho thấy: trình tự đoạn ADN đặc hiệu gen cry1Ab tạo dòng từ ... định trình tự đoạn ADN đặc hiệu gen cry1Ab từ chủng B thuringiensis var kurstaki H15 phân lập, đoạn ADN có chiều dài 236bp, mã hố cho đoạn protein có chiều dài 78 axit amin Trình tự đoạn ADN đặc...

Ngày tải lên: 26/07/2014, 14:21