... NGUYÊN LÝ CỦA CÁC PHƯƠNG PHÁP PHÂNTÍCHTRÌNHTỰ GEN PHƯƠNG PHÁP SANGER PHƯƠNG PHÁP MAXAM-GILBERT PHƯƠNG PHÁP PHÂNTÍCHTRÌNHTỰ GEN TỰ ĐỘNG HĨA HỌC/ PHẢN ỨNG CHUỖI (DÂY CHUYỀN) POLYMERASE ... sánh nhiều trìnhtự EMBL-Bank: Ngân hàng EMBL gọi CSDL trìnhtự nucleotide EMBL, đóng góp vào nguồn trìnhtự nucleotide sơ cấp châu Âu EMBL CDS: CSDL trìnhtự nucleotide trìnhtự mã hóa (CDS ... Mutation Checker Đánh giá độ trính xác trình tự, phát đột biến Pepstats/Pepwindow/Pepinfo Chương trìnhphântíchtrìnhtự protein PromoterWise So sánh hai trìnhtự DNA cho phép đảo ngược đổi vị trí,...
... tíchtrìnhtự gen lumbrokinase Gen mã hóa lumbrokinase plasmid tái tổ hợp phântíchtrìnhtự máy ABI-3130 Trìnhtự nucleotide gen mã hóa lumbrokinase trình bày hình so sánh với số trìnhtự gen ... gel trình bày hình 3, cho thấy gen thu có kích thước khoảng 700 bp Để kết luận đoạn gen tách từ giun quế gen mã hóa lumbrokinase chúng tơi tiến hành phântíchtrìnhtự nucleotide gen 3.2 Phântích ... bào để tách chiết DNA plasmid tái tổ hợp Trìnhtự nucleotide gen xác định theo phương pháp Sanger máy ABI 3130 Phântíchtrìnhtự nucleotide thực chương trình BioEdit Kết thảo luận 3.1 Tạo dòng...
... liệu trìnhtự thô đợc chuyển đến AutoAssemble software 1.40 (applied Biosystem) GeneBuilder (Applied Maths), trìnhtự liên tục gen PheS đợc xác định Trìnhtự liên tục ny đợc nhập vo chơng trình ... axit phương pháp phântíchtrìnhtự gene pheS Maths), gi¸ trị tơng đồng loi v phân loại đợc tạo dựa vo phơng pháp neighbourjoining v maximumparsimony (Saitou v cs., 1987) Trìnhtự chủng ny đợc ... vμ thêm 45 l dung dịch SAM, 10 l XTerm Giải trìnhtự đợc thực nhờ máy ABI PRISM 3100 (Applied Biosystem) 2.2.2 Phản ứng PCR 2.2.3 Phântíchtrìnhtự gen pheS v xác định loi Mồi PheS-21-F (5-C...
... tắc phương pháp giải trìnhtự theo Sanger Giải trìnhtự đoạn oligonucleotide theo phương pháp enzyme học Các phương pháp cải biên từ phương pháp Sanger Xác định trìnhtự máy tự động: Trong kĩ ... Gilbert) Dựa vào thủy giải đặc trưng phântử DNA cần xác định trìnhtự phương pháp hóa học Trước hết DNA đánh dấu P32 đầu Sau đó, chúng chia thành năm phân đoạn, phân đoạn xử lí với chất hóa học ... dideoxynucleotide Dựa vào tổng hợp nhờ enzyme DNA polymerase mạch bổ sung cho trìnhtự DNA mạch đơn cần xác định trìnhtự Sử dụng loại nucleotide thơng thường + dideoxynucleotide Dideoxynucleotide...
... cs (1999) 2.4 Phương pháp giải trìnhtự gen: Giải trìnhtự nucleotit thực theo bước sau: Sản phẩm sau PCR làm Pre-sequence kít: gồm m l ADN- PCR cần xác định trình tự, 0,5 m l exonuclease III (10 ... gen hormone sinh trưởng Trong vùng exon II, trìnhtự nucleotit có đột biến điểm nucleotit vị trí 507, 555 556 tạo nên thay đổi trìnhtự axit amin phântử Protein mà gen mã hố từ tạo nên đa hình ... giải trìnhtự gen hormone sinh trưởng từ giống lợn nội cho thấy vị trí 506-509 có thay C/T vị trí 507 tạo hai ba mã hố (GCG GTG) tạo axit amin Alanine (GTG) thay cho valine (GCG) trìnhtự axít...
... tổ hợp enzym giới hạn EcoRI Giải trìnhtrìnhtựchuỗi nucleotit xử lý số liệu: ChuỗiADN chứa gen 16S- ARNr nột phần plasmid giải trìnhtự máy giải trìnhtựtự động ABI 377 PRISM (Perkin- Elmer) ... nucleotid Trong báo này, vị trí phân loại chủng Ps7-1 trình bày sở phântíchtrìnhtự nucleotid gen 16S-ARN ribosom (16S-ARNr) I NGUYÊN LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP Vi sinh vật: Chủng phân lập Ps7-1 có nguồn ... mồi ngược M13R (5’CAGGAAACAGCTATGAC3’) dùng giải trìnhtựchuỗi cố định vectơ nằm gần hai đầu biên ADN tái tổ hợp cần giải trình Trong trình giải trình, mồi khác ký hiệu Seq16SF (5’CAGTGGGGAATATTGGACAAT...
... Các tốn phântíchtrìnhtự là: tìm kiếm trìnhtự tƣơng đồng sở liệu; hàng trình tự; chuyển đổi trìnhtự Mục tiêu phântíchtrìnhtự là: Xác định gien chức gien Xác định lặp lại trìnhtự Xác định ... TỐN PHÂNTÍCH MỐI QUAN HỆ GIỮA CÁC TRÌNHTỰ 2.1 Bài tốn phântích mối quan hệ hai trìnhtự 2.1.1 Giới thiệu tốn Bài tốn phântích mối quan hệ hai trìnhtự tốn so sánh trìnhtự chưa biết với trình ... EST, hay gọi nhãn xác định trìnhtự biểu hiện, thực chất đoạn trìnhtự ngắn đƣợc trích từtrìnhtựADN biết Các trìnhtựADN ngẫu nhiên (có thể trìnhtự đầy đủ hay trìnhtựphần EST) đƣợc xác định...
... thang 100 bp 3.2.1.2 Phântíchtrìnhtự vùng ITS Trìnhtự ITS 25 mẫu ngải (xem thêm phụ lục C) phântích với 25 trìnhtự ITS GenBank Như vậy, tổng cộng có 53 trìnhtự ITS phân tích, gồm 50 mẫu nhóm ... Kb 3.2.2.2 Phântíchtrìnhtự vùng trnK - matK Trìnhtự trnK - matK 19 mẫu thực nghiệm phântích với 20 mẫu trìnhtự trnK - matK GenBank Như vậy, tổng cộng có 39 trìnhtự trnK phân tích, gồm 36 ... pc 2.1 2.3.7.2 Phântíchtrìnhtự dựng phát sinh lồi dựa vào trìnhtự ITS matK Trìnhtự 25 mẫu ngải, 25 lồi thuộc nhóm lồi thuộc nhóm ngồi (Bảng 2.1) so sánh với Phântíchtrìnhtự dựng phát sinh...
... phát vạch điện di kỹ thuật phóng xạ ký tự ghi, từ vạch giải trìnhtự đoạn ADN Ngày nay, phương pháp xác định trìnhtự gen chủ yếu thực máy giải trìnhtựtự động Nguyên tắc ban đầu hai phương pháp ... cần phântích qua ống dẫn đến đầu dò MS Tại diễn trình ion, ion sinh tập trung gia tốc hệ quang học ion để đưa vào phântích khối Tại phântích khối, tứ cực thứ chọn ion mẹ có m/z xác định, phân ... mẫu lựa chọn phântíchtrìnhtự gen GLA mẫu có hoạt độ enzyme thấp (
... vụ cho việc giải trìnhtự • Giải trìnhtự DNA vùng D-loop Sau giải trìnhtự DNA ty thể mẫu cần giám định, trìnhtự so sánh với phần mềm SeqScape2.5, so sánh thơng qua trìnhtự chuẩn Anderson ... camera phântích chương trìnhphần mềm Ưu điểm kỹ thuật pyrosequencing tính linh hoạt cao kết cặp primer, phântích nhiều đột biến, liệu thơng tin trìnhtự tập hợp đầy đủ Hệ thống giải trìnhtự ... trìnhtựtự động khác mẫu DNA điện di ống thuỷ tinh nhỏ gọi ống mao dẫn (capillary) Vì ống mỏng lượng nhiệt tỏa trình điện di nên việc đọc trìnhtự diễn nhanh, kỹ thuật cho phép đọc trình tự...
... trạng xác lập HĐLĐ nước ta lý khác mà dường chủ thể chưa nhận thức đầy đủ vấn đề Trong thực tế, trình thương lượng, đàm phán hợp đồng hai bên khơng có có thường khơng thực với ý nghĩa đích thực ... Trước thực HĐLĐ thức bên có thỏa thuận việc làm thử, thời gian thử việc quyền nghĩa vụ hai bên trình thử việc Việc giao kết HĐLĐ sở để hình thành quan hệ lao động bên có vai trò quan trọng Mọi...
... lượng ADN khn cho phản ứng PCR giải trìnhtự Error! Bookmark not defined Bảng 2.7 Chu trình nhiệt cho phản ứng PCR giải trìnhtự Error! Bookmark not defined Bảng 3.1 Đặc điểm 26 mẫu giải trìnhtự ... Đoạn trìnhtự exon đột biến c.[178 C>T] ; [0], p.P60S Error! Bookmark not defined Hình 3.8 Đoạn trìnhtự exon có đột biến 5'UTR -12 G>A Error! Bookmark not defined Hình 3.9 Đoạn trìnhtự exon ... –galactosidase A phântíchtrìnhtự gen GLA bệnh nhân phì đại tim” Đề tài khơng mang ý nghĩa khoa học mà có ý nghĩa thực tiễn y học điều trị bệnh phì đại tim MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Phântích rối loạn...
... giải trìnhtự 3.4 Xác định phântíchtrìnhtự gen mã hóa Flavonol synthase Chúng tơi xác định trìnhtự gen FLS gắn với vector pJET 1.2 Sau phântíchtrình tự, khẳng định chắn đoạn cDNA 35 phân ... tím; FLS CX: trìnhtự gen FLS phân lập từ mẫu chè Trung du xanh; Trìnhtự nucleotide thay đổi làm thay đổi trìnhtự amino acid ( ); Trìnhtự nucleotide thay đổi khơng làm thay đổi trìnhtự amino ... P Q * Hình 3.6 Kết phântíchtrìnhtự gen FLS phân lập từ mẫu chè xanh chè tím FLS: Trìnhtự gen FLS từ chè cơng bố Genbank với mã số DQ198089.1; FLS CT: trìnhtự gen FLS phân lập từ mẫu chè...
... ứng giải trìnhtự Sanger [92] Ở đây, mồi giải trìnhtự gắn phóng xạ phản ứng tạo đoạn trìnhtự bổ sung với khn DNA Các đoạn trìnhtựphân tách gel polyacrylamide chụp ảnh phóng xạ Trìnhtự xác ... đại trìnhtự hệ gen ty thể kỹ thuật PCR 23 2.3.5 Giải trìnhtự máy ABI 3500 24 Footer Page of 126 Header Page of 126 2.3.6 Xử lí kết giải trìnhtự 25 2.3.7 Phântíchtrình ... chủng loại phát sinh sử dụng trìnhtự hồn chỉnh phântích theo phương pháp Bayesian 47 Hình 3.12 Cây chủng loại phát sinh sử dụng trìnhtự D loop phântích theo phương pháp Bayesian...
... (http://www.dna-dragon.com/) Trìnhtự cuối thu đƣợc trìnhtự hồn chỉnh ty thể Trìnhtự đƣợc lƣu dƣới dạng file FASTA 2.3.7 Phântíchtrìnhtự Với đoạn trìnhtự thu đƣợc, chúng tơi tiến hành phântích số nhƣ phần ... trìnhtựtrìnhtự lợn Ỉ so với trìnhtự giống lợn khác a So sánh trìnhtự D loop Phầntrìnhtự D loop cho thấy nhiều điểm khác biệt trìnhtự Đa phần khác biệt đơn nucleaotide Với đoạn trìnhtự ... đại trìnhtự hệ gen ty thể kỹ thuật PCR 23 2.3.5 Giải trìnhtự máy ABI 3500 24 2.3.6 Xử lí kết giải trìnhtự 25 2.3.7 Phântíchtrìnhtự 26 2.3.8 Phân tích...
... trìnhtự (DTCS-Quick Start Master Mix) hãng Beckman Coulter tiến hành phântích máy giải trìnhtự CEQ8000 PhântíchtrìnhtựTrìnhtự nucleotid vùng D-loop ty thể mẫu bò H’mơng so sánh với trìnhtự ... đoạn trìnhtựADNphântích (530 bp) Trong số 26 mẫu bò H’mơng phântích có 14 kiểu di truyền ty thể xác định, kết trình bày Hình Hình 1: Đa dạng trìnhtự vùng D-loop ty thể 67 mẫu bò phântích ... phẩm PCR Đoạn trìnhtự có vị trí từ nucleotid 15813 đến 16343 tồn trìnhtựADN ty thể cơng bố Anderson cs (1982) với mã truy nhập ngân hàng gen Quốc tế V00654 So sánh phântíchtrìnhtự vùng D-loop...
... định trìnhtựADNtự động ALFExpress Hãng Pharmacia Phântích kết tiến hành với chương trình PC/Gene II KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN: Chúng tiến hành nghiên cứu 10 chủng B thuringiensis var kurstaki phân ... chắn điều này, cần xác định trìnhtự đoạn ADN gắn vào vectơ II.4 Xác định trìnhtự nucleotid đoạn ADN đặc hiệu gen cry 1Ab Kết hình cho thấy: trìnhtự đoạn ADN đặc hiệu gen cry1Ab tạo dòng từ ... định trìnhtự đoạn ADN đặc hiệu gen cry1Ab từ chủng B thuringiensis var kurstaki H15 phân lập, đoạn ADN có chiều dài 236bp, mã hố cho đoạn protein có chiều dài 78 axit amin Trìnhtự đoạn ADN đặc...