Bài giảng Công cụ di truyền mới trong chọn tạo giống cây trồng: Chương 5 - TS. Vũ Thị Thúy Hằng

Bài giảng Công cụ di truyền mới trong chọn tạo giống cây trồng: Chương 5 - TS. Vũ Thị Thúy Hằng cung cấp đến học viên các kiến thức về sử dụng chỉ thị phân tử trong chọn giống cây trồng; sử dụng chỉ thị phân tử trong phân tích đa dạng di truyền; ý nghĩa của phân tích đa dạng di truyền;... Mời các bạn cùng tham khảo chi tiết nội dung bài giảng!

07/08/2017 Lớp Học Phần VNUA - Khoa Nông Học - Học Viện Nông Nghiệp Việt Nam Chỉ thị di truyền phân tử gen hay đoạn ADN sử dụng để phân biệt khác kiểu hình cá thể hay lồi SỬ DỤNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ TRONG CHỌN GIỐNG CÂY TRỒNG CÁC ỨNG DỤNG CỦA THỊ PHÂN TỬ Sử dụng thị phân tử phân tích đa dạng di truyền  Phân tích đa dạng di truyền Xây dựng đồ gen  Chọn lọc dựa vào thị phân tử Quy trình chọn lọc sử dụng thị phân tử  Hiện trạng MAS  Ý nghĩa phân tích đa dạng di truyền   Xác định nguồn gốc cá thể/loài (qua phát đột biến) Điều khiển ảnh hưởng biện pháp canh tác  Đa dạng di truyền sở, tảng cho đa dạng sinh học cấp, từ hình thành nên cộng đồng hệ sinh thái Những biến động di truyền dẫn đến thay đổi trình tiến hóa chọn lọc nhân tạo Đa dạng di truyền Xây dựng chế truyền gen (gene flow) (chuyển alen gen từ quần thể sang quần thể khác)   Đa dạng di truyền hình thành từ đột biến xảy cấp độ DNA NST Xác định mức độ địa lý để quản lý trì đa dạng di truyền   Khái niệm: Đa dạng di truyền biến động di truyền cá thể loài loài Quản lý số lượng nhỏ cá thể thu thập bảo tồn ex situ Thiết lập danh tính giống (fingerprint) Phân tích mối quan hệ lồi; từ hỗ trợ lựa chọn bố mẹ lai tạo giống https://sites.google.com/site/lophocphank57vnua/home 07/08/2017 Lớp Học Phần VNUA - Khoa Nông Học - Học Viện Nông Nghiệp Việt Nam Nhận dạng Làm để phân tích đa dạng di truyền a Sử dụng kỹ thuật khác (i) hình thái, (ii) đặc điểm hóa sinh; (iii) thị phân tử ADN fingerprints Hạt, Các thị phân tử tuân theo chế di truyền tính trạng nào, tức trội, lặn đồng trội Chọn lọc sớm alen tốt * Chỉ thị hình thái: vd màu sắc hạt, hoa; hình dạng quả, hoa, hạt; kiểu sinh trưởng… - Ưu:….??? * Chỉ thị phân tử: - Có thể phát biến động mất, nhân đôi, đảo đoạn thêm đoạn NST - Các thị phân tử khơng ảnh hưởng đến kiểu hình tính trạng thị nằm vị trí gần liên kết với gen điều khiển tính trạng - Nhược điểm:????? * Chỉ thị hóa sinh: - Ưu: đồng trội, xác định đa dạng cấp độ gen chức di truyền đơn giản; yêu cầu lượng nhỏ vật liệu để phân tích - Nhược điểm: có số thị hóa sinh; thị có cấu trúc phức tạp khó sử dụng nên mức độ phát đa dang di truyền bị giới hạn b Phân tích đa dạng di truyền - Có cách phân tích: (i) Phân tích quan hệ di truyền mẫu/cá thể; (ii) phân tích xác định tham số di truyền quần thể - Chỉ thị trội, đồng trội - Ưu điểm: ???? - Nhược điểm: ??? - Khoảng cách di truyền tính hệ số (i) hệ số Nei and Li’s (GDNL), (ii) hệ số Jaccard’s (GDJ), (iii) hệ số tương đồng đơn giản (simple matching coefficient (GDSM); and (iv) khoảng cách Rogers (GDMR) - Phân tích quan hệ di truyền cá thể cần xây dựng ma trận khoảng cách di truyền (hay mức độ giống nhau) cặp mẫu N11: số băng/alen xuất mẫu 𝑁00 số băng không xuất 02 mẫu; 𝑁10 số băng xuất mẫu i 𝑁01 số băng xuất mẫu 𝑗; N: tổng số băng https://sites.google.com/site/lophocphank57vnua/home 07/08/2017 Lớp Học Phần VNUA - Khoa Nông Học - Học Viện Nông Nghiệp Việt Nam Sau có ma trận khoảng cách di truyền, có 02 cách phân tích: Luyện tập: Xác định số lượng băng/score cho mẫu + sử dụng PCA (Principle component analysis – phân tích thành phần chính) cho hình ảnh chiều mối quan hệ mẫu/cá thể + di truyền (dendrogram): nhóm cá thể gần vào nhóm + Các phân tích thực nhiều phần mềm khác (tham khảo Govindaraj 2015 – link: http://dx.doi.org/10.1155/2015/431487) - \ \ \Research grants\Hang's articles\Published papers\Trieu Thi Thinh 2010 - SB genetic diversity SSR.pdf Hết chương V https://sites.google.com/site/lophocphank57vnua/home ... đa dang di truyền bị giới hạn b Phân tích đa dạng di truyền - Có cách phân tích: (i) Phân tích quan hệ di truyền mẫu/cá thể; (ii) phân tích xác định tham số di truyền quần thể - Chỉ thị trội,... trạng - Nhược điểm:????? * Chỉ thị hóa sinh: - Ưu: đồng trội, xác định đa dạng cấp độ gen chức di truyền đơn giản; yêu cầu lượng nhỏ vật liệu để phân tích - Nhược điểm: có số thị hóa sinh; thị. .. mẫu/cá thể + di truyền (dendrogram): nhóm cá thể gần vào nhóm + Các phân tích thực nhiều phần mềm khác (tham khảo Govindaraj 20 15 – link: http://dx.doi.org/10.1 155 /20 15/ 431487) - Research