Slide vi sinh vật chương 6 sinh thái học vi sinh vật

Chương 6: Sinh thái học vi sinh vật Mục tiêu sinh thái học vi sinh vật Đặc điểm vi sinh vật tự nhiên Các phương pháp nghiên cứu sinh thái học vi sinh vật Hoạt động vai trò vi sinh vật hệ sinh thái Vai trò vi sinh vật chu trình sinh điạ hóa nguyên tố CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Sinh thái học vi sinh vật - Sinh thái học (ecology): nghiên cứu hình thành, tồn phát triển hệ thống sinh vật với điều kiện không sống định mối quan hệ hữu tác động qua lại với - Sinh thái học vi sinh vật (microbial ecology): nghiên cứu vi sinh vật khía cạnh sinh thái học + Làm quần thể (population) tụ tập lại hình thành quần xã (community) + Làm để quần xã tương tác với tương tác mơi trường CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Mục tiêu sinh thái học vi sinh vật - Nghiên cứu đa dạng sinh học (biodiversity): xác định chủng loại số lượng VSV tự nhiên, nghiên cứu tương tác quần dưỡng khác quần xã (giúp phân lập VSV quan tâm) - Nghiên cứu hoạt tính VSV (microbial activity): đo trình biến dưỡng tự nhiên giàm sát tác động VSV lên hệ sinh thái - VSV học môi trường/Vi sinh môi trường (Environmental Microbiology) CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Ý nghóa nghiên cứu sinh thái học VSV - Vi sinh vật có vai trò thiết yếu cho trì phát triển hệ sinh thái: + Thu lấy lượng ánh sáng, cố định đạm, cố định CO2, tạo O2,phân hủy chất hữu + Là tác nhân thực phản ứng chu trình sinh địa hóa nguyên tố cần cho sống + Là tác nhân giúp phân hủy độc chất, phục hồi môi trường - Sinh thái học VSV giúp hiểu tương tác VSV với với môi trường, hiểu vai trò VSV điều kiện tự nhiên hệ sinh thái - Giúp hiểu mơi sinh VSV từ phân lập VSV quan tâm CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Habitat, niche, microenvironment - Môi trường sống vi sinh vật: + Habitat: môi trường sống nơi quần thể, quần dưỡng hình thành quần xã + Niche: vi môi trường tối ưu cho tăng trưởng VSV - Trong tự nhiên, vi môi trường (microenvironment) nơi mà VSV thực tế sống biến dưỡng: + Các điều kiện hóa lý vi môi trường biến đổi nhanh theo không gian thời gian + Trong không gian vật lý hẹp có tồn nhiều vi môi trường khác + Tính không đồng vi môi trường định tính đa dạng VSV CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Oxygen microenvironments CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Bề mặt màng sinh khối (biofilm) - Bề mặt (surface): môi sinh quan trọng cho VSV: cung cấp chất dinh dưỡng, bảo vệ tránh kẻ thù thay đổi hóa lý, làm giá đỡ để giữ vi sinh vật khỏi bị rữa trơi - Chất dinh dưỡng nhân tố hạn chế tốc độ tăng trưởng hầu hết môi trường tự nhiên cung cấp dạng xung - Vi sinh vật thường diện bề mặt giá thể nồng độ chất dinh dưỡng giới hạn cao tạo thành màng sinh khối (biofilm) tập hợp khuẩn lạc quần thể khác CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Tăng trưởng VSV tự nhiên - Chất dinh dưỡng tự nhiên - tài nguyên (resources) cho VSV không cung cấp liên tục - VSV tăng trưởng thành xung theo nguồn tài nguyên môi trường - Các chất dự trữ tế bào (PHA, PHB, polysaccharide, polyphosphate) sử dụng nguồn tài nguyên bị cạn kiệt - Đặc điểm chung tăng trưởng VSV tự nhiên: + Tăng trưởng hàm mũ thường ngắn + Tốc độ tăng trưởng nhỏ nhiều so với trường hợp nuôi cấy chủng phòng thí nghiệm - Tốc độ tăng trưởng chậm do: + Nguồn chất dinh dưỡng thấp + Phân bố chất dinh dưỡng không đồng + Bị cạnh tranh quần thể khác CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Sự hình thành Biofilm Vi sinh vật ống thép nhuộm DAPI CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Sự hình thành quần xã vi sinh vật - Các mức tổ chức vi sinh vật tự nhiên + Tế bào + Quần thể (population): tập hợp tế bào loài, hình thành tăng trưởng tế bào riêng biệt vi môi trường định + Quần dưỡng (guild): tập hợp quần thể khác loài có đặc tính chung nguồn chất dinh dưỡng, yếu tố hoá lý vi môi trường + Quần xã, hệ vi sinh vật (community): tập hợp nhiều quần dưỡng diện điều kiện môi trường, tiến hành trình sinh lý bổ trợ để tăng trưởng + Hệ sinh thái (ecosystem): nhiều quần xã đựợc hình thành có mối quan hệ với lượng vật chất CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Cơ chế kháng độc tính thủy ngân VSV - Ở Pseudomonas aeruginosa: + Plasmid chứa operon mer + Một sản phẩm Hg2+-reductase khử Hg2+ thành Hg0 + Hg0 thăng hoa khỏi tế bào CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Các chất dị sinh - Chất dị sinh (xenobiotics) hợp chất tổng hợp hóa học phóng thích với số lượng lớn vào môi trường - Thuốc trừ sâu, thuốc diệt cỏ CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Chuyển hóa chất dị sinh chứa chlor - Khử chlor kỵ khí (reductive dechlorination) thuốc trừ sâu chứa chlor vi sinh vật : + Chất cho điện tử: acetate, formate hay H2 + Chất nhận điện tử: thuốc trừ sâu chứa chlor - Khử chlor hiếu khí (aerobic dechlorination) vi sinh vật: sau bước khử chlor bước phân hủy vòng benzene tác dụng oxygenase cuối thành axít béo bậc thấp - Trong tự nhiên khử chlor kỵ khí có vai trò quan trọng xu hình thành môi trường ôxi CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Chất dẽo tổng hợp bị phân hủy sinh học CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt Sinh thái học vi sinh vật Cập nhật chương theo thứ tự chương 22, 23, 24 25 Brock Biology of Microorganism Giới thiệu chung sinh thái học VSV Các phương pháp nghiên cứu sinh thái học VSV Các mơi sinh cho VSV đa dạng Chu trình sinh địa hóa, biodegradation and bioremediation Cộng sinh VSV CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt CuuDuongThanCong.com https://fb.com/tailieudientucntt ... FISH nghiên cứu sinh thái học vi sinh vật - Phân lập vi sinh vật - Định tính định lượng vi sinh vật - Nghiên thành phần tương tác vi sinh vật: + Sử dụng đồng thời nhiều mẫu dò phát sinh loài đánh.. .Sinh thái học vi sinh vật - Sinh thái học (ecology): nghiên cứu hình thành, tồn phát triển hệ thống sinh vật với điều kiện không sống định mối quan hệ hữu tác động qua lại với - Sinh thái học. .. SSU-rRNA - Kỹ thuật giải trình tự rRNA dùng sinh thái học vi sinh vật để phân tích thành phần quần xã vi sinh vật mà không cần phân lập, nuôi cấy chủng vi sinh vật - Qui trình: + Thu nhận DNA tổng +