1. Trang chủ
  2. » Luận Văn - Báo Cáo

Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen

62 30 1
Tài liệu đã được kiểm tra trùng lặp

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

THÔNG TIN TÀI LIỆU

Thông tin cơ bản

Định dạng
Số trang 62
Dung lượng 2,29 MB

Nội dung

Ngày đăng: 11/11/2021, 15:39

Nguồn tham khảo

Tài liệu tham khảo Loại Chi tiết
1. Abdelbary Mohamed H. H., Senn Laurence, et al. (2019), "Whole-genome sequencing revealed independent emergence of vancomycin-resistant Enterococcus faecium causing sequential outbreaks over 3 years in a tertiary care hospital", European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, 38(6), pp. 1163-1170 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Whole-genome sequencing revealed independent emergence of vancomycin-resistant Enterococcus faecium causing sequential outbreaks over 3 years in a tertiary care hospital
Tác giả: Abdelbary Mohamed H. H., Senn Laurence, et al
Năm: 2019
2. Armstrong Joel, Fiddes Ian T., et al. (2019), "Whole-Genome Alignment and Comparative Annotation", Annual Review of Animal Biosciences, 7(1), pp. 41- 64 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Whole-Genome Alignment and Comparative Annotation
Tác giả: Armstrong Joel, Fiddes Ian T., et al
Năm: 2019
3. Boisvert Sộbastien, Laviolette Franỗois, et al. (2010), "Ray: Simultaneous Assembly of Reads from a Mix of High-Throughput Sequencing Technologies", Journal of Computational Biology, 17(11), pp. 1519-1533 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Ray: Simultaneous Assembly of Reads from a Mix of High-Throughput Sequencing Technologies
Tác giả: Boisvert Sộbastien, Laviolette Franỗois, et al
Năm: 2010
4. Bradley C. R., Fraise A. P. (1996), "Heat and chemical resistance of enterococci", Journal of Hospital Infection, 34(3), pp. 191-196 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Heat and chemical resistance of enterococci
Tác giả: Bradley C. R., Fraise A. P
Năm: 1996
5. Brodrick Hayley J., Raven Kathy E., et al. (2016), "Whole-genome sequencing reveals transmission of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a healthcare network", Genome Medicine, 8(1), pp. 4 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Whole-genome sequencing reveals transmission of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a healthcare network
Tác giả: Brodrick Hayley J., Raven Kathy E., et al
Năm: 2016
6. Byers Karin E., Durbin Lisa J., et al. (1998), "Disinfection of Hospital Rooms Contaminated With Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium", Infection Control & Hospital Epidemiology, 19(4), pp. 261-264 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Disinfection of Hospital Rooms Contaminated With Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium
Tác giả: Byers Karin E., Durbin Lisa J., et al
Năm: 1998
7. Cantino Philip D., Queiroz Kevin de (2010), "International Code of Phylogenetic Nomenclature", PhyloCode, Version 4c, pp. 28-30 Sách, tạp chí
Tiêu đề: International Code of Phylogenetic Nomenclature
Tác giả: Cantino Philip D., Queiroz Kevin de
Năm: 2010
8. Chung The Hao, Karkey Abhilasha, et al. (2015), "A high-resolution genomic analysis of multidrug-resistant hospital outbreaks of Klebsiella pneumoniae", EMBO Molecular Medicine, 7(3), pp. 227-239 Sách, tạp chí
Tiêu đề: A high-resolution genomic analysis of multidrug-resistant hospital outbreaks of Klebsiella pneumoniae
Tác giả: Chung The Hao, Karkey Abhilasha, et al
Năm: 2015
9. Cock Peter J. A., Fields Christopher J., et al. (2010), "The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants", Nucleic Acids Research, 38(6), pp. 1767-1771 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants
Tác giả: Cock Peter J. A., Fields Christopher J., et al
Năm: 2010
10. Corredor Nancy Carolina, López Carolina, et al. (2019), "An epidemiological and molecular study regarding the spread of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a teaching hospital in Bogotá, Colombia 2016", BMC Infectious Diseases, 19(1), pp. 258 Sách, tạp chí
Tiêu đề: An epidemiological and molecular study regarding the spread of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in a teaching hospital in Bogotá, Colombia 2016
Tác giả: Corredor Nancy Carolina, López Carolina, et al
Năm: 2019
11. Croucher Nicholas J., Didelot Xavier (2015), "The application of genomics to tracing bacterial pathogen transmission", Current Opinion in Microbiology, 23, pp. 62-67 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The application of genomics to tracing bacterial pathogen transmission
Tác giả: Croucher Nicholas J., Didelot Xavier
Năm: 2015
12. Daniel Diane Sunira, Lee Sui Mae, et al. (2015), "Public Health Risks of Multiple-Drug-Resistant Enterococcus spp. in Southeast Asia", Applied and Environmental Microbiology, 81(18), pp. 6090 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Public Health Risks of Multiple-Drug-Resistant Enterococcus spp. in Southeast Asia
Tác giả: Daniel Diane Sunira, Lee Sui Mae, et al
Năm: 2015
13. de Been Mark, van Schaik Willem, et al. (2013), "Recent Recombination Events in the Core Genome Are Associated with Adaptive Evolution in Enterococcus faecium", Genome Biology and Evolution, 5(8), pp. 1524-1535 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Recent Recombination Events in the Core Genome Are Associated with Adaptive Evolution in Enterococcus faecium
Tác giả: de Been Mark, van Schaik Willem, et al
Năm: 2013
14. Eichel Vanessa, Klein Sabrina, et al. (2020), "Challenges in interpretation of WGS and epidemiological data to investigate nosocomial transmission of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in an endemic region: incorporation of patient movement network and admission screening", Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 75(7), pp. 1716-1721 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Challenges in interpretation of WGS and epidemiological data to investigate nosocomial transmission of vancomycin-resistant Enterococcus faecium in an endemic region: incorporation of patient movement network and admission screening
Tác giả: Eichel Vanessa, Klein Sabrina, et al
Năm: 2020
15. Faison William J., Rostovtsev Alexandre, et al. (2014), "Whole genome single- nucleotide variation profile-based phylogenetic tree building methods for analysis of viral, bacterial and human genomes", Genomics, 104(1), pp. 1-7 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Whole genome single-nucleotide variation profile-based phylogenetic tree building methods for analysis of viral, bacterial and human genomes
Tác giả: Faison William J., Rostovtsev Alexandre, et al
Năm: 2014
16. Faron Matthew L., Ledeboer Nathan A., et al. (2016), "Resistance Mechanisms, Epidemiology, and Approaches to Screening for Vancomycin-Resistant Enterococcus in the Health Care Setting", Journal of Clinical Microbiology, 54(10), pp. 2436 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Resistance Mechanisms, Epidemiology, and Approaches to Screening for Vancomycin-Resistant Enterococcus in the Health Care Setting
Tác giả: Faron Matthew L., Ledeboer Nathan A., et al
Năm: 2016
17. Fitzpatrick Margaret A., Ozer Egon A., et al. (2016), "Utility of Whole-Genome Sequencing in Characterizing Acinetobacter Epidemiology and Analyzing Hospital Outbreaks", Journal of Clinical Microbiology, 54(3), pp. 593 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Utility of Whole-Genome Sequencing in Characterizing Acinetobacter Epidemiology and Analyzing Hospital Outbreaks
Tác giả: Fitzpatrick Margaret A., Ozer Egon A., et al
Năm: 2016
18. Gao Wei, Howden Benjamin P., et al. (2018), "Evolution of virulence in Enterococcus faecium, a hospital-adapted opportunistic pathogen", Current Opinion in Microbiology, 41, pp. 76-82 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Evolution of virulence in Enterococcus faecium, a hospital-adapted opportunistic pathogen
Tác giả: Gao Wei, Howden Benjamin P., et al
Năm: 2018
19. Gouliouris Theodore, Coll Francesc, et al. (2021), "Quantifying acquisition and transmission of Enterococcus faecium using genomic surveillance", Nature Microbiology, 6(1), pp. 103-111 Sách, tạp chí
Tiêu đề: Quantifying acquisition and transmission of Enterococcus faecium using genomic surveillance
Tác giả: Gouliouris Theodore, Coll Francesc, et al
Năm: 2021
20. Guzmán Prieto Ana M., Wijngaarden Jessica, et al. (2017), "The Two- Component System ChtRS Contributes to Chlorhexidine Tolerance in Enterococcus faecium", Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 61(5), pp.e02122-16 Sách, tạp chí
Tiêu đề: The Two-Component System ChtRS Contributes to Chlorhexidine Tolerance in Enterococcus faecium
Tác giả: Guzmán Prieto Ana M., Wijngaarden Jessica, et al
Năm: 2017

HÌNH ẢNH LIÊN QUAN

Đa hình chiều dài đoạn cắt giới hạn   - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
a hình chiều dài đoạn cắt giới hạn (Trang 6)
Hình 1.1 Quá trình lắp ráp bộ gen từ các đoạn đọc ngắnHình  1.1 Quá trình lắp ráp bộ gen từ các đoạn đọc ngắnHình 1.1 - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Hình 1.1 Quá trình lắp ráp bộ gen từ các đoạn đọc ngắnHình 1.1 Quá trình lắp ráp bộ gen từ các đoạn đọc ngắnHình 1.1 (Trang 18)
Hình 1.2. - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Hình 1.2. (Trang 19)
Bảng 1.1. Các phương pháp xây dựng cây phân loài Nhóm Tên phương  - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Bảng 1.1. Các phương pháp xây dựng cây phân loài Nhóm Tên phương (Trang 21)
Hình 2.1. Quy trình nghiên cứu - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Hình 2.1. Quy trình nghiên cứu (Trang 25)
Bảng 3.1. Tỉ lệ các chủng VREfm theo loại mẫu bệnh phẩm - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Bảng 3.1. Tỉ lệ các chủng VREfm theo loại mẫu bệnh phẩm (Trang 29)
Hình 3.1. Biểu đồ thống kê số lượng SNP sai khác tại hệ gen cốt lõi - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Hình 3.1. Biểu đồ thống kê số lượng SNP sai khác tại hệ gen cốt lõi (Trang 30)
Hình 3.2. Cây phân loài của 104 chủng VREfm dựa trên SNP hệ gen cốt lõi - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Hình 3.2. Cây phân loài của 104 chủng VREfm dựa trên SNP hệ gen cốt lõi (Trang 32)
Hình 3.3. Kết quả phân chia nhánh trên cây phân loài - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Hình 3.3. Kết quả phân chia nhánh trên cây phân loài (Trang 34)
Bảng 3.2. Các cụm lây truyền trong 104 chủng VREfm - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Bảng 3.2. Các cụm lây truyền trong 104 chủng VREfm (Trang 36)
3.2.2. Kết quả ngưỡng SNP và cụm lây truyền - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
3.2.2. Kết quả ngưỡng SNP và cụm lây truyền (Trang 36)
A-D: Mô hình dịch tễ của các bệnh nhân tại phòng HS1-HS4 - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
h ình dịch tễ của các bệnh nhân tại phòng HS1-HS4 (Trang 40)
Hình 3.5. Đường lây truyền VREfm giữa các bệnh nhân tại Khoa ICU theo mô hình TPS - Nghiên cứu đường lây truyền của vi khuẩn enterococcus faecium kháng vancomycin từ dữ liệu giải trình tự toàn bộ hệ gen
Hình 3.5. Đường lây truyền VREfm giữa các bệnh nhân tại Khoa ICU theo mô hình TPS (Trang 43)

TỪ KHÓA LIÊN QUAN

TÀI LIỆU CÙNG NGƯỜI DÙNG

TÀI LIỆU LIÊN QUAN

w