Bài viết này trình bày về các thông số di truyền tính trạng kháng bệnh gan thận mủ được ước tính trên quần thể chọn giống thế hệ thứ 1. Tổng cộng có 8.207 và 5.838 cá thể tương ứng thuộc 147 và 130 gia đình được cảm nhiễm vi khuẩn Edwardsiella ictaluri gây bệnh gan thận mủ ở cá giống và nuôi đánh giá tăng trưởng trong ao. Mời các bạn cùng tham khảo!
39 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Genetic parameter estimates for resistance to Enteric Septicemia of Catfish on Pangasianodon hypophthalmus Dung T P Tran1,3∗ , Phuc H Tran2 , Vu T Nguyen2 , Phuong H Vo2 , Lien T B Huynh2 , & Sang V Nguyen2 Faculty of Biology, Ho Chi Minh City University of Education, Ho Chi Minh City, Vietnam Research Institute for Aquaculture No 2, Ho Chi Minh City, Vietnam Department of Biology, Nong Lam University, Ho Chi Minh City, Vietnam ARTICLE INFO ABSTRACT Research Paper Genetic parameters were estimated for resistant traits against Enteric Septicemia of Catfish (ESC) on the first generation of selection on striped catfish In total, 8,207 and 5,838 individuals from 147 and 130 full-sib families were challenged by Edwardsiella ictaluri causing ESC on fingerlings and tested growth in pond accordingly Harvest body weight (HW), length (HL) and survival (SURGROW) from grow-out test and ESC resistant traits such as binary alive-dead survival (SUR) and time to dead (TIME) at different truncated points from challenged test of fingerlings were recorded Heritability for each trait and genetic correlations among these recorded traits were estimated High heritabilities were found for HW (0.48) and HL (0.47), and mostly from medium to high values were estimated for SURGROW (0.23), SUR (0.13 - 0.40) and TIME (0.25 - 0.39) Genetic correlations among different truncated SUR and TIME traits were almost highly positive (0.57 - 0.99) Genetic correlations among different truncated SUR and TIME traits with HW and SURGROW were low positive (0.10 - 0.40) In summary, selection for ESC resistance would not negatively affect the growth in fingerling stage Received: December 09, 2020 Revised: February 19, 2021 Accepted: February 26, 2021 Keywords Disease resistance to ESC Edwardsiella ictaluri Genetic correlation Heritability Striped catfish ∗ Corresponding author Tran Thi Phuong Dung Email: dungttp@hcmue.edu.vn Cited as: Tran, D T P., Tran, P H., Nguyen, V T., Vo, P H., Huynh, L T B., & Nguyen, S V (2021) Genetic parameter estimates for resistance to Enteric Septicemia of Catfish on Pangasianodon hypophthalmus The Journal of Agriculture and Development 20(1), 39-48 www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) 40 Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh Các thơng số di truyền ước tính cho tính trạng kháng bệnh gan thận mủ cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) Trần Thị Phương Dung1,3∗ , Trần Hữu Phúc2 , Nguyễn Thanh Vũ2 , Võ Hồng Phượng2 , Huỳnh Thị Bích Liên2 & Nguyễn Văn Sáng2 Khoa Sinh Học, Trường Đại Học Sư Phạm TP.HCM, TP Hồ Chí Minh Viện Nghiên Cứu Nuôi Trồng Thủy Sản II, TP Hồ Chí Minh Bộ Mơn Cơng Nghệ Sinh Học, Trường Đại Học Nơng Lâm TP.HCM, TP Hồ Chí Minh THƠNG TIN BÀI BÁO TĨM TẮT Bài báo khoa học Các thơng số di truyền tính trạng kháng bệnh gan thận mủ ước tính quần thể chọn giống hệ thứ Tổng cộng có 8.207 5.838 cá thể tương ứng thuộc 147 130 gia đình cảm nhiễm vi khuẩn Edwardsiella ictaluri gây bệnh gan thận mủ cá giống nuôi đánh giá tăng trưởng ao Các tính trạng khối lượng (HW), chiều dài (HL) tỉ lệ sống (SURGROW) sau nuôi tăng trưởng tính trạng kháng bệnh gan thận mủ thông qua khả sống/chết dạng nhị phân (SUR) thời gian sống theo (TIME) theo mức cắt ngang thu thập ước tính hệ số di truyền tính trạng tương quan chúng Hệ số di truyền cao cho tính trạng HW (0,48) HL (0,47) hầu hết từ trung bình đến cao cho tính trạng SURGROW (0,23), SUR (0,13 - 0,40) TIME (0,25 - 0,39) tìm thấy Tương quan di truyền SUR TIME cắt ngang hầu hết thuận cao ước tính (0,57 - 0,99) Tương quan di truyền SUR TIME cắt ngang với HW SURGROW tương quan thuận thấp ước tính (0,10 - 0,40) Do đó, chọn lọc tính trạng kháng bệnh khơng gây ảnh hưởng tiêu cực đến tính trạng tăng trưởng giai đoạn cá giống Ngày nhận: 09/12/2020 Ngày chỉnh sửa: 19/02/2021 Ngày chấp nhận: 26/02/2021 Từ khóa Cá tra Edwardsiella ictaluri Hệ số di truyền Kháng bệnh gan thận mủ Tương quan di truyền ∗ Tác giả liên hệ Trần Thị Phương Dung Email: dungttp@hcmue.edu.vn Đặt Vấn Đề Cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) trở thành đối tượng nuôi quan trọng xuất chủ lực Việt Nam Trong năm 2019, xuất cá tra đến 127 quốc gia giới đạt kim ngạch 1,9 tỉ USD Diện tích thả ni 6.600 (DOF, 2020) Tuy nhiên, năm gần đây, việc sản xuất cá tra phải đối mặt với nhiều khó khăn việc thâm canh hóa với mật độ ni cao làm cho bệnh cá xảy thường xuyên (Tu & ctv., 2008) Bệnh gan thận mủ vi khuẩn Edwarsiella ictaluri (E ictaluri ) gây (Crumlish & ctv., 2010 ) bệnh phổ biến cá tra đưa vào danh mục phải kiểm dịch Bộ Nông nghiệp Phát triển Nông thôn Bệnh xuất Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) kích cỡ cá nhiều cá nuôi tháng tuổi, tỉ lệ nhiễm cá ni kích cỡ nhỏ 250 g 24,4 - 25,2% giảm dần theo tăng trọng lượng (Ly & ctv., 2008) Hiện nay, phương pháp phòng trị bệnh chủ yếu sử dụng kháng sinh hóa chất phổ biến Điều ảnh hưởng đến hiệu nghề nuôi, làm giảm chất lượng sản phẩm tiềm ẩn nguy kháng thuốc vi khuẩn dư lượng hóa chất, kháng sinh sản phẩm Chọn giống theo phương pháp di truyền số lượng giải pháp để nâng cao chất lượng giống có khả kháng bệnh gan thận mủ Cá tra chọn giống kháng bệnh làm giảm thiểu thiệt hại kinh tế hao hụt, nâng cao tỉ lệ sống giảm bớt rủi ro ương ni Từ đó, giảm việc sử dụng thuốc, hóa chất, kháng sinh góp phần vào www.jad.hcmuaf.edu.vn Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh phát triển bền vững nghề nuôi cá tra phục vụ xuất (Trinh & ctv., 2016) Trinh & ctv (2016) công bố hệ số di truyền tính trạng kháng bệnh gan thận mủ 0,23 0,11, khác biệt có ý nghĩa so với zero (0) quần thể chọn giống ban đầu G0 Chương trình chọn giống địi hỏi phải chọn lọc dựa thơng số di truyền tính tốn từ gia đình qua nhiều hệ nhằm mang lại hiệu cao Do đó, việc thực chọn giống cá tra kháng bệnh gan thận mủ hệ (G1) cần thiết với mục đích là: (a) ước tính thơng số di truyền tính trạng cá tra giống hệ G1 (b) tìm mối tương quan di truyền khả kháng bệnh với tính trạng tăng trưởng tỉ lệ sống nhằm đánh giá tính trạng phục vụ chọn lọc ➧ Vật Liệu Phương Pháp Nghiên Cứu 2.1 Cá thí nghiệm Cá tra bố mẹ thuộc quần thể ban đầu (G0) cho chọn giống kháng bệnh gan thận mủ thành lập đề tài nghiên cứu giai đoạn 2012 - 2015 Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II (Viện NC NTTS II) Quần thể G0 bao gồm nhóm chọn lọc (700 con, thuộc 120 gia đình) nhóm đối chứng (131 con, thuộc 25 gia đình), khối lượng trung bình 8,0 kg/con Các nhóm cá bố mẹ lưu trữ phả hệ, giá trị kiểu hình tính trạng giá trị chọn giống ước tính (Estimated breeding value - EBV) đánh dấu từ PIT (Passive Integrated Transponder) cá thể Các cá thể thuộc quần đàn G0 nuôi vỗ cho sinh sản theo đợt từ 22/08 - 09/10/2019 Trung tâm Quốc gia Giống Thủy sản Nước Nam Bộ thuộc Viện NC NTTS II để tạo quần đàn G1 (Bảng 1) Sử dụng phương pháp ghép phối thứ bậc cá đực với cá Tổng cộng có 147 gia đình cá giống cho thí nghiệm cảm nhiễm (90 bố phối với 147 mẹ tạo 90 gia đình fullsib 57 gia đình halfsib) 130 gia đình cá giống cho thí nghiệm ni tăng trưởng (77 bố phối với 130 mẹ tạo 77 gia đình fullsib 53 gia đình halfsib) Số lượng cá giống cho thí nghiệm cảm nhiễm 8.207 cá thể (trung bình 56 con/gia đình, chia theo gia đình cho bể thí nghiệm) với khối lượng trung bình 20,9 g số lượng cá giống cho thí nghiệm tăng trưởng 5.838 cá thể (trung bình 45 con/gia đình) với khối lượng trung bình 21,0 g (Bảng 1) www.jad.hcmuaf.edu.vn 41 2.2 Đánh dấu dưỡng cá cho thí nghiệm cảm nhiễm nuôi tăng trưởng Ngay sau kết thúc ương cá giống khoảng 150 ngày, tiến hành gắn dấu cá giống thời gian 10 ngày, từ ngày 05/02/2020 đến 14/02/2020 Cá gắn dấu từ PIT vào vị trí phía vây lưng Các gia đình ni tăng trưởng có đại diện cho thí nghiệm cảm nhiễm Sau đánh dấu tiến hành dưỡng cá trước tiến hành sau: (1) với thí nghiệm cảm nhiễm sau đánh dấu, cá thả vào bể xi măng 15 m3 nuôi dưỡng, có sục khí, mật độ thả khoảng con/4 lít Thuần dưỡng cá 10 ngày nước trước tiến hành thí nghiệm cảm nhiễm; (2) với thí nghiệm ni tăng trưởng sau đánh dấu, cá thả vào giai lưới kích thước 15 m2 lưu giữ khoảng ngày sau thả ni ao 2.3 Thí nghiệm cảm nhiễm gia đình cá giống Thí nghiệm thăm dị: thực dựa thơng số kĩ thuật tối ưu theo nghiên cứu Trinh & ctv (2016) trình bày bảng Cá bệnh (cá cohabitant) tạo cách tiêm vi khuẩn E ictaluri chủng Gly09M mật độ × 106 CFU/0,2 mL/cá vào xoang bụng cho sống chung với cá thí nghiệm Sau đó, dung dịch vi khuẩn E ictaluri bổ sung lần vào bể thí nghiệm ngày thứ sau cho cá cohabitant cá thí nghiệm sống chung với bể Thực hai thí nghiệm thăm dị lựa chọn tỉ lệ ghép cá Cohabitant (35% 50%) mật độ vi khuẩn (105 CFU/mL 106 CFU/mL) cho vào bể cảm nhiễm cho đạt 105 CFU/mL Mỗi nghiệm thức/thí nghiệm thăm dị lặp lại lần Thí nghiệm cảm nhiễm chính: thí nghiệm cảm nhiễm 147 gia đình cá giống thực với thông số kĩ thuật tương tự thí nghiệm thăm dị nêu trên, thí nghiệm thực bể 16.000 L, số lượng cá cho vào bể 1, bể tổng hai bể tương ứng 4.103, 4.104 8.207 con, mật độ cá 0,26 con/L Liều tiêm tỉ lệ ghép cá cohabitant liều bổ sung vi khuẩn vào nước bể cảm nhiễm lấy từ kết thí nghiệm thăm dị (Bảng 1) Thí nghiệm cảm nhiễm kết thúc cá khơng cịn chết ngày liên tục khuyến cáo Nordmo & ctv (1998) tổng thời gian thí nghiệm 23 ngày Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh 42 ➧ ➧ 0,26 10 35 106 105 8.207 80 16.000/16.000 - 88,93 - 3,10 5.838 5.192 2.000 Ư Ư 0,97 23 ➧ Thí nghiệm cảm nhiễm Thí nghiệm đánh giá tăng trưởng 22/8/2019 - 9/10/2019 90 77 147 130 147 130 20,90 12,00 21,00 12,30 123 - 167 141 - 184 145,60 6,80 Bảng Kết sản xuất gia đình, đánh dấu, ương ni cảm nhiễm bệnh gia đình cá tra ➧ Chỉ tiêu Thời gian cho sinh sản Số lượng bố Số lượng mẹ Số lượng gia đình Khối lượng cá đánh dấu (g) SD Thời gian ương (từ cá bột đến đánh dấu - Nursetime) Thời gian nuôi (từ đánh dấu đến cân đo tăng trưởng - Growday) Diện tích, thể tích thí nghiệm: Thể tích nước/bể thí nghiệm (L) Diện tích ao ni (m2 ) Mật độ cá: Con/L Con/m2 Thời gian cá (ngày) Tỉ lệ cá bệnh sống chung cá khỏe (%) Liều tiêm gây bệnh cá (CFU/cá) Mật độ vi khuẩn bổ sung vào đạt bể cảm nhiễm (CFU/mL) Số lượng cá thí nghiệm (con) Số lượng cá cịn sống sót (con) Tỉ lệ sống cá cuối thí nghiệm: Cảm nhiễm (SUREND, %) Tăng trưởng (SURGROW, %) Thời gian thí nghiệm cảm nhiễm (ngày) www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) 43 Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh 2.4 Thí nghiệm ni chung đánh giá tính trạng tăng trưởng Tổng cộng có 5.838 cá thuộc 130 gia đình sau đánh dấu thả ni ao 2.000 m2 , mực nước 1,5 m, mật độ trung bình 3,1 con/m2 (Bảng 1) Cá cho ăn thức ăn viên cá tra (24 - 32% đạm) Hàng ngày cho ăn lần vào lúc 16 Khẩu phần ăn - 5% khối lượng thân tháng đầu, - 4% khối lượng thân từ tháng thứ đến thứ - 3% khối lượng thân cá tháng tuổi Các kỹ thuật nuôi khác áp dụng theo qui trình hồn thiện cho đánh giá tăng trưởng cho chọn giống Viện NC NTTS II Đo chiều dài tổng cân khối lượng cá thể (5.192 cá thể) cá nuôi sau 146 ngày 2.5 Thu thập xử lí số liệu Thí nghiệm ni tăng trưởng: Mơ hình tuyến tính hỗn hợp cá thể sử dụng ước tính thành phần phương sai tính trạng khối lượng (HW) chiều dài (HL) lúc thu hoạch bao gồm 2 σA = phương sai di truyền cộng gộp, σC phương sai ảnh hưởng môi trường chung, σE phương sai số dư phương sai kiểu hình σP 2 = σA + σC + σE Khối lượngijkl = + β1 × Nursetimei + + β2 × Growdayj + cá thểk + cá mẹl + eijkl (Mơ hình 1) Trong đó: Khối lượngijkl khối lượng cá thể k thu hoạch, trung bình quần thể, β1 hệ số hồi quy hiệp biến thời gian ương đánh dấu (Nursetime), β2 hệ số hồi quy hiệp biến thời gian nuôi tăng trưởng (Growday), cá thểk ảnh hưởng ngẫu nhiên cá thể k, cá mẹl ảnh hưởng môi trường ương riêng rẽ đến đánh dấu eijkl ảnh hưởng ngẫu nhiên số dư Hệ số σA di truyền ước tính h2 = 2 + σ2 σA + σC E ảnh hưởng môi trường ương riêng rẽ σC ước tính c2 = 2 + σ Tương tự cho σA + σC E tính trạng HL Đối với tính trạng tỉ lệ sống tăng trưởng (biến dạng nhị phân mã hóa sống: 1, chết: thời điểm lúc thu hoạch) sử dụng mô hình (2) bên để ước tính thơng số di truyền ➭ ➭ ➭ điểm cắt ngang thí nghiệm mã hóa thời gian sống tồn thí nghiệm (là 528,5 giờ) chết thời điểm trước thời điểm cắt ngang thí nghiệm lấy thời gian cá sống đến thời điểm thực tế Các tính trạng SUR TIME tính ba thời điểm trình cảm nhiễm thời điểm tổng số cá thí nghiệm sống 50%, 25% cuối thí nghiệm với tỉ lệ sống 0,97% tương ứng SUR50, SUR25, SUREND TIME50, TIME25 VÀ TIMEEND Số liệu xử lý phần mềm ASReml V3 (Gilmour & ctv., 2014) Mơ hình tuyến tính hỗn hợp cá thể dùng để ước tính thành phần phương sai tính trạng, khơng bao gồm "cá mẹ" ảnh hưởng môi trường ương riêng rẽ đến đánh dấu mơ hình khơng ước tính 2 có bao gồm (σG = phương sai di truyền, σE = phương sai số dư phương sai kiểu hình, σP 2 = σG + σE ) yijk = + βi × tuổi đánh dấui + bểj + cá thểk + eijk (Mơ hình 2) Trong đó: yijk tình trạng (sống chết, SUR) thời gian chết (TIME) cá thể k cắt ngang kết thúc thí nghiệm cảm nhiễm, trung bình quần thể cá thí nghiệm, β1 hệ số hồi quy hiệp biến ‘tuổi đánh dấu’, bểj ảnh hưởng cố định hai bể thí nghiệm, cá thểk ảnh hưởng ngẫu nhiên cá thể k eijk ảnh hưởng số dư Hệ số di truyền tính trạng tỉ lệ sống σ2 thời gian sống h2 = G σG + σE ➭ ➭ Uớc tính tương quan di truyền tính trạng: Tương quan di truyền (rA ) hai tính trạng HW HL ước tính theo cơng thức rA = σ12 (3) Trong đó: σ12 hiệp phương sai σ1 + σ22 ảnh hưởng di truyền cộng gộp hai tính trạng, σ12 σ22 phương sai ảnh hưởng di truyền cộng gộp tính trạng theo mơ hình tốn (1) (Falconer & Mackay, 1996) Đối với tương quan di truyền (rG ) HW tính trạng kháng bệnh gan thận mủ (SUR50, SUR25, SUREND TIME50, TIME25 TIMEEND) giống công thức (3) sử dụng với phương sai hiệp phương sai giống mơ hình tốn (2) Kết Quả Thảo Luận Thí nghiệm cảm nhiễm: Tính trạng tỉ lệ sống thơng qua khả sống/chết (SUR) theo cá thể 3.1 Thông tin tính trạng khảo sát thí nghiệm cảm nhiễm (biến nhị phân) mã hóa sống chết lúc kiểm tra Tính trạng Kết qua hai thí nghiệm thăm dị (thí thời gian sống theo cá thể tính theo (TIME, biến liên tục), cá thể sống thời nghiệm tỉ lệ ghép cá cohabitant: cá thí nghiệm thí nghiệm liều bổ sung vi khuẩn vào bể www.jad.hcmuaf.edu.vn Tạp chí Nông nghiệp Phát triển 20(1) 44 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh cảm nhiễm sau hai ngày cho cá cohabitant cá thí nghiệm sống chung) cho thấy: (1) tỉ lệ chết tương ứng cho tỉ lệ ghép cá cohabitant (50% 35%) 20,0%, 31,1% (2) tỉ lệ chết tương ứng liều bổ sung vi khuẩn (105 CFU/mL 106 CFU/mL) 73,5% 93,0% Kết cho thấy tỉ lệ ghép cá cohabitant : cá thí nghiệm 35%: 65% liều bổ sung vi khuẩn 105 CFU/mL vào bể thí nghiệm vào ngày thứ sau cho cá cohabitant sống chung với cá thí nghiệm phù hợp cho thí nghiệm cảm nhiễm thức Qua thí nghiệm cảm nhiễm thức gia đình cá giống, hệ số biến thiên (CV) tính trạng kháng bệnh gan thận mủ thơng qua tiêu sống/chết (SUR) thời gian sống (TIME) theo cắt ngang tỉ lệ sống 50%, 25% cuối thí nghiệm với tỉ lệ sống 0,97% (SUR50, SUR25, SUREND TIME50, TIME25, TIMEEND) tương ứng 109,14%, 141,84%, 508,25% 58,42%, 56,66% 34,94% Kết cho thấy CV TIME50, TIME25 TIMEEND thấp CV SUR50, SUR25 SUREND Nguyên nhân tính trạng TIME gia đình theo dõi theo giờ/lần, SUR gia đình thời điểm cắt ngang tính theo số lượng cá thể chết thời điểm cắt ngang nên mức độ biến thiên tính trạng TIME thấp SUR thời điểm Hệ số cho tính trạng tỉ lệ sống lúc thu hoạch sau nuôi tăng trưởng (SURGROW) 35,27% (Bảng 2) Nguyen & ctv (2019b) công bố CV cho SUR60 cuối thí nghiệm cao (80,2%) quần thể cá tra chọn giống kháng bệnh gan thận mủ hệ bố mẹ G0 3.2 Hệ số di truyền tính trạng khảo sát thống kê nằm khoảng cơng bố cho tính trạng quần thể cá tra hệ khác (Trinh & ctv., 2016; Nguyen & ctv., 2019a) Mơ hình tốn sử dụng nghiên cứu có điều chỉnh ảnh hưởng không đồng thời gian sinh sản gia đình nhằm ước tính thơng số di truyền xác Tuy nhiên, việc sinh sản gia đình khơng đồng thời gian hạn chế nghiên cứu Với số lượng gia đình half-sib đạt cho số liệu cảm nhiễm bệnh gan thận mủ 58, sử dụng mơ hình tuyến tính khơng bao gồm ảnh hưởng môi trường chung (c2 ) để xử lý số liệu Cách tiếp cận phù hợp Pham & ctv (2021b) thử nghiệm mơ hình có khơng c2 cho xử lý số liệu kháng bệnh gan thận mủ quần thể cá tra chọn lọc theo tính tăng tăng trưởng qua hệ, cho ước tính hệ số di truyền với sai số thấp h2 cho tính trạng kháng bệnh thơng qua sống/chết (SUR) mức trung bình, cao thấp tương ứng 0,20, 0,40 0,13 cho cắt ngang SUR50, SUR25 SUREND Trong đó, h2 cho tính trạng kháng bệnh thơng qua thời gian sống (TIME) có hệ số di truyền mức trung bình, cao trung bình tương ứng 0,25, 0,39 0,35 (Bảng 3) Kết cho thấy cắt ngang tỉ lệ sống 25% (SUR25 TIME25) có hệ số di truyền cao Tất giá trị h2 vừa nêu khác zero có ý nghĩa thống kê Với hệ số di truyền cho phép kết luận hiệu mang mức trung bình đến cao thực chọn lọc cho tính trạng kháng bện gan thận mủ h2 cho SUR nghiên cứu có cao giá trị ước tính mơ hình tốn quần thể chọn giống kháng bệnh gan thận mủ hệ G0 với tỉ lệ sống 60,9% (0,19; Nguyen & ctv., 2019b) quần thể chọn giống tăng trưởng cảm nhiễm bệnh gan thận mủ với tỉ lệ sống 8,0 - 11,8% (0,11 - 0,13; Pham & ctv., 2021b) h2 cho tính trạng thời gian chết (TIME) theo ngày cho giá trị ước tính cao SUR, 0,23 so với 0,19 (Nguyen & ctv., 2019b) Khi tỉ lệ sống giảm dần đến cuối thí nghiệm h2 thấp hơn, điều thấy rõ kết cảm nhiễm WSSV tôm thẻ chân trắng tỉ lệ sống giảm từ 92,1% xuống 42,8% h2 giảm từ 0,38 xuống 0,01 (Trinh & ctv., 2016) Uớc tính mơ hình tuyến tính có bao gồm ảnh hưởng môi trường chung (c2 ), hệ số di truyền (h2 ) cho HW HL cho quần thể G1 nghiên cứu mức cao tương ứng 0,48 0,17 0,47 0,18 khác zero có ý nghĩa thống kê (Bảng 3) Kết cho thấy chọn lọc nâng cao tốc độ tăng trưởng hiệu mang lại cao h2 cho HW nghiên cứu G1 cao h2 quần thể chọn giống kháng bệnh gan thận mủ hệ bố mẹ G0 0,35 0,12 (Trinh & ctv., 2016) Hệ số cho HW cao với số liệu xử lý quần thể cá tra khác chọn giống nâng cao tốc độ tăng trưởng qua hệ Việt Nam 0,34 0,04 Hệ số di truyền (h2 ) cho tỉ lệ sống lúc thu hoạch (Nguyen & ctv., 2019a) Ảnh hưởng môi trường sau nuôi tăng trưởng (SURGROW) mức trung chung (c2 ) cho HW HL nghiên cứu bình (0,23 0,03) khác zero có ý nghĩa thống (0,18 0,07 0,23 0,08) khác zero có ý nghĩa ➧ ➧ ➧ ➧ ➧ ➧ Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) ➧ www.jad.hcmuaf.edu.vn 45 Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh Bảng Kết giá trị biến thiên tính trạng tăng trưởng kháng bệnh cắt ngang theo tỉ lệ sống Tính trạng quan sát (đơn vị)2 Số cá thể (n) Trung bình∗1 Độ lệch chuẩn∗1 Hệ số biến thiên (CV, %)∗1 HL (cm) HW (g) SUR50 (1/0) TIME50 (giờ) SUR25 (1/0) TIME25 (giờ) SUREND (1/0) TIMEEND (giờ) SURGROW (1/0) 5.192 5.192 8.207 8.207 8.207 8.207 8.207 8.207 5.838 38,45 868,40 45,64 318,00 25,55 237,00 0,97 200,7 88,93 3,49 279,10 49,81 185,80 36,24 134,30 4,93 70,12 31,37 9,07 32,14 109,14 58,42 141,84 56,66 508,25 34,94 35,27 Giá trị nhỏ 21,00 104,00 0,00 61,00 0,00 61,00 0,00 61,00 0,00 Giá trị lớn 48,50 1973,00 1,00 528,50 1,00 528,50 1,00 528,50 1,00 ∗1 : Đối với tính trạng sống/chết số liệu trung bình, độ lệch chuẩn, hệ số biến thiên bảng tính tốn theo tỉ lệ sống gia đình HL: Chiều dài; HW: Khối lượng; SUR50, TIME50, SUR25, TIME25, TIMEEND: Kháng bệnh gan thận mủ; SUREND: Cảm nhiễm, SURGROW: Tăng tưởng Bảng Các phương sai thành phần, hệ số di truyền ước (h2 ) ảnh hưởng mơi trường chung (c2 ) cho tính trạng tăng trưởng kháng bệnh gan thận mủ cắt ngang theo tỉ lệ sống khác Tính trạng1 HL HW SUR50 TIME50 SUR25 TIME25 SUREND TIMEEND SURGROW σA 3,97 25.532,50 σG 0,05 7.404,37 0,05 6.191,78 0,33e−3 1.521,16 0,02 Phương sai thành phần 2 σC σE σP 1,51 2,83 8,30 12.539,30 15.796,70 53.868,00 2 σE σP 0,17 0,22 22.192,80 29.597,00 0,08 0,13 9.792,03 15.984,00 0,21e−2 0,24e−2 2.601,33 4.122,5 0,08 0,10 ➧ Hệ số di truyền (h2 , TB se) 0,48 0,17 0,47 0,18 ➧ ➧ 0,20 ➧ 0,03 0,25 ➧ 0,04 0,40 ➧ 0,05 0,39 ➧ 0,05 0,13 ➧ 0,03 0,37 ➧ 0,05 0,23 ➧ 0,03 ➧ ➧ ➧ Hệ số c2 (TB se∗∗ ) 0,18 0,07 0,23 0,08 - HL: Chiều dài; HW: Khối lượng; SUR50, TIME50, SUR25, TIME25, TIMEEND: Kháng bệnh gan thận mủ; SUREND: Cảm nhiễm, SURGROW: Tăng tưởng ➧ kê (Bảng 3) Giá trị gần tương đương (0,27 0,03) với công bố Nguyen & ctv (2019a) ước tính quần thể cá tra khác chọn giống nâng cao tốc độ tăng trưởng qua hệ Việt Nam 3.3 Tương quan di truyền tính trạng khảo sát ➧ Tương quan di truyền (rA ) thuận HW HL gần tuyệt đối (0,99 0,01; Bảng 4) hai tính trạng xem rG HW SURGROW nghịch mức -0,13 0,12, khác zero khơng có ý nghĩa thống kê cho thấy chọn lọc nâng cao HW khơng ảnh hưởng đến tỉ lệ sống lúc nuôi tăng trưởng rG HW với HL SURGROW quần thể cá ➧ www.jad.hcmuaf.edu.vn tra khác chọn giống qua hệ nâng cao tốc độ tăng trưởng Việt Nam tương tự tương ứng thuận cao (0,94 0,01) thuận (0,27 0,09) tìm thấy (Nguyen & ctv., 2019a) ➧ ➧ Tương quan di truyền (rG ) HW với SUR50, SUR25 SUREND thuận thấp tương ứng 0,16, 0,10 0,37 có rG HW với SUREND khác zero có ý nghĩa thống kê (Bảng 4) Trong đó, rG HW với TIME50, TIME25 TIMEEND thuận cao tương ứng 0,26, 0,33 0,40 tất giá trị rG khác zero có ý nghĩa thống kê rG SURGROW SUR50, SUR25, SUREND, TIME50, TIME25 TIMEEND thuận có chung xu hướng HW, dao động khoảng 0,10 - 0,39 Tất cá giá trị rG khác zero có ý nghĩa thống kê, Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) 46 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh ➧ 0,01 ➧ 0,12 ➧ 0,10 ➧ 0,11 ➧ 0,09 ➧ 0,10 ➧ 0,09 ➧ 0,12 HW 0,99 0,16 0,26 0,10 0,33 0,37 0,40 -0,13 ➧ 0,00 ➧ 0,05 ➧ 0,03 ➧ 0,13 ➧ 0,03 ➧ 0,16 SUR50 0,99 0,78 0,90 0,17 0,87 0,36 ➧ 0,06 ➧ 0,03 ➧ 0,12 ➧ 0,02 ➧ 0,16 TIME50 0,72 0,87 0,22 0,89 0,39 ➧ 0,01 ➧ 0,11 ➧ 0,03 ➧ 0,16 SUR25 0,96 0,39 0,84 0,32 ➧ 0,11 ➧ 0,02 ➧ 0,16 TIME25 0,33 0,92 0,37 ➧ 0,09 ➧ 0,19 SUREND 0,57 0,10 ➧ 0,16 TIMEEND 0,37 Bảng Tương quan di truyền tính trạng tăng trưởng tỉ lệ sống lúc thu hoạch tính trạng kháng bệnh gan thận mủ cắt ngang theo tỉ lệ sống Tính trạng1 HW HL SUR50 TIME50 SUR25 TIME25 SUREND TIMEEND SURGROW HL: Chiều dài; HW: Khối lượng; SUR50, TIME50, SUR25, TIME25, TIMEEND: Kháng bệnh gan thận mủ; SUREND: Cảm nhiễm, SURGROW: Tăng tưởng Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) ngoại trừ SURGROW với SUREND Từ kết cho thấy, chọn lọc áp dụng cho tính trạng kháng bệnh gan thận mủ có khả mang lại phần hiệu khơng ảnh hưởng đến tính trạng tăng trưởng hay tỉ lệ sống sau nuôi tăng trưởng quần thể cá tra G1 rG xung quanh zero thuận HW kháng bệnh thông qua SUR công bố quần thể khác chọn giống tăng trưởng G3 Việt Nam (0,16 - 0,19; Pham & ctv., 2021b) xử lý chung G3 với quần thể chọn giống kháng bệnh gan thận mủ nghiên cứu hệ bố mẹ G0 (0,03; Nguyen & ctv., 2019b) Xu hướng tìm thấy HW tính trạng thời gian sống (TIME) theo ngày xử lý chung G3 với quần thể chọn giống kháng bệnh gan thận mủ nghiên cứu hệ bố mẹ G0 (0,13; Nguyen & ctv., 2019b) Tương quan di truyền (rG ) tính trạng kháng bệnh dạng sống/chết (SUR), thời gian sống (TIME) cắt ngang tỉ lệ sống 50%, 25% cuối thí nghiệm chúng với tương quan thuận khoảng 0,17 0,99 (Bảng 4) Tương quan tính trạng thời điểm cắt ngang gần tuyệt đối (0,99 SUR50 với TIME50; 0,96 SUR25 với TIME25) cao (0,57; SUREND với TIMEEND) Trong rG SUR cắt ngang (a), TIME cắt ngang (b) SUR với TIME cắt ngang (c) xu hướng rG cao (b) khoảng 0,87 - 0,92 (c) khoảng 0,84 - 0,90 so với (a) 0,78 SUR50 SUR25 Tương quan rG cao cho SUR (0,80 - 0,99) cắt ngang trình cảm nhiễm bệnh đốm trắng tôm thẻ chân trắng (Trinh & ctv., 2016) Trong nghiên cứu này, riêng SUREND có rG thấp với SUR TIME cắt ngang khác, khoảng 0,17 - 0,39 có giá trị rG khác zero khơng có ý nghĩa thống kê Kết với hệ số di truyền thấp SUREND (0,13) Bảng cho thấy, tính trạng sống/chết dạng nhị phân 1/0 cuối thí nghiệm mà có tỉ lệ chết cao thí nghiệm nghiên cứu (lên đến 99,03%) làm cho biến dị di truyền thấp ước tính tương quan di truyền với cắt ngang khác xảy tương tự Gjøen & ctv., (1997) nghiên cứu bệnh cá hồi Ødeg˚ ard & ctv (2011) nghiên cứu mơ hình tốn xử lý số liệu kháng bệnh thảo luận tính trạng kháng bệnh cần xem xét tỉ lệ sống xung quanh 50%, đạt tỉ lệ sống thấp số gia đình khơng cịn cá thể sống dẫn đến làm sai lệch kết tính trạng www.jad.hcmuaf.edu.vn 47 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh sống/chết Trong nghiên cứu thí nghiệm cảm nhiễm quần thể cá tra chọn giống tăng trưởng G3 với kết phân tích quần thể cá tra chọn giống kháng bệnh với nghiên cứu hệ bố mẹ G0, nhóm tác giả Pham & ctv (2021a 2021b) thảo luận thí nghiệm cảm nhiễm nên kết thúc tỉ lệ sống xung quanh 50% có phương sai kiểu hình hệ số di truyền cao hơn, phản ảnh tính trạng kháng bệnh gan thận mủ Ngoài ra, Pham & ctv (2021a) thảo luận mơ hình tốn với tính trạng thời gian sống đến 50% phản ảnh tốt mẫn cảm cá tra với mầm bệnh Edwardsiella ictaluri gây bệnh gan thận mủ Kết nghiên cứu cho thấy phương sai kiểu hình (σP ) cho SUR TIME có xu hướng giảm từ cắt ngang 50% sang 25% (0,22 so với 0,13 29.597,0 so với 15.984,0 giờ) phương sai di truyền (σG ) giữ nguyên SUR50 (0,05) SUR25 (0,05), giảm TIME50 (7.404,37) TIME25 (6.191,78) Với kết nghiên cứu thông số di truyền thảo luận tác giả vừa nêu kháng bệnh cá hồi tính trạng khác quần thể cá tra, cho thấy với tỉ lệ chết thí nghiệm cao (99,03%) tại, xem xét chọn tính trạng SUR50 SUR25 hay TIME50 để ước tính giá trị chọn giống ước tính (EBV) phục vụ cho chọn lọc Kết Luận Hệ số di truyền tính trạng kháng bệnh gan thận mủ quần thể chọn giống G1 thơng qua tính trạng sống/chết thời gian sống theo cắt ngang tỉ lệ sống 50% 25% mức từ trung bình đến cao (0,20 - 0,40), cho thấy khả thi mang lại hiệu trung bình đến cao thực chọn lọc tính trạng Tương quan di truyền tính trạng kháng bệnh từ cao đến gần tuyệt đối (0,72 - 0,99) xem xét ước tính giá trị chọn giống cho tính trạng sống/chết cắt ngang 50% 25% tính trạng thời gian sống theo cắt ngang 50% phục vụ cho chọn lọc Chọn lọc theo tính trạng kháng bệnh gan thận mủ mang lại hiệu phần cho khối lượng tỉ lệ sống lúc thu hoạch sau nuôi thương phẩm nhờ vào tương quan di truyền thuận tương ứng 0,10 - 0,33 0,32 - 0,39 www.jad.hcmuaf.edu.vn Lời Cam Đoan Chúng tơi xin tun bố khơng có mâu thuẫn tác giả đồng tác giả báo Lời Cảm Ơn Nghiên cứu thực khuôn khổ đề tài “Nghiên cứu chọn giống cá tra kháng bệnh gan thận mủ, 2019 - 2020” thuộc chương trình Công nghệ Sinh học Nông nghiệp Thuỷ sản Bộ Nông Nghiệp Phát triển Nông thôn Chân thành cám ơn anh chị thuộc Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II tạo điều kiện cho nhóm nghiên cứu thực nghiên cứu liên quan Tài Liệu Tham Khảo (References) Crumlish, M., Thanh, P C., Koesling, J., Tung, V T., & Gravingen, K (2010) Experimental challenge studies in Vietnamese catfish, Pangasianodon hypophthalmus (Sauvage), exposed to Edwardsiella ictaluri and Aeromonas hydrophila Journal of Fish Diseases 33(9), 717-722 DOF (Directorate of fisheries) (2020) Production results of the aquaculture sector in 2019 Retrieved December 09, 2020, from https://tongcucthuysan.gov.vn/Tint%E1%BB%A9c/-Tin-v%E1%BA%AFn/doctin/014196?2020-01-15=Banner+002 Falconer, D S., & Mackay, T F C (Eds.) (1996) Introduction to quantitative genetics (4th ed.) Essex, England: Prentice Hall Gilmour, A., Gogel, B., Cullis, B., Welham, S., Thompson, R., Butler, D., Cherry, M., Collins, D., Dutkowski, G., & Harding, S (Eds.) (2014) ASReml user guide Release 4.1 structural specification Hemel Hempstead, UK: VSN International Gjøen, H M., Refstie, T., Ulla, O., & Gjerde, B (1997) Genetic correlations between survival of Atlantic salmon in challenge and field tests Aquaculture 158, 277-288 Nguyen, V T., Nguyen, S V., Tran, P H., Nguyen, V T., & Nguyen, N H (2019a) Genetic evaluation of a 15year selection program for high growth in striped catfish Pangasianodon hypophthalmus Aquaculture 509, 221-226 Nguyen, V T., Nguyen, S V., Trinh, T Q., Nguyen, D H., Nguyen, D T., & Nguyen, N H (2019b) Breeding for improved resistance to Edwardsiella ictaluri in striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus): Quantitative genetic parameters Journal of Fish Diseases 42(10), 1409-1417 Nordmo, R., Ramstad, A., & Riseth, J H (1998) Induction of experimental furunculosis in heterogenous test populations of Atlantic salmon (Salmo salar L.) by use of a cohabitation method Aquaculture 162(1-2), 11-21 Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) 48 Ødeg˚ ard, J., Madsen, P., Labouriau, R., Gjerde, B., & Meuwissen, T H E (2011) A sequential threshold cure model for genetic analysis of time-to-event data Journal of Animal Science 89(4), 943-950 Pham, K D., Nguyen, S V., Jørgen Ødeg˚ ard, J., Gjøen, H M., Klemetsdal, G (2021a), Case study development of a challenge test against Edwardsiella ictaluri in Mekong striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus), for use in breeding: Estimates of the genetic correlation between susceptibilities in replicated tanks Journal of Fish Diseases 44(5), 553-561 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Trinh, T Q., Nguyen, D H., & Nguyen, V T (2016) Genetic parameters of resistant white spot symptoms trait on striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) Science and Technology Journal of Agriculutre & Rural Development 23, 84-90 Tu, D T., Nguyen, N T N., Nguyen, T Q., Duong, T T M., Nguyen, T A., Shinn, A., & Crumlish, M (2008) Common diseases of pangasius catfish farmed in Vietnam Global Aquaculture Advocate 11, 76-77 Pham, K D., Ødeg˚ ard, J., Nguyen, S V, Gjøen, H M, & Klemetsdal, G (2021b) Genetic analysis of resistance in Mekong striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) to bacillary necrosis caused by Edwardsiella ictaluri Journal of Fish Diseases 44(2), 201-210 Tạp chí Nơng nghiệp Phát triển 20(1) www.jad.hcmuaf.edu.vn ... giống cá tra kháng bệnh gan thận mủ hệ (G1) cần thiết với mục đích là: (a) ước tính thơng số di truyền tính trạng cá tra giống hệ G1 (b) tìm mối tương quan di truyền khả kháng bệnh với tính trạng. ..40 Trường Đại học Nơng Lâm TP Hồ Chí Minh Các thơng số di truyền ước tính cho tính trạng kháng bệnh gan thận mủ cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) Trần Thị Phương Dung1,3∗ , Trần Hữu... ictaluri gây bệnh gan thận mủ cá giống nuôi đánh giá tăng trưởng ao Các tính trạng khối lượng (HW), chiều dài (HL) tỉ lệ sống (SURGROW) sau nuôi tăng trưởng tính trạng kháng bệnh gan thận mủ thơng