Sự đề kháng kháng sinh của các chủng trực khuẩn gram âm gây bệnh thường gặp tại bệnh viện quân y 175 từ 11 2017 đến 6 2018

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - LÊ THÙY DƯƠNG SỰ ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA CÁC CHỦNG TRỰC KHUẨN GRAM ÂM GÂY BỆNH THƯỜNG GẶP TẠI BỆNH VIỆN QUÂN Y 175 TỪ 11/2017 ĐẾN 6/2018 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH – NĂM 2018 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - LÊ THÙY DƯƠNG SỰ ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA CÁC CHỦNG TRỰC KHUẨN GRAM ÂM GÂY BỆNH THƯỜNG GẶP TẠI BỆNH VIỆN QUÂN Y 175 TỪ 11/2017 ĐẾN 6/2018 Ngành: KHOA HOC Y SINH Mã số: 8720101 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS.TS CAO MINH NGA THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH – NĂM 2018 i LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng Các số liệu kết luận văn trung thực chưa công bố cơng trình khác Tác giả luận văn LÊ THÙY DƯƠNG ii MỤC LỤC LỜI CAM ĐOAN i MỤC LỤC ii DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT v DANH MỤC CÁC BẢNG vi DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ vii DANH MỤC CÁC HÌNH VÀ SƠ ĐỒ viii MỞ ĐẦU CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Trực khuẩn Gram âm gây bệnh thường gặp 1.1.1 Họ vi khuẩn đường ruột Enterobacteriaceae 1.1.2 Nhóm trực khuẩn Gram âm khơng lên men đường .7 1.2 Kháng sinh đề kháng kháng sinh .9 1.2.1 Cơ chế kháng sinh tác động đến vi khuẩn 10 1.2.2 Sự đề kháng kháng sinh vi khuẩn .12 1.3 Vấn đề kháng kháng sinh trực khuẩn Gram âm 15 1.4 Kháng sinh nhóm carbapenem men carbapenemase 17 1.4.1 Kháng sinh nhóm carbapenem 17 1.4.2 Cơ chế đề kháng kháng sinh nhóm carbapenem .18 1.4.3 Các carbapenemase 18 1.5 Kỹ thuật real-time PCR phát vi khuẩn mang gen KPC NDM-1 20 CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 22 2.1 Thiết kế nghiên cứu 22 2.2 Địa điểm thời gian nghiên cứu 22 2.3 Đối tượng nghiên cứu 22 2.4 Phương pháp chọn mẫu 22 2.4.1 Cỡ mẫu 22 iii 2.4.2 Tiêu chuẩn chọn mẫu 23 2.4.3 Phương pháp thu thập 23 2.4.4 Tiêu chuẩn loại trừ 23 2.5 Phương pháp tiến hành 24 2.5.1 Vật liệu 24 2.5.2 Kỹ thuật nghiên cứu 25 2.6 Kiểm soát xử lý số liệu .32 2.6.1 Kiểm soát sai lệch số liệu 32 2.6.2 Xử lý số liệu 32 2.7 Vấn đề y đức 32 CHƯƠNG KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU .34 3.1 Một số đặc điểm mẫu nghiên cứu .34 3.1.1 Phân bố theo giới .34 3.1.2 Phân bố theo tuổi .35 3.1.3 Tỉ lệ loại bệnh phẩm phân lập 36 3.1.4 Tỉ lệ nhóm vi khuẩn phân lập 37 3.1.5 Tỉ lệ vi khuẩn nhóm trực khuẩn đường ruột 38 3.1.6 Tỉ lệ vi khuẩn nhóm trực khuẩn Gram âm khơng lên men đường 39 3.2 Tỉ lệ vi khuẩn gây bệnh theo loại bệnh phẩm 40 3.2.1 Nhóm bệnh phẩm dịch mủ - vết thương .40 3.2.2 Nhóm bệnh phẩm đường hơ hấp .42 3.2.3 Nhóm bệnh phẩm máu 44 3.3 Đặc điểm đề kháng kháng sinh chủng vi khuẩn 45 3.3.1 Tỉ lệ kháng kháng sinh K pneumoniae .45 3.3.2 Tỉ lệ kháng kháng sinh E coli 46 3.3.3 Tỉ lệ kháng kháng sinh A baumannii 48 3.3.4 Tỉ lệ kháng kháng sinh P aeruginosa 49 3.3.5 Tỉ lệ kháng kháng sinh B cepacia 50 3.3.6 Đặc điểm kháng nhóm carbapenem 51 3.4 Kết thử nghiệm vi khuẩn mang gen sinh men carbapenemase 51 iv CHƯƠNG BÀN LUẬN 56 4.1 Một số đặc điểm mẫu nghiên cứu .56 4.1.1 Đặc điểm phân bố giới tuổi 56 4.1.2 Tỉ lệ loại bệnh phẩm phân lập 56 4.1.3 Tỉ lệ loại vi khuẩn phân lập 57 4.1.4 Tỉ lệ loại vi khuẩn theo loại bệnh phẩm 58 4.2 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh chủng vi khuẩn 60 4.2.1 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh K pneumoniae 60 4.2.2 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh E coli .62 4.2.3 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh A baumannii 63 4.2.4 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh P aeruginosa 65 4.2.5 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh B cepacia 66 4.3 Đặc điểm kháng kháng sinh nhóm carbapenem vi khuẩn mang gen sinh men carbapenemase 67 HẠN CHẾ CỦA NGHIÊN CỨU 70 KẾT LUẬN 71 KIẾN NGHỊ .73 TÀI LIỆU THAM KHẢO PHỤ LỤC PHỤ LỤC PHỤ LỤC v DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT BA Blood agar BHI Brain Heart Infusion BV Bệnh viện CAXV Chocolate agar X V (thạch nâu bổ sung yếu tố X, V) CDC Centre for Disease Control and Prevention (Trung tâm kiểm sốt ngăn ngừa bệnh tật - Hoa Kì) CFU Colony Forming Unit CHDLs Carbapenem hydrolyzing class D beta-lactamases CLSI Clinical and Laboratory Standards Institute (Viện tiêu chuẩn lâm sàng xét nghiệm) DNA Deoxyribonucleic acid KPC Klebsiella Pneumoniae Carbapenemase KS Kháng sinh MBLs Metalo beta-lactamase MDR Multi Drug Resistant NDM New Delhi Metalo-beta-lactamase NMIC/ID Negative- Minimum Inhibitory Concentration/ Identity PCR Polymerase Chain Reaction RNA Ribonucleic Acid SMART Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends TP.HCM Thành phố Hồ Chí Minh VK Vi khuẩn vi DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng 3.1 Phân bố theo giới 34 Bảng 3.2 Phân bố theo nhóm tuổi 35 Bảng 3.3 Tỉ lệ loại bệnh phẩm 36 Bảng 3.4 Tỉ lệ nhóm vi khuẩn phân lập 37 Bảng 3.5 Tỉ lệ vi khuẩn nhóm trực khuẩn đường ruột 38 Bảng 3.6 Tỉ lệ vi khuẩn nhóm Gram âm khơng lên men đường 39 Bảng 3.7 Tỉ lệ vi khuẩn gây bệnh nhóm bệnh phẩm dịch mủ - vết thương 40 Bảng 3.8 Tỉ lệ vi khuẩn gây bệnh nhóm bệnh phẩm đường hơ hấp 42 Bảng 3.9 Tỉ lệ vi khuẩn gây bệnh nhóm bệnh phẩm máu 44 Bảng 3.10 Kết phát gen mã hóa carbapenemase 52 Bảng 3.11 Đề kháng kháng sinh chủng mang gen mã hóa KPC NDM-1 53 Bảng 4.1 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh K pneumoniae số Bệnh viện 61 Bảng 4.2 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh E coli số Bệnh viện 63 Bảng 4.3 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh A baumannii số Bệnh viện 64 Bảng 4.3 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh P aeruginosa số Bệnh viện 66 Bảng 4.4 So sánh đề kháng kháng sinh B cepacia Bệnh viện 67 vii DANH MỤC CÁC BIỂU ĐỒ Biểu đồ 3.1 Tỉ lệ phân bố giới tính 34 Biểu đồ 3.2 Tỉ lệ phân bố theo nhóm tuổi 35 Biểu đồ 3.3 Phân bố loại bệnh phẩm 36 Biểu đồ 3.4 Tỉ lệ nhóm vi khuẩn phân lập .37 Biểu đồ 3.5 Tỉ lệ vi khuẩn nhóm trực khuẩn đường ruột 38 Biểu đồ 3.6 Tỉ lệ vi khuẩn nhóm Gram âm khơng lên men đường 40 Biểu đồ 3.7 Tỉ lệ vi khuẩn gây bệnh nhóm bệnh phẩm dịch mủ-vết thương 41 Biểu đồ 3.8 Tỉ lệ vi khuẩn gây bệnh nhóm bệnh phẩm đường hơ hấp 43 Biểu đồ 3.9 Tỉ lệ vi khuẩn gây bệnh nhóm bệnh phẩm máu 44 Biểu đồ 3.10 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh K pneumoniae 45 Biểu đồ 3.11 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh E coli 46 Biểu đồ 3.12 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh A baumannii 48 Biểu đồ 3.13 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh P aeruginosa 49 Biểu đồ 3.14 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh B cepacia 50 Biểu đồ 3.15 Tỉ lệ đề kháng kháng sinh nhóm carbapenem .51 Biểu đồ 3.16 Tỉ lệ vi khuẩn mang gen sinh carbapenemase .54 viii DANH MỤC CÁC HÌNH Hình 1.1: Hình ảnh trực khuẩn Gram âm Hình 1.2 Hình ảnh cấu trúc nhuộm Gram vi khuẩn E coli .6 Hình 1.3 Hình ảnh khuẩn lạc nhuộm Gram Klebsiella pneumoniae Hình 1.4 Hình ảnh khuẩn lạc nhuộm Gram Acinetobacter baumannii Hình 1.5 Hình ảnh khuẩn lạc nhuộm Gram Pseudomonas aeruginosa Hình 1.6 Hình ảnh khuẩn lạc nhuộm Gram Burkholderia cepacia .9 Hình 1.7 Cơ chế tác dụng kháng sinh 10 Hình 1.8 Cơ chế kháng thuốc vi khuẩn 14 Hình 1.9 Cấu tạo phân tử kháng sinh nhóm carbapenem 18 Hình 1.10 Biểu đồ khuếch đại kết phản ứng real-time PCR .20 Hình 2.1 Máy Phoenix-100 .24 Hình 2.2 Panel định danh kháng sinh đồ 25 Hình 2.3 Máy real-time PCR hãng BioRad 31 Hình 2.4 Hình ảnh kết phát gen blaKPC blaNDM-1của K.pneumoniae 31 Hình 2.5 Hình ảnh kết phát gen blaKPC .32 DANH MỤC CÁC SƠ ĐỒ Sơ đồ 2.2 Xử lí bệnh phẩm dịch, mủ - vết thương 28 Sơ đồ 2.3 Bệnh phẩm máu 28 Sơ đồ 2.4 Bệnh phẩm dịch thể .29 71 KẾT LUẬN Qua nghiên cứu 329 chủng trực khuẩn gram âm gây bệnh thường gặp phân lập Bệnh viện Quân Y 175 từ 11/2017 đến 6/2018, chúng tơi có kết luận sau: Tỉ lệ chủng trực khuẩn gram âm gây bệnh thường gặp  Trực khuẩn đường ruột: Klebsiella spp chiếm tỉ lệ cao 52,1% (n= 85), E.coli 19,7% (n= 32), Enterobacter spp 10,4% (n=17), Proteus spp 7,4% (n= 12) Các vi khuẩn khác chiếm tỉ lệ thấp 10,4 % (n= 17)  Trực khuẩn gram âm không lên men: Acinetobacter baumanniichiếm tỉ lệ cao 59% (n= 98), Pseudomonas aeruginosa29% (n= 48), Burkholderia cepacia 9% (n= 15)  Bệnh phẩm đường hô hấp: Acinetobacter baumanniilà tác nhân hàng đầu chiếm 34,0% (n= 83), Klebsiella pneumoniae30% (n= 75), Pseudomonas aeruginosa17% (n= 43), Enterobacterspp.4% (n=11) Các chủng vi khuẩn khác chiếm tỉ lệ thấp 6%  Bệnh phẩm dịch, mủ - vết thương: E.coli tác nhân hàng đầu chiếm 27% (n=13), Acinetobacterbaumannii17% (n= 8), Klebsiellapneumoniae Enterobacter spp 13% (n=6), Pseudomonas spp Proteus spp 10% (n= 5) số vi khuẩn khác  Bệnh phẩm máu: gặp nhiều E.coli 34% (n=11), Burkholderia cepacia21% Acinetobacter baumannii 21% (n=7), Klebsiella pneumoniae 12% (n=4) Đặc biệt có hai trường hợp cấy máu dương tính với Salmonella, trường hợp dương tính với Serratia trường hợp dương tính với Sphingomonas Kết kháng kháng sinh chủng trực khuẩn gram âm phân lập  Acinetobacter baumannii: đề kháng cao 80% với hầu hết nhóm kháng sinh, đặc biệt với nhóm kháng sinh dự trữ carbapenem Tác nhân Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 72 kháng thấp với colistin 5,8% nhạy với trimethoprimsulfamethoxazole với tỉ lệ 38,8%  Pseudomonas aeruginosa : kháng cao với aztreonam (76,6%), kháng 60% với fluoroquinolone, kháng cao với nhóm cephalosporin hệ III, IV (kháng ceftazidime 56,3%, kháng cefepime 63%) 56,3% kháng nhóm carbapenem; cịn nhạy cảm cao với piperacillin-tazobactam (nhạy 67,6%, kháng 16,2%) colistin (nhạy 65,7%, kháng 20%)  Burkholderia cepacia: nhạy cảm với fluoroquinolone (levofloxacin nhạy cảm 60%, kháng 33,3%), cephalosporin hệ (ceftazidime nhạy cảm 66,7%, kháng 33,3%); kháng thấp với meropenem ( 16,7%)  Klebsiella pneumoniae: kháng cao với nhóm cephalosporin (>70%), kháng > 60% với nhóm kháng sinh phối hợp beta-lactam/chất ức chế betalactamase, kháng 50-60% với kháng sinh nhóm carbapenem, fluoroquinolone, kháng thấp với tigercyclin (14,1%): nhạy cảm với amikacin (87,1%)  E.coli: kháng cao với kháng sinh nhóm cefalosporin (từ 65,6%-81,2%), fluoroquinolone (65,6%), trimethoprim-sulfamethoxazole (75%), kháng cao với nhóm kháng sinh kết hợp (ampicillin-sulbactam kháng 68,8%, ticarcilin-acid clavunalic kháng 43,8%), nhóm aminoglycoside (gentamycin 53,1%); kháng thấp với nhóm carbapenem (ertapenem 6,2%, imipenem 12,5%) amikacin 3,1% Khảo sát Klebsiella pneumoniae mang gen sinh men carbapenemase Với 14 chủng Klebsiella pneumoniae kháng carbapenem, bước đầu chúng tơi phát 8/14 chủng có mang gen mã hóa enzyme carbapenemase, số lượng vi khuẩn mang gen mã hóa KPC nhiều vi khuẩn mang gen mã hóa NDM-1 Có 5/8 chủng mang gen mã hóa KPC, 2/8 chủng mang gen mã hóa NDM1 đặc biệt có 1/8 chủng mang gen mã hóa loại enzyme Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 73 KIẾN NGHỊ Cần có thêm nhiều nghiên cứu thường xuyên, để kịp thời cập nhật thông tin tình hình đề kháng kháng sinh bệnh viện Từ giúp bác sĩ khoa lâm sàng có chiến lược sử dụng hợp lí kháng sinh ban đầu, thay đổi xuống thang kháng sinh theo kháng sinh đồ Tránh dùng đơn trị liệu kháng sinh cho vi khuẩn có tỉ lệ đề kháng cao Acinetobacter baumannii, Psedomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae Cần có nghiên cứu sâu gen mã hóa carbapenemase để có cảnh báo sớm, hạn chế khả lan rộng gen bệnh viện Tăng cường hợp tác chặt chẽ khoa lâm sàng khoa vi sinh nâng cao chất lượng thực giám sát nhiễm khuẩn bệnh viện Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn TÀI LIỆU THAM KHẢO Tài liệu tiếng việt Phạm Thị Hoài An tgk.“Khảo sát kháng kháng sinh Klebsiella pneumoniae bệnh phẩm phân lập Viện Pasteur TP Hồ Chí Minh”,Tạp chí khoa học Đại học Sư phạm Tp HCM, số 61 năm 2014, tr 146-155 Nguyễn Ngọc Tú Anh “ Các vi khuẩn thường gặp nhiễm khuẩn bệnh viện đề kháng kháng sinh bệnh viện Nhi đồng TP HCM từ 01/2012 đến 06/2012” Luận văn thạc sỹ y học, chuyên ngành Vi sinh y học, Đại học Y dược TP HCM Nguyễn Thanh Bảo (2016), “Thuốc kháng sinh” Vi khuẩn y học, Đại học Y Dược TP HCM, tr 47-65 Nguyễn Thanh Bảo (2014), “ Họ vi khuẩn đường ruột” Vi khuẩn y học, Đại học Y Dược TP HCM, tr 154-166 Nguyễn Thanh Bảo CS (2018) “Trực khuẩn Gram âm không lên men đường bệnh nhiễm khuẩn đề kháng kháng sinh”, Tạp chí YHọc TP HCM, Phụ Tập 22, Số 2, 2018, tr 149-153 Trần Minh Giang CS “Pseudomonas aeruginosa đa kháng: Kết nghiên cứu lâm sàng bệnh nhân viêm phổi thở máy”, Chuyên đề: Bệnh phổi, Hội hô hấp thành phố HCM, 9/2016 Lê Thị Ánh Phúc Nhi (2016) “Trực khuẩn Gram âm không lên men tính đề kháng kháng sinh Bệnh viện Đại học y dược TP Hồ Chí Minh từ 6/2015 đến 6/2016”, Luận văn thạc sĩ y học, Đại học y dược TP HCM Cao Minh Nga (2014) “ Đại cương vi khuẩn” Vi khuẩn y học, Đại học Y Dược TP HCM, tr 7-18 Cao Minh Nga (2014) “ Vi khuẩn Acinetobacter” Vi khuẩn y học, Đại học Y Dược TP HCM, tr 195-196 10 Cao Minh Nga (2016) “ Phương pháp phân lập vi khuẩn” Thực tập vi sinh y học, Đại học Y Dược TP HCM, tr 15-16 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 11 Cao Minh Nga CS (2013) “Sự kháng thuốc vi khuẩn gây bệnh thường gặp Bệnh viện Đại học y dược TP Hồ Chí Minh tháng đầu năm 2013”, Tạp chí y học TP HCM, tập 17, phụ số 1, 2013, tr 272-278 12 Cao Minh Nga, Nguyễn Thanh Bảo ”Sự đề kháng kháng sinh vi khuẩn gây nhiễm khuẩn bệnh viện đường hơ hấp TP Hồ Chí Minh”, Tạp chí Y Học TP HCM, Tập 18, Phụ Số 1, 2014, tr 318-323 13 Cao Minh Nga CS “Sự kháng thuốc vi khuẩn gây bệnh thường gặp Bệnh viện Đại học y dược TP.HCM tháng đầu năm 2012”, Tạp chí Y Học TP HCM, Tập số 17, Phụ Số 1, 2013, tr 272-279 14 Trần Thị Thanh Nga “ Vi khuẩn Gram âm đa kháng thách thức điều trị nay” Bài giảng 15 Trần Thị Thanh Nga (2010), “Đặc điểm nhiễm khuẩn đề kháng kháng sinh bệnh viện Chợ Rẫy năm 2009-2010”, Tạp chí Y Học TP Hồ Chí Minh, Tập 15, Phụ Số 4, 2011, tr 545-549 16 Trần Thị Thanh Nga (2014) “Tác nhân gây nhiễm khuẩn huyết khuynh hướng đề kháng kháng sinh năm từ 2008-2012 Bệnh viện Chợ Rẫy” Tạp chí Y Học TP HCM, Tập số 18, Phụ Số 2, 2014, tr 485-490 17 Trần Văn Ngọc CS “Khảo sát đặc điểm kháng thuốc Pseudomonas aeruginosa Acinetobacter baumannii gây viêm phổi bệnh viện”, Tạp chí Thời y học, 03/2017, tr 64-70 18 Lê Thị Kim Nhung, Nguyễn Ngọc Khánh “Một số đặc điểm lâm sàng tác nhân gây bệnh nhiễm khuẩn huyết người cao tuổi”, Tạp chí Y Học TP Hồ Chí Minh, Tập số 18, Phụ Số 3, 2014, tr 192-197 19 Nguyễn Ngọc Lân CS “Sự kháng thuốc vi khuẩn gây bệnh thường gặp bệnh phẩm đường hô hấp bệnh viện Đại học Y dược TP.HCM năm ( 1.5.2015-30.4.2016)”, Tạp chí Y Học TP Hồ Chí Minh, Tập 21, Phụ Số 1, 2017, tr 132-140 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 20 Dương Hồng Phúc, Hoàng Tiến Mỹ (2010).” Sự đề kháng kháng sinh vi khuẩn phân lập Bệnh viện Đại học Y dược TP.Hồ Chí Minh” Tạp chí y học TP HCM, Tập 14- Phụ số 1-2010, tr 480-486 21 Trần Nhật Phương “Nghiên cứu đặc điểm sinh học phân tử Klebsiella pneumoniae kháng carbapenem qua chế KPC”, Luận án nghiên cứu sinh, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, ĐH Quốc gia TP HCM 22 Trần Thị Thủy Trinh, Nguyễn Thanh Bảo (2014) “Tình hình đề kháng kháng sinh vi khuẩn gây bệnh phân lập Bệnh viện An Bình từ 01/10/2012 đến 31/5/2013”, Tạp chí Y Học TP HCM, Tập số 18, Phụ Số 1, 2014, tr 297-333 23 Phạm Hùng Vân “ Vi khuẩn Gram âm đề kháng kháng sinh thực trạng Việt Nam điểm biện luận đề kháng” 24 Phạm Hùng Vân nhóm nghiên cứu MIDAS(2009) “ Nghiên cứu đa trung tâm tình hình đề kháng imipenem meropenem trực khuẩn gram âm dễ mọc- kết 16 bệnh viện Việt Nam” Tạp chí Y học TP Hồ Chí Minh tập 14- Phụ số 2, tr 279-286 25 Phạm Hùng Vân (2009) “PCR real-time PCR Các vấn đề thường gặp”, Nhà xuất Y học, TP HCM 26 Chăn Phon Phôn Ha Vông (2017).“Nghiên cứu đặc điểm phân bố mức độ kháng kháng sinh vi khuẩn gây bệnh nổi, tái bệnh viện Quân y 103 (1-2015 đến 12-2017)”, Tạp chí y-dược học Quân sự, Số 52018, tr 64-71 27 Lý Văn Xuân (2008) “Họ vi khuẩn đường ruột” Vi khuẩn học, Nhà xuất Y học, tr 155-165 28 Lý Văn Xuân (2014) “ Vi khuẩn Pseudomonas” Vi khuẩn y học, Đại học Y Dược TP.HCM, tr 188-192 29 Nguyễn Thị Hải Yến “Khảo sát tình hình sử dụng kháng sinh Bệnh viện Trung ương Quân đội 108”, Khóa luận tốt nghiệp dược sỹ, 2013 Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 30 Chu Thị Hải Yến CS, “Khảo sát tỉ lệ đề kháng kháng sinh vi khuẩn phân lập Bệnh viện cấp cứu Trưng Vương”,Tạp chí Y Học TP HCM, Tập số 18, Phụ Số 5, 2014, tr 75-83 Tài liệu tiếng anh 31 ABC News, 28 feb 2017, Reuters “Super bugs: WHO says new drugs urgently needed to fight 12 bacteria families” 32 Abdallah HM, Wintermans BB, Reuland EA, Koek A, Al Naiemi N, Ammar AM, Mohamed AA, Vandenbroucke-Grauls CMJE (2015), “Extended spectrum -lactamase and carbapenemase-producing Enterrobacteriaceae isolated from egyptian patients with suspected blood stream infection” PloS one, 10 (5), e0128120 33 Aseem R, Shenoy S, Mala SS, Baliga S, Ashish A.J Clin Diagn Res “Approach to Carbapenemase Detection inKlebsiella pneumoniae in Routine Diagnostic Laboratories” 2016 Dec; 10(12): DC24DC27.doi: 10.7860/JCDR/2016/23036.9026 Epub 2016 Dec 34 Castanheira M, Deshpande LM, Mathai D, Bell JM, Jones RN, Mendes RE “Early dissemination of NDM-1- and OXA-181- producing Enterobacteriaceae in Indian hospitals”, Report from the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program, 2006–2007 Antimicrob Agents Chemother 2011; 55 :1274–8 10.1128/AAC.01497-10 35 CDC (2017) Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) infection: clinician FAQs 36 CDC “Burkholderia cepacia in Healthcare Settings” https://www.cdc.gov/hai/organisms/bcepacia.html 37 CDC (2011) “Multiplex Real-time PCR Detection of Klebsiella pneumoniae Carbapenemase (KPC) and New Delhi metalo--lactamase (NDM-1) genes” Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 38 Centers for Disease Control and Prevention Antibiotic resistance threats in the United States, 2013 [cited 2014 Sept 15] http://www.cdc.gov/drugresistance/threat-report-2013/index.html 39 Clinical and Laboratory Standards Institute – CLSI 2016 40 Clinical and Laboratory Standards Institute – CLSI(2017) Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; 26th Informational Supplement 41 D Yong, M.A Toleman, C.G Giske, H.S Cho, K Sundman, K Lee, T Walsh, “Characterization of a new metallo-beta-lactamase gene, bla (NDM-1), and a novel erythromycin esterase gene carried on a unique genetic structure in Klebsiella pneumoniae sequence type 14 from India” Antimicrob Agents Chemother, 53, 12, 5046–5054 (2009) 42 Hasan Ghajavand, Bahram Nasr Esfahani, Seyed Asghar Havaei, Sharareh Moghim, Hossein Fazeli (2015), “Molecular identification of Acinetobacter baumannii isolated from intensive care units and their antimicrobial resistancepatterns”, Adv Biomed Res, 4, pp110 43 HUAPA, Cumana, Venezuela.(2016) “ Aminoglycoside ressistance genes in Pseudomonas aeruginosa isolate from Cumana Venezuela” http://dx.doi:org/10.1590/S1678-9946201658013 44 I.J.Clifton, L.X.Doan, M.C.Sleeman, M Topf, H Suzuki, R.C.Wilmouth, C.J Schofield(2003) “ Crystal structure of carbapenem synthase( CarC)” The journal of biological chemistry, 20843-50 45 Karlowsky James A, Lob Sibylle H, Kazmierczak Krystyna M, Badal Robert E, Young Katherine, Motyl Mary R, Sahm Daniel F (2017) “ In vitro activity of imipenem against carbapenemase-positive Enterobacteriaceae isolates collected by the smart global surveillance program from 2008 to 2014”, J Clin Microbiol, 55 (6), pp 1638-1649 46 L.N Andrade,T Curiao et al., “Dissemination of bla KPC-2 by the Spread of Klebsiella pneumoniae clonal complex 258 Clones (ST258, ST11, ST437) Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn and plasmids (IncFII, IncN, IncL/M) among Enterobacteriaceae Species in Brazil”, Antimicrobialagents and Chemotherapy, 3579–3583 (2011) 47 Lee C R, Lee J H, Park K S, Kim Y B, Jeong B C, Lee S H (2016) “Global dissemination of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae: Epidemiology, genetic context, treatment options and detection methods”, Front Microbiol, 7, pp.895 48 Lee Jung Hun, Bae Il Kwon, Hee Lee Sang (2012), “ New definitions of extended- spectrum beta-lactamase conferring worldwide emerging antibiotic resistance” Medical research reviews, 32(1), 216-232 49 Liu YN, Cao B, Wang H, Chen LA, She DY(2010), “Adult hospital acquired pneumonia: a multicenter study on microbiology and clinical characteristics of patients from Chinese cities”, Clin Infect Dis, 35(10), pp 739-746 50 Morrissey I., Hackel M., Badal R., Bouchillon S., Hawser S., Biedenbach D ( 2013), “ A review of ten years of the study for monitoring Antimicrobial Risistance Trends(SMART) from 2002 to 2011”, Pharmaceuticals (Basel), 1335-46 51 Munoz-Price LS, Poirel L, Bonomo RA, Schwaber MJ, Daikos GL, Cormican M, et al “Clinical epidemiology of the global expansion of Klebsiella pneumoniaecarbapenemases” Lancet Infect Dis 2013; 13: 78596.10.1016/S1473-3099(13)70190-7 52 O’Neill Jim (2016) “Tackling drug-resistant infections globally: Final report and recommendations” 53 Pesesky MW, Hussain T, Wallace M, Wang B, Andleed S, Burnham CD, et al “KPC and NDM-1 genes in related Enterobacteriaceae strains and plasmids from Pakistan and the United States” Emerg Infect Dis 2015 Jun [ date cited ].http://dx.doi.org/10.3201/eid2106.141504 54 Queenan AM, Busk K, “Carbapenemases: The versatile beta-lactamase”, Clin Microbiol Rev 2007; 20:440-58 55 Shalini Anandan, Sunganya Damodaran, Radha Gopi, Yamuna Devi Bakthavatchalam, Balaji Veeraraghavan “Rapid Screening for Carbapenem Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn Resistant Organisms: Current Results and Future Approaches” Microbiology Section DOI : 10.7860/JCDR/2015/14246 Volume 9, Issue 9, pp DM01-DM03 56 Tada T, Tsuchiya M, Shimada K, Nga T.T.T, Thu L.T.A, Phu T.T, Ohmagari N, Kirikae T (2017) “ Dissemination of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae clinical isolates with various combinations of Carbapenemases (KPC-2, NDM-1, NDM-4, and OXA -48) and 16S rRNA Methylases (RmtB and RmtC) in Vietnam”, BMC Infect Dis, 17 (1), pp 467 57 V Cattoir (2016) Mechanisms of Antibiotic Resistance IN Ferretti, J.J., Stevens, D.L.,Fischetti, V.A (Eds.) Streptococcus pyogenes: Basic Biology to Clinical Manifestations Oklahoma City 58 Van Duin D, Doi Y (2017).“The Global epidemiology of carbapenemaseproducingEnterobacteriaceae”, Virulence, (4), pp 460-469 59 Ventola C Lee (2015), “ The antibiotic resistance crisis”, P&T, 40(4), pp 277-283 60 World Health Organization (2014), WHO’s first global report on antibiotic resistance reveals serious, worldwide threat to public health Antimicrobial resistance – global surveillance report Virtual Press Conference 61 World Health Organization (2015), “Worldwide country situation analysis: response to antimicrobial resistance” 62 Zhongjie Liang ,Lianchun Li , Yuanyuan Wang , Limin Chen , Xiangqian Kong , Yao Hong , Lefu Yang , HongLiu , Xu Lan , Mingyue Shen , Cheng Zheng , Cai Luo , Keqin Guang- Kathy Li , Kaixian Chen , and Hualiang Jiang “ Molecular Basis of NDM-1, a New Antibiotic Resistance Determinant” https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3161043/ PHỤ LỤC Các xét nghiệm sinh hóa giếng thẻ định danh Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn TÊN PHẢN ỨNG STT KÍ HIỆU L-Phenylalanine - AMC 4MU-N-Acetyl-BD-Glucosamine M-NAG L-glutamic acid- AMC A-LGTA L-Tryptophan-AMC A-LTRY L-Pyroglutamic acid- AMC A-LPYR L-Proline- AMC A-LPROB L-Arginine- AMC A-LARGH Arginine-Arginine-AMC A-ARARR Glycine- AMC 10 L-Leucine- AMC A-LLEUH 11 Lysine-Alanine- AMC A-LYALD 12 Glutaryl-Glycine-Arginine- AMC A-GUGAH 13 Glycine-Proline- AMC A-GLPRB 14 Colistin 15 Polymyxin B 16 D-mannitol 17 Citrat C-CIT 18 Acetate C-ACT 19 Adonitol C-ADO 20 Malonate C-MLO 21 Anpha-Ketoglutaric acid C-KGA 22 Tiglic acid C-TIG 23 Fluorescent positive control FLR-CTL 24 L-Proline-NA N-LPROT Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn A-LPHET A-GLYB C-CLST C-PXB C-DMNT 25 Gamma-L-Glutamyl-NA N-LGGH 26 BIS phosphate P-BPHO 27 PNP-BD-Glucoside 28 Beta-Allose R-BALL 29 N-Acetyl-Galactosamine R-NGA 30 N-Acetyl-Glucosamine R-NGU 31 Sorbitol R-DSBT 32 Sucrose R-DSUC 33 Galacturonic acid R-GRA 34 Maltulose R-MTU 35 L-Rhamnose R-LRHA 36 Beta-gentiobiose R-BGEN 37 Dextrose 38 D-Galactose R-DGAL 39 D-Fructose R-DFRU 40 D-Gluconic acid R-DGUA 41 D-Melibiose R-DMLB 42 L-arabinose R-LARA 43 Methyl-B-Glucosid R-MBGU 44 Ornithine S-ORN 45 Urea S-URE 46 Esculin T-ESC Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn P-BDGLU R-DEX PHỤ LỤC Danh mục kháng sinh Panel trực khuẩn gram âm STT TÊN KHÁNG SINH KÍ HIỆU Amikacin Ampicillin/Sulbactam SAM Aztreonam ATM Cefazolin CZ Cefepime FEP Cefoperazone/Sulbactam SCP Cefoxitin FOX Ceftazidime CAZ Ceftriaxone CRO AN 10 Ciprofloxacin CIP 11 Colistin CL 12 Ertapenem ETP 13 Gentamycin GM 14 Imipenem IPM 15 Levofloxacin LVX 16 Meropenem MEM 17 Piperacilin/Tazobactam TZP 18 Ticarcillin/Clavulanate TIM 19 Tigecycline TGC 20 Trimethoprim/Sulfamethoxazole SXT 21 Cefotaxime/Clavulanate( ESBL) CCX 22 Ceftazidime/Clavulanate( ESBL) CCZ 23 Cefpodoxime-proxetil ( ESBL) CPD 24 Ceftazidime ( ESBL) CAZ Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn 25 Ceftriaxone/Clavulanate ( ESBL) CCR PHỤ LỤC PHIẾU ĐIỀU TRA SỐ LIỆU Mẫu số: Họ tên : Năm sinh : Giới tính : 1.Nam Nữ Số xét nghiệm : Bệnh phẩm: Máu Đàm Mủ, dịch tiết Dịch thể Các bệnh phẩm khác Kết nuôi cấy Kết kháng sinh đồ Tên kháng sinh MIC (g/ml) Amikacin Gentamycin Ertapenem Imipenem Meropenem Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn S R I Ghi Cefazolin Cefoxitin Ceftazidime Ceftriaxone Cefepime Cefoperazone/Sulbactam Aztreonam Ampicillin/Sulbactam Ticarcillin/Clavulante Piperacillin/Tazobactam Colistin Trimethoprim/Sulfamethoxazole Ciprofloxacin Levofloxacin Tigecycline Tuân thủ Luật Sở hữu trí tuệ Quy định truy cập tài liệu điện tử Ghi rõ nguồn tài liệu trích dẫn ... hành đề tài: ? ?Sự đề kháng kháng sinh chủng trực khuẩn Gram âm g? ?y bệnh thường gặp bệnh viện Quân y 175 từ 11/ 2017 đến 6/ 2018? ?? MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU Xác định tỉ lệ chủng trực khuẩn Gram âm g? ?y bệnh. .. TẠO BỘ Y TẾ ĐẠI HỌC Y DƯỢC THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - LÊ TH? ?Y DƯƠNG SỰ ĐỀ KHÁNG KHÁNG SINH CỦA CÁC CHỦNG TRỰC KHUẨN GRAM ÂM G? ?Y BỆNH THƯỜNG GẶP TẠI BỆNH VIỆN QUÂN Y 175 TỪ 11/ 2017 ĐẾN 6/ 2018 Ngành:... sinh- Bệnh viện Quân y 175 Bộ Quốc phòng - Thời gian: từ tháng 11/ 2017 đến 6/ 2018 2.3 Đối tượng nghiên cứu Các chủng trực khuẩn gram âm thường gặp phân lập khoa Vi sinh Bệnh viện Quân y 175 từ