Luận văn thạc sĩ Di truyền học, Ký sinh trùng, Bệnh sốt rét, Tính đa hình

Đại học quốc gia hà nội Tr-ờng đại học khoa học tự nhiên Tr-ơng Văn Hạnh Nghiên cứu tính đa hình di truyền ký sinh trùng sốt rét tính kháng thuốc sốt rét Plasmodium falciparum số tỉnh biên giới thuộc khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam Luận án tiến sĩ sinh học Hà Nội - 2013 Đại học quốc gia hà nội Tr-ờng đại học khoa học tự nhiên Tr-ơng Văn Hạnh Nghiên cứu tính đa hình di truyền ký sinh trùng sốt rét tính kháng thuốc sốt rét Plasmodium falciparum số tỉnh biên giới thuộc khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam Chuyên ngành: Di truyền học Mà sè: 62 42 70 01 LuËn ¸n tiÕn sÜ sinh học Ng-ời h-ớng dẫn khoa học: PGS.TS Trịnh Đình Đạt PGS.TS Hồ Đình Trung Hà Nội - 2013 Lời cam đoan Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu thân Các số liệu, kết luận án trung thực ch-a đ-ợc công bố công trình tài liệu Tác giả Tr-ơng Văn Hạnh Lời cảm ơn Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Trịnh Đình Đạt, PGS.TS Hồ Đình Trung đà tận tình h-ớng dẫn, giúp đỡ suốt trình học tập nghiên cứu Tôi vô biết ơn cố PGS.TS Nguyễn Đức Mạnh, Thầy đà h-ớng dẫn giúp đỡ năm đầu học tập nghiên cứu sinh thực đề tài nghiên cứu Tôi xin trân trọng cảm ơn LÃnh đạo Viện Sốt rét-KST-CTTƯ đà tạo điều kiện thuận lợi, ủng hộ vật chất, thời gian tinh thần trình thực luận án Tôi xin trân trọng cảm ơn thầy cô Bộ môn Di truyền, thầy cô Khoa Sinh học, Phòng Đào tạo Sau đại học, thầy cô Ban giám hiệu Tr-ờng Đại học Khoa học Tự nhiên đà tận tình giúp đỡ trình học tập Tr-ờng Tôi xin chân thành cảm ơn tập thể cán nghiên cứu Khoa Sinh học Phân tử cán Khoa/Phòng Viện Sốt rét-KST-CTTƯ, cán Trung tâm phòng chống sốt rét tỉnh Quảng Bình, Quảng Trị Thừa Thiên Huế đà giúp đỡ, ủng hộ động viên trình học tập thực đề tài phòng thí nghiệm nh- địa điểm nghiên cứu Cảm ơn gia đình thân yêu bạn bè đà động viên, giúp đỡ, tạo điều kiện cho học tập nghiên cứu Tr-ơng Văn Hạnh Mục Lục Mở Đầu Ch-ơng 1- Tổng quan tài liệu 1.1 BÖnh sèt rÐt 1.2 Các loài ký sinh trùng gây bệnh sèt rÐt ë ng-êi 1.2.1 Thành phần loài ký sinh trùng gây bệnh sốt rét ë ng-êi 1.2.2 Chu kú ph¸t triĨn cđa ký sinh trïng sèt rÐt 1.3 Muỗi truyền bệnh sốt rét 1.4 Tình hình sốt rét giới ViÖt Nam 1.4.1 Tình hình sốt rét giới 1.4.2 T×nh h×nh sèt rÐt t¹i ViƯt Nam 10 1.4.3 Đặc điểm điều kiện tự nhiên, kinh tế xà hội tình hình sốt rét tỉnh biên giới thuộc khu vực Bắc Tr-êng S¬n, ViƯt Nam 12 1.5 Mét số kỹ thuật sử dụng chẩn đoán, phân biệt loµi KSTSR 15 1.5.1 Kü tht xÐt nghiƯm lam m¸u nhuém giemsa 15 1.5.2 Kỹ thuật chẩn đoán nhanh que thử (Rapid diagnostic test) 16 1.5.3 Kü thuËt PCR chÈn đoán, phân biệt bốn loài ký sinh trùng sốt rét 16 1.6 Nghiên cứu tính đa hình di truyền cña ký sinh trïng sèt rÐt 19 1.6.1 §a h×nh di trun cđa P falciparum 19 1.6.2 Đa hình di truyền P vivax 25 1.7 Ký sinh trïng sèt rÐt kh¸ng thuèc 28 1.7.1 Định nghĩa phân loại ký sinh trùng sốt rét kháng thuốc 28 1.7.2 Mét sè lo¹i thc sư dụng điều trị bệnh sốt rét 29 1.7.3 Tình hình KSTSR kháng thuốc giới Việt Nam 31 1.7.4 Cơ chế tác động thuốc sốt rét KSTSR 35 1.7.5 §ét biÕn gen P falciparum liên quan đến kháng thuốc sốt rét 38 i 1.7.6 Một số kết nghiên cứu phân tích đột biến gen P falciparum kháng thuốc sèt rÐt 41 Ch-ơng - Đối t-ợng, vật liệu Và ph-ơng pháp nghiên cứu 43 2.1 Đối t-ợng nghiên cứu 43 2.2 Địa điểm thời gian nghiên cứu 43 2.2.1 Địa điểm nghiên cứu 43 2.2.2 Thêi gian nghiªn cøu 43 2.3 VËt liƯu nghiªn cøu 43 2.3.1 Dơng vµ hãa chÊt cho kü tht xÐt nghiƯm lam m¸u 43 2.3.2 Thiết bị hóa chất tách chiết ADN 43 2.3.3 ThiÕt bÞ, dơng cụ hóa chất để tiến hành phản ứng PCR 44 2.3.4 Thiết bị, dụng cụ hóa chất cho điện di phân tích kết PCR 45 2.4 Ph-ơng pháp nghiên cứu 45 2.4.1 ThiÕt kÕ nghiªn cøu 45 2.4.2 MÉu nghiªn cøu 45 2.4.3 Các kỹ thuật sử dụng nghiên cứu 47 2.4.4 Cách đánh giá kết qu¶ 58 2.4.5 Công thức tính số phân tích số liệu nghiên cứu 60 Ch-ơng - Kết thảo Luận 62 3.1 Thành phần, cấu loài KSTSR tỉnh Quảng Bình, Quảng Trị Thừa Thiên Huế thuộc khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam 62 3.1.1 Kết xác định thành phần, cấu loài KSTSR kỹ thuật xÐt nghiƯm lam m¸u nhm giemsa 62 3.1.2 Kết xác định thành phần, cấu loài KSTSR kỹ thuật PCR 64 ii 3.2 Tính đa hình di truyền quần thể P falciparum khu vực Bắc Tr-êng S¬n, ViƯt Nam 71 3.2.1 Tính đa hình di truyền cña P falciparum theo locus msp1 71 3.2.2 Tính đa hình di truyền P falciparum theo locus msp2 79 3.2.3 Tính đa hình di trun cđa P falciparum theo locus glurp 86 3.3 Tính đa hình di truyền P vivax khu vực Bắc Tr-ờng sơn, Việt Nam 89 3.3.1 Tính đa hình di truyền P vivax theo locus Pvcs 89 3.3.2 TÝnh ®a h×nh di trun theo locus Pvmsp1 93 3.4 Đặc điểm KSTSR kháng thuốc tỉnh Quảng Bình, Quảng Trị Thừa Thiên Huế thuộc khu vực Bắc Tr-ờng Sơn Việt Nam 97 3.4.1 Tû lƯ ®ét biÕn cđa P falciparum kháng thuốc pyrimethamin 97 3.4.2 Tỷ lệ đột biÕn cđa P falciparum kh¸ng thc sulfadoxin 101 3.4.3 Tỷ lệ đột biến P falciparum kháng thuốc chloroquin 106 KếT LUậN Và KIếN NGHị 112 KÕt luËn 112 KiÕn nghÞ 113 Danh mục công trình khoa học liên quan đến Néi dung luËn ¸n 114 Tài liệu tham khảo 115 Phô lôc 138 iii Danh mơc b¶ng B¶ng 1.1 Tình hình sốt rét khu vực Tây Thái Bình D-ơng năm 2008 11 Bảng 1.2 Tình hình sốt rét theo khu vực Việt Nam năm 2006 2010 12 Bảng 1.3 Tình hình sốt rét khu vực Bắc Tr-ờng Sơn năm 2008 2011 15 Bảng 1.4 Thành phần tên số thuèc sèt rÐt 30 B¶ng 1.5 Thời gian KSTSR P falciparum kháng với loại thuốc sốt rét 33 Bảng 1.6 Đột biến điểm gen dhfr P falciparum liên quan đến kháng pyrimethamin 38 Bảng 1.7 Mối liên quan đột biến điểm gen dhfr đáp ứng với pyrimethamin in vitro cđa mét sè chđng, ph©n lËp chn 39 Bảng 1.8 Đột biến điểm gen dhps P falciparum liên quan đến kháng sulfadoxin 40 Bảng 1.9 Mối liên quan đột biến điểm gen dhps đáp ứng với sulfadoxin in vitro cđa mét sè chđng, ph©n lËp chn 40 Bảng 2.1 Trình tự cặp mồi nhân kiểu gen P falciparum 50 Bảng 2.2 Trình tự cặp mồi xác định kiểu gen nhạy đột biến vị trí đột biến gen dhfr 54 Bảng 2.3 Trình tự cặp mồi xác định kiểu gen nhạy đột biến vị trí đột biến gen dhps 56 B¶ng 3.1 Tû lƯ ng-ời dân mắc sốt rét tỉnh Quảng Bình, Quảng Trị Thừa Thiên Huế kỹ thuật xét nghiệm lam máu nhuộm giemsa 62 Bảng 3.2 Kết xác định tỷ lệ nhiễm đơn, nhiễm phối hợp loài KSTSR kỹ thuật xét nghiệm lam máu nhuộm giemsa 63 Bảng 3.3 Cơ cấu loài KSTSR khu vực Bắc Tr-ờng Sơn kü tht xÐt nghiƯm lam m¸u nhm giemsa 64 B¶ng 3.4 Tû lệ phát bệnh nhân nhiễm đơn, nhiễm phối hợp loµi KSTSR theo kü thuËt PCR 65 B¶ng 3.5 So sánh tỷ lệ bệnh nhân nhiễm đơn nhiễm phối hợp khu iv vực Bắc Tr-ờng Sơn Việt Nam 67 Bảng 3.6 Cơ cấu loài KSTSR khu vực Bắc Tr-ờng Sơn theo kỹ thuật xét nghiệm lam máu nhuộm giemsa vµ PCR 69 Bảng 3.7 Tỷ lệ phân bố kiểu gen cđa P falciparum theo locus msp1 71 B¶ng 3.8 Tỷ lệ mẫu nhiễm đơn nhiễm phối hợp kiểu gen theo locus msp1 72 Bảng 3.9 Tần suất xuất hiƯn cđa c¸c alen ë kiĨu gen K1 73 Bảng 3.10 Tần suất xuất alen kiểu gen MAD20 75 Bảng 3.11 Tỷ lệ phân bố kiểu gen P falciparum theo locus msp2 79 Bảng 3.12 Tần suất xt hiƯn cđa c¸c alen ë kiĨu gen FC 81 Bảng 3.13 Tần suất xuất cđa c¸c alen ë kiĨu gen IC 83 Bảng 3.14 Số l-ợng tần suất alen theo locus glurp 86 B¶ng 3.15 Số l-ợng tần suất alen P vivax theo locus Pvcs 90 B¶ng 3.16 Tû lƯ kiểu gen nhiễm đơn, nhiễm phối hợp theo locus Pvcs 91 Bảng 3.17 Tần suất c¸c alen cđa P vivax theo locus Pvmsp1 95 B¶ng 3.18 Kết phân tích đột biến gen dhfr P falciparum 98 B¶ng 3.19 Tû lƯ mÉu bệnh nhân nhạy, kháng với pyrimethamin 98 Bảng 3.20 Tỷ lệ P falciparum mang kiểu gen nhạy đột biến kháng pyrimethamin quần thể 99 B¶ng 3.21 Sè l-ợng đột biến điểm mức độ đáp ứng với pyrimethamin 100 Bảng 3.22 Kết phân tích đột biến gen dhps 102 Bảng 3.23 Tỷ lệ mẫu bệnh nhân nhạy, kháng với sulfadoxin 103 B¶ng 3.24 Tû lƯ P falciparum mang kiểu gen nhạy đột biến kháng với thuốc sulfadoxin qn thĨ 109 Bảng 3.25 Số l-ợng đột biến điểm mức độ đáp ứng với sulfadoxin 105 Bảng 3.26 Kết phân tích đột biến điểm 76 gen Pfcrt 106 B¶ng 3.27 Tû lƯ mÉu bƯnh nhân nhạy, kháng với thuốc chloroquin 107 Bảng 3.28 Tỷ lệ P falciparum mang kiểu gen nhạy, kiểu gen đột biến kháng với thuốc chloroquin quần thể 107 v Danh môc hình Hình 1.1 Chu trình phát triển ký sinh trïng sèt rÐt H×nh 1.2 Bản đồ quốc gia vùng lÃnh thổ có lan truyền sốt rét năm 2012 10 Hình 1.3 Bản đồ địa hình khu vực Bắc Tr-ờng Sơn 13 Hình 1.4 Sơ đồ cấu trúc locus msp1 P falciparum 19 Hình 1.5 Sơ đồ cấu tróc locus msp2 cđa P falciparum 20 Hình 1.6 Sơ đồ mô tả cấu trúc locus Pvcs cña P vivax 26 Hình 1.7 Sơ đồ mô tả cấu trúc locus Pvmsp1 cđa P vivax 26 H×nh 1.8 Tác động pyrimethamin sulfadoxin lên enzym dihydrofolate reductase dihydropteroate synthase chu trình sinh tổng hợp axit folic 36 Hình 1.9 (A,B) Cơ chế tác động chloroquin lysosome KST 37 Hình 2.1 Sơ đồ kỹ thuật PCR lồng chẩn đoán, phân biệt loài KSTSR 49 Hình 2.2 Sơ đồ kỹ thuật PCR xác định kiểu gen P falciparum 51 Hình 3.1 ảnh in di sn phẩm PCR mẫu bệnh nh©n nhiễm đơn P falciparum P vivax 66 Hình 3.2 ảnh điện di sn phm PCR mu bnh nhân nhim phối hợp 2, loµi KSTSR 66 Hình 3.3 Tỷ lệ bệnh nhân nhiễm đơn nhiễm phối hợp theo kỹ thuật xét nghiệm lam máu nhuộm giemsa PCR 67 Hình 3.4 Biểu đồ cấu loài KSTSR khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam 68 Hình 3.5 Biểu đồ biểu diễn phân bố kiểu gen theo locus msp1 .72 Hình 3.6 Biểu đồ tần suất xuất alen kiểu gen K1 74 Hình 3.7 ảnh điện di s¶n phÈm PCR mét sè mÉu nhiƠm kiĨu gen K1 74 Hình 3.8 Biểu đồ tần suất xuất cđa c¸c alen ë kiĨu gen MAD20 76 vi 122 Paganotti G.M., Babiker H.A., Modiano D., Sirima B.S., Verra F., Konate A., Ouedraogo A.L., Diarra A., Mackinnon M.J., Coluzzi M., and Walliker D (2004), “ Genetic complexity of Plasmodium falciparum in two ethnic groups of Burkina Faso with marked differences in susceptibility to malaria” , Am J Trop Med Hyg 71(2), pp 173-178 123 Petersen I., Eastman R., Lanzer M (2011), “ Drug-resistant malaria: Molecular mechanisms and implications for public health” , FEBS Letters 585, pp 1551-1562 124 Peterson D.S., Walliker D., Wellems T.E (1988), “ Evidence that apoint mutation in dihydrofolate reductase-thymidylate synthase confers resistance to pyrimethamine in falciparum malaria” , Proc Natl Acad Sci USA 85, pp 9114-9118 125 Plowe C.V., Djimde A., Bouare M., Doumbo O., Wellems T.E 1995a, (Pyrimethamine and proguanil resistance– conferring mutations in Plasmodium falciparum dihydrofolate reductase: polymerase chain reaction methods for surveillance in Africa” , Am J Trop Med Hyg 52, pp 565-568 126 Plowe C.V., Cortese J.F., Djimde A., Nwanyanwu O.C., Watkins W.M., Winstanley P.A., Estrada-Franco J.G., Mollinedo R.E., Avila J.C., Cespedes J.L., Carter D., Doumbo O.K (1997), “ Mutations in Plasmodium falciparum dihydrofolate reductase and dihydropteroate synthase and epidemiologic patterns of pyrimethamine-sulfadoxine use and resistance” , J Infect Dis 176(6), pp 1590-1596 127 Powell R.D., Brewer G.J., Alving A (1963), “ Chloroquine resistance of Plasmodium falciparum from Vietnam” , WHO-Mal 402, pp 379-392 128 Price R.N., Douglas N.M., Anstey N.M (2009), “ New developments in Plasmodium vivax malaria: severe disease and the rise of chloroquine resistance” , Curr Opin Infect Dis 22, pp 430-435 133 129 Qari S.H., Collins W.E., Lobel H.O., Taylor F., Lal A.A (1994), “ A study of polymorphism in the circumsporozoite protein of human malaria parasites” , Am J Trop Med Hyg 50(1), pp 45-51 130 Raman J., Little F., Roper C., Kleinschmidt I., Cassam Y., Maharaj R., and Barnes K.I (2010), “ Five years of large-scale dhfr and dhps mutation surveillance following the phased mmplementation of Artesunate plus Sulfadoxine-Pyrimethamine in Maputo province, Southern Mozambique” , Am J Trop Med Hyg 82(5), pp 788-794 131 Rie Isozumi, Haruki Uemura, Le Duc Dao, Truong Van Hanh, Nguyen Duc Giang, Ha Viet Vien, Bui Quang Phuc, Nguyen Van Tuan, and Shusuke Nakazawa (2010), “ Longitudinal Survey of Plasmodium falciparum Infection in Vietnam: Characteristics of Antimalarial Resistance and Their Associated Factors” , J Clin Microbiol 48(1), pp 70-77 132 Roper C., Elhassan I.M., Hvid L (1996), “ Detection of very low level Plasmodium falciparum infections using the nested polymerase chain reaction and a reassessment of the epidemiology of unstable malaria in Sudan” , Am J Trop Med Hyg 54, pp 325-331 133 Snewin V.A., England S.M., Sims P.F., Hyde J.E (1989), “ Characterisation of the dihydrofolate reductase-thymidylate synthetase gene from human malaria parasites highly resistant to pyrimethamine” , Gene 76(1), pp 41-52 134 Soulama I., Issa NÐbiÐ, Alphonse Ouédraogo, Adama Gansane, Amidou Diarra, Alfred B Tiono, Edith C Bougouma, Amadou T KonatÐ, Gustave B KabrÐ, Walter RJ Taylor, and Sodiomon B Sirima (2009), “ Plasmodium falciparum genotypes diversity in symptomatic malaria of children living in an urban and a rural setting in Burkina Faso” , Malaria Journal 8, pp 135 134 135 Snounou G., Bourne T., Jarra W., Viriyakosol S., Wood J.C., and Brown K.N (1992), “ Assessment of parasite population dynamics in mixed infections of rodent plasmodia” , Parasitology 105(3), pp 363-374 136 Snounou G., Viryakosol S., Jarra W., Thai Thong S., and Brown K.N (1993b), “ Identification of the four human malaria species in field samples by the polymerase chain reaction of the high prevalence of mixed infection” , Mol Biochem Parasitol 58, pp 283-292 137 Snounou G., Viryakosol S., Zhu X.P., Jarra W., Pinheiro L., Rosario V.E., Thai Thong S., and Brown K.N (1993c), “ High sensitivity of detection of human malaria parasites by the use of polymerase chain reaction” , Mol Biochem Parasitol 61, pp 315-320 138 Snounou G., Beck H.P (1998), “ The use of PCR genotyping in the assessment of recrudescence or reinfection after antimalarial treatment” , Parasitology Today 14, pp 462-467 139 Snounou G., Zhu X., Siripoon N., Jarra W., Thai Thong S., Brown N.K., and Viriyakosol S (1999), “ Biased distribution of MSP1 and MSP2 allelic variants in Plasmodium falciparum population in Thailand” , Trans R Soc Trop Med Hyg 93, pp 369-374 140 Tirasophon, Witoon, ponglikitmongkol, Mathurose, Wilairat, prapon, Boosaeng, Vichai, panyim, Sakol (1991), “ A novel detection of a single Plasmodium falciparum in infected blood” , Biochemical and Biophysical research communications 175, pp 179-184 141 Trigalia T and Cowman A.F (1994), “ Primary stucture and expression of the dihydropteroate synthetase gene of Plasmodium falciparum” , Proc Natl Acad Sci USA 91, pp 7149-7153 142 Viriyakosol S., Siripoon N., Petcharapirat C., Jarra W., Thai Thong S., Brown K.N., and Snounou G (1995), “ Genotyping of Plasmodium falciparum isolates by the polymerase chain raction and potential uses in 135 epidemiological studies” , Bulletin of the World Heath Organization 73(1), pp 85-95 143 Wallace P (1987), “ In: Chemotherapy and drug resitance in malaria” , Academic Press, London, UK, pp 829-844 144 Walliker, D., Carter, R & Sanderson, A (1975), “ Genetic studies on Plasmodium chabaudi: recombination between enzyme markers” , Parasitology 70, pp 19-24 145 Wang P., Darren R., Brooks, Paul F.G., Sims, Hyde J.E (1995), “ A mutation-specific PCR system to detect sequence variation in the DHPS gene of P falciparum” , Mol Biochem Parasitol 71, pp 115-125 146 Wang P., Read M., Sims P.F., Hyde J.E (1997), “ Sulfadoxine resistance in the human malaria parasite Plasmodium falciparum is determined by mutations in dihydropteroate synthetase and an additional factor associated with folate utilization” , Mol Microbiol 23, pp 979-986 147 Wernsdorfer W.H., and McGregor I (1988), “ The apparent transfer of pyrimethamine resistance from the B1 strain of P gallinaceum in the chicken” , In Malaria principles and Practice of Malariology 2, pp 1573 148 WHO (2001), “ Antimalarial drug combination therapy Report of a WHO technical consultation” , Geneva, World Health Organization 149 WHO (2006), “ Guidelines for the treatment of malaria” , Geneva, World Health Organization 150 WHO (2009a), “ Methods for surveillance of antimalarial drug efficacy” , Geneva, World Health Organization 151 WHO (2010), “ Global report on antimalarial drug efficacy and drug resistance: 2000-2010” , Geneva, World Health Organization 152 WHO (2011), “ World malaria report” , Geneva, World Health Organization 136 153 Wilkerson R (2009), “ Mosquito Classification” , Walter Reed Biosystematics Units online catalog, 91 pages 154 Zakeri S., Mehrizi A.A., Mamaghani S., Noorizadeh S., Snounou G., Djadid N.D (2006), “ Population structure analysis of Plasmodium vivax in areas of Iran with different malaria endemicity” , Am J Trop Med Hyg 74 pp 394-400 137 Phụ lục - Phụ lục 1: Kết xác định thành phần, cấu loài KSTSR tỉnh Quảng Bình, Quảng Trị Thừa Thiên Huế thuộc khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam - Phụ lục 2: Một số hình ảnh hoạt động nghiên cứu sinh thực địa - Phụ lục 3: Một số hình ảnh hoạt động nghiên cứu sinh phòng thí nghiệm 138 Phụ lục Kết xác định thành phần, cấu loài KSTSR tỉnh Quảng Bình, Quảng Trị Thừa Thiên Huế thuộc khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam Kí hiệu Kết phân tích PCR KÕt qu¶ XN TT mÉu cã Ghi chó F V M O giemsa KSTSR Kết phân tích mẫu thu thập tỉnh Quảng Bình B1 V V B2 F F B3 F F B4 F F B5 F F B6 F F V B7 V V B8 V V B9 V F V 10 B10 F F 11 B11 F F 12 B12 F F 13 B13 F F V 14 B14 F F 15 B15 F F 16 B16 V V 17 B17 V V 18 B18 F F 19 B19 F F 20 B20 F F V 21 B21 F F 22 B22 V V 23 B23 V F V 24 B24 F F 25 B25 F F 26 B26 F F 27 B27 FV F V 28 B28 FV F V 29 B29 F F 30 B30 F F 31 B31 V V 32 B32 V V 33 B33 F F 34 B34 V V TT 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 KÝ hiÖu Kết phân tích PCR Kết XN mẫu có giêm sa F V M O KSTSR Kết phân tích mẫu thu thập tỉnh Quảng Bình B35 F F B36 F F B37 F F V B38 F F B39 F V B40 V V B41 V V B42 V V B43 FV F V B44 F F B45 V V B46 F F B47 F F B48 F F V B49 F F B50 V V B51 F F B52 F F B53 V V B54 F F B55 F F V B56 F F V B57 F F B58 FV F V M B59 F F B60 F F B61 V V B62 F F B63 F F M B64 F F B65 F F V B66 F F V B67 F F B68 F F B69 V V B70 V V B71 V V Ghi chó TT 72 73 74 75 76 77 77 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 KÝ hiệu Kết phân tích PCR Kết XN mẫu có giêm sa F V M O KSTSR Kết phân tích mẫu thu thập tỉnh Quảng Bình B72 FV F V B73 V V B74 V V B75 F F B76 F F B77 V V B78 F F B79 F F V B80 V V B81 F F B82 F F B83 V V B84 V V B85 F F V B86 F F B87 V F V B88 F F B89 F F B90 V V B91 F F B92 F F V B93 F F B94 F F B95 V V B96 F F Kết phân tích mẫu thu thập tỉnh Quảng Trị T1 F F T2 F F T3 F F T4 F F T5 F F T6 F F T7 F F T8 F F T9 FV F V T10 V V T11 F F Ghi chó TT 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 124 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 KÝ hiƯu KÕt qu¶ phân tích PCR Kết XN mẫu có giêm sa F V M O KSTSR Kết phân tích mẫu thu thập Quảng Trị T12 F F T13 F F T14 V V T15 F F T16 V V T17 F F T18 V V T19 V V T20 F F T21 V V T22 V V T23 F F T24 V V T25 F F T26 V V T27 F F T28 FV F V T29 F F T30 V V T31 F F T32 F F T33 F F T34 V V T35 F F V T36 F F V T37 V V T38 V V T39 F F V T40 V V T41 FV F V T42 V V T43 F F T44 V V T45 F F V T46 F F T47 V V T48 F F V Ghi chó TT 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 Kí hiệu Kết phân tích PCR Kết XN mẫu có giêm sa F V M O KSTSR Kết phân tích mẫu thu thập tỉnh Quảng Trị T49 F F T50 V V T51 FV F V T52 F F T53 F F T54 V V T55 F F V T56 V V T57 V V T58 F F V T59 F F T60 F F T61 F F V T62 F F T63 F F T64 V V T65 F F T66 F F T67 F F T68 F F T69 FV F V T70 F F T71 F F V T72 V V T73 F F T74 F F T75 F F T76 V V T77 V V T78 F F T79 F F T80 F F V T81 V V T82 F F T83 F F T84 F F T85 F F Ghi chó TT 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 Kí hiệu Kết phân tích PCR Kết qu¶ XN mÉu cã Ghi chó F V M O giêm sa KSTSR Kết phân tích mẫu thu thập tỉnh Quảng Trị T86 V V T87 F F T88 F F T89 F F ` T90 FV F V T91 F F T92 V V T93 F F T94 F F T95 V V T96 F F T97 F F T98 F F V T99 F V T100 F F T101 F F T102 F F T103 F F T104 V V T105 F F T106 F F T107 F F T108 F F T109 F F T110 F F T111 F F T112 FV F V Kết phân tích mẫu thu thập tỉnh Thõa Thiªn HuÕ H1 F F V H2 V V H3 V H4 F H5 V H6 F H7 F H8 F H9 V TT 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 KÝ hiệu Kết phân tích PCR Kết XN mẫu cã Ghi chó F V M O giªm sa KSTSR Kết phân tích mẫu thu thập tỉnh Thõa Thiªn HuÕ H10 F H11 F H12 F H13 F H14 F H15 V H16 F H17 F H18 F H19 V H20 V H21 F V H22 F H23 F phụ lục 2: sinh cảnh hoạt động điểm nghiên cứu Cảnh ng-ời dân Quảng Trị qua lại vùng biên giới với n-ớc bạn Lào Nghiên cứu sinh đồng nghiệp khám bệnh thu thập mẫu Quảng Trị năm 2008 Nghiên cứu sinh đồng nghiệp khám bệnh thu thập mẫu Thừa Thiên Huế năm 2011 Mẫu máu bệnh nhân đ-ợc để khô tự nhiên thực địa tr-ớc đ-a vào bảo quản phụ lục : số hoạt động phòng thí nghiệm Nghiên cứu sinh chuẩn bị mẫu cho phản ứng PCR Nghiên cứu sinh thực kỹ thuật PCR buồng PCR1 Nghiên cứu sinh thực kỹ thuật điện di buồng điện di Nghiên cứu sinh phân tích kết hệ thống chụp ảnh kỹ thuật số Nghiên cứu sinh tham gia khóa tập huấn kỹ thuật xác đột biến kháng thuốc phân tích kiểu gen KSTSR úc Băngkod, Thái Lan ... (Rapid diagnostic test) 16 1.5.3 Kỹ thuật PCR chẩn đoán, phân biƯt loµi ký sinh trïng sèt rÐt 16 1.6 Nghiên cứu tính đa hình di truyền ký sinh trùng sốt rét 19 1.6.1 Đa hình di trun cđa P... msp2 79 3.2.3 Tính đa hình di truyền P falciparum theo locus glurp 86 3.3 Tính đa hình di truyền P vivax khu vực Bắc Tr-ờng sơn, Việt Nam 89 3.3.1 Tính đa hình di truyền P vivax... Tr-ơng Văn Hạnh Nghiên cứu tính đa hình di truyền ký sinh trùng sốt rét tính kháng thuốc sốt rét Plasmodium falciparum số tỉnh biên giới thuộc khu vực Bắc Tr-ờng Sơn, Việt Nam Chuyên ngành: Di truyền