2/ Có khả năng tái bản: VCDT phải có khả năng hình thành các bản sao, chứa đầy đủ thông tin DT Prokaryote : phân bào trực phân =>mỗi tế bào con nhận được một bản sao vật chất nhân giốn
Trang 1CƠ SỞ VẬT CHẤT VÀ CƠ CHẾ DI TRUYỀN Ở CẤP ĐỘ PHÂN
TỬ
I ACID NUCLEIC LÀ VẬT CHẤT DI TRUYỀN Ở CẤP ĐỘ PHÂN TỬ
1 Tiêu chuẩn của Vật chất di truyền ( VCDT )
VCDT phải có đủ 3 tính chất:
1/ Mang thông tin DT đặc trưng cho loài
Vật chất di truyền có khả năng mã hóa mọi thông tin di truyền của thế
hệ trước chuyển giao cho thế hệ sau: gen cấu trúc quy định cấu trúc chuỗi
polypeptide và một hệ thống các gen chuyên trách ngoài gen cấu trúc đảm nhiệm
việc điều hòa biểu hiện gen
2/ Có khả năng tái bản: VCDT phải có khả năng hình thành các bản sao,
chứa đầy đủ thông tin DT
Prokaryote : phân bào trực phân =>mỗi tế bào con nhận được một bản
sao vật chất nhân giống hệt tế bào mẹ
Eukaryote: phân bào gián phân
+ Qua nguyên phân , mỗi tế bào con nhận được một bản sao chứa
toàn bộ thông tin di truyền trong nhân
+ Qua giảm phân , mỗi tế bào đơn bội chỉ nhận được của một nửa
VCDT trong nhân
Akaryote : nhân lên hàng loạt trong TB ký chủ, gđ tổng hợp bao hàm sự
tái bản VCDT cho thế hệ sau
3/ Có khả năng biến đổi
- Đột biến , hiện tượng tái tổ hợp , và các yếu tố di truyền vận động
làm biến đổi VCDT của các sinh vật tạo nguyên liệu cho tiến hóa
2 Chứng minh acid nucleic là VC mang TTDT
a/ Hiện thương Biến nạp (transformation)
Frederick Griffith quan sát thấy một hiện tượng bí ẩn khi tiến hành
các thí nghiệm trên VK Streptococcus pneumoniae
Griffith dùng 2 chủng vi khuẩn (khác nhau về hình dạng khuẩn lạc và
độc tính):
Chủng S (mooth): độc, khuẩn lạc nhẵn, láng (vỏ nhày= polysaccharide)
Chủng R (rough), không độc, khuẩn lạc sần, không vỏ nhày.
Lần lượt tiêm các trường hợp sau vào chuột, ta thu được kết quả:
* Nhận xét:
Thí nghiệm trên chuột Kết quả
1 Tiêm R Chuột Sống
2 Tiêm S sống ‘’ Chết
3 Tiêm S chết ‘’ Sống
4 Tiêm S chết và R sống ‘’Chết
Trang 2 Ở TH 4, những mảnh vỡ TB từ chủng S bị đun sôi đã biến đổi các VK R
sống trở thành các VK S sống Hiện tượng này gọi là Biến nạp.
Thí nghiệm của Oswald Avery, C M MacLeod và M McCarty xác định bản chất
của hiện tượng biến nạp:
Loại bỏ lipid và carbohydrate khỏi 3 ống nghiệm chứa tế bào S chết
Ống 1:
Thêm enzyme proteinase loại bỏ protein thêm tế bào R sống xuất hiện tế
bào S có biến nạp
Ống 2:
Thêm enzyme ribonuclease loại bỏ ARN thêm tế bào R sống xuất hiện tế
bào S có biến nạp
Ống 3:
Thêm enzyme deoxyribonuclease loại bỏ ADN thêm tế bào R sống không
xuất hiện tế bào S không có biến nạp
Nhận xét:
Bản thân các polysaccharide không gây biến nạp TB R Vỏ nhày chỉ là 1
biểu hiện kiểu hình của độc tính
DNA chính là yêu tố xác định đặc tính vỏ polysaccharide, từ đó xác định
đặc tính gây bệnh
(hoặc tham khảo sách Di truyền học – Phạm Thành Hổ - Trang 138, đoạn 2)
b/ Thí nghiệm của Hershey - Chase
32 P đánh dấu DNA của 1 nhóm phage T2.
35 S đánh dấu protein của 1 nhóm phage T2 khác.
Dùng 2 nhóm phage này cho nhiễm riêng rẽ vào E coli với số lượng virus
lớn
Sau đó, dùng lực khuấy để tách vỏ virus, sử dụng pp ly tâm để tách riêng vỏ
virus với TB VK rồi phân tích phóng xạ
* Kết quả:
Nhóm phage đánh dấu = 32 P: trong TB VK có chứa chất phóng xạ
chứng tỏ: DNA của phage đã vào trong VK
Nhóm phage đánh dấu = 35 S: chất phóng xạ nằm trong phần vỏ virus bỏ lại
bên ngoài
Protein vỏ của phage không xâm nhập TB VK mà chỉ có DNA của phage được
nạp vào Phân tử DNA này giúp sinh sản ra thế hệ phage mới Như vậy, DNA chính
là vật liệu DT của phage.
c/ RNA cũng là VCDT
Cấu tạo chính của phần lớn virus ký sinh thực vật gồm: vỏ bằng protein và
phần lõi RNA.
Trang 3 VD: virus khảm thuốc lá TMV, HRV,… xâm nhập vào TB lá khiến diệp lục
tố bị phân hủy, gây ra những đốm màu trên lá
* Thí nghiệm của Fraenkel – Conrat chứng minh RNA là VCDT của HRV :
Dùng RNA của HRV kết hợp với protein của TMV tạo ra virus ghép, cấy
vào trong cây thuốc lá lành thấy cây bị nhiễm bệnh với triệu chứng bệnh
của HRV
Phân lập từ cây bệnh này được các HRV hoàn chỉnh
(có thể trình bày TN ngược lại làm đối chứng)
Thí nghi ệm ng ư ợc :
(Dùng RNA của TMV kết hợp với protein của HRV tạo ra virus ghép, cấy
vào trong cây thuốc lá lành thấy cây bị nhiễm bệnh với triệu chứng bệnh của
HRV )
RNA chính là CSVT của sự DT, còn protein chỉ đóng vai trò vỏ bọc hỗ
trợ
II THÀNH PHẦN HÓA HỌC VÀ CẤU TRÚC CỦA ACID NUCLEIC
1 Thành phần hóa học của acid nucleic
a/ Nucleic – đơn phân của acid nucleic
* Bazo
Các bazo của DNA và RNA có cấu trúc dị vòng thơm.
Các purin có cấu trúc 2 vòng, gồm adenine (A) và guanine (G).
Các pyrimidine có cấu trúc 1 vòng, gồm cytosine (C), thymine (T)
và uracil (U)
Trong RNA, T thay = U Thymine = 5-methyluracil
* Nucleoside
Trong các acid nucleic, nucleoside được tạo thành bởi: bazo (purin
ở N9, pyrimidine ở N1) liên kết hóa trị với đường pentose ở vị trí
C1.
Ở RNA, đường pentose là ribose, ở DNA là 2’-deoxyribose
Liên kết giữa bazo và đường gọi là liên kết glycosyl (hay glycosid).
* Nucleotide
Một nucleotide: một nucleoside cùng với 1 hay nhiều nhóm
photphate nối ở vị trí 3’, 5’ hoặc 2’ ( 2’ chỉ có ở đường ribose)
* Liên kết phosphodiester
Mỗi photphate liên kết hóa trị với một pentose ở vị trí 5’ và một
pentose kế tiếp ở vị trí 3’ tạo thành liên kết 3’,5’-phosphodiester
Ở pH trung tính, mỗi phosphate đều chức điện tích âm acid nucleic
là nhưng polymer mang điện tích âm
* Trình tự DNA/RNA :
Trang 4Mỗi chuỗi nucleotide (trừ chuỗi nucleotide dạng vòng) đều có :
+ Một đầu 5’ tự do có thể gắn hoặc không gắn các nhóm
phosphate
+ Một đầu 3’ tự do có một nhóm hydroxyl
+ Định hướng của mỗi chuỗi nucleotide là 5’ -> 3’
2 Cấu trúc không gian của acid nucleic :
2.1 Chuỗi xoắn kép DNA
2.1.1 Cấu trúc chuỗi xoắn kép :
Cấu trúc phổ biến nhất của DNA là cấu trúc chuỗi xoắn kép
+ Phân tử DNA là một chuỗi xoắn kép gồm hai mạch đơn xoắn đều
quanh một trục , mỗi mạch đơn là một chuỗi nucleotide
+ Mỗi chuỗi có định hướng 5’ -> 3’ ; hướng của hai mạch ngược chiều
nhau nên ta gọi là hai mạch đối song song
+ Mỗi chu kỳ xoắn của DNA gồm 10 bp ( cặp base ) dài khoảng 3,4 nm
, đường kính vòng xoắn khoảng 2 nm
+ Sườn phosphate – đường của mỗi mạch đơn hướng ra ngoài , còn các
base của chuỗi xoắn kép hướng vào trong
+ Hai mạch đơn kết hợp với nhau nhờ các lien kết hydro hình thành
giữa các cặp base bổ sung nằm trên hai mạch ( A- T có hai liên kết( lk ) hydro , G- X có
ba lk hydro )
(Tham khảo bảng 2.1: Một số dạng cấu trúc của DNA / Sách DT trang 21)
Từ các dữ kiện về cấu trúc chuỗi xoắn kép của DNA cho ta hai khái niệm cơ bản :
+ Mỗi mạch đơn là một trình tự base khác nhau -> mỗi mạch đơn mang
thông tin khác với mạch kia
+ Hai mạch đơn lk với nhau bởi một quan hệ bổ sung - > giải thích được cấu
trúc chặt chẽ của phân tử DNA , phương cách tự tái bản để tạo ra hai phân tử con giống
hệt nhau từ một phân tử mẹ ban đầu (tham khảo)
2.1.2 ý nghĩa của cấu trúc chuỗi xoắn kép :
Phân tử DNA thường có cấu trúc chuỗi xoắn kép Cấu trúc này là một cấu trúc ổn
định:
+ Trong chuỗi xoắn kép, các đường pentose và các nhóm phosphate xoay ra ngoài,
hình thành lk hydro với nước đảm bảo tính ổn định cho phân tử
+ Chuỗi xoắn kép cho phép các base purine và pyrimidine có cấu trúc phẳng xếp
chồng khít lên nhau bên trong phân tử DNA , hạn chế sự tiếp xúc của chúng với nước
+ Mỗi phân tử DNA có một số lượng liên kết hydro rất lớn nên dù chuyển động
của nhiệt có phá vỡ lk nằm ở hai bên đầu thì vẫn còn lk ở các vùng giữa
2.2 Cấu trúc thứ cấp của RNA :
+ RNA trong tb thường tồn tại ở dạng phân tử mạch đơn -> tạo nên vùng xoắn kép
cục bộ do sự hình thành lk hydro giữa hai đoạn trình tự bổ sung nào đó
Trang 5+ RNA trong tế bào có nhiều dạng cấu trúc thứ cấp ứng với những chức năng
riêng Có ba loại RNA chính là: RNA thông tin (mRNA) , RNA vận chuyển (tRNA),
RNA của ribosome ( rRNA )
Phân tích rõ các loại RNA, kể cả của virus để xem loại nào có cấu trúc xoắn kép cục
bộ
(Chỉ có mARN không có nguyên tắc bổ sung Còn tARN, rARN đều có cấu trúc xoắn kép
cục bộ Ngoài ra snARN (ARN nhân nhỏ) tham gia vào quá trình ghép nối trong quá trình
trưởng thành của mARN cũng có cấu trúc xoắn kép cục bộ.)
Chưa biết (sách Di truyền học – Dự án – Trang 92 / Sách cô – Trang 53)
III TÁI BẢN DNA
1 Các nguyên tắc và đặc điểm chung của tái bản DNA
a/ Sự tái bản DNA theo cơ chế bán bảo tồn
Trong chuỗi xoắn kép DNA, 2 mạch đơn liên kết với nhau bằng 1
quan hệ bổ sung
Trong quá trình tái bản, nếu 2 mạch đơn tách rời nhau và mỗi mạch
đơn được dùng làm khuôn để tổng hợp nên một mạch mới theo
nguyên tắc bổ sung thì kết quả là: từ 1 phân tử DNA ban đầu đã
tạo được 2 phân tử mới giống hệt nhau Vì trong mỗi phân tử
DNA con đều mang một mạch cũ và một mạch mới nên kiểu tái
bản này được gọi là bán bảo tồn
* Thí nghiệm chứng minh cơ chế bán bảo tồn (E coli)
Nuôi E coli trong môi trường có nguồn N15, TB sử dụng N15 để tổng
hợp DNA cho đến khi DNA của VK đều mang đồng vị nặng N15
Sau đó các tế bào được chuyển sang môi trường có chứa N14
Cách khoảng thời gian đều đặn tương ứng với mỗi đợt phân bào, lấy
các TB đem chiết tách DNA Bằng pp ly tâm trong gradient tỉ trọng
CsCl, các loại DNA nặng (N15-N15), nhẹ (N14-N14) và lai (N14-N15)
được tách ra, kết quả phân tích phù hợp với kiểu tái bản bán bảo tồn
(vẽ hình minh họa thêm)
b/ Cơ chế phân tử của quá trình tái bản DNA (THUỘC)
Các liên kết H ổn định cấu trúc xoắn và liên kết 2 mạch đơn với nhau
phải được phá vỡ để tách rời 2 mạch
Phải có đoạn mồi (primer) (đoạn DNA/RNA ngắn) bắt cặp bổ
sung với mạch khuôn để tạo đầu 3 ’ OH tự do.
Nguyên liệu tổng hợp DNA là các desoxynucleosid 5’-triphosphate
(dNTPs):dATP, dGTP, dCTP, dTTP
Mạch khuôn luôn được đọc theo chiều 3 ’ -5 ’ trong khi mạch mới
được tổng hợp theo chiều 5’-3’ Mỗi nucleotide mới được gắn vào
đầu 3’OH của mạch đang kéo dài = liên kết phosphodiester
Trang 6 Mỗi bước được thực hiện một cách nhanh chóng , chính xác dưới sự
điều khiển của enzyme đặc hiệu
c/ Đơn vị tái bản, điểm khởi đầu và điểm kết thúc tái bản
Mỗi đoạn DNA được tái bản như một đơn vị riêng lẻ được gọi là một
đơn vị tái bản ( replicon )
Các DNA vòng của prokaryote hay Akaryote, kích thước nhỏ chỉ
gồm một đơn vị tái bản duy nhất
Sự tái bản khởi đầu từ một điểm được gọi là điểm khởi đầu sao
chép (Ori)và lan ra theo 2 hướng, hình thành 2 chạc ba tái bản cho đến
khi gặp nhau tại điểm kết thúc (T) Điểm khởi đầu tái bản có khuynh
hướng giàu A-T để dễ dàng khởi đầu tách rời 2 mạch đơn.
Ở Eukaryote, mỗi phân tử DNA mạch thẳng bao gồm nhiều đơn vị
tái bản tế bào hữu nhũ điển hình có từ 50000- 100000 đơn vị tái
bản , mỗi đơn vị tái bản có kích thước khoảng 40 – 200 kp Tái bản
ntn, khi nào kết thúc?
(Mỗi đơn vị tái bản có điểm khởi đầu riêng và sự tái bản cũng lan
theo hai hướng Khi các chạc ba tái bản gặp nhau thì sự tái bản
ADN được hoàn thành)
(Sách cô – Trang 34)
d/ Sự tổng hợp mạch mới của DNA xảy ra liên tục trên một mạch và gián
đoạn trên mạch kia ( - Tái bản bán gián đoạn )
Cơ chế tái bản DNA chỉ cho phép sự tổng hợp theo hướng 5’-3’,
vì thế trên 2 mạch khuôn có hướng ngược nhau, sự tổng hợp
mạch mới không diễn tiến giống nhau.
Từ điểm khởi đầu tái bản, trên mạch khuôn 3’-5’ sự tổng hợp mạch
mới diễn ra một cách liên tục theo chiều 5’-3’ cùng chiêu với hướng
tháo xoắn Mạch này được gọi là mạch tới.
Trong khi đó trên mạch khuôn 5 ’ -3 ’, sự tổng hợp mạch mới cũng
diễn ra theo hướng 5’-3’ nhưng ngược với hướng tháo xoắn Do đó,
sự tổng hợp mạch mới không xảy ra liên tục mà dưới dạng những
đoạn ngắn gọi là đoạn Okazaki (1000-2000 bp ở proka, 100-200 ở
euka) Mạch này được gọi là mạch chậm.
Trên thực tế, sự tổng hợp 2 mạch theo cùng hướng vì mạch khuôn
chậm được uốn vòng để quay 180 o tại chạc ba tái bản, cùng hướng
với mạch khuôn tới.
e/ Mồi RNA
Mạch tới và tất cả những đoạn Okazaki của mạch chậm chỉ có thể
được tổng hợp = cách kéo dài một mồi đã bắt cặp sẵn trên mạch
khuôn
Mồi là một đoạn RNA ngắn, dược tổng hợp bởi 1 phức hợp
protein gọi là primosome, primome gồm nhiều protein và 1
enzyme primase.
Trang 7 Các mồi RNA sau đó bị phân hủy bởi Rnase và được thay = trình
tự DNA nhờ DNA polymerase Enzyme ligase sẽ nối các đoạn DNA
trên mạch chậm lại với nhau
2 Tái bản DNA prokaryote
Giai đoạn Diễn biến Enzyme
Khởi đầu
1 Tháo xoắn phân tử Enzyme topoisomerase
loại I tháo dạng siêu
xoắn
Enzyme topoisomerase
loại II tháo các nút nảy
sinh do các biến đổi cấu
trúc của chuỗi xoắn
2 Tách rời 2 mạch khuôn tại điểm khởi đầu tái
bản
- phá vỡ liên kết H giữa các bazo, tách rời 2 mạch đơn
tại Ori
- Các mạch tách rời sẽ được ổn định dưới dạng mạch
đơn
protein Dna A DnaC
và
Dna B
DnaB là 1 DNA helicase
nằm trong phức hợp
primose
nhờ các protein SSB
Mạch khuôn được sử
dụng đến đâu thì các
protein SSB được giải
phóng khỏi khuôn đến
đó
Kéo dài 1 Tổng hợp mồi RNA - enzyme primase trong
phức hợp primose
2 Tổng hợp mạch mới (kiểu bán gián đoạn, kéo dài
mồi RNA)
- DNA polymerase III gắn vào mạch, lắp nucleotide
bổ sung vào vị trí tương ứng, kéo dài mồi RNA từ đầu
3’OH tự do
- Nếu gặp chỗ lắp sai, DNA polymerase III dùng hoạt
tính exonuclease 3’-5’ cắt lùi lại để bỏ nucleotide sai,
lắp cái đúng vào rồi tiếp tục tái bản
- DNA polymerase III
là phức hợp dimer Gồm
nhiều đơn vị gắn với
nhau, tổng hợp 1 mạch
đơn DNA
+ Đơn vị : hoạt tính
polymerase thực sự
+ Đơn vị : chức năng
đọc sửa nhờ hoạt tính
exonuclease 3’-5’
+ Đơn vị : gắn
polymerase vào DNA
- Đây là nhân tố duy trì
quy định độ dài của
DNA được tổng hợp ở
Trang 8mạch tới khác với mạch
chậm
3 Hoàn chỉnh sợi mới tổng hợp
- mồi RNA được dời đi và bị phân hủy
- chỗ trống mà mồi để lại thay bằng trình tự DNA nhờ
hoạt tính polymerase 5’-3’ và exonuclease 3’-5’ của
DNA polymerase I
- nối đoạn DNA trên mạch mới tổng hợp lại
- DNA polymerase I:
Loại mồi RNA (hoạt
tính exonuclease 5’-3’),
lắp trình tự DNA
- Rnase H: phân hủy
mồi RNA.
-Enzyme ligase: nối
đoạn DNA lại với nhau
Giai đoạn
kết thúc tái
bản và phân
chia TB
- 2 chạc ba tái bản gặp nhau ở khoảng 1800 đối diện
OriC Quanh vùng kết thúc có vài điểm làm dừng lại
sự tái bản bằng cách gắn với 1 sản phẩm của gen tus
- 2 phân tử DNA vòng dính vào nhau
- 2 NST con được phân phối vào 2 TB con
- gen tus: là 1 nhân tố
kìm hãm hoạt động
helicase của Dna B
- topoisomerase IV tách
2 phân tử DNA
IV PHIÊN MÃ
1 Những nguyên tắc và đặc điểm chung của quá trình phiên mã (THUỘC)
Quá trình chuyển thông tin di truyền từ DNA sang RNA được gọi là sự
phiên mã.
RNA được tổng hợp nhờ tác dụng của hệ enzyme RNA polymerase.
Sự phiên mã được thực hiện theo các nguyên tắc sau:
Vùng DNA chứa gen cần phiên mã phải mở xoắn cục bộ và chỉ 1
trong 2 mạch của phân tử DNA được dùng làm khuôn tổng hợp
RNA.
Nguyên liệu cho sự tổng hợp là 4 loại ribonucleosid 5 ’
triphosphate: ATP, GTP, CTP và UTP.
Phản ứng trùng hợp RNA diễn ra theo nguyên tắc bổ sung Sợi
RNA được kéo dài theo chiều 5 ’ -3 ’ , ngược với chiều của mạch
khuôn.
Sự sinh tổng hợp RNA không cần đến mồi.
Sản phẩm phiên mã là các RNA sợi đơn.
Sự khởi đầu và kết thúc phiên mã phụ thuộc vào các trình tự
DNA chuyên biệt nằm ở trước và nằm sau vùng mã hóa.
Ở mức độ từng gen riêng biệt, RNA polymerase quyết định việc chọn mạch
khuôn bằng cách gắn với phân tử DNA tại một trình tự đặc biệt trên mạch
khuôn gọi là promoter
Như vậy, trên phân tử DNA xoắn kép, cả 2 mạch đều có khả năng được
chọn làm mạch khuôn cho sự phiên mã, tùy từng gen.
2 Sự phiên mã ở prokaryote
a/ RNA polymerase của prokaryote Đọc để hiểu và vận dụng
Trang 9 Ở prokaryote, RNA polymerase có cấu trúc bậc 4 rất phức tạp, gồm nhiều
đơn vị nối với nhau bởi các liên kết yếu
Một holoenzyme RNA polymeraee của E coli gồm 2 hợp phần:
Nhân tố
Enzyme lõi 2 đơn vị
1 đơn vị
1 đơn vị ’
1 đơn vị
Nhân tố :
Là một hợp phần tách biệt với enzyme lõi
Với cấu trúc đặc trưng, nhân tố giúp cho enzyme lõi nhận biết
và gắn đúng với promoter để khởi đầu phiên mã tại vị trí
chính xác.
Nhiều thí nghiệm cho thấy, nếu thiếu nhân tố , enzyme lõi sẽ
khởi đầu phiên mã một cách tùy tiện tại những vị trí không đặc
hiệu
Khi sự phiên mã tiến hành được khoảng 8-9 nt thì nhân tố được
giải phóng khỏi enzyme lõi
Enzyme lõi : đóng vai trò chủ chốt trong việc heo dài phiên mã Trong
đó:
Đơn vị : liên quan đến việc gắn với promoter
Đơn vị : chịu trách nhiệm khởi đầu và kéo dài phiên mã
Đơn vị ’:liên quan đến việc gắn với khuôn DNA
b/ Các trình tự khởi đầu và kết thúc phiên mã ở prokaryote
Đó là những trình tự đặc biệt nằm trên DNA, báo hiệu cho sự khởi đầu
và kết thúc phiên mã
Các trình tự được dẫn dưới đây là của sợi đối khuôn (sợi ý nghĩa) 5’-3’
có trình tự giống như trình tự bản mã phiên, chỉ thay đổi T với U
Trình tự khởi đầu
Tín hiệu khởi đầu phiên mã là vùng promoter có chứa 2 vị trí
đặc hiệu, cho phép RNA polymerase nhận biết, bám vào và
khởi đầu phiên mã.
Kích thước promoter khoảng trên 40 bp, trong đó có 2 trình tự 6
bp được bảo tồn, quyết định chức năng khởi đầu
Trình tự -35 (trình tự nhận biết) nằm cách điểm khởi đầu phiên
mã khoảng 35 nt về trước, thường có trình tự 5’TTGACA3’
Trình tự thứ hai nằm ở vị trí -10 (hộp “TATA” hay “hộp
Pribnow”), có trình tự 5’TATAAT3’hoặc tương tự
Trang 10 Điểm khởi đầu phiên , có vị trí +1, hầu như luôn là 1 purine , G
phổ biến hơn A
Trình tự kết thúc
Tín hiệu kết thúc phiên mã trên DNA là 1 đoạn trình tự đặc biệt
nằm sau gen cấu trúc, bao gồm 2 trình tự đối xứng bổ sung giàu
GC và 1 loạt 6 cặp AT
Ngay khi được hình thành trên RNA, 2 trình tự đối xứng bổ xung
có khả năng tự bắt cặp hình thành cấu trúc “kẹp tóc”, đình chỉ
hoạt động phiên mã Vùng giàu A-T gồm 6T trên mạch đối khuôn
sẽ phiên mã thành 6U nằm ở vùng đuôi RNA
Với một số gen, ngoài trình tự kết thúc, đòi hỏi sự có mặt của 1
protein gọi là nhân tố Nhân tố gồm 6 tiểu đơn vị, gắn với
những vị trí đặc hiệu trên sợi đơn RNA
Nhân tố gắn với một đoạn khoảng 72 nt trên RNA, thủy phân
ATP và di chuyển dọc RNA, hướng về phía phức hợp phiên mã
Chức năng của nhân tố : tách rời enzyme và sợi RNA ra
khỏi khuôn DNA.
3 Các giai đoạn của quá trinh phiên mã ở prokaryote
Giai đoạn Diễn biến Enzyme
Khởi đầu
(tháo xoắn,
tách mạch)
- Nhân tố kết hợp với enzyme lõi, giúp cho RNA
polymerase nhận biết và gắn vào promoter để khởi
đầu phiên mã.
+ Enzyme nhận biết và gắn lỏng lẻo vào trình tự -35,
hình thành “phức hợp đóng”.
+ Sự gắn kết này trở nên chặc chẽ hơn, “phức hợp đóng”
chuyển thành “phức hợp mở” Một vùng DNA kích
thước 17 bp, bắt đầu từ trình tự -10 sẽ được enzyme tháo
xoắn và phơi ra sợi đơn DNA dưới dạng tự do để làm
khuôn cho sự tổng hợp RNA
- RNA
polymerase
Kéo dài - Sau khi RNA polymerase tiến hành phiên mã được
8-9 nt thì nhân tố tách khỏi phức hợp để có thể tham
gia vào một quá trình phiên mã khác
- Sự tách rời nhân tố là cần thiết cho gđ kéo dài vì sự
có mặt của nó sẽ gắn chặt phức hợp enzyme vào
promoter khiến enzyme không thể trượt dài theo
khuôn DNA để tiến hành sinh tổng hợp.
- RNA polymerase lõi tạo thành 1 phức hợp mới gồm 3
hợp phần là polymerase-DNA-RNA mới tổng hợp.
- Trong quá trình sinh tổng hợp, RNA polymerase di
chuyển và tháo xoắn phân tử DNA 1 cách liên tục trên
- RNA
polymerase