XÁC ĐỊNH NỒNG độ ức CHẾ tối THIỂU của TIGECYCLINE với một số CHỦNG VI KHUẨN PHÂN lập tại BỆNH VIỆN BẠCH MAI năm 2015 2017

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG I HC Y H NI NGUYN VN THU XáC ĐịNH NåNG §é øC CHÕ TèI THIĨU CđA TIGECYCLINE VíI MéT Số CHủNG VI KHUẩN PHÂN LậP TạI BệNH VIệN BạCH MAI N¡M 2015 2017 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC HÀ NỘI - 2017 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI NGUYỄN VN THU XáC ĐịNH NồNG Độ ứC CHế TốI THIểU CđA TIGECYCLINE VíI MéT Sè CHđNG VI KHN PH¢N LËP T¹I BƯNH VIƯN B¹CH MAI N¡M 2015 2017 Chun ngành: Vi sinh Mã số: 607286 LUẬN VĂN THẠC SĨ Y HỌC Người hướng dẫn khoa học: TS Phạm Hồng Nhung HÀ NỘI - 2017 LỜI CẢM ƠN Trước hết xin bày tỏ lòng kính trọng biết ơn sâu sắc t ới th ầy hướng dẫn - TS Phạm Hồng Nhung, người thầy tận tâm nhiệt tình dẫn dắt, giúp đỡ tơi vượt qua khó khăn suốt trình học tập nghiên cứu để hồn thành luận văn Tơi xin chân thành cảm ơn Ban chủ nhiệm thầy cô Bộ môn Vi sinh, trường Đại học Y Hà Nội tạo điều kiện tốt nh ất cho suốt thời gian học tập Tôi xin gửi lời cảm ơn tới toàn thể Bác sĩ, Kỹ thuật viên, nhân viên khoa Vi sinh Bệnh viện Bạch Mai tạo điều kiện giúp đỡ th ời gian thực nghiên cứu Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới tất thầy cô hội đ ồng thơng qua đề cương hội đồng chấm khóa luận dành th ời gian đ ọc cho tơi đóng góp q báu để hồn ch ỉnh luận văn Tơi xin chân thành cảm ơn Phòng Đào tạo Sau đại h ọc tr ường Đ ại học Y Hà Nội giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi cho tơi q trình học tập nghiên cứu Cuối cùng, xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới gia đình bạn bè thân thiết, người bên cạnh, động viên khích lệ ủng h ộ tơi trình học tập nghiên cứu Hà Nội, ngày 19 tháng 10 năm 2017 Học viên Nguyễn Vân Thu LỜI CAM ĐOAN Tôi Nguyễn Vân Thu, học viên lớp cao học khóa 24 chuyên ngành Vi sinh Y học, Trường Đại học Y Hà Nội, xin cam đoan: Đây luận văn thân trực tiếp thực hướng dẫn TS Phạm Hồng Nhung Cơng trình khơng trùng lặp với nghiên cứu khác công bố Việt Nam Các số liệu thông tin nghiên cứu hồn tồn xác, trung thực khách quan Tơi xin hồn tồn chịu trách nhiệm cam kết Hà Nội, ngày 19 tháng 10 năm 2017 Học viên Nguyễn Vân Thu DANH MỤC CÁC TỪ VIẾT TẮT Một số tên gọi chung MIC : Minimum Inhibitory Concentration (Nồng độ ức chế tối thiểu) MIC50 : Nồng độ ức chế tối thiểu ức chế 50% số chủng thử nghiệm MIC90 : Nồng độ ức chế tối thiểu ức chế 90% số chủng thử nghiệm ESBL : Extended spectrum beta-lactamase (Enzyme beta-lactamase phổ rộng) MRSA : Methicillin resistant Staphylococcus aureus (Staphylococcus aureus kháng Methicillin) MSSA : Methicillin sensitive Staphylococcus aureus (Staphylococcus aureus nhạy cảm Methicillin) VRE : Vancomycin resistance Enterococcus (Enterococcus kháng vancomycin) ATCC : American Type Culture Collection (Bộ sưu tập chủng chuẩn Mỹ) CLSI : Clinical and Laboratory Standards Institute (Viện tiêu chuẩn lâm sàng xét nghiệm) EUCAST : European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (Ủy ban Châu Âu thử nghiệm độ nhạy cảm kháng sinh) IHMA : International Health Management Associates (Hiệp hội Quản lý Sức khỏe Quốc tế) FDA : Food and Drug Administration (Cục Quản lý Thực phẩm Dược phẩm Hoa Kỳ) Viết tắt tên kháng sinh AUG : Amoxicillin-clavulanic acid P/T : Piperacillin-tazobactam LEV : Levofloxacin CRO : Ceftriaxone LZD : Linezolid MIN : Minocycline VA : Vancomycin AM : Ampicillin P : Penicillin TGC : Tigecycline MEM : Meropenem FEP : Cefepime AK : Amikacin CAZ : Ceftazidime MỤC LỤ ĐẶT VẤN ĐỀ Chương 1: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Đặc điểm kháng sinh tigecycline 1.1.1 Cấu tạo 1.1.2 Cơ chế tác dụng đề kháng 1.1.3 Phổ tác dụng 1.1.4 Dược động học 1.1.5 Chỉ định 1.1.6 Tác dụng không mong muốn 1.1.7 Chống định 1.1.8 Tương tác thuốc 1.1.9 Liều dùng 1.2 Một số loại vi khuẩn gây bệnh phổ biến .8 1.2.1 Enterococcus spp 1.2.2 Staphylococcus aureus 1.2.3 Acinetobacter spp 1.2.4 Enterobacteriaceae spp 10 1.3 Các phương pháp xác định MIC 12 1.3.1 Phương pháp kháng sinh pha loãng thạch 13 1.3.2 Phương pháp kháng sinh pha loãng canh thang 14 1.3.3 Kỹ thuật kháng sinh đồ hệ thống tự động 15 1.3.4 E-test .16 1.3.5.Phương pháp vi pha loãng 18 Chương 2: ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 20 2.1 Đối tượng nghiên cứu 20 2.2 Địa điểm nghiên cứu 20 2.3 Thời gian nghiên cứu 20 2.4 Kinh phí nghiên cứu 20 2.5 Phương pháp nghiên cứu .21 2.6 Phương pháp chọn mẫu .21 2.7 Phương pháp thu thập số liệu 21 2.7.1 Kháng sinh 21 2.7.2 Quy trình làm xét nghiệm .22 2.8 Đạo đức nghiên cứu: 25 Chương 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 26 3.1 Xác định nồng độ ức chế tối thiểu tigecycline .26 3.1.1 Tình hình nhạy cảm kháng sinh chủng nghiên cứu 26 3.1.2 Nồng độ ức chế tối thiểu tigecycline với chủng vi khuẩn nhóm nghiên cứu 29 3.2 Xác định kiểu cách đề kháng chủng nghiên cứu 32 3.2.1 Kiểu cách đề kháng chủng Enterococcus spp 32 3.2.2 Kiểu cách đề kháng chủng S aureus 32 3.2.3 Kiểu cách đề kháng chủng Acinetobacter spp 33 3.2.4 Kiểu cách đề kháng chủng E coli .34 3.2.5 Kiểu cách đề kháng chủng Enterobacter spp 35 3.2.6 Kiểu cách đề kháng chủng Serratia spp 36 3.2.7 Kiểu cách đề kháng chủng Klebsiella spp 37 3.2.8 So sánh độ nhạy cảm in vitro tigecycline kháng sinh sử dụng với chủng vi khuẩn gây bệnh nhóm nghiên cứu 38 Chương 4: BÀN LUẬN .41 4.1 Xác định nồng độ ức chế tối thiểu tigecycline .41 4.2 Xác định kiểu cách đề kháng chủng nghiên cứu 44 KẾT LUẬN 47 TÀI LIỆU THAM KHẢOY 42 KS AK P/T FEP CAZ S R S 53 45 11 34 22 34 22 35 21 40 11 48 R 16 16 p 8 µg/ml - MIC tigecycline với Enterobacter spp dao động từ 0,25-8µg/ml - MIC tigecycline với Serratia spp dao động từ 0,25-2µg/ml - MIC tigecycline với Klebsiella spp dao động từ 0,25 - >8 µg/ml Xác định kiểu cách đề kháng ch ủng nghiên c ứu - Enterococcus spp có kiểu đề kháng kháng sinh - S aureus có kiểu đề kháng kháng sinh - Acinetobacter spp có kiểu đề kháng kháng sinh - E coli có 19 kiểu đề kháng kháng sinh - Enterobacter spp có 25 kiểu đề kháng kháng sinh - Serratia spp có 10 kiểu đề kháng kháng sinh - Klebsiella spp có 22 kiểu đề kháng kháng sinh TÀI LIỆU THAM KHẢO Nicolau DP (2009) Managenment of complicated infections in the era of antimicrobial resistance: the role of tigecycline Expert Opini Pharmacother., 10, 1213-1222 Pages J Bambeke FV, Lee VJ (2010) Inhibitors of bacterial efflux pumps as adjuvants in antibacterial therapy and diagnostic tools for detection of resistance by efflux Frontiers in a anti-infective drug discovery., 1, 138- 175 Livermore DM (2005) Tygecycline: What is it, and where should it be used? Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 56, 611-614 Institute for Quality and Efficiency in Health Care (2013) Using medication: Using antibiotics correctly and avoiding resistance Informed Health Online, (2017) European Committee on Antimicrobial Susceptibility TestingEUCAST, breakpoint table for interprettation of MIC and zone diameter, v 7.1 Journal, Peterson LR (2008) A review of tigecycline - the first glycylcline 2008 International J Antimicrobial Agents, 215-222 Robert A Bonomo Megan Brooks (2012) Tigecycline: 'A Choice of Last Resort' Medscape Infectious Diseases, Jung Ah Shin cs (2012) Clinical Outcomes of Tigecycline in the Treatment of Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii Infection Yonsei Medical Journal, 53(5), 974-984 Straus Robinson K cs Schechner V (2009) Evaluation of PCR-based testing for surveillace of KPC-producing carbapenem-resistant member of the Enterobacteriaceae family J Clin Microbiol, 47(10), 738-744 10 P.G Mortimer, and Piddock, L.J (1993) The accumulation of five antibacterial agents in porin-deficient mutants of Escherichia coli 32 Antimicrob Chemother, 32, 195–213 11 P.E Sum, and Petersen, P (1999) Synthesis and structure-activity relationship of novel glycylcycline derivatives leading to the discovery of GAR- 936 Bioorg Med Chem Lett, 9, 1459–1462 12 P.J Petersen, Jacobus, N.V., Weiss, W.J., Sum, P.E., and Testa, R.T (1999) In vitro and in vivo antibacterial activities of a novel glycylcycline, the 56 9-t- butylglycylamido derivative of minocycline (GAR-936) Antimicrob Agents Chemother, 43, 738-744 13 H Nikaido, and Thanassi, D.G (1993) Penetration of lipophilic agents with multiple protonation sites into bacterial cells: tetracyclines and fluoroquinolones as examples Antimicrob Agents Chemother, 37, 1393– 1399 14 K.N Agwuh, and MacGowan, A (2006) Pharmacokinetics and pharmacodynamics of the tetracyclines including glycylcyclines Antimicrob Chemother, 58, 256– 265 15 I Chopra, and Roberts, M (2001) Tetracycline antibiotics: mode of action, applications, molecular biology, and epidemiology of bacterial resistance Microbiol Mol Biol, 65, 232–260 16 CDC (2013) Antibiotic resistance threats in the United States 17 PhD Christopher J Kristich, Louis B Rice, MD, and Cesar A Arias (2014) Enterococcal Infection—Treatment and Antibiotic Resistance, , 18 MD; Chief Editor: John L Brusch Susan L Fraser, MD, FACP (2017) Enterococcal Infections Treatment & Management, , 19 Wang Y Qin S, Zhang Q, Chen X, Shen Z, Deng F, Wu C, Shen Identification of a novel genomic island conferring resistance to multiple aminoglycoside antibiotics in Campylobacter coli Antimicrob Agents Chemother, 56(10), 5332-5339 20 Paul R Yarnold Adam N Treitman, John Warren and Gary A Noskin* (2005) Emerging Incidence of Enterococcus faecium among Hospital Isolates (1993 to 2002) Clinical Microbiology and infection, 43(1), 462-463 21 Lê Huy Chính (2007) Vi sinh vật Y học, NXB Y học, 22 Đoàn Mai Phương Phạm Hồng Nhung, Lê Vân Anh (2014) Đề kháng kháng sinh chủng Staphylococcus aureus phân lập Bệnh viện Bạch Mai Tạp chí Nghiên cứu Y học, 90, 66-73 23 Harrington S Patel N, Dihmess A, Woo B, Masoud R, Martis P, Fiorenza M, Graffunder E, Evans A, McNutt LA Clinical epidemiology of carbapenem- intermediate or -resistant Enterobacteriaceae Antimicrob Chemother, 66(7), 1600-1608 24 O'Donnell MR Walkey AJ, Wiener RS3 (2011) Linezolid vs glycopeptide antibiotics for the treatment of suspected methicillinresistant Staphylococcus aureus nosocomial pneumonia: a meta-analysis of randomized controlled trials Chest, 139(5), 1148-1155 25 European Centre for Disease Prevention and Control (2014) Antimicrobial resistance interactive database Journal, 26 Nguyễn Trần Mỹ Phương Johnes Stephanie, Nguyễn Văn Kim (2006) Tần suất mắc vi khuẩn đa kháng Bệnh viện Bình Dân từ 01 / 07 / 2004 đến 30/ 09 / 2004 10(1), 27 Nguyễn Văn Kính cs Phân tích thực trạng sử dụng kháng sinh kháng kháng sinh Việt Nam Journal, 28 Doumith M Dhanji H, Rooney PJ, O'Leary MC, Loughrey AC, Hope R, Woodford N, Livermore DM Molecular epidemiology of fluoroquinolone- resistant ST131 Escherichia coli producing CTX-M extended-spectrum beta- lactamases in nursing homes in Belfast, UK Antimicrob Chemother, 66(2), 297-303 29 (2005) Báo cáo hoạt động theo dõi đề kháng kháng sinh vi khuẩn gây bệnh thường gặp Việt Nam năm 2004 Journal, 10(2), 2-15, 30 Wattal C Datta S, Goel N, Oberoi JK, Raveendran R, Prasad KJ A ten year analysis of multi-drug resistant blood stream infections caused by Escherichia coli & Klebsiella pneumoniae in a tertiary care hospital Indian J Med Res, 135(6), 907-912 31 Navon-Venezia S Marchaim D, Schwaber MJ, Carmeli Y (2008) Isolation of imipenem-resistant Enterobacter species: emergence of KPC-2 carbapenemase, molecular characterization, epidemiology, and outcomes Antimicrob Agents Chemother, 52(4), 1413-1418 32 Ak K Koksal F, Kucukbasmaci O, Samasti M (2009) Prevalence and antimicrobial resistance patterns of extended-spectrum beta-lactamaseproducing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolated from blood cultures in an Istanbul University Hospital Chemotherapy, 55(4), 293-297 33 Subhash Chandra Parija (2009) Textbook of Microbiology & Immunology, Elservier India, 34 (2007) Thực tập vi sinh y học, Nhà xuất Y học, Đại học Y Hà Nội 35 Bộ Y tế (2013) Hướng dẫn quy trình kỹ thuật chuyên ngành Vi sinh Y học Journal, 24, NXB Y học, 36 Lynne S Garcia (2010) Clinical Microbiology Procedures Handbook 2, 995-1012 37 The Clinical & Laboratory Standards Institute (2015) M07-A10: Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Test for Bacteria That Grow Aerobically; Approved Standard - Tenth Edition, 38 Clinical and Laboratory Standards Institute (2017) M100, Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing, 39 Tsai HY cs (2012) Trends in susceptibility of vancomycin-resistant Enterococcus faecium to tigecycline, daptomycin, and linezolid and molecular epidemiology of the isolates: results from the Tigecycline In Vitro Surveillance in Taiwan (TIST) study, 2006 to 2010 Antimicrobial Agents Chemother, 56(6), 40 G A Contreras C A Arias, and B E Murray (2013) Management of multidrug-resistant enterococcal infections Clinical Microbiology and infection, 16(6), 41 Phạm Hồng Nhung Vũ Ngọc Hiếu (2017) Mức độ kháng kháng sinh số vi khuẩn thường gặp gây nhiễm trùng da mô mềm bệnh nhân đái tháo đường phân lập Bệnh viện Bạch Mai Tạp chí Nghiên cứu Y học, 109 (4), 42 Hossein Khalili cs (2010) Evaluation of Tigecycline Activity Against Methicillin-Resistante Staphylococcus aureus Isolated from Biological Samples Iranian Journal of Pharmaceutical Research, 9(1), 61-65 43 Debra A Goff and Michael J Dowzicky (2007) Prevalence and regional variation in methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) ìn the USA and coparative in vitro activity of tigecycline, a glycylcycline antimicrobial Medical Microbiology, 56, 1189-1195 44 Cao Hữu Nghĩa Vũ Lê Ngọc An, Trần Thị Tuyết Nga, Nguyễn Hữu An (2013) Tỷ lệ kháng kháng sinh Staphylococcus aureus mẫu bệnh phẩm viện Pasteur TP Hồ Chí Minh Tạp chí Y học dự phòng, 10, 270 45 Ngơ Thị Hồng Phương (2013) Khảo sát kháng kháng sinh Acinetobacter baumannii chủng Acinetobacter spp viện Pasteur TP Hồ Chí Minh, Luận văn Thạc sĩ, Trường Đại học Sư phạm TP Hồ Chí Minh, 46 Farrell DJ Sader HS, Jones RN (2011) Tigecycline activity tested against multidrug-resistant Enterobacteriaceae and Acinetobacter spp isolated in US medical centers (2005-2009) Diagnostic Microbiol Infectious Diseases, 69(2), 47 Cao Minh Nga cs (2013) Sự đề kháng kháng sinh vi khuẩn Klebsiella spp E coli sinh ESBL phân lập bệnh viện 175 Y học TP Hồ Chí Minh, 17, 279 48 Chiang YC Shen WC1, Chen HY, Chen TH, Yu FL, Tang CH, Sue YM (2011) Nephrotoxicity of vancomycin in patients with methicillinresistant Staphylococcus aureus bacteraemia Asian Pacific Society of Nephrology, 16(8), 697-703 49 Yu Chen Zhijin Chen, cs (2015) Meta-analysis of colistin for the treatment of Acinetobacter baumannii infection Sci Rep, 5, 50 Vũ Thị Kim Cương Nguyễn Anh Dũng Nguyễn Thị Thanh Tâm (2014) Kháng kháng sinh nhiễm khuẩn bệnh viện bệnh viện Thống TP Hồ Chí Minh, , ... vi khuẩn phân lập Bệnh vi n Bạch Mai năm 2015 - 2017 với hai mục tiêu sau: Xác định nồng độ ức chế tối thi ểu c tigecycline v ới m ột s ố chủng vi khuẩn phân lập t ại b ệnh vi ện B ạch Mai t 20152 017... Minimum Inhibitory Concentration (Nồng độ ức chế tối thiểu) MIC50 : Nồng độ ức chế tối thiểu ức chế 50% số chủng thử nghiệm MIC90 : Nồng độ ức chế tối thiểu ức chế 90% số chủng thử nghiệm ESBL : Extended... Bệnh vi n Bạch Mai, góp phần vi c xây dựng hướng dẫn điều trị bệnh lý nhiễm khuẩn, đem lại hiệu điều trị tốt hơn ,với lý thực đề tài: Xác định nồng độ ức chế tối thiểu tigecycline với số chủng vi