Tuyển chọn vi khuẩn lactic kháng với vi khuẩn gây bệnh hoại tử gan tụy cấp tính (Vibrio parahaemolyticus) trên tôm thẻ chân trắng (Penaeus vannamei).

Chương 1: GIỚI THIỆU 1.1. Đặt vấn đề Việc nuôi tôm sú, tôm thẻ ở Đồng Bằng sông Cửu Long trong những năm trước đây đã đem lại nguồn lợi nhuận đáng kể và góp phần vào việc phát triển nền kinh tế cho cả nước. Nhưng trong khoảng thời gian gần đây, nghề nuôi tôm đang đối mặt với rất nhiều thách thức, dịch bệnh, môi trường ô nhiễm và hiện tượng tôm chết hàng loạt. Trong đó đáng quan tâm nhất là hội chứng hoại tử gan tụy cấp tính (Acute Hepatopancreatic Necrosis Syndrome - AHPNS) (Flegel, 2012) hay còn gọi là hội chứng chết sớm (early mortality syndrome – EMS) (Lightner et al., 2012). Bệnh đã gây ra thiệt hại cho người nuôi trên 1 tỷ USD/năm (Zorriehzahra and Banaederakhshan, 2015). Hội chứng hoại tử gan tụy cấp tính xuất hiện ở Trung Quốc vào năm 2009, ở Việt Nam vào năm 2010 rồi đến Thái Lan và Mã Lai vào năm 2011 (Lightner et al., 2012; Flegel, 2012). Bệnh xuất hiện và gây chết hàng loạt trên tôm nuôi ở các Tỉnh Sóc Trăng, Bạc Liêu, Trà Vinh, và Cà Mau. Tổng số diện tích nuôi thiệt hại ở ĐBSCL là 39.000 ha (FAO, 2013). Bệnh xuất hiện ở tôm sú và tôm thẻ khoảng 10-45 ngày sau khi thả giống, tỉ lệ chết có thể lên đến 100% ở những ao bị nhiễm nặng. Tác nhân gây ra hội chứng hoại tử gan tụy cấp tính là do vi khuẩn V. parahaemolyticus (Lightner et al., 2012) mang thể thực khuẩn (Bateriophage) (Loc Tran et al., 2013). Hiện nay có nhiều biện pháp được đề xuất để ngăn chặn sự phát triển của vi khuẩn V. parahaemolyticus gây hội chứng hoại tử gan tụy cấp như: dùng hóa chất diệt khuẩn, sử dụng kháng sinh, áp dụng biện pháp sinh học,.... Tuy nhiên, biện pháp sử dụng hóa chất, kháng sinh thì hiệu quả không cao, dễ gây ra nguy cơ phát sinh nhiều loài vi khuẩn gây bệnh kháng với kháng sinh. Thêm vào đó, sự tồn dư thuốc trong thực phẩm cũng là chỉ tiêu quan trọng trong kiểm định nhập khẩu sản phẩm nông nghiệp tại nhiều quốc gia trên thế giới. Vì thế, cách tốt nhất là sử dụng biện pháp pháp sinh học, dùng vi khuẩn có lợi có khả năng đối kháng với vi khuẩn gây bệnh. Biện pháp này không những có thể kiểm soát được mật độ vi khuẩn gây bệnh mà còn đảm bảo an toàn vệ sinh thực phẩm và có lợi cho môi trường do chỉ sử dụng các loài vi khuẩn hữu ích (Huỳnh Ngọc Trưởng và ctv., 2015). Vi khuẩn lactic (LAB) đã được ứng dụng rộng rãi và ngày càng phổ biến trong việc sản xuất chế phẩm sinh học, bổ sung trong thức ăn động vật thủy sản, thức ăn chăn nuôi cũng như việc bón vào ao nuôi để ức chế các loài vi khuẩn gây bệnh cho động vật thủy sản. Trong nghiên cứu về các loài vi khuẩn hữu ích thì có một số dòng vi khuẩn tiết ra chất ức chế đề kháng lại với vi khuẩn khác như Lactobacillus sp. kháng lại vi khuẩn Vibrio sp. (Trịnh Hùng Cường, 2011); Lactobacillus suntoryeus LII1 có khả năng kháng mạnh đối với Escherichia coli và Bacillus cereus (Hồ Lê Huỳnh Châu và ctv., 2010). Trong quá trình lên men, vi khuẩn lactic sinh ra acid hữu cơ, chúng ức chế vi khuẩn gây bệnh do sự tác động lên tế bào chất của vi khuẩn, ảnh hưởng đến chức năng bảo vệ của màng tế bào (Fooks et al., 1999; Jay, 2000; Gerald, 1999; Kuipers et al., 2000). Các nghiên cứu vừa nêu đã cho thấy dòng vi khuẩn lactic có khả năng tiết ra chất ức chế vi khuẩn gây bệnh. Việc nghiên cứu khả năng phòng trị bệnh của các chủng vi khuẩn là rất khả thi và đặc biệt là việc giảm thiểu ô nhiễm môi trường. Hiện nay, trên thị trường có rất nhiều loại chế phẩm vi sinh. Chúng được phân chia thành các loại như chế phẩm cải thiện sức khỏe (probiotics); chế phẩm cải thiện môi trường (bioremediation); và chế phẩm ức chế tác nhân gây bệnh (bio-control). Trên thực tế, người nuôi đã sử dụng nhiều loại chế phẩm vi sinh khác nhau trong quá trình nuôi tôm, nhưng bệnh hoại tử gan tụy vẫn diễn ra và gây thiệt hại to lớn về kinh tế. Thế nhưng, vẫn chưa có công bố nào về việc nghiên cứu chế phẩm vi sinh trong phòng bệnh hoại tử gan tụy trên tôm biển. Do đó, để giải quyết vấn đề cấp bách trong việc phòng trị bệnh hoại tử gan tụy cấp tính cũng như góp phần giảm thiểu ô nhiễm môi trường và nâng cao chất lượng tôm biển trên thị trường thế giới. Việc tuyển chọn vi khuẩn lactic kháng với vi khuẩn gây bệnh hoại tử gan tụy cấp tính (V. parahaemolyticus) trên tôm thẻ chân trắng (Penaeus vannamei) là việc thật sự cấp thiết. 1.2. Mục tiêu tổng quát Sưu tập và chọn lọc bộ chủng vi khuẩn lactic có nguồn gốc từ ao nuôi tôm cá nước mặn nhằm tạo nguồn vi khuẩn hữu ích để sản xuất chế phẩm sinh học sử dụng cho nuôi trồng thủy sản đồng thời làm giảm việc sử dụng hóa chất kháng sinh, là sản phẩm an toàn cho người tiêu dùng thực phẩm thủy sản. 1.3. Mục tiêu cụ thể Sưu tập và chọn lọc các chủng vi khuẩn lactic từ ruột tôm thẻ, ruột cá rô phi và bùn đáy ao nuôi tôm đối kháng mạnh với chủng vi khuẩn V. parahaemolyticus gây bệnh hoại tử gan tụy cấp (AHPND) trên tôm he, từ đó sử dụng chúng để phòng bệnh AHPND trên đàn tôm nuôi.

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC CẦN THƠ NGUYỄN THỊ TRÚC LINH TUYỂN CHỌN VI KHUẨN LACTIC KHÁNG VỚI VI KHUẨN GÂY BỆNH HOẠI TỬ GAN TỤY CẤP TÍNH (Vibrio parahaemolyticus) TRÊN TÔM THẺ CHÂN TRẮNG (Penaeus vannamei) LUẬN ÁN TIẾN SĨ CHUYÊN NGÀNH NUÔI TRỒNG THỦY SẢN CẦN THƠ, 2018 TÓM TẮT Tuyển chọn vi khuẩn lactic (LAB) kháng với vi khuẩn gây bệnh hoại tử gan tụy cấp tính (Vibrio parahaemolyticus) tôm thẻ chân trắng (Penaeus vannamei) được thực Trường Đại học Cần Thơ từ tháng 12/2014 đến 4/2017 Mục tiêu nghiên cứu tìm chủng LAB có khả phòng bệnh hoại tử gan tụy cấp tính (AHPND) tôm thẻ chân trắng Nghiên cứu được thực với nội dung (1) Phân lập LAB từ ruột tôm thẻ, ruột cá rô phi bùn đáy ao nuôi tôm ở tỉnh Trà Vinh, Bến Tre Sóc Trăng sàng lọc chủng LAB chỉ tiêu: hình thái, sinh lý, sinh hóa; (2) Xác định tính đối kháng LAB phân lập được với vi khuẩn V parahaemolyticus phương pháp khuếch tán giếng thạch, đồng thời xác định khả kháng V parahaemolyticus bacteriocin khả chịu đựng nồng độ muối chủng LAB kháng với V parahaemolyticus mạnh nhất được tiến hành; (3) Thử nghiệm ảnh hưởng LAB bổ sung vào thức ăn lên khả kháng AHPND Thí nghiệm được tiến hành nhằm xác định ảnh hưởng LAB bổ sung vào thức ăn đến tỷ lệ sống khả kháng AHPND tôm thẻ chân trắng Đồng thời, ảnh hưởng việc bổ sung C, N P lên khả kháng AHPND chủng LAB được xác định; (4) Định danh chủng LAB có khả kháng bệnh hoại tử gan tụy cấp tính tôm thẻ Kết phân lập LAB từ ruột tôm thẻ, ruột cá rô phi bùn đáy ao nuôi tôm biển ở tỉnh Trà Vinh, Sóc Trăng Bến Tre thu được 94 chủng LAB bao gồm: 30 chủng LAB ở Trà Vinh, 25 chủng LAB ở Sóc Trăng, 39 chủng LAB ở Bến Tre Kết sàng lọc chỉ tiêu hình thái cho thấy tất khuẩn lạc phân lập được có màu trắng đục, tròn, lồi, có kích cỡ 1-2 mm sau 48 nuôi cấy môi trường MRS agar bổ sung 1,5% NaCl Đối với chỉ tiêu sinh lý cho thấy kính hiển vi LAB có hình cầu hình que, Gram dương, không sinh bào tử Kết xác định đặc điểm sinh hóa chỉ tất chủng LAB được lựa chọn có khả làm tan CaCO3, âm tính oxidase catalase dương tính với O/F Kết xác định tính đối kháng phương pháp khuếch tán giếng thạch cho thấy hầu hết 94 chủng LAB phân lập được có khả kháng với vi khuẩn V parahaemolyticus Trong 94 chủng phân lập được có 82 chủng LAB có khả kháng với V parahaemolyticus chỉ ở mức yếu (+) trung bình (++) Mười hai chủng LAB lại bao gồm 08 chủng phân lập được ở Trà Vinh 04 chủng LAB phân lập ở Bến Tre có khả kháng V parahaemolyticus ở mức cao (+++) với vòng kháng khuẩn lớn 16 mm, đặc biệt có 05 chủng LAB (T3.1, RP5.4.1, T4.2, RP5.5.1, RP6.5) có khả kháng V parahaemolyticus mạnh nhất với vòng kháng khuẩn từ 17,5-18,5 iii mm Kết thử nghiệm khả tạo bacteriocin tính kháng khuẩn LAB với V parahaemolyticus cho thấy chúng không có khả ức chế vi khuẩn V parahaemolyticus thí nghiệm Các chủng LAB dùng thí nghiệm phát triển ở độ mặn từ 0-25‰ phát triển tốt nhất ở độ mặn 5‰ với thời gian nuôi 48 phát triển chậm ở độ mặn 25‰ với thời gian nuôi 96 Kết xác định thời gian mật số LAB khác lên khả kháng vi khuẩn V parahaemolyticus cho thấy mật số LAB đến 107 CFU/mL với thời gian nuôi từ 24 đến 96 không có khả kháng vi khuẩn V parahaemolyticus Kết thử nghiệm ảnh hưởng việc bổ sung LAB vào thức ăn đến tỷ lệ sống khả kháng AHPND tôm thẻ chân trắng cho thấy ở nghiệm thức có bổ sung LAB vào thức ăn không cảm nhiễm vi khuẩn V parahaemolyticus tỷ lệ sớng tơm rất cao khác biệt không có ý nghĩa thống kê so với nghiệm thức đối chứng âm (87,77%) Tỉ lệ sống tôm cao nhất ở nghiệm thức bổ sung chủng LAB5 (92,23%) Ngồi ra, tơm ở nghiệm thức không có dấu hiệu AHPND Ở nghiệm thức cảm nhiễm vi khuẩn V parahaemolyticus, tôm có dấu hiệu bệnh lý đặc trưng AHPND chết nhiều nhất ở nghiệm thức VP+LAB3, tỉ lệ chết lên đến 70,02%, nghiệm thức đối chứng dương (54,43%) nghiệm thức VP+LAB4 (43,33%) Tuy nhiên, ở nghiệm thức VP+LAB1,VP+LAB2 VP+LAB5 tôm có tỷ lệ sống cao từ (73,33-79,77%), khác biệt không có ý nghĩa thống kê so với nghiệm thức ĐCA (87,77%) phần lớn mẫu gan tụy thu được không có dấu hiệu bệnh lý đặc trưng bệnh hoại tử gan tụy cấp tính phân tích mơ bệnh học Kết thử nghiệm khả kháng AHPND LAB có bổ sung thành phần acid glutamic, đường trehalose, KH2PO4, K2HPO4 với tỷ lệ C, N, P 15, 1, 0,1 cho thấy hầu hết nghiệm thức bổ sung thành phần trên, tỷ lệ sống tôm thấp so với nghiệm thức không bổ sung trường hợp có không có cảm nhiễm V parahaemolyticus Đối với nghiệm thức khơng cảm nhiễm V parahaemolyticus tôm không có biểu bệnh lý đặc trưng AHPND, tỷ lệ sống tôm lên đến 88,2% đối với nghiệm thức không bổ sung C, N, P 82% đối với nghiệm thức có bổ sung C, N, P Tuy nhiên, hai nghiệm thức khác biệt không có ý nghĩa thống kê với Kết phân tích mô bệnh học không thấy mẫu gan tụy có dấu bất thường Tuy nhiên, nghiệm thức có cảm nhiễm V parahaemolyticus bổ sung C, N, P tỷ lệ sớng tơm thấp so với nghiệm thức lại Tỷ lệ sớng thấp nhất ở nghiệm thức đối chứng dương có bổ sung không bổ sung C, N, P lần lượt (47 52%) tỉ lệ iv sống cao nhất nghiệm thức LAB1 (76 78%) Kết mô bệnh học cho thấy ở nghiệm thức bổ sung C, N, P LAB đồng thời cảm nhiễm V parahaemolyticus gan tụy tơm ít bị ảnh hưởng cảm nhiễm AHPND Việc bổ sung LAB vào thức ăn đặc biệt chủng LAB1 có khả làm hạn chế AHPND tôm thẻ Kết định danh chủng LAB1 phương pháp giải trình tự đoạn gen 16S-rRNA xác định chủng vi khuẩn Lactobacillus plantarum Từ khóa: AHPND, LAB, Lactobacillus plantarum, Tôm thẻ chân trắng (Penaeus vannamei), Vibrio parahaemolyticus v 2.3.6 Các yếu tố môi trường tác động đến vi khuẩn V parahaemolyticus 18 2.3.7 Một số giải pháp được áp dụng phòng bệnh hoại tử gan tụy 19 2.4 Đặc điểm sinh học vi khuẩn lactic 21 2.4.1 Sơ lược vi khuẩn lactic 21 2.4.2 Đặc tính chung vi khuẩn lactic 23 2.4.3 Ảnh hưởng yếu tố môi trường lên phát triển LAB 24 2.4.4 Khả kháng với kháng sinh 25 2.4.5 Cơ chế kháng khuẩn vi khuẩn lactic 25 2.4.6 Các nghiên cứu khả kháng khuẩn vi khuẩn lactic nuôi trồng thủy sản 28 Chương 3: PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 38 3.1 Thời gian địa điểm nghiên cứu 38 3.2 Vật liệu nghiên cứu 38 3.2.1 Dụng cụ trang thiết bị phục vụ nghiên cứu 38 3.2.2 Hóa chất, môi trường nuôi cấy vi khuẩn 38 3.3 Phương pháp nghiên cứu 39 3.3.1 Phân lập LAB từ nhiều nguồn khác 39 3.3.2 Xác định tính đối kháng chủng vi khuẩn phân lập được với vi khuẩn V parahaemolyticus điều kiện in vitro 41 3.3.3 Thử nghiệm khả kháng bệnh hoại tử gan tụy cấp bổ sung chủng LAB vào thức ăn 43 3.3.4 Định danh chủng LAB có khả kháng bệnh hoại tử gan tụy cấp tính 49 3.4 Phương pháp xử lý số liệu 49 Chương 4: KẾT QUẢ THẢO LUẬN 50 4.1 Phân lập chủng LAB xác định chỉ tiêu hình thái sinh lý sinh hóa 50 4.1.1 Phân lập LAB 50 4.1.2 Xác định chỉ tiêu hình thái, sinh lý sinh hóa LAB 51 4.2 Kết xác định tính đối kháng vi khuẩn lactic với vi khuẩn V parahaemolyticus điều kiện in vitro 52 x 4.2.1 Kết xác định khả tạo bacteriocin tính kháng khuẩn LAB với V parahaemolyticus 56 4.2.2 Kết thí nghiệm khảo sát ảnh hưởng mật số nuôi vi khuẩn lactic thời gian ủ khác lên khả kháng V parahaemolyticus 58 4.2.3 Thử nghiệm nồng độ muối khác ảnh hưởng lên mật số vi khuẩn lactic 58 4.3 Thử nghiệm khả kháng bệnh hoại tử gan tụy cấp chủng LAB phương pháp cho ăn 60 4.3.1 Biến động yếu tố môi trường lô thí nghiệm 60 4.3.2 Kết kiểm tra chất lượng tôm thí nghiệm 61 4.3.3 Ảnh hưởng việc bổ sung LAB vào thức ăn lên tỷ lệ sống khả kháng bệnh hoại tử gan tụy cấp tính tôm thẻ chân trắng (Penaeus vannamei) 61 4.4 Thử nghiệm khả kháng bệnh hoại tử gan tụy cấp tính chủng vi khuẩn lactic có bổ sung thành phần C,N,P (acid glutamic, KH2PO4, K2HPO4, đường trehalose) vào môi trường nước thí nghiệm 71 4.4.1 Mật số vi khuẩn Vibrio nước 71 4.4.2 Mật số vi khuẩn Vibrio tổng ruột tôm thí nghiệm 73 4.4.3 Mật số Vibrio có khuẩn lạc màu xanh ruột tôm thí nghiệm 75 4.4.4 Mật số vi khuẩn lactic ruột tôm thí nghiệm 77 4.4.5 Dấu hiệu bệnh lý tỷ lệ sống 80 4.4.6 Kết phân tích mô bệnh học 83 4.5 Kết định danh LAB có khả kháng mạnh nhất với vi khuẩn V parahaemolyticus 85 4.5.1 Kết định danh LAB1 phương pháp giải trình tự gen 16s 86 4.5.2 Kết định danh LAB2 phương pháp giải trình tự gen 16s 87 4.5.3 Kết định danh LAB3 phương pháp giải trình tự gen 16s 87 4.5.4 Kết định danh LAB4 phương pháp giải trình tự gen 16s 88 4.5.5 Kết định danh LAB5 phương pháp giải trình tự gen 16s 89 Chương KẾT LUẬN VÀ ĐỀ XUẤT 91 5.1 Kết luận 91 xi 5.2 Đề xuất 91 DANH MỤC BÀI BÁO ĐÃ CÔNG BỐ 92 TÀI LIỆU THAM KHẢO 93 xii DANH SÁCH BẢNG Bảng 2.1: Tỷ lệ thành phần nguyên tố protein vi khuẩn 13 Bảng 2.2: Các sản phẩm biến dưỡng kiểu hoạt động vi khuẩn lactic 26 Bảng 4.1: Các chỉ tiêu hình thái, sinh lý sinh hóa vi khuẩn lactic 51 Bảng 4.2: Biến động mật số LAB ở nồng độ muối khác theo thời gian nuôi cấy 59 Bảng 4.3: Biến động yếu tố thủy lý hóa lô thí nghiệm 60 Bảng 4.4: Biến động mật số Vibrio nước thí nghiệm 62 Bảng 4.5: Mật số vi khuẩn Vibrio tổng ruột tôm thẻ 64 Bảng 4.6: Mật số LAB ruột tôm thẻ thí nghiệm 67 Bảng 4.7: Biến động mật số Vibrio nước thí nghiệm 72 Bảng 4.8: Biến động mật độ vi khuẩn Vibrio tổng ruột tôm thí nghiệm 74 Bảng 4.9: Biến động mật độ vi khuẩn Vibrio có khuẩn lạc màu xanh ruột tôm thí nghiệm 75 Bảng 4.10: Biến động mật số LAB ruột tôm thí nghiệm 78 xiii DANH SÁCH HÌNH Hình 2.1: Sản lượng tôm nuôi giới Hình 2.2: Sản lượng tơm thẻ ni ở chấu Á giai đoạn 2011-2018 Hình 2.3: Diễn biến diện tích nuôi tôm thẻ chân trắng giai đoạn 20082014 Hình 2.4: Biểu bệnh hoại tử gan tụy cấp tính tơm 14 Hình 2.5: Mơ bệnh học tôm hoại tử gan tụy AHPND 16 Hình 2.6: Cây phát sinh lồi vi khuẩn lactic 22 Hình 4.1: Các chủng LAB được phân lập từ ruột tôm 50 Hình 4.2: Các chủng LAB được phân lập từ ruột cá rô phi 50 Hình 4.3: Các chủng LAB được phân lập từ bùn 51 Hình 4.4: Khả kháng khuẩn LAB với V parahaemolyticus Trà Vinh 53 Hình 4.5: Khả kháng V parahaemolyticus chủng vi khuẩn lactic phân lập được Trà Vinh 54 Hình 4.6: Khả kháng khuẩn LAB với V parahaemolyticus Sóc Trăng 54 Hình 4.7: Khả kháng khuẩn vi khuẩn lactic với vi khuẩn V parahaemolyticus ở tỉnh Sóc Trăng 55 Hình 4.8: Khả kháng khuẩn LAB với V parahaemolyticus Bến Tre 55 Hình 4.9: Khả kháng khuẩn vi khuẩn lactic với vi khuẩn V parahaemolyticus ở tỉnh Bến Tre 56 Hình 4.10: Kết xác định khả tạo bacteriocin tính kháng khuẩn LAB với V parahaemolyticus 57 Hình 4.11: Tỷ lệ chết tôm qua từng mốc thời gian thí nghiệm 68 Hình 4.12: Tỷ lệ sớng tơm thẻ được cho ăn thức ăn có bổ sung LAB 68 Hình 4.13: Mơ bệnh học tơm thí nghiệm 71 xiv Hình 4.14: Hình tôm gan tụy tôm 80 Hình 4.15: Tỷ lệ chết tơm qua từng giai đoạn thí nghiệm 82 Hình 4.16: Tỷ lệ sống tôm thẻ chân trắng sau 14 ngày cảm nhiễm 82 Hình 4.17: Kết mô bệnh học gan tụy tôm 85 Hình 4.18: Kết tương đồng chủng LAB1 với Lactobacillus plantarum 86 Hình 4.19: Kết tương đồng chủng LAB2 với Pediocococcus pentosaceus 87 Hình 4.20: Kết tương đồng chủng LAB3 với Lactococus garvieae 88 Hình 4.21: Kết tương đồng chủng LAB4 với Lactobacillus fermentum 89 Hình 4.22: Kết tương đồng chủng LAB5 với Pediocococcus pentosaceus 90 xv CÔNG TY TNHH DỊCH VỤ VÀ THƯƠNG MẠI NAM KHOA 793/58 Trần Xuân Soạn, P Tân Hưng, Q.7, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam Phone: (08)37715818; (08)37752252 Fax: (08)37750583; (08)37752250 Email: phhvan.nkbiotek@gmail.com Email: namkhoa.biotek@gmail.com ISO 9001:2008 ISO 13485 WHO GMP/GLP KẾT QUẢ THÍ NGHIỆM Số: EK2610 THÔNG TIN VỀ MẪU THỬ Nơi gởi mẫu: TRẦN VIỆT TIẾN Mẫu thử: Mẫu vi khuẩn L7 Yêu cầu: Định danh phương pháp giải trình tự gen 16S PHƯƠNG PHÁP THỰC HIỆN ⌦ Giải trình tự gen 16S rRNA tra cứu BLAST SEARCH Kết Gram MRS Kết giải trình tự gen 16S ATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGA ACTCTGGTATTGATTGGTGCTTGCATCATGATTTACATTTGAGTGAGTGGCGAACT GGTGAGTAACACGTGGGAAACCTGCCCAGAAGCGGGGGATAACACCTGGAAACA GATGCTAATACCGCATAACAACTTGGACCGCATGGTCCGAGTTTGAAAGATGGCT TCGGCTATCACTTTTGGATGGTCCCGCGGCGTATTAGCTAGATGGTGGGGTAAC GGCTCACCATGGCAATGATACGTAGCCGACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTG GGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCAC AATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCT CGTAAAACTCTGTTGTTAAAGAAGAACATATCTGAGAGTAACTGTTCAGGTATTGA CGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAG Kết tra cứu BLAST SEARCH Lactobacillus plantarum JDM1, complete genome Sequence ID: gb|CP001617.1|Length: 3197759Number of Matches: Related Information Range 1: 484855 to 485384GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 979 bits(530) 0.0 530/530(100%) 0/530(0%) Plus/Plus Query ATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGAACTCTG 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 484855 ATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGAACTCTG 484914 Query 61 GTATTGATTGGTGCTTGCATCATGATTTACATTTGAGTGAGTGGCGAACTGGTGAGTAAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 484915 GTATTGATTGGTGCTTGCATCATGATTTACATTTGAGTGAGTGGCGAACTGGTGAGTAAC 484974 Query 121 ACGTGGGAAACCTGCCCAGAAGCGGGGGATAACACCTGGAAACAGATGCTAATACCGCAT 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 484975 ACGTGGGAAACCTGCCCAGAAGCGGGGGATAACACCTGGAAACAGATGCTAATACCGCAT 485034 Query 181 AACAACTTGGACCGCATGGTCCGAGTTTGAAAGATGGCTTCGGCTATCACTTTTGGATGG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 485035 AACAACTTGGACCGCATGGTCCGAGTTTGAAAGATGGCTTCGGCTATCACTTTTGGATGG 485094 Query 241 TCCCGCGGCGTATTAGCTAGATGGTGGGGTAACGGCTCACCATGGCAATGATACGTAGCC 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 485095 TCCCGCGGCGTATTAGCTAGATGGTGGGGTAACGGCTCACCATGGCAATGATACGTAGCC 485154 Query 301 GACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGG 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 485155 GACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGG 485214 Query 361 CAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAACGCCGCGTGAGTGA 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 485215 CAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGAAAGTCTGATGGAGCAACGCCGCGTGAGTGA 485274 Query 421 AGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAACTCTGTTGTTAAAGAAGAACATATCTGAGAGTAACTGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 485275 AGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAACTCTGTTGTTAAAGAAGAACATATCTGAGAGTAACTGT Query 481 TCAGGTATTGACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAG 530 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 485335 K T LU N TCAGGTATTGACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAG 485384 Lactobacillus plantarum TP Hồ Chí Minh, ngày 28 tháng 10 năm 2015 TRƯỞNG PHỊNG TS.BS.Phạm Hùng Vân 485334 CÔNG TY TNHH DỊCH VỤ VÀ THƯƠNG MẠI NAM KHOA 793/58 Trần Xuân Soạn, P Tân Hưng, Q.7, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam Phone: (08)37715818; (08)37752252 Fax: (08)37750583; (08)37752250 Email: phhvan.nkbiotek@gmail.com Email: namkhoa.biotek@gmail.com ISO 9001:2008 WHO GMP/GLP ISO 13485 Số: EG1832/2015/DVVS KẾT QUẢ THÍ NGHIỆM THÔNG TIN VỀ MẪU THỬ Nơi gởi mẫu: NGUYỄN THỊ TRÚC LINH Mẫu thử: Mẫu vi khuẩn TV5 Yêu cầu: Định danh phương pháp giải trình tự gen 16S PHƯƠNG PHÁP THỰC HIỆN ⌦ Giải trình tự gen 16S rRNA tra cứu BLAST SEARCH Kết GRAM Kết giải trình tự gen 16S CTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAAATACCGTCACTGGGTAAACAGTT ACTCTTACCCACGTTCTTCTTTAACAACAGAGCTTTACGAGCCGAAACCCTTCTTC ACTCACGCGGCGTTGCTCCATCAGACTTGCGTCCATTGTGGAAGATTCCCTACTGC TGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAATGTGGCCGATTACCCTCT CAGGTCGGCTACGTATCACTGCCTTGGTGAGCCTTTACCTCACCAACTAGCTAATA CGCCGCGGGTCCATCCAGAAGTGATAGCAGAGCCATCTTTTAAAAGAAAACCATG CGGTTTTCTCTGTTATACGGTATTAGCATCTGTTTCCAGGTGTTATCCCCTACTTCT GGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTTCGCCACTCACTTCGTGTTAAAATCT CAATCAGTACAAGTACGTCATAATCAATTAACGGAAGTTCGTTCGACTTGCATGT ATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGAT Kết tra cứu BLAST SEARCH Pediococcus pentosaceus strain 12 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: gb|KP119819.1|Length: 1538Number of Matches: Related Information Range 1: to 548GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 998 bits(540) 0.0 540/540(100%) 0/540(0%) Plus/Minus Query CTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAAATACCGTCACTGGGTAAACAGTTACTC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 548 CTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAAATACCGTCACTGGGTAAACAGTTACTC 489 Query 61 TTACCCACGTTCTTCTTTAACAACAGAGCTTTACGAGCCGAAACCCTTCTTCACTCACGC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 488 TTACCCACGTTCTTCTTTAACAACAGAGCTTTACGAGCCGAAACCCTTCTTCACTCACGC 429 Query 121 GGCGTTGCTCCATCAGACTTGCGTCCATTGTGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 428 GGCGTTGCTCCATCAGACTTGCGTCCATTGTGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAG 369 Query 181 GAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAATGTGGCCGATTACCCTCTCAGGTCGGCTACGTAT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 368 GAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAATGTGGCCGATTACCCTCTCAGGTCGGCTACGTAT 309 Query 241 CACTGCCTTGGTGAGCCTTTACCTCACCAACTAGCTAATACGCCGCGGGTCCATCCAGAA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 308 CACTGCCTTGGTGAGCCTTTACCTCACCAACTAGCTAATACGCCGCGGGTCCATCCAGAA 249 Query 301 GTGATAGCAGAGCCATCTTTTAAAAGAAAACCATGCGGTTTTCTCTGTTATACGGTATTA 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 248 GTGATAGCAGAGCCATCTTTTAAAAGAAAACCATGCGGTTTTCTCTGTTATACGGTATTA 189 Query 361 GCATCTGTTTCCAGGTGTTATCCCCTACTTCTGGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 188 GCATCTGTTTCCAGGTGTTATCCCCTACTTCTGGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCC 129 Query 421 GTTCGCCACTCACTTCGTGTTAAAATCTCAATCAGTACAAGTACGTCATAATCAATTAAC 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 128 GTTCGCCACTCACTTCGTGTTAAAATCTCAATCAGTACAAGTACGTCATAATCAATTAAC 69 Query 481 GGAAGTTCGTTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGAT 540 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 68 GGAAGTTCGTTCGACTTGCATGTATTAGGCACGCCGCCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGAT KẾT LUẬN Pediococcus pentosaceus TP Hồ Chí Minh, ngày 18 tháng 07 năm 2015 TRƯỞNG PHỊNG TS.BS.Phạm Hùng Vân CƠNG TY TNHH DỊCH VỤ VÀ THƯƠNG MẠI NAM KHOA 793/58 Trần Xuân Soạn, P Tân Hưng, Q.7, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam Phone: (08)37715818; (08)37752252 Fax: (08)37750583; (08)37752250 Email: phhvan.nkbiotek@gmail.com Email: namkhoa.biotek@gmail.com ISO 9001:2008 WHO GMP/GLP ISO 13485 Số: EG1832/2015/DVVS KẾT QUẢ THÍ NGHIỆM THƠNG TIN VỀ MẪU THỬ Nơi gởi mẫu: NGUYỄN THỊ TRÚC LINH Mẫu thử: Mẫu vi khuẩn TV18 Yêu cầu: Định danh phương pháp giải trình tự gen 16S PHƯƠNG PHÁP THỰC HIỆN ⌦ Giải trình tự gen 16S rRNA tra cứu BLAST SEARCH Kết GRAM Kết giải trình tự gen 16S ATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGAT GATTAAAGATAGCTTGCTATTTTTATGAAGAGCGGCGAACGGGTGAGTAACGCGT GGGAAATCTGCCGAGTAGCGGGGGACAACGTTTGGAAACGAACGCTAATACCGCA TAACAATGAGAATCGCATGATTCTTATTTAAAAGAAGCAATTGCTTCACTACTTGA TGATCCCGCGTTGTATTAGCTAGTTGGTAGTGTAAAGGACTACCAAGGCGATGATA CATAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGAC TCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCGGCAATGGGGGCAACCCTGACCGAG CAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGTTAGAGAA GAACGTTAAGTAGAGTGGAAAATTACTTAAGTGACGGTATCTAACCAGAAAGGGA CGGCTAACTACGTGCCAG Kết tra cứu BLAST SEARCH Lactococcus garvieae culture-collection CECT:4531 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: gb|KF012886.1|Length: 805Number of Matches: Related Information Range 1: to 521GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 952 bits(515) 0.0 515/515(100%) 0/515(0%) Plus/Plus Query ATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGATGATTA 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct ATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAGCGATGATTA 66 Query 61 AAGATAGCTTGCTATTTTTATGAAGAGCGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGGAAATCTG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 67 AAGATAGCTTGCTATTTTTATGAAGAGCGGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGGAAATCTG 126 Query 121 CCGAGTAGCGGGGGACAACGTTTGGAAACGAACGCTAATACCGCATAACAATGAGAATCG 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 127 CCGAGTAGCGGGGGACAACGTTTGGAAACGAACGCTAATACCGCATAACAATGAGAATCG 186 Query 181 CATGATTCTTATTTAAAAGAAGCAATTGCTTCACTACTTGATGATCCCGCGTTGTATTAG 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 187 CATGATTCTTATTTAAAAGAAGCAATTGCTTCACTACTTGATGATCCCGCGTTGTATTAG 246 Query 241 CTAGTTGGTAGTGTAAAGGACTACCAAGGCGATGATACATAGCCGACCTGAGAGGGTGAT 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 247 CTAGTTGGTAGTGTAAAGGACTACCAAGGCGATGATACATAGCCGACCTGAGAGGGTGAT 306 Query 301 CGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCT 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 307 CGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCT 366 Query 361 TCGGCAATGGGGGCAACCCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 367 TCGGCAATGGGGGCAACCCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATC 426 Query 421 GTAAAACTCTGTTGTTAGAGAAGAACGTTAAGTAGAGTGGAAAATTACTTAAGTGACGGT 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 427 GTAAAACTCTGTTGTTAGAGAAGAACGTTAAGTAGAGTGGAAAATTACTTAAGTGACGGT Query 481 ATCTAACCAGAAAGGGACGGCTAACTACGTGCCAG 515 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 487 ATCTAACCAGAAAGGGACGGCTAACTACGTGCCAG KẾT LUẬN 521 Lactococcus garvieae TP Hồ Chí Minh, ngày 27 tháng 07 năm 2015 TRƯỞNG PHỊNG TS.BS.Phạm Hùng Vân 486 CƠNG TY TNHH DỊCH VỤ VÀ THƯƠNG MẠI NAM KHOA 793/58 Trần Xuân Soạn, P Tân Hưng, Q.7, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam Phone: (08)37715818; (08)37752252 Fax: (08)37750583; (08)37752250 Email: phhvan.nkbiotek@gmail.com Email: namkhoa.biotek@gmail.com ISO 9001:2008 WHO GMP/GLP ISO 13485 Số: EG1832/2015/DVVS KẾT QUẢ THÍ NGHIỆM THƠNG TIN VỀ MẪU THỬ Nơi gởi mẫu: NGUYỄN THỊ TRÚC LINH Mẫu thử: Mẫu vi khuẩn TV11 Yêu cầu: Định danh phương pháp giải trình tự gen 16S PHƯƠNG PHÁP THỰC HIỆN ⌦ Giải trình tự gen 16S rRNA tra cứu BLAST SEARCH Kết GRAM Kết giải trình tự gen 16S ATCCTGGCTCAGGATGAACGCCGGCGGTGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGCG TTGGCCCAATTGATTGATGGTGCTTGCACCTGATTGATTTTGGTTGCCAACGAGTG GCGGACGGGTGAGTAACACGTAGGTAACCTGCCCAGAAGCGGGGGACAACATTTG GAAACAGATGCTAATACCGCATAACAGCGTTGTTCGCATGAACAACGCTTAAAAG ATGGCTTCTCGCTATCACTTCTGGATGGACCTGCGGTGCATTAGCTTGTTGGTGGG GTAACGGCCTACCAAGGCGATGATGCATAGCCGAGTTGAGAGACTGATCGGCCAC AATGGGACTGAGACACGGCCCATACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTC CACAATGGGCGCAAGCCTGATGGAGCAACACCGCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGG CTCGTAAAGCTCTGTTGTTAAAGAAGAACACGTATGAGAGTAACTGTTCATACGTT GACGGTATTTAACCAGAAAGTCACGGCTAACTACGTGCCA Kết tra cứu BLAST SEARCH Lactobacillus fermentum 3872, complete genome Sequence ID: gb|CP011536.1|Length: 2297851Number of Matches: Related Information Range 1: 216985 to 217522GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 989 bits(535) 0.0 537/538(99%) 0/538(0%) Plus/Plus Query ATCCTGGCTCAGGATGAACGCCGGCGGTGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGCGTTGGC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 216985 ATCCTGGCTCAGGATGAACGCCGGCGGTGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGCGTTGGC 217044 Query 61 CCAATTGATTGATGGTGCTTGCACCTGATTGATTTTGGTTGCCAACGAGTGGCGGACGGG 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 217045 CCAATTGATTGATGGTGCTTGCACCTGATTGATTTTGGTTGCCAGCGAGTGGCGGACGGG 217104 Query 121 TGAGTAACACGTAGGTAACCTGCCCAGAAGCGGGGGACAACATTTGGAAACAGATGCTAA 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217105 TGAGTAACACGTAGGTAACCTGCCCAGAAGCGGGGGACAACATTTGGAAACAGATGCTAA 217164 Query 181 TACCGCATAACAGCGTTGTTCGCATGAACAACGCTTAAAAGATGGCTTCTCGCTATCACT 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217165 TACCGCATAACAGCGTTGTTCGCATGAACAACGCTTAAAAGATGGCTTCTCGCTATCACT 217224 Query 241 TCTGGATGGACCTGCGGTGCATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGATGA 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217225 TCTGGATGGACCTGCGGTGCATTAGCTTGTTGGTGGGGTAACGGCCTACCAAGGCGATGA 217284 Query 301 TGCATAGCCGAGTTGAGAGACTGATCGGCCACAATGGGACTGAGACACGGCCCATACTCC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217285 TGCATAGCCGAGTTGAGAGACTGATCGGCCACAATGGGACTGAGACACGGCCCATACTCC 217344 Query 361 TACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGGCGCAAGCCTGATGGAGCAACACCG 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217345 TACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGGCGCAAGCCTGATGGAGCAACACCG 217404 Query 421 CGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAGCTCTGTTGTTAAAGAAGAACACGTATGAG 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217405 CGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAGCTCTGTTGTTAAAGAAGAACACGTATGAG Query 481 AGTAACTGTTCATACGTTGACGGTATTTAACCAGAAAGTCACGGCTAACTACGTGCCA 217464 538 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 217465 KẾT LUẬN AGTAACTGTTCATACGTTGACGGTATTTAACCAGAAAGTCACGGCTAACTACGTGCCA 217522 Lactobacillus fermentum TP Hồ Chí Minh, ngày 27 tháng 07 năm 2015 TRƯỞNG PHỊNG TS.BS.Phạm Hùng Vân CƠNG TY TNHH DỊCH VỤ VÀ THƯƠNG MẠI NAM KHOA 793/58 Trần Xuân Soạn, P Tân Hưng, Q.7, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam Phone: (08)37715818; (08)37752252 Fax: (08)37750583; (08)37752250 Email: phhvan.nkbiotek@gmail.com Email: namkhoa.biotek@gmail.com ISO 9001:2008 WHO GMP/GLP ISO 13485 Số: EG1832/2015/DVVS KẾT QUẢ THÍ NGHIỆM THƠNG TIN VỀ MẪU THỬ Nơi gởi mẫu: NGUYỄN THỊ TRÚC LINH Mẫu thử: Mẫu vi khuẩn TV28 Yêu cầu: Định danh phương pháp giải trình tự gen 16S PHƯƠNG PHÁP THỰC HIỆN ⌦ Giải trình tự gen 16S rRNA tra cứu BLAST SEARCH Kết GRAM Kết giải trình tự gen 16S ATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGAA CTTCCGTTAATTGATTATGACGTACTTGTACTGATTGAGATTTTAACACGAAGTGA GTGGCGAACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCCAGAAGTAGGGGATAACAC CTGGAAACAGATGCTAATACCGTATAACAGAGAAAACCGCATGGTTTTCTTTTAAA AGATGGCTCTGCTATCACTTCTGGATGGACCCGCGGCGTATTAGCTAGTTGGTGAG GTAAAGGCTCACCAAGGCAGTGATACGTAGCCGACCTGAGAGGGTAATCGGCCAC ATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTC CACAATGGACGCAAGTCTGATGGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGG CTCGTAAAGCTCTGTTGTTAAAGAAGAACGTGGGTAAGAGTAACTGTTTACCCAGT GACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCA Kết tra cứu BLAST SEARCH Pediococcus pentosaceus strain 12 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Sequence ID: gb|KP119819.1|Length: 1538Number of Matches: Related Information Range 1: to 547GenBankGraphicsNext MatchPrevious Match Alignment statistics for match #1 Score Expect Identities Gaps Strand 996 bits(539) 0.0 539/539(100%) 0/539(0%) Plus/Plus Query ATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGAACTTCC 60 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct ATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGAACTTCC 68 Query 61 GTTAATTGATTATGACGTACTTGTACTGATTGAGATTTTAACACGAAGTGAGTGGCGAAC 120 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 69 GTTAATTGATTATGACGTACTTGTACTGATTGAGATTTTAACACGAAGTGAGTGGCGAAC 128 Query 121 GGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCCAGAAGTAGGGGATAACACCTGGAAACAGATGC 180 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 129 GGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGCCCAGAAGTAGGGGATAACACCTGGAAACAGATGC 188 Query 181 TAATACCGTATAACAGAGAAAACCGCATGGTTTTCTTTTAAAAGATGGCTCTGCTATCAC 240 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 189 TAATACCGTATAACAGAGAAAACCGCATGGTTTTCTTTTAAAAGATGGCTCTGCTATCAC 248 Query 241 TTCTGGATGGACCCGCGGCGTATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCAGTG 300 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 249 TTCTGGATGGACCCGCGGCGTATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCAGTG 308 Query 301 ATACGTAGCCGACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTC 360 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 309 ATACGTAGCCGACCTGAGAGGGTAATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTC 368 Query 361 CTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGCAAGTCTGATGGAGCAACGCC 420 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 369 CTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCCACAATGGACGCAAGTCTGATGGAGCAACGCC 428 Query 421 GCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAGCTCTGTTGTTAAAGAAGAACGTGGGTAA 480 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 429 GCGTGAGTGAAGAAGGGTTTCGGCTCGTAAAGCTCTGTTGTTAAAGAAGAACGTGGGTAA Query 481 GAGTAACTGTTTACCCAGTGACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCA 488 539 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 489 GAGTAACTGTTTACCCAGTGACGGTATTTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCA KẾT LUẬN Pediococcus pentosaceus TP Hồ Chí Minh, ngày 27 tháng 07 năm 2015 TRƯỞNG PHÒNG TS.BS.Phạm Hùng Vân 547 ...TÓM TẮT Tuyển chọn vi khuẩn lactic (LAB) kháng với vi khuẩn gây bệnh hoại tử gan tụy cấp tính (Vibrio parahaemolyticus) tôm thẻ chân trắng (Penaeus vannamei) được thực... vi khuẩn gây bệnh hoại tử cấp tính, đồng thời làm tăng khả gây bệnh hoại tử gan tụy cấp tính tơm thẻ Chương 2: TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Sơ lược tôm thẻ chân trắng Theo ITIS (2016), tôm thẻ chân. .. đề cấp bách vi c phòng trị bệnh hoại tử gan tụy cấp tính góp phần giảm thiểu nhiễm mơi trường nâng cao chất lượng tôm biển thị trường giới Vi c tuyển chọn vi khuẩn lactic kháng với vi khuẩn gây