Phân lập và nghiên cứu các đặc tính dịch tễ học phân tử của các chủng listeria monocytogenes được phân lập trên địa bàn hà nội

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA HÀ NỘI - PHAN THỊ HƯƠNG TRÀ ĐỀ TÀI: PHÂN LẬP VÀ NGHIÊN CỨU CÁC ĐẶC TÍNH DỊCH TỄ HỌC PHÂN TỬ CỦA CÁC CHỦNG LISTERIA MONOCYTOGENES ĐƯỢC PHÂN LẬP TRÊN ĐỊA BÀN HÀ NỘI LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NGÀNH: CÔNG NGHỆ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS LÊ QUANG HÒA HÀ NỘI - 2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà LỜI CẢM ƠN Khóa luận nghiên cứu không thực hỗ trợ nhiều người Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc đến TS Lê Quang Hòa – Phòng Hóa sinh Sinh học phân tử - Viện CNSH & CNTP – Trường ĐHBK Hà Nội, người hướng dẫn tận tình suốt thời gian làm việc phòng thí nghiệm sẵn sàng giúp đỡ, hỗ trợ nghiên cứu để hoàn thành khóa luận tốt nghiệp Tôi muốn bày tỏ lòng cảm ơn tới thầy, cô thuộc Viện Công nghệ sinh học Công nghệ thực phẩm dạy bảo giúp đỡ trình học tập Đặc biệt cảm ơn đến tất cán nhân viên phòng thí nghiệm Hóa sinh Sinh học phân tử, phòng thí nghiệm Công nghệ cao phòng thí nghiệm Công nghệ sinh học với bạn sinh viên, học viên, nghiên cứu sinh thực tập nhiệt tình giúp đỡ trình tiến hành thí nghiệm Cuối xin cảm ơn gia đình tôi, người thân bạn bè cổ vũ, động viên suốt trình học tập hoàn thành luận văn Học viên Phan Thị Hương Trà Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan, nội dung trình bày luận văn tìm tòi, nghiên cứu thân Các kết nghiên cứu trung thực chưa công bố luận văn tác giả khác Tôi xin chịu trách nhiện nội dung cam đoan Hà Nội, ngày 25 tháng 10 năm 2010 Tác giả Phan Thị Hương Trà Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà MỤC LỤC Trang LỜI CẢM ƠN 0  LỜI CAM ĐOAN 1  MỤC LỤC 2  DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT 5  MỞ ĐẦU 6  PHẦN I TỔNG QUAN 8  I.1 Tổng quan L monocytogenes 8  I.1.1 Các đặc tính L monocytogenes 8  I.1.1.1 Đặc hình thái 9  I.1.1.2 Đặc tính sinh lý 10  I.1.1.3 Đặc tính sinh hoá 11  I.1.1.4 Đặc tính huyết học 12  I.1.1.5 Đặc điểm cấu trúc phân tử đường xâm nhiễm .14  I.1.2 Con đường lây nhiễm bệnh L monocytogenes gây 21  I.1.2.1 Con đường lây nhiễm L monocytogenes 21  I.1.2.2 Bệnh L monocytogenes gây .22  I.1.3 Tình hình ngộ độc thực phẩm L monocytogenes gây 24  I.1.3.1 Trên giới 24  I.1.3.2 Ở Việt Nam 28  I.1.3.3 Quy định kiểm soát L monocytogenes 30  I.2 Các phương pháp phát L monocytogenes 31  I.2.1 Các phương pháp truyền thống 31  I.2.1.1 Phương pháp dựa đặc điểm hình thái vi sinh vật học 31  I.2.1.2 Phương pháp sinh hóa 32  I.2.1.3 Phương pháp huyết học 35  I.2.2 Các phương pháp không truyền thống 36  I.2.2.1 Phương pháp ELISA (Enzyme-Linked Immuno Sorbent Assay) 36  I.2.2.2 Phương pháp lai phân tử DNA (DNA-Hybridization) 37  Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà I.2.2.3 Phương pháp PCR (Polymerase Chain Reaction) 39  I.3 Các phương pháp xác định kiểu phụ L monocytogenes 42  I.3.1 Phương pháp xác định kiểu phụ dựa kiểu hình 43  I.3.1.1 Phương pháp huyết học 43  I.3.1.2 Phương pháp dựa kiểu thể thực khuẩn 43  I.3.1.3 Phương pháp MLEE (multilocus enzyme electrophoresis) 44  I.3.1.4 Phương pháp xác định kiểu phụ dựa kiểu esterase .44  I.3.2 Phương pháp xác định kiểu phụ dựa kiểu gen 45  I.3.2.1 Phương pháp PFGE (pulsed-field gel electrophoresis) 45  I.3.2.2 Phương pháp ribotyping 47  I.3.2.3 Các phương pháp dựa kỹ thuật PCR .48  I.3.2.4 Phương pháp xác định kiểu phụ dựa trình tự DNA .50  I.4 Các phương pháp xác định độc tính L monocytogenes 51  I.4.1 Thử nghiệm độc tính chuột 51  I.4.2 Thử nghiệm độc tính dòng tế bào 52  I.4.3 Xét nghiệm dựa gen protein liên quan tới độc tính 53  PHẦN II VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .55  II.1 Vật liệu .55  II.1.1 Nguyên liệu 55  II.1.2 Chủng vi sinh vật 55  II.1.3 Hóa chất 56  II.1.4 Thiết bị 57  II.2 Phương pháp nghiên cứu .57  II.2.1 Xây dựng quy trình phân lập L monocytogenes từ thực phẩm .57  II.2.1.1 Giai đoạn tăng sinh từ mẫu thực phẩm ban đầu 57  II.2.1.2 Giai đoạn chọn lọc môi trường rắn 57  II.2.1.3 Giai đoạn tăng sinh chủng bảo quản giống 61  II.2.1.4 Thí nghiệm xác định chu kỳ phát triển L monocytogenes 61  II.2.2 Nghiên cứu dịch tễ học phân tử chủng phân lập .63  II.2.2.1 Thu DNA làm khuôn cho phản ứng PCR .63  Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà II.2.2.2 Thực phản ứng PCR .63  II.2.2.3 Kiểm tra kết PCR điện di gel agarose 64  II.2.2.4 Tinh sản phẩm PCR giải trình tự gen .64  II.2.2.5 Phương pháp phân tích trình tự gen .66  PHẦN III KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN .68  III.1 Xây dựng quy trình phân lập L monocytogenes từ thực phẩm 68  III.1.1 Thí nghiệm xác định chu kỳ phát triển L monocytogenes 68  III.1.2 Kết phân lập L monocytogenes môi trường chọn lọc 71  III.2 Nghiên cứu dịch tễ học phân tử chủng phân lập .74  III.2.1 Kiểm tra độ nhạy phản ứng PCR 74  III.2.2 Khảo sát số chu kỳ cần thiết phản ứng PCR 77  III.2.3 Kết tinh DNA 79  III.2.4 Kết giải trình tự gen 81  II.2.4.1 Tinh trình tự gen 81  III.2.4.2 Xác định kiểu phụ chủng dựa trình tự gen đặc trưng 83  III.2.4.3 Phân tích dịch tễ học phân tử chủng phân lập 87  PHẦN IV KẾT LUẬN VÀ ĐỀ NGHỊ 94  IV.1 Kết luận 94  IV.2 Đề nghị 95  TÀI LIỆU THAM KHẢO 96  PHỤ LỤC .104  Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà DANH MỤC CÁC KÝ HIỆU, CÁC CHỮ VIẾT TẮT STT Ký hiệu Tên đầy đủ aw Water activity (hoạt độ nước) DNA Axit Deoxyribonucleic bp Base pair (cặp bazơ) dNTP Deoxynucleotide EDTA Ethylen Diamine Tetra acetic Acid EtBr Ethidium Bromide MVLST A multi-virulence-locus sequence typing kDa Kilo Dalton LAMP Loop-Mediated Isothermal Amplification of DNA 10 PCR Polymerase Chain Reaction 11 PEG Polyetylen Glycol 12 TAE Tris - Acetate - EDTA 13 TE Tris - EDTA 14 PBS Phosphate Buffered Saline- muối đệm phosphate 15 HFb Half Fraser Broth (Môi trường tiền tăng sinh Lm) 16 Fb Fraser Broth (Môi trường tăng sinh Lm) 17 CFU Colony forming unit (Số đơn vị hình thành khuẩn lạc) 18 CAMP Christie, Atkins, Munch-Petersen Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà MỞ ĐẦU Listeria monocytogenes vi sinh vật gây bệnh nguy hiểm người động vật Trong tự nhiên, L monocytogenes có phạm vi phân bố rộng, tìm thấy nhiều nơi đất, nước, thực vật, nhiều loại thực phẩm, thức ăn gia súc có phân người phân động vật Một đặc tính đặc biệt loài vi khuẩn chúng có khả tồn phát triển điều kiện nhiệt độ thấp nên mặt hàng đông lạnh thịt, xúc xích, sản phẩm bơ, sữa …có nguy cao bị nhiễm loại vi khuẩn Bệnh L monocytogenes gây gọi chung listeriosis Đối tượng có nguy bị nhiễm bệnh cao thường người có hệ thống miễn dịch hoạt động trẻ sơ sinh, phụ nữ mang thai, người lớn tuổi bệnh nhân mắc hội chứng suy giảm miễn dịch Hậu bệnh gây lớn Trong giai đoạn bị nhiễm bệnh, người bệnh thường biểu triệu chứng lâm sàng không đặc trưng giống người bị cảm cúm thông thường (như ớn lạnh, mệt mỏi, đau đầu, mỏi xương) – người ta thường không nhận biết lây nhiễm loại vi khuẩn Nếu độc tính đủ mạnh chúng gây ngộ độc thực phẩm cấp tính với triệu chứng nôn mửa, tiêu chảy, đau bụng, viêm dày Tuy nhiên, không điều trị kịp thời thuốc kháng sinh, chúng phát triển gây nhiễm trùng máu, viêm màng não, sẩy thai gây tử vong Với tỷ lệ tử vong cao, lên tới gần 30%, L monocytogenes nguy hiểm nhiều so với tác nhân gây bệnh thông qua thực phẩm phổ biến Salmonella (với tỷ lệ tử vong 0,38%), Campylobacter (0,02-0,1%) Vibrio (0.005-0,01%) Vi khuẩn L monocytogenes Tổ chức Y tế Thế giới xếp vào nhóm tác nhân sinh học có nguy cao lĩnh vực an toàn vệ sinh thực phẩm Các ca nhiễm bệnh L monocytogenes xảy nước Châu Âu, Châu Mỹ, Châu Phi nước khu vực Châu Á có xu hướng ngày tăng Trong vài trường hợp, chúng bùng phát thành dịch bệnh diện rộng Ở Việt Nam, với phát triển kinh tế , lối sống công ngiệp hóa nhu cầu sử dụng thực phẩm chế biến sẵn sữa sản phẩm sữa, trứng Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà sản phẩm trứng, đặc biệt thực phẩm đông lạnh ngày gia tăng bữa ăn hàng ngày người dân nguy nhiễm bệnh L monocytogenes ngày cao Tuy nước ta chưa có trường hợp nhiễm bệnh báo cáo liên quan đến L monocytogenes có số nghiên cứu phát nhiễm tạp loại vi khuẩn số loại thực phẩm chế biến sẵn Bên cạnh đó, khả gây bệnh dịch chủng L monocytogenes có nguồn gốc từ thực phẩm nước ta nói chung Hà Nội nói riêng chưa xác định Do vậy, khuôn khổ luận văn cao học này, nghiên cứu “Phân lập xác định độc tính dịch tễ học phân tử chủng Listeria monocytogenes từ mẫu thực phẩm thu thập địa bàn Hà Nội” Nghiên cứu giải vấn đề sau: ¾ Xây dựng quy trình phân lập L monocytogenes từ thực phẩm ¾ Áp dụng quy trình xây dựng để phân lập chủng L monocytogenes từ mẫu thực phẩm địa bàn Hà Nội ¾ Nghiên cứu dịch tễ học chủng phân lập dựa việc phân tích trình tự gen mang độc tính – MVLST (Multi-virulence-locus sequence typing) Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà PHẦN I TỔNG QUAN I.1 Tổng quan L monocytogenes I.1.1 Các đặc tính L monocytogenes L monocytogenes loại vi khuẩn khiến phụ nữ mang thai bị sẩy thai, gây bệnh viêm màng não người già người có hệ miễn dịch yếu [51] L monocytogenes biết đến lần vào năm 1911 Hulpher, nhà vi sinh vật học Thụy Điển, phân lập loài vi khuẩn từ bệnh hoại tử gan thỏ ông đặt tên Bacillus hepatic Các đặc tính loài vi khuẩn Hulpher mô tả cho thấy giống với L monocytogenes Năm 1926, Muray đặt tên monocytogenes cho loài đồng nghiệp ông cho loài bacillus có khả hoạt động sinh monocytosis (hiện tượng tăng lượng bạch cầu mức bình thường) thỏ chuột lang Đồng thời vào năm 1927, Pirie trình nghiên cứu nguyên nhân gây bệnh dịch động vật Nam Phi phát vi sinh vật đặt tên Listerella hepatolytica Hai tác giả Murray Pirie gửi chủng họ tới NCTC (National Collection of Type Cultures) London Sự giống đặc tính hai chủng dẫn đến kết Murray Pirie thống gọi vi khuẩn Listerella monocytogenes Năm 1929, Nyfeldt lần phân lập loài vi khuẩn từ người Sau đó, Pirie đề xuất đổi tên từ Listerella monocytogenes thành L monocytogenes [51] Về phân loại học, chi Listeria chia làm sáu loài L monocytogenes, L ivanovii, L innocua, L welshimeri, L seeligeri, L gray Tuy vậy, có L monocytogenes L ivanovii có khả gây bệnh [56] Nhiều nghiên cứu cho thấy, L monocytogenes có khả gây bệnh cho người động vật L ivanovii chủ yếu gây bệnh cho động vật thấy chúng gây bệnh cho người [43] Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà 30 Jersek, B., Gilot, P., Gubina, M., Klun, N., Mehle, J., Tcherneva, E., Rijpens, N & Herman, L (1999), “Typing of L monocytogenes strains by repetitive element sequence-based PCR”, J Clin Microbiol 37, pp 103–109 31 J Denny, J McLauchlin (2008), “Human L monocytogenes infections in EuropeAn opportunity for improved European surveillance”, Eurosurveillance, Volume 13, Isue 13 32 Jinneman, K C & Hill, W E (2001), “L monocytogenes lineage group classification by MAMA-PCR of the listeriolysin gene”, Curr Microbiol 43, pp 129–133 33 Kathariou, S (2002), “L monocytogenes virulence and pathogenicity, a food safety perspective”, J Food Prot 65, 1811–1829 34 Kerouanton, A., Brisabois, A., Denoyer, E., Dilasser, F., Grout, J., Salvat, G & Picard, B (1998), “Comparison of five typing methods for the epidemiological study of L monocytogenes”, Int J Food Microbiol 43, pp 61–71 35 Keto-Timonen, R O., Autio, T J & Korkeala, H J (2003), “An improved amplified fragment length polymorphism (AFLP) protocol for discrimination of Listeria isolates”, Syst Appl Microbiol 26, pp 236–244 36 Klinger, J D., Johnson, A., Croan, D., Flynn, P., Whippie, K., Kimball, M., Lawrie, J & Curiale, M (1988), “Comparative studies of nucleic acid hybridization assay for Listeria in foods”, J Assoc Off Anal Chem 71, pp 669– 673 37 Kohler, S., Leimeister-Wachter, M., Chakraborty, T., Lottspeich, F & Goebel, W (1990), “The gene coding for protein p60 of L monocytogenes and its use as a specific probe for L monocytogenes”, Infect Immun 58, pp 1943–1950 38 Liu, D., Ainsworth, A J., Austin, F W & Lawrence, M L (2003), “Characterization of virulent and avirulent L monocytogenes strains by PCR amplification of putative transcriptional regulator and internalin genes”, J Med Microbiol 52, pp 1066–1070 39 Liu, D., Ainsworth, A J., Austin, F W & Lawrence, M L (2004), “Use of PCR primers derived from a putative transcriptional regulator gene for species- 99 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà specific identification of L monocytogenes”, Int J Food Microbiol 91, pp 297– 304 40 Liu, D., Lawrence, M., Gorski, L., Mandrell, R E., Austin, F W & Ainsworth, A J (2006), “L monocytogenes serotype 4b strains belonging to lineages I and III possess distinct molecular features”, J Clin Microbiol 44, pp 204–207 41 Loessner, M J & Busse, M (1990), “Bacteriophage typing of Listeria species”, Appl Environ Microbiol 56, pp 1912–1918 42 Loessner, M J (1991), “Improved procedure for bacteriophage typing of Listeria strains and evaluation of new phages”, Appl Environ Microbiol 57, pp 882–884 43 Low, J C & Donachie, W (1997), “A review of L monocytogenes and listeriosis”, Vet J, 153, pp 9–29 44 Manzano, M., Cocolin, L., Cantoni, C & Comi, G (2000), “Temperature gradient gel electrophoresis of the amplified productof a small 16S rRNA gene fragment for the identification of Listeriaspecies isolated from food”, J Food Prot 63, pp 659–661 45 Nishibori, T., Cooray, K., Xiong, H., Kawamura, I., Fujita, M & Mitsuyama, M (1995), “Correlation between the presence of virulence-associated genes as determined by PCR and actual virulence to mice in various strains of Listeria spp”, Microbiol Immunol 39, pp 343–349 46 O’Donoghue, K., Bowker, K., McLauchlin, J., Reeves, D S., Bennett, P M & MacGowan, A P (1995), “Typing of L monocytogenes by random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis”, Int J Food Microbiol 27, pp 245–252 47 Olier, M., Pierre, F., Lemaitre, J P., Divies, C., Rousset, A & Guzzo, J (2002), “Assessment of the pathogenic potential of two L monocytogenes human faecal carriage isolates”, Microbiology 148, pp 1855–1862 48 Palumbo, J D., Borucki, M K., Mandrell, R E & Gorski, L (2003), “Serotyping of L monocytogenes by enzyme-linked immunosorbent assay and identification of mixed-serotype cultures by colony immunoblotting”, J Clin Microbiol 41, pp 564–571 100 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà 49 Piffaretti, J.-C., Kressebuch, H., Aeschenbacher, M., Bille, J., Bannerman, E., Musser, J M., Seelander, R K & Rocourt, J (1989), “Genetic characterization of clones of the bacterium L monocytogenes causing epidemic disease” Proc Natl Acad Sci USA 86, pp 3818–3822 50 Pine, L., Kathariou, S., Quinn, F., George, V., Wenger, J D & Weaver, R E (1991), “Cytopathogenic effects in enterocytelike Caco-2 cells differentiate virulent from avirulent Listeria strains”, J Clin Microbiol 29, pp 990–996 51 P I Peterkin and J M Farber (1991), “L monocytogenes, a Food-Borne Pathogen”, Microbiological reviews S Vol55, pp 476-511 52 Rasmussen, O F., Skouboe, P., Dons, L., Rossen, L & Olsen, J E (1995), “L monocytogenes exists in at least three evolutionary lines: Evidence from flagellin, invasive associated protein and listeriolysin O genes, Microbiology 141, pp 2053–2061 53 Reed, L J & Muench, H (1938), “A simple method of estimating fifty per cent endpoints”, Am J Hyg 27, pp 493–497 54 Ripabelli, G., McLauchin, J & Threlfall, E J (2000), “Amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis of L monocytogenes”, Syst Appl Microbiol 23, pp 132–136 55 Roberts, A., Chan, Y & Wiedmann, M (2005), “Definition of genetically distinct attenuation mechanisms in naturally virulence-attenuated L monocytogenes by comparative cell culture and molecular characterization”, Appl Environ Microbiol 71, pp 3900–3910 56 Robinson, R K., Batt, C A & Patel, P D (editors) (2000), “Encyclopedia of Food Microbiology”, San Diego, CA: Academic Press 57 Roche, S M., Velge, P., Bottreau, E., Durier, C., Marquet-van der Mee, N & Pardon, P (2001), “Assessment of the virulence of L monocytogenes: agreement between a plaque-forming assay with HT-29 cells and infection of immunocompetent mice”, Int J Food Microbiol 68, pp 33–44 58 Roche, S M., Gracieux, P., Milohanic, P & other authors (2005), “Investigation of specific substitutions in virulence genes characterizing 101 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà phenotypic groups of low-virulence field strains of L monocytogenes”, Appl Environ Microbiol 71, pp 6039–6048 59 Rocourt, J & Catimel, B (1985), “Biochemical characterization of species in the genus Listeria”, Zentralbl Bakteriol Mikrobiol Hyg [A]260, pp 221–231.9 60 Seeliger, H P R & Jones, D (1986), “Listeria In Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology”, vol 2, pp 1235–1245 61 Vazquez-Boland, J A., Kuhn, M., Berche, P., Chakraborty, T., DominguezBernal, G., Goebel, W., Gonzalez-Zorn, B., Wehlan, J & Kreft, J (2001), “Listeria pathogenesis and molecular virulence determinants”, Clin Microbiol Rev 14, pp 584–640 62 Volokhov, D., Rasooly, A., Chumakov, K & Chizhikov, V (2002), “Identification of Listeria species by microarray-based assay”, J Clin Microbiol 40, pp 4720–4728 63 Wang, R F., Cao, W W., Wang, H & Johnson, M G (1993), “A 16S rRNAbased DNA probe and PCR method specific for Listeria ivanovii”, FEMS Microbiol Lett 106, pp 85–92 64 Ward, T J., Gorski, L., Borucki, M K., Mandrell, R E., Hutchins, J & Pupedis, K (2004), “Intraspecific phylogeny and lineage group identification based on the prfA virulence gene cluster of L monocytogenes”, J Bacteriol 186, pp 4994–5002 65 Wei Zhang, Bhushan M Jayarao, and Stephen J Knabel (2003), “MultiVirulence-Locus Sequence Typing of L monocytogenes”, American Society for Microbiology, Vol 70, No 66 Welkos, S & O’Brien, A (1994), “Determination of median lethal and infectious doses in animal model systems”, Methods Enzymol 235, pp 29–39 67 Wiedmann, M., Bruce, J L., Knorr, R., Bodis, M., Cole, E M.,McDowell, C I., McDonough, P L & Batt, C A (1996), “Ribotype diversity of L monocytogenes strains associated with outbreaks of listeriosis in ruminants”, J Clin Microbiol 34, pp 1086–1090 102 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà 68 Wiedmann, M., Bruce, J L., Keating, C., Johnson, A E., McDonough, P L & Batt, C A (1997), “Ribotypes and virulence gene polymorphisms suggest three distinct L monocytogenes lineages with differences in pathogenic potential”, Infect Immun 65, pp 2707–2716 69 Yi Chen, Wei Zhang, and Stephen J Knabel (2006), “Multi-Virulence-Locus Sequence Typing Identifies Single Nucleotide Polymorphisms Which Differentiate Epidemic Clones and Outbreak Strains of L monocytogenes”, American Society for Microbiology Vol 45, No 70 http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html 71 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 103 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà PHỤ LỤC ¾ Phụ lục Thành phần môi trường Môi trường Half-Fraser Broth Thành phần Nồng độ Polypeptone 10,00 g/l Yeast extract 5,00 g/l Meat extract 5,00 g/l Sodium choloride 20,00 g/l Disodium phosphate, anhydrous 9,60 g/l Monopotassium phosphate 1,35 g/l Esculin 1,00 g/l Lithium chloride 3,00 g/l Nalidixic acid 10,0 mg/l Acriflavine (chlorhydrate) 12,5 mg/l Ferric ammonium citrate Fraser Broth 0,5 g/l Polypeptone 10,00 g/l Yeast extract 5,00 g/l Meat extract 5,00 g/l Sodium choloride 20,00 g/l Disodium phosphate, anhydrous 9,60 g/l Monopotassium phosphate 1,35 g/l Esculin 1,00 g/l Lithium chloride 3,00 g/l Nalidixic acid 20,0 mg/l Acriflavine (chlorhydrate) 25 mg/l Ferric ammonium citrate 0,50 g/l 104 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà ¾ Phụ lục Trình tự gen inlB 25 chủng so sánh >XX31 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >XX40 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >XX5 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GAATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATTTTTAAAGCGGAAACGACTGAA AAAGCAGTGAATTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGGATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACGCTTGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTTTAACTGTTGATAGAGAAGCGCGAAA TGGCAGTGAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGNCCAAAGCTGAAAATCTTTCCTTAGACC >XX34 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >M1 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >TX7 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >M2 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAAAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >TX12 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC 105 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà >LM2 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >TX8 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >TX6 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >LM3 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >XX32 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL6 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL9 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL12 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL13 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA 106 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL85 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL92 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL95 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL98 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >AL213 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GGATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATGTTTAAAGTGGAAACGACTGAA AAAGCGGTGAACTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGCATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCACTTAAACAAGGAACGCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGGAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >H12 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GAATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATTTTTAAAGCGGAAACGACTGAA AAAGCAGTGAATTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGGATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACGCTTGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTTTAACTGTTGATAGAGAAGCGCGAAA TGGCAGTGAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACCAAAGCTGAAAATCTTTCCTTAGACC >NV5 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAAGCAGGGACGCGGATAACTG CACCTAAACCTCCGACTAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGATGGTATACTGAAAAAAATGGTGGGCATGAGTG GAATTTTAATACGGATTATATGTCCGGAAATGATTTTACTTTGTACGCAGTATTTAAAGCGGAAACGACCGAA AAAGCAGTCAACTTAACCCGCTATGTCAAATATATTCGCGGGAATGCAGGCATCTACAAACTTCCACGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACTCTAGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTCTAACTGTTGATAGAGAAGCCCGAAA TGGCGGAAAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACTAAAGCGGAAAACCTTTCCTTAGACC >VN3 GTTTACACAGTAAGTTATGATGTTGATGGAACGGTAATAAAAACAAAAGTAGAGGCAGGGACGCGAATAACTG CACCTAAACCTCCGACCAAACAAGGCTATGTTTTTAAAGGCTGGTATACTGAAAAAAATGGTGGACATGAGTG GAATTTTAGTACGGATTATATGTCCGGAAACGATTTTACTTTGTACGCGATTTTTAAAGCGGAAACGACTGAA AAAGCAGTGAATTTAACACGCTATGTTAAATATATTCGCGGGAATGCGGGGATCTACAAACTTCCAAGAGAAG ATAACTCGCTTAAACAAGGAACGCTTGCCTCGCACCGCTGTAAAGCTTTAACTGTTGATAGAGAAGCGCGAAA TGGCAGTGAATTATGGTACAGGTTAAAAAATATTGGCTGGACCAAAGCTGAAAATCTTTCCTTAGACC 107 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà ¾ Phụ lục Trình tự gen inlC 25 chủng so sánh >XX31 AACTTCATCTATCCCATAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >XX40 AACTTCATCTATCCCATAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >XX5 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >XX34 AACTTCATCTATCCCACCATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >M1 AACTTCATCTATCCCATAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTANATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >TX7 AACTTCATCTATCCCACCATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >M2 AACTTCATCTATCCCATAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATTTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >TX12 AACTTCATCTATCCCACCATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG 108 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà >LM2 AACTTCATCTATCCCACCATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >TX8 AACTTCATCTATCCCACCATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGANTANAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >TX6 AACTTCATCTATCCCACCATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTNGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >LM3 AACTTCATCTATCCCACCATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >XX32 AACTTCATCTATCCCACCATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATTTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGATTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL6 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL9 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL12 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL13 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC 109 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL85 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL92 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL95 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL98 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >AL213 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >H12 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >NV5 AACTTCATCTATCCCATAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAGTTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAACAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGCTTGTTTTTAGATAAC AACGAACTCAGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGT TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCAAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAAATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG >VN3 AACTTCATCTATCCCACAATCAAATAAGTGACCTTAGTCCTTTAAAGGATCTAACTAAATTAGAAGAGCTATC TGTGAATAGAAATAGACTGAAAAATTTAAACGGAATTCCAAGTGCTTGTTTATCTCGTTTGTTTGTAGATAAC AACGAACTCCGAGATACTGACTCGCTTATTCATTTGAAAAATCTAGAAATCTTATCTATTCGTAATAATAAGC TAAAAAGTATTGTGATGCTTGGTTTTTTATCTAAACTAGAGGTATTAGATTTGCATGGTAATGAAATAACAAA TACAGGTGGACTAACTAGATTGAAGAAAGTTAACTGGATAGATTTAACTGGTCAGAAATGTGTGAATGAACCA GTAAGATACCAACCAGAATTGTATATAACAAATACTGTCAAAGACCCAGATGG 110 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà ¾ Phụ lục Trình tự gen clpP 25 chủng so sánh >XX31 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >XX40 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >XX5 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >XX34 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >M1 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAAAAAACTG >TX7 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >M2 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >TX12 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAAAAAACTG 111 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà >LM2 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAAAAAACTG >TX8 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAAAAAACTG >TX6 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >LM3 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAAAAAACTG >XX32 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAAAAAACTG >AL6 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >AL9 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >AL12 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >AL13 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG 112 Công nghệ sinh học 2008-2010 Luận văn thạc sĩ Phan Thị Hương Trà CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >AL85 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >AL92 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACGG >AL95 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >AL98 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >AL213 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >H12 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >NV5 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGACAACGTGGCGAATTCC ATCGTTTCTCAATTATTATTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTGTACATCAATTCTCCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACAATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGTTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGCGGTGCTCAAGGTCAAGCAACTGAAATCGAGATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG >VN3 CATTTATTCCCGTTTATTAAAAGACAGAATTATTATGTTAGGATCTGCAATTGATGATAACGTGGCGAATTCG ATCGTTTCTCAATTACTCTTCTTAGATGCACAAGATCCTGAAAAAGATATTTTCCTATATATCAATTCACCAG GTGGAAGTATTTCAGCTGGTATGGCCATTTACGATACAATGAATTTCGTTAAAGCGGACGTACAAACTATCGG CATGGGTATGGCAGCTTCCATGGGCTCATTCTTACTAACAGCTGGTGCAAATGGCAAACGGTTTGCCTTGCCA AACGCTGAAATTATGATTCACCAACCACTTGGTGGCGCTCAAGGTCAAGCGACTGAAATCGAAATCGCTGCTC GCCACATTTTAAAAATCAAAGAACGTATGAATACGATTATGGCTGAGAAAACTG 113 Công nghệ sinh học 2008-2010 ... Nội nói riêng chưa xác định Do vậy, khuôn khổ luận văn cao học này, nghiên cứu Phân lập xác định độc tính dịch tễ học phân tử chủng Listeria monocytogenes từ mẫu thực phẩm thu thập địa bàn Hà. .. Hà Nội Nghiên cứu giải vấn đề sau: ¾ Xây dựng quy trình phân lập L monocytogenes từ thực phẩm ¾ Áp dụng quy trình xây dựng để phân lập chủng L monocytogenes từ mẫu thực phẩm địa bàn Hà Nội ¾ Nghiên. .. nghiệm xác định chu kỳ phát triển L monocytogenes 68  III.1.2 Kết phân lập L monocytogenes môi trường chọn lọc 71  III.2 Nghiên cứu dịch tễ học phân tử chủng phân lập .74  III.2.1 Kiểm tra độ nhạy