Đánh giá đa hình di truyền nguồn gen chịu hạn phục vụ công tác lập bản đồ QTL ở một số giống lúa địa phương việt nam

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO TRƯỜNG ĐẠI HỌC BÁCH KHOA HÀ NỘI ********* PHẠM THỊ HOA ĐÁNH GIÁ ĐA HÌNH DI TRUYỀN NGUỒN GEN CHỊU HẠN PHỤC VỤ CÔNG TÁC LẬP BẢN ĐỒ QTL Ở MỘT SỐ GIỐNG LÚA ĐỊA PHƯƠNG VIỆT NAM   CHUYÊN NGÀNH: CÔNG NGHỆ SINH HỌC LUẬN VĂN THẠC SỸ CÔNG NGHỆ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC TS NGUYỄN THỊ THANH THỦY HÀ NỘI - 2011 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan trực tiếp thực nghiên cứu luận văn Mọi kết thu nguyên bản, không chỉnh sửa chép từ nghiên cứu khác Các số liệu, sơ đồ kết luận văn chưa công bố Tôi xin hoàn toàn chịu trách nhiệm với lời cam đoan trên! Học viên Phạm Thị Hoa i LỜI CẢM ƠN Trước hết, xin gửi lời cảm ơn chân thành sâu sắc tới TS Nguyễn Thị Thanh Thủy, người tận tình hướng dẫn, giúp đỡ bảo hỗ trợ suốt trình công tác thời gian học tập, nghiên cứu hoàn thành luận văn Tôi xin bày tỏ lòng biết ơn tới thầy cô cán công tác Viện Công nghệ Sinh học thực phẩm, Viện Đào tạo Sau Đại học- Trường Đại học Bách khoa Hà Nội giảng dạy tạo điều kiện thuận lợi cho suốt trình học tập trường Tôi xin chân thành cảm ơn cán bộ, anh chị em Bộ môn Sinh học phân tử- Viện Di truyền Nông nghiệp giúp đỡ động viên trình công tác thực luận văn Cuối xin gửi lời cảm ơn chân thành tới gia đình, bạn bè người thân động viên, khuyến khích giúp vượt qua khó khăn suốt trình nghiên cứu Luận văn thực với nguồn kinh phí từ Quỹ phát triển Khoa học Công nghệ Quốc gia Học viên PHẠM THỊ HOA ` ii MỤC LỤC MỞ ĐẦU CHƯƠNG TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 Giới thiệu chung lúa 1.1.1 Nguồn gốc, phân bố lúa .4 1.1.2 Phân loại lúa .5 1.2 Nguồn tài nguyên lúa Việt Nam 1.2.1 Tài nguyên lúa hoang dại - Oryza granulata : Ở tỉnh vùng Tây Bắc 1.2.2 Tài nguyên lúa trồng Việt Nam 1.3 Hạn hán chế tính chống chịu hạn thực vật .9 1.3.1 Khái niệm phân loại hạn hán 1.3.2 Phân loại hạn hán trồng 1.3.3 Tác hại hạn hán lúa 10 1.3.4 Cơ sở sinh lý hóa sinh tính chống chịu hạn lúa 11 1.4 Các phương pháp nghiên cứu đa dạng di truyền 16 1.4.1 Chỉ thị hình thái 17 1.4.2 Chỉ thị sinh hóa 18 1.4.3 Chỉ thị phân tử ADN 18 1.5 Bản đồ QTL 24 1.5.1 Giới thiệu chung đồ QTL 24 1.5.2 Một số nghiên cứu QTL kiểm soát tính trạng chịu hạn lúa 25 1.6 Nghiên cứu đánh giá đa dạng di truyền lúa 26 1.6.1 Nghiên cứu đánh giá đa dạng di truyền lúa giới .26 1.6.2 Nghiên cứu đánh giá đa dạng di truyền lúa nước .28 CHƯƠNG VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .31 2.1 Vật liệu nghiên cứu 31 2.1.1 Các giống lúa nghiên cứu 31 2.1.2 Hóa chất thiết bị thí nghiệm 32 iii 2.2 Phương pháp nghiên cứu .32 2.2.1 Phương pháp đánh giá khả chịu hạn 41 giống lúa nghiên cứu 32 2.2.2 Phương pháp tách chiết ADN tổng số .33 2.2.3 Kỹ thuật SSR .35 2.2.4 Phương pháp tạo quần thể lập đồ 36 2.2.5 Phân tích số liệu 36 CHƯƠNG KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ THẢO LUẬN 39 3.1 Kết đánh giá khả chịu hạn 41 giống lúa .39 3.2 Kết đánh giá đa hình di truyền giống lúa nghiên cứu .43 3.2.1 Kết tách chiết ADN tổng số giống lúa nghiên cứu 44 3.2.2 Kết phân tích đa hình ADN thị phân tử SSR 46 3.2.3 Kết phân tích mối quan hệ di truyền giống lúa nghiên cứu 55 3.3 Kết lai tạo quần thể xác định thị cho đa hình hai giống bố mẹ phục vụ công tác lập đồ QTL 61 3.3.1 Kết chọn cặp lai tiềm lai tạo quần thể lập đồ 61 3.3.2 Đánh giá đa hình hai giống bố mẹ phục vụ lập đồ QTL 64 CHƯƠNG KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ .69 4.1 Kết luận .69 4.2 Kiến nghị 69 TÀI LIỆU THAM KHẢO 70 iv CHỮ VIẾT TẮT ABA : Abcisis acid AFLPs (Amplified Fragment Length : Đa hình chiều dài đoạn nhân chọn lọc Polymorphism) ADN : Acid Deoxyribonucleic bp (Base pair) : Cặp bazơ nitơ cs : Cộng CTAB : Cetyltrimethyl Amonium Bromide dNTPs : Deoxynucleotide triphosphate EDTA : Ethylenediaminetetra Acetic Acid EtBr : Ethidium bromide EST : Expressed sequence tag GD (Genetic dictance) : Khoảng cách di truyền HG (Heterogeneity) : Tỷ lệ dị hợp tử ISSR : Inter-simple sequence repeat Kb : Kilo base M (missing) : Tỉ lệ khuyết số liệu NaCl : Sodium chloride OD (optical density) : Mật độ quang PCR (Polymerase Chain Reaction) : Phản ứng chuỗi trùng hợp PIC (Polymorphism Information : Chỉ số thông tin đa hình mồi Content) QTL (quantity trait loci) : Locus kiểm soát tính trạng số lượng RNAse : Ribonuclease RAPD (Random Amplification of : Đa hình ADN nhân ngẫu Polymorphic DNA) RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) nhiên : Đa hình chiều dài đoạn phân cắt giới hạn v SDS : Sodium Dodecyl Sulphate SSR (Simple Sequence repeat) : Sự lặp lại trình tự đơn giản STS (Sequennce Tagged Site) : Điểm trình tự đánh dấu TBE : Tris-Boric Acid-EDTA TT : Thứ tự TE : Tris-EDTA UV : Ultraviolet vi DANH MỤC BẢNG TT Bảng Trang Bảng 1.1 Phân loại chi Oryza Bảng 1.2 Vai trò số chất xuất thực vật bị thiếu nước 12 Bảng 2.1 Danh sách giống lúa sử dụng nghiên cứu 30-31 Bảng 2.2 Thời điểm đánh giá tiêu khả chịu hạn 32 Bảng 2.2 Thang điểm đánh giá khả chịu hạn (SES- IRRI) 32 Bảng 2.3 Thành phần phản ứng PCR 34 Bảng 2.4 Chu trình nhiệt phản ứng PCR 34 Bảng 3.1 Kết đánh giá khả chịu hạn 41 giống lúa 40-41 Bảng 3.2 Danh sách giống lúa có khả chịu hạn tốt giống lúa mẫn cảm với điều kiện khô hạn Bảng 3.3 Độ tinh nồng độ ADN giống lúa nghiên cứu 42 Bảng 3.4 Tỷ lệ khuyết số liệu dị hợp tử giống lúa nghiên cứu Bảng 3.5 Chỉ tiêu số alen số đa dạng di truyền PIC thị nghiên cứu Bảng 3.6 Chỉ tiêu tần số alen phổ biến nhất, alen đặc trưng tỷ lệ dị hợp tử thị nghiên cứu Bảng 3.7 Các thị SSR cho alen đặc trưng 18 giống lúa 47-48 50 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 44 51-52 53 Bảng 3.8 Một số kết phân tích đa dạng di truyền SSR lúa 54 công bố Bảng 3.9 Mối quan hệ di truyền 41 giống lúa nghiên cứu 57-58 Bảng 3.10 Khoảng cách di truyền cặp lai dựa khả chống 61 chịu tốt/ mẫn cảm với điều kiện khô hạn 62 Bảng 3.11 Danh sách cặp lai tiềm Bảng 3.12 Danh sách quần thể F2 có số đạt yêu cầu sử dụng lập đồ QTL Bảng 3.13 Kết phân tích đa hình cặp lai Bảng 3.14 Số lượng thị cho đa hình/ nhiễm sắc thể cặp bố mẹ Q5 Bieò hồng súi vii 62 64 66 DANH MỤC HÌNH TT Hình Trang Hình 1.1 Sơ đồ tiến hóa hai loài lúa trồng Hình 3.1 Hình ảnh giống lúa trước ngừng tưới 38 Hình 3.2 Hình ảnh giống lúa sau 21 ngày ngừng tưới 39 Hình 3.3.Tỷ lệ giống lúa có khả chịu hạn khác với điều kiện khô hạn 39 Hình 3.4 ADN tổng số tách chiết từ mẫu 41 giống lúa theo phương pháp CTAB cải tiến gel agarose 0,8% 43 Hình 3.5 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR 41 giống lúa với thị RM1364 45 Hình 3.6 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR 41 giống lúa với thị RM3288 45 Hình 3.7 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR 41 giống lúa với thị RM3467 46 Hình 3.8 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR 41 giống lúa với thị RM3468 46 10 Hình 3.9 Hình ảnh điện di sản phẩm PCR 41 giống lúa với thị RM259 46 11 Hình 3.10 Sơ đồ hình biểu diễn mối quan hệ di truyền 41 giống lúa nghiên cứu 59 12 Hình 3.11 Điện di sản phẩm PCR hai giống lúa Q5 Bieò hồng súi với 15 thị SSR gel agarose SFR3,5% 63 13 Hình 3.12 Điện di sản phẩm PCR hai giống lúa Khang dân Ble ch- cấu với 15 thị SSR gel agarose SFR 3,5% 63 14 65 Hình 3.13 Hình ảnh điện di số thị SSR với cặp bố mẹ Q5 Bieò hồng súi viii Luận văn thạc sỹ khoa học Công nghệ Sinh Học MỞ ĐẦU Tính cấp thiết đề tài Cây lúa lương thực chủ yếu nuôi sống nửa dân số giới, phần lớn thuộc nước phát triển Cây lúa gieo trồng 114 quốc gia, tập trung chủ yếu châu Á, Phi, Mỹ Latinh Đây nước có tỷ lệ dân số tăng cao nhu cầu lúa gạo ngày nhiều Tuy nhiên nước này, đặc biệt nước châu Á, diện tích trồng lúa giảm mạnh mở rộng vùng dân cư, khu công nghiệp giao thông Thêm vào đó, điều kiện bất lợi môi trường lũ lụt, hạn hán, xâm nhập mặn… nguyên nhân làm cho sản lượng lúa giảm [2],[81] Theo đánh giá nhà chuyên môn, khô hạn yếu tố gây ảnh hưởng đến an ninh lương thực giới, làm giảm tới 70% suất trồng nói chung [19] Trong lúa ngoại lệ Hàng năm 46 nghìn đất trồng lúa châu Á canh tác nhờ nước mưa tự nhiên Vì vậy, hạn hán yếu tố gây ảnh hưởng nghiêm trọng đến sản lượng lúa đời sống người dân vùng này, nơi mà lúa gạo nguồn lương thực [55] Thêm vào đó, việc khan nước tưới phục vụ cho sản xuất lúa xảy thường xuyên vùng có hệ thống tưới tiêu khiến cho suất lúa giảm đáng kể, ảnh hưởng nhiều đến sống nông dân Ngành sản xuất lúa không đối mặt với hạn hán mà tượng nước biển dâng làm diện tích trồng lúa giảm mạnh Trong Việt Nam nước bị thiệt hại nhiều nhất, đặc biệt vùng Đồng sông Cửu Long, nơi sản xuất lúa gạo phục vụ xuất [81] Trong bối cảnh đó, để đảm bảo an ninh lương thực phát triển bền vững, lúa phải canh tác vùng đất trung du miền núi, nơi dựa vào nguồn nước tưới tự nhiên Tuy chiếm diện tích không nhiều suất thấp lúa địa phương đóng vai trò quan trọng việc cung cấp lương thực chỗ cho vùng khó khăn Mặt khác giống lúa địa phương có nguồn gen phong Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học Công nghệ Sinh Học Thiết bị: + Máy ly tâm + Máy khuấy từ gia nhiệt + Máy đo pH + Máy nanodrop + Máy PCR + Bộ điện di ngang + Hệ thống soi gel 89 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học Công nghệ Sinh Học Phụ lục 3: Danh sách thị đa hình hai giống bố mẹ TT Tên NST TT Tên thị NST TT Tên thị NST TT Tên thị NST RM5 19 RM11553 37 RM1703 55 RM5592 RM495 20 RM1313 38 RM2275 56 RM5693 RM1003 21 RM1367 39 RM2416 57 RM6054 RM1349 22 RM3515 40 RM3288 58 RM6320 5 RM1387 23 RM6911 41 RM3534 59 RM7446 RM3468 24 RM8024 42 RM16382 60 RM8039 RM5501 25 RM13302 43 RM16559 61 RM17709 RM5781 26 RM145 44 RM16575 62 RM162 RM6334 27 RM166 45 RM13 63 RM19267 10 RM8047 28 RM3436 46 RM19 64 RM19318 11 RM8061 29 RM3467 47 RM267 65 RM19360 12 RM8062 30 RM6931 48 RM3476 66 RM3431 13 RM8133 31 RM7076 49 RM4674 67 RM3509 14 RM10000 32 RM7134 50 RM4691 68 RM3628 15 RM10086 33 RM14487 51 RM4710 69 RM5314 16 RM10227 34 RM14526 52 RM4777 70 RM5509 17 RM10383 35 RM1153 53 RM5140 71 RM6811 18 RM10974 36 RM1359 54 RM5579 72 RM6836 90 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học TT Tên Công nghệ Sinh Học NST TT Tên thị NST TT Tên thị NST TT Tên thị NST 73 RM8114 91 RM22597 109 RM23876 127 RM25949 11 74 RM1364 92 RM22674 110 RM24353 128 RM25998 11 75 RM1973 93 RM22703 111 RM24412 129 RM26290 11 76 RM2256 94 RM23022 112 RM2887 10 130 RM26319 11 77 RM6394 95 RM23330 113 RM3019 10 131 RM26362 11 78 RM6767 96 RM23364 114 RM3152 10 132 RM1103 12 79 RM7161 97 RM23420 115 RM5274 10 133 RM3483 12 80 RM8015 98 RM23510 116 RM5352 10 134 RM4552 12 81 RM8037 99 RM23555 117 RM6364 10 135 RM4552 12 82 RM21131 100 RM219 118 RM25319 10 136 RM4585 12 83 RM21725 101 RM285 119 RM6673 10 137 RM5479 12 84 RM25 102 RM524 120 RM6868 10 138 RM27402 12 85 RM152 103 RM566 121 RM25296 10 139 RM27515 12 86 RM8005 104 RM4413 122 RM4844 11 140 RM27552 12 87 RM8019 105 RM5102 123 RM4862 11 141 RM27613 12 88 RM8058 106 RM5384 124 RM5599 11 142 RM27863 12 89 RM22516 107 RM5657 125 RM6688 11 143 RM27888 12 90 RM22558 108 RM23851 126 RM7277 11 91 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học Công nghệ Sinh Học Phụ lục Hình ảnh gel cặp mồi 92 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học Công nghệ Sinh Học 93 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học Công nghệ Sinh Học 94 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học Công nghệ Sinh Học 95 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học Công nghệ Sinh Học Phụ lục Số liệu kiểu gen cặp mồi RM5 RM13 RM19 RM25 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 0 1 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 96 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học RM152 RM162 RM237 RM259 RM267 Công nghệ Sinh Học 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 97 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học RM495 RM566 RM1103 RM1153 6 4 Công nghệ Sinh Học 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 1 98 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học RM1313 RM1364 RM1367 7 # # # Công nghệ Sinh Học 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 1 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học RM3288 RM3431 RM3436 RM3467 RM3468 3 5 Công nghệ Sinh Học 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 1 100 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học RM3476 RM3483 RM3515 RM3534 Công nghệ Sinh Học 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 1 0 0 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 1 1 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 101 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học RM5501 RM5586 RM5599 Công nghệ Sinh Học 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 1 1 0 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 102 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa Luận văn thạc sỹ khoa học RM25271 RM25319 # Công nghệ Sinh Học 1 1 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 103 Phạm Thị Hoa Đại học Bách Khoa 1 ... Đánh giá đa hình di truyền nguồn gen chịu hạn phục vụ công tác lập đồ QTL số giống lúa địa phương Việt Nam Mục đích đề tài Kết hợp phân tích đa dạng di truyền giống lúa sử dụng thị SSR khả chịu. .. thiếu nguồn nước tưới [7] Chính vậy, việc khai thác, đánh giá nguồn gen chịu hạn từ giống lúa địa phương phục vụ lập đồ QTL, tạo tiền đề cho công tác chọn tạo giống lúa có suất cao khả chịu hạn. .. Kết đánh giá khả chịu hạn 41 giống lúa .39 3.2 Kết đánh giá đa hình di truyền giống lúa nghiên cứu .43 3.2.1 Kết tách chiết ADN tổng số giống lúa nghiên cứu 44 3.2.2 Kết phân tích đa hình