Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)

Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)Phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng (luận văn thạc sĩ)

I HC QUC GIA H NI TRNG I HC KHOA HC T NHIấN - Nguyn Th Ngc H PHN TCH PROTEOMICS Mễ UNG TH CA BNH NHN UNG TH I TRC TRNG LUN VN THC S KHOA HC H Ni Nm 2012 I HC QUC GIA H NI TRNG I HC KHOA HC T NHIấN - Nguyn Th Ngc H PHN TCH PROTEOMICS Mễ UNG TH CA BNH NHN UNG TH I TRC TRNG Chuyờn ngnh: Sinh hc thc nghim Mó s: 60 42 30 LUN VN THC S KHOA HC NGI HNG DN KHOA HC PGS.TS Trnh Hng Thỏi H Ni Nm 2012 LI CM N Tụi xin by t lũng bit n sõu sc ti PGS TS Trnh Hng Thỏi, ngi thy ó tn tỡnh ch bo, hng dn tụi sut thi gian hc tp, nghiờn cu khoa hc v thc hin lun ny Tụi cng xin trõn trng cm n cỏc thy giỏo, cụ giỏo khoa Sinh hc, trng i hc Khoa hc T nhiờn ó tn tỡnh ging dy, dỡu dt tụi sut thi gian hc ti Trng Tụi xin gi li cm n chõn thnh ti cỏc anh, ch, cỏc bn sinh viờn lm vic ti Phũng Proteomics v Sinh hc Cu trỳc thuc Phũng thớ nghim Trng im Cụng ngh Enzyme v Protein ó tn tỡnh giỳp tụi sut quỏ trỡnh hc v thc hin lun ti Phũng Trong quỏ trỡnh thc hin lun vn, tụi ó nhn c rt nhiu s quan tõm, giỳp ca cỏc cỏn b nhõn viờn thuc khoa T bo v Gii phu bnh, Bnh vin K Tam Hip, H Ni v khoa Gii phu bnh, Bnh vin Vit c, H ni Tụi xin chõn thnh cm n Cui cựng, tụi vụ cựng bit n gia ỡnh, bn bố, ng nghip ó luụn khớch l ng viờn tụi sut thi gian qua H Ni, thỏng 12 nm 2012 Hc viờn Nguyn Th Ngc H MC LC M U .1 Chng TNG QUAN 1.1 TNG QUAN V UNG TH I TRC TRNG 1.1.1 Ung th i trc trng l gỡ? .3 1.1.2 Nguyờn nhõn dn n ung th i trc trng .6 1.1.3 Cỏc h thng phõn loi giai on ung th i trc trng 1.2 NGHIấN CU CH TH SINH HC I VI UNG TH .12 1.2.1 Ch th sinh hc i vi ung th .12 1.2.2 Cỏc k thut sinh hc phõn t c ng dng nghiờn cu ch th sinh hc ung th 14 1.3 PROTEOMICS TRONG NGHIấN CU UNG TH I TRC TRNG 16 1.3.1 Proteomic l gỡ? 16 1.3.2 Cụng c nghiờn cu proteomics .17 1.3.3 ng dng ca proteomics nghiờn cu ung th i trc trng 19 Chng - NGUYấN LIU V PHNG PHP NGHIấN CU 28 2.1 NGUYấN LIU .28 2.1.1 i tng nghiờn cu .28 2.1.2 Húa cht 28 2.1.3 Thit b .29 2.2 PHNG PHP NGHIấN CU 29 2.2.1 X lý mu mụ i trc trng 29 2.2.2 nh lng protein bng phng phỏp Bradford .31 2.2.3 in di hai chiu .31 2.2.4 Phõn tớch hỡnh nh bn gel in di hai chiu 33 2.2.5 Ct v thy phõn spot .34 2.2.6 Phõn tớch ph v nhn dng protein 35 Chng - KT QU V BN LUN 37 3.1 TCH CHIT PROTEIN Mễ I TRC TRNG 37 3.2 PHN TCH PROTEIN Mễ I TRC TRNG TRấN BN GEL IN DI HAI CHIU 39 3.3 PHN TCH HèNH NH BN GEL IN DI HAI CHIU .41 3.4 XC NH PROTEIN BNG PHNG PHP MALDI-TOF MS 44 3.5 C IM, VAI TRề CA CC PROTEIN BIU HIN KHC BIT 52 3.5.1 Protein liờn quan n chu trỡnh t bo v apoptosis 56 3.5.2 Protein liờn quan n quỏ trỡnh dch v bo v c th 58 3.5.3 Protein tham gia cu trỳc t bo .60 3.5.4 Protein tham gia cỏc quỏ trỡnh trao i cht .61 3.5.5 Protein liờn quan n quỏ trỡnh phiờn mó, dch mó, ci bin sau phiờn mó, dch mó .62 KT LUN .64 KIN NGH 65 TI LIU THAM KHO 66 PH LC DANH SCH BNH NHN UNG TH I TRC TRNG C S DNG TRONG NGHIấN CU i PH LC KT QU NHN DIN PROTEIN BNG C S D LIU NCBI S DNG PHN MM MASCOT ii BNG Kí HIU V CC CH VIT TT 2-DE in di hai chiu (Two - Dimensional Electrophoresis) ABC Ammonium Bicarbonate AcCN Acetonitrile AFAP Hi chng a polyp tuyn nh di truyn (Attenuated Familial Adenomatous Polypsis) APC Adenomatous Polyposis Coli CHAPS 3-[(3-cholamidopropyl)dimethylammonio]-1-propanesulfonic acid CHCA -Cyano-4-hydroxycinnamic acid CEA Khỏng nguyờn phụi thai (Carcinoembryonic Antigen) CK Cytokeratin cs Cng s Da Dalton DTT Dithiothreitol ELISA Enzyme-linked immunosorbent assay FAP Hi chng a polyp tuyn gia ỡnh (Familial Adenomatous Polyposis) HCCS Suppressor of tumorigenicity 20 protein HNPCC Hi chng ung th i trng di truyn khụng phi a polyp (Hereditary Nonpolyposis Colon Cancer) HSP Protein sc nhit (Heat sock protein) HUPO T chc nghiờn cu h protein ngi (Human Proteome Organisation) IAA Iodoacetamide IEF in di phõn vựng ng in (Isoelectric Focusing) IPG Gradient pH c nh (Immobilized pH gradient) LC-MS/MS Sc k l ng kt ni vi ph (Liquid Chromatography coupled with tandem Mass Spectrometry) MALDI-TOF Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight MS Khi ph (Mass spectrometry) PBS m mui Photphat (Phosphate Buffer Saline) PMF c trng peptide (Peptide Mass Fingerprint) SDS Sodium dodecyl sulfate SDS-PAGE in di trờn gel polyacrylamide cú SDS (SDS-Polyacrylamide Gel Electrophoresis) SELDI-TOF Surface-enhanced laser desorption/ionization time - of - flight Spot im protein TAA Khỏng nguyờn liờn quan n u (Tumor Associated Antigens) TFA Trifluoroacetic acid TNM Tumor Lympho node Metastases DANH MC CC BNG Bng Cỏc giai on bnh TNM v t l sng sút cỏc giai on bnh khỏc Bng Cỏc húa cht chớnh s dng nghiờn cu Bng Cỏc bc chy in di ng in trờn IPG strip di 17cm Bng S lng spot protein phõn tỏch trờn bn gel in di hai chiu Bng Thng kờ cỏc spot protein biu hin khỏc bit trờn bn gel in di hai chiu ca bnh nhõn Bng Danh sỏch cỏc protein c xỏc nh bng MALDI TOF-MS t bn gel mụ ung th so sỏnh vi bn gel mụ i trc trng bỡnh thng ca bnh nhõn ung th i trc trng Bng Túm tt chc nng chớnh ca cỏc protein ó c nh danh biu hin khỏc bit gia mụ ung th i trc trng so vi mụ i trc trng bỡnh thng DANH MC CC HèNH Hỡnh Hỡnh nh i trc trng Hỡnh Cỏc giai on phỏt trin ca ung th i trc trng Hỡnh Phõn tớch hỡnh nh bn gel in di hai chiu s dng phn mm Phoretix Hỡnh in di kim tra cỏc phõn on dch chit protein t mụ i trc trng bỡnh thng v mụ ung th i trc trng trờn cựng bn gel polyacrylamide 10% cú SDS Hỡnh in di kim tra mu ta ca phõn on dch chit protein PBS v lysis t mụ i trc trng bỡnh thng v mụ ung th i trc trng Hỡnh Phõn tỏch protein mụ i trc trng ca bnh nhõn mó s 11781 trờn bn gel in di hai chiu Hỡnh Minh cỏc spot biu hin khỏc bit trờn bn gel mụ ung th so vi mụ bỡnh thng Hỡnh Cỏc spot protein biu hin khỏc bit gia bn gel in di hai chiu ca mu mụ ung th i trc trng so vi mu mụ i trc trng bỡnh thng ca bnh nhõn ung th i trc trng mó s 11781 Hỡnh Phõn tớch ph cỏc peptide thu c sau thy phõn protein T17B33 bng enzyme trypsin Hỡnh 10 Kt qu nhn dng protein bng tra cu c s d liu NCBI s dng phn mm Mascot Hỡnh 11 Cỏc nhúm protein theo chc nng Hỡnh 12 Quỏ trỡnh apoptosis t bo Hỡnh 13 S trỡnh din khỏng nguyờn ca phc h phự hp t chc mụ cho t bo lympho T Hỡnh 14 C ch tỏc dng ca Zinc finger protein i vi quỏ trỡnh phiờn mó Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà M U Ung th i trc trng l mt nhng bnh ung th ph bin nht trờn th gii, nú ng th ba ch sau ung th phi v ung th vỳ õy l cn bnh cú t l t vong cao v t l mc bnh cú xu hng ngy cng tng Theo thng kờ, nm 2008 c tớnh cú khong 1,24 triu ngi trờn th gii c chn oỏn l mc ung th i trc trng, chim khong 10% s cỏc loi ung th S ca t vong ung th i trc trng nm 2008 l 610.000 ca trờn ton th gii, chim khong 8% s lng t vong ung th Ti Vit Nam, ung th i trc trng l loi ung th ng th nm cỏc loi ung th thng gp, sau ung th d dy, phi, vỳ, vũm hng Theo thng kờ ca Bnh vin Ung Bu thnh ph H Chớ Minh, nm 2008, bnh vin cú 306 ca bnh ung th i trc trng v s ny ngy cng gia tng Tớnh n thỏng nm 2009, ó cú n trờn 220 bnh nhõn mi n iu tr ung th i trc trng ti õy [54] T l mc ung th i trc trng l 9% tng s bnh nhõn ung th [55] Vic chn oỏn v phỏt hin sm ung th i trc trng cú ngha rt quan trng, giỳp lm tng hiu qu iu tr bnh, gim t l t vong loi ung th ny gõy Thc t cho thy, nu phỏt hin u i trc trng giai on u v cha tr kp thi thỡ t l sng sút ca bnh nhõn sau nm s l 80 100% Hin nay, mt s phng phỏp xột nghim lõm sng ang c ỏp dng chn oỏn ung th i trc trng nh chn oỏn hỡnh nh thụng quan ni soi, sinh thit, chp X quang, xột nghim tỡm mỏu phõn, thm khỏm trc tip, s dng ch th CEA Nhc im ca cỏc phng phỏp ny l thng phỏt hin bnh giai on mun, phng phỏp ni soi thng gõy khú chu cho bnh nhõn, xột nghim mỏu phõn cho nhiu kt qu dng tớnh v õm tớnh gi nờn hiu qu chn oỏn v iu tr bnh khụng cao Vỡ vy, nhu cu t cho cỏc nh khoa hc l lm th no tỡm c cỏc ch th sinh hc c trng chn oỏn, phỏt hin ung th i trc trng giai on sm Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà KIN NGH T quỏ trỡnh nghiờn cu thc t, chỳng tụi a mt s kin ngh sau: Tip tc nhn dng cỏc spot protein biu hin khỏc bit gia mụ ung th i trc trng so vi mụ i trc trng bỡnh thng trờn s lng bnh nhõn ln hn nhm tỡm cỏc protein c trng cho ung th i trc trng Tip tc thu thp mu v phõn tớch proteomics mụ i trc trng ca bnh nhõn ung th i trc trng cỏc giai on ung th khỏc nhm phõn tớch s bin i thnh phn cỏc protein liờn quan n bnh 65 Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà TI LIU THAM KHO Ting Vit Phan Vn Chi (2006), Proteomics Khoa hc v h protein, Vin Khoa hc v Cụng ngh Vit Nam, H Ni Ngc Liờn (2004), Min dch hc c s, Nh xut bn i hc Quc gia H Ni Hunh Quyt Thng (2009), iu tr ung th i trc trng gia on II-III ti Bnh vin Ung bu Cn Th, Y Hc TP H Chớ Minh, 13(1), pp 177 186 Ting Anh Albrethsen J., Bứgebo R., Gammeltoft S., Olsen J., Winther B., Raskov H (2005), Upregulated expression of human neutrophil peptides 1, and (HNP 1-3) in colon cancer serum and tumours: a biomarker study, BMC Cancer, 5(1) Albrethsen J., Moller C H., Olsen J., Raskov H., Gammeltoft S (2006), Human neutrophil peptides 1, and are biochemical markers for metastatic colorectal cancer, Eur J Cancer, 42(17), pp 3057 64 Alfonso P., Nỳủez A., Lombardia L., and Sỏnchez L (2005), Proteomic expression analysis of colorectal cancer by two-dimensional differential gel electrophoresis, PROTEOMICS, 5(10), pp 2602-2611 Allal A.S., Kọhne T., Reverdin A K., Lippert H., Schlegel W., Reymond M A (2004), Radioresistance-related proteins in rectal cancer, PROTEOMICS, 4(8), pp 2261-2269 Bai X., Li S Y., Yu B., An P., Cai H Y., Du J F (2010), Proteome analysis of human colorectal cancer tissue using 2-D DIGE and tandem mass 66 Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà spectrometry for identification of disease-related proteins, African Journal of Biotechnology, (41), pp 6840-6847 Balasubramani M., Day B W., Schoen R E., Getzenberg R H (2006), Altered expression and localization of creatine kinase B, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, and high mobility group box protein in the nuclear matrix associated with colon cancer, Cancer Res 10 Cancer Research UK (2012), Treating Bowel Cancer - A Quick Guide 11 Ciocca D R., Calderwood S K (2005), Heat shock proteins in cancer: diagnostic, prognostic, predictive, and treatment implications, Cell Stress Chaperones, 10(2), pp 86103 12 Dukes C E (1932), The classification of cancer of the rectum, Journal of Pathological Bacteriology, 35(3), pp 323-332 13 Fedirko V., Tramacere I., Bagnardi V., Rota M., Scotti L., Islami F., Negri E., Straif K., Romieu I., La V C., Boffetta P, Jenab M (2011), "Alcohol drinking and colorectal cancer risk: an overall and dose-response metaanalysis of published studies", Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology / ESMO, 22(9), pp 19581972 14 Gasparini G., Hayes D F (2006), Biomarkers in Breast Cancer, Molecular Diagnostics for Predicting and Monitoring Therapeutic Effect, Humana Press, pp.1820 15 Goldstein M J., Mitchell E P (2005), Carcinoembryonic antigen in the staging and follow-up of patients with colorectal cancer, Cancer Invest; 23(4), pp 338-51 16 International Agency for Research on Cancer (2011), Cancer Worldwide, Cancer Research UK 67 Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà 17 Jing Y., Zhang J., Waxman S., Mira-y-Lopez R (1996), Upregulation of cytokeratins and 18 in human breast cancer T47D cells is retinoid-specific and retinoic acid receptor-dependent, Differentiation, 60(2),pp 109-117 18 Kim C Y., Jung W Y., Lee H J., Kim H K., Kim A., Shin B K (2012), Proteomic analysis reveals overexpression of moesin and cytokeratin 17 proteins in colorectal carcinoma, Oncol Rep., 27(3), pp 608-620 19 Kim T E., Kim Y W., Hwang S Y., Shin S M., Shin J W., Lee Y H., Shin S Y., Han K T., Lee J M., Namkoong S E., Kim J W (2002), Candidate tumor suppressor, HCCS-1 is downregulated in human cancers and induces apoptosis in cervical cancer, Int J Cancer, 97, pp.780786 20 Habermann J K., Bader F G., Franke C., Zimmermann K., Gemoll T., Fritzsche B., Ried T., Auer G., Bruch H P., Roblick U J (2008), From the genome to the proteome - biomarkers in colorectal cancer, Langenbeck's Archives of Surgery, 393(1), pp 93-104 21 Labianca R., Beretta G D., Kildani B., Milesi L., Merlin F., Mosconi S., Pessi M A., Prochilo T., Quadri A., Gatta G., Braud de F., Wils J (2010), Colon cancer, Critical Reviews in Oncology/Hematology, 74(2010), 106133 22 Lee I M., Shiroma E J., Lobelo F., Puska P., Blair S N., Katzmarzyk P T (2012), Effect of physical inactivity on major non-communicable diseases worldwide: an analysis of burden of disease and life expectancy, Lancet 23 Li C., Tan Y X., Zhou H., Ding S J., Li S J., Ma D J., Man X B., Hong Y., Zhang L., Li L., Xia Q C., Wu J R., Wang H Y., Zeng R (2005), Proteomic analysis of hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma: Identification of potential tumor markers, Proteomics, 5(4), pp 1125-1139 24 Liebler D C (2002), Introduction to Proteomics, Humana Press, Totowa, NJ, USA 68 Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà 25 Lucas S D., Ek B., Rask L., Rastad J., Akerstrửm G., Juhlin C (1997), Aberrantly expressed cytokeratin 1, a tumor-associated autoantigen in papillary thyroid carcinoma, Int J Cancer., 73(2), pp 171-177 26 Marion M B (1976), A Rapid and Sensitive Method for the Quantitation of Microgram Quantities of Protein Utilizing the Principle of Protein Dye Binding, Analytical Biochemistry, 72, pp 248 254 27 Maximilian L W., Maike A L., Markus R (2012), The central role of initiator caspase-9 in apoptosis signal transduction and the regulation of its activation and activity on the apoptosome, Experimental Cell Research, 318(11), pp 12131220 28 National Commission of Digestive Disease (2008), Cancers of the Digestive System, Nature, 445, pp 111-115 29 Newton K F., Newman W., Hill J (2010), Review of biomarkers in colorectal cancer, Colorectal Disease, 14(1), pp 3-17 30 Parkin D M., Bray F I., Devesa S S (2001), Cancer burden in the year 2000 The global picture, Eur J Cancer 2001, 37(8), pp 4-66 31 Peng Y., Li X., Wu M., Yang J., Liu M., Zhang W., Xiang B., Wang X., Li X., Li G., Shen S (2012), New prognosis biomarkers identified by dynamic proteomic analysis of colorectal cancer, Mol BioSyst., 8, pp 3077-3088 32 Polanski M., Anderson N.L (2006), A List of Candidate Cancer Biomarkers for Targeted Proteomics, Biomarker Insights, 2, pp 1-48 33 Radiya G A., Helen M B., Ruth M A (2012), Zinc fingers of the cerebellum (Zic): Transcription factors and co-factors, The International Journal of Biochemistry & Cell Biology, 44(11), pp 20652068 34 Research Advocacy Network (2010), Biomarkers in Cancer An Introductory Guide for Advocates 69 Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà 35 Shi Y L., Ping A., Hui-Yun C., Xue B., Ying-Nan Z., Bo Y., Fu-Yi Z., Gang C (2010), Proteomic analysis of differentially expressed proteins involving in liver metastasis of human colorectal carcinoma, Hepatobiliary Pancreat Dis Int, 9, pp 149-153 36 Tan H T., Wu W., Ng Y Z., Zhang X., Yan B., Ong C W., Tan S., Salto-Tellez M., Hooi S C., Chung M C (2012), Proteomic analysis of colorectal cancer metastasis: stathmin-1 revealed as a player in cancer cell migration and prognostic marker, J Proteome Res., 11(2), pp 1433-1445 37 Xue H., Lu B., Zhang J., Wu M., Huang Q., Wu Q., Sheng H., Wu D., Hu J., Lai M (2010), Identification of serum biomarkers for colorectal cancer metastasis using a differential secretome approach, J Proteome Res ;9(1), pp 545-55 38 Xuezhi B., Quingsong L., Tet W F., Shashikant J., Tao Y., Han-Ming S., Choon N O., Peh Y C., Kong W E, Choy-Leong H (2006), Proteomic Analysis of Colorectal Cancer Reveals Alterations in Metabolic Pathways, Molecular & Cellular Proteomics, 5(6), pp 1119 - 1130 39 Yu J K., Chen Y D., Zheng S (2004), An integrated approach to the detection of colorectal cancer utilizing proteomics and bioinformatics, World J Gastroenterol, 10, pp 3127-3131 40 Ward D G., Nyangoma S., Joy H., Hamilton E., Wei W., Tselepis C., Steven N., Wakelam M J O , Johnson P J , Ismail T., Martin A (2008), Proteomic profiling of urine for the detection of colon cancer, Proteome Science, 2008, pp 6-19 41 Watson A J., Collins P D (2011), Colon cancer: acivilixation disorder, Digestive diseases, 29(2):, pp 222-228 42 Weng Y R., Cui Y., Fang J Y (2012), Biological functions of cytokeratin 18 in cancer, Mol Cancer Res., 10(4), pp 485-493 70 Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà 43 Westermeier R., Naven T (2002), Proteomics in practice, Wiley-VCH VerlagGmbH, Freiburg 44 Wittenmayer N., Jandrig B., Rothkegel M., Schlỹter K., Arnold W., Haensch W., Scherneck S., Jockusch B M (2004), Tumor Suppressor Activity of Profilin Requires a Functional Actin Binding Site, Mol Biol Cell., 15(4), pp 1600-1608 45 World Health Organisation (2008), Global Cancer Facts & Figures, 2rd Edition, American Cancer Society Inc Cụng c World Wide Web 46 http://www.cancerstaging.org/staging/index.html (6/12/2012) 47 http://www.cancer.gov/cancertopics/pdq/treatment/colon/Patient/page2 (20/12/2012) 48 http://www.cancer.gov/dictionary (20/12/2012) 49 http://giangduongykhoa.wordpress.com/2009/02/22/ung-th%C6% (15/12/2012) 50 http://iwandahnial.wordpress.com/2010/11/16/understanding-colorectal-cancer (10/12/2012) 51 http://www.lesc.ic.ac.uk/projects/appp.html (12/12/2012) 52 http://www.medicinenet.com/colon_cancer/page2.htm (02/12/2012) 53 http://www.sinobiological.com/Cancer-Biomarker-a-835.html (10/12/2012) 54 http://www.timbacsy.com/tin-tuc-ung-thu-ung-th%C6%B0-d%E1%BA%A1itr%E1%BB%B1c-trang-co-di-truy%E1%BB%81n/ (15/12/2012) 55 http://ungthuvn.org/chude.aspx?id=406 (20/12/2012) 56 http://www.uniprot.org/ (25/12/2012) 57 http://www.webmd.com/digestive-disorders/picture-of-the-colon (25/05/2012) 71 Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà PH LC DANH SCH BNH NHN UNG TH I TRC TRNG C S DNG TRONG NGHIấN CU Tui Gii tớnh V trớ u Phõn loi TNM Ngy ly mu V Quang N 63 Nam i trng T2N1M0 05/11/201 10597 Hong Th Q 51 N i trng T3N1M0 10/5/2011 10608 Ninh Th C 46 N Trc trng T2N0M0 10/5/2011 11781 Dng Vn T 57 Nam Trc trng T2N0M0 02/8/2011 10483 Lng Xuõn 69 N Trc trng 2903 Nguyn Vn S 71 Nam i trng T3N0M0 3558 Nguyn Hu 42 Nam Trc trng T4N0M0 11812 Nguyn Trung T 57 Nam Trc trng T3N0M0 4644 Hong Hu T 55 Nam Trc trng T4N1 10 4841 C Th V 68 N Trc trng T3N0 TT Mó 8276 H v tờn bnh nhõn i 04/5/2011 Luận văn cao học Nguyễn Thị Ngọc Hà PH LC KT QU NHN DIN PROTEIN BNG C S D LIU NCBI S DNG PHN MM MASCOT Mascot Search Results User Email Search title Database Taxonomy Timestamp Top Score : : : : : : : Nguyen Ha hanguyen510@gmail.com NCBInr 20121223 (22321465 sequences; 7672129783 residues) Homo sapiens (human) (247296 sequences) 28 Dec 2012 at 00:33:13 GMT 67 for gi|7512479, heat shock protein 27 - human Mascot Score Histogram Protein score is -10*Log(P), where P is the probability that the observed match is a random event Protein scores greater than 66 are significant (p[...]... nhõn mi n iu tr ung th i trc trng [54] Theo thng kờ ca Bnh vin K, t l mc ung th i trng 5 Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà l 9% tng s bnh nhõn ung th [55] Theo mt nghiờn cu c tin hnh ti Bnh vin Ung bu Cn Th, tui mc ung th i trng trung bỡnh ca cỏc bnh nhõn iu tr ung th i trc trng õy l 54 tui, t l mc bnh nam/n l 1,34 [3] 1.1.2 Nguyờn nhõn dn n ung th i trc trng Nguyờn nhõn chớnh xỏc dn n ung th i trc... phn: manh trng, i trng lờn, i trng ngang, i trng xung v i trng sigma (Hỡnh 1) Trc trng nm ngay trc hu mụn Ung th xy ra i trng gi l ung th i trng v ung th xy ra trc trng gi l 3 Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà ung th trc trng Ung th i trng xy ra thng xuyờn hn ung th trc trng [21Error! Reference source not found.] Hỡnh 1 Hỡnh nh i trc trng [57] Ung th i trc trng xy ra khi mt s t bo lp lút trong... dng ung th i trc trng khỏc, ớt gp hn l ung th bt u t cỏc t bo lympho v cỏc t bo biu mụ vy Ung th i trc trng l ung th ph bin th ba trờn th gii ch sau ung th phi v ung th vỳ Nm 2008 c tớnh cú khong 1,24 triu ngi trờn th gii c chn oỏn l mc ung th i trc trng, chim khong 10% trong s cỏc loi ung th S ca t vong do ung th i trc trng trong nm 2008 l 610.000 ca trờn ton th gii, chim khong 8% s lng t vong do ung. .. soỏt v cú th xõm ln cỏc mụ khỏc Cỏc t bo ung th cú th di cn ti cỏc phn khỏc ca c th thụng qua mỏu hoc h bch huyt Ung th khụng ch l mt bnh m bao gm nhiu bnh Hin nay, cú hn 100 loi ung th khỏc nhau Hu ht ung th c t tờn theo c quan hoc loi t bo, ni ung th phỏt sinh Vớ d ung th phỏt sinh t i trng c gi l ung th i trng, ung th phỏt sinh t gan c gi l ung th gan [48] Ung th l mt trong 8 nguyờn nhõn gõy cht... ngi t vong do ung th cũn ln hn s lng t vong do nhim HIV, lao v st xut huyt cng li i vi cỏc nc cú nn kinh t phỏt trin, ung th l nguyờn nhõn gõy t vong hng u i vi cỏc nc ang phỏt trin, ung th l nguyờn nhõn gõy t vong th hai, sau bnh tim mch [45] Nm 2008, c tớnh cú khong 12,66 triu ngi mc ung th v 7,56 triu ngi cht do cn bnh ny Trong ú 4 loi ung th l ung th phi, ung th vỳ, ung th d dy v ung th i trc trng... bo ung th thng di cn n cỏc hch bch huyt Khi cỏc t bo ung th n c hch bch huyt, chỳng cú th phỏt tỏn n cỏc cỏc hch bch huyt khỏc hay cỏc c quan khỏc Cỏc t bo ung th i trc trng thng phỏt tỏn n gan [10] 4 Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà Hu ht cỏc trng hp ung th i trc trng l ung th biu mụ tuyn, chim 90 95% trong cỏc loi ung th i trc trng [21Error! Reference source not found.] iu ny cú ngha l t bo ung. .. mc ung th i trng l 20/100.000/nm Nhúm tui t 55 n 64, t l mc ung th i trng l 55/100.000/nm Nhúm tui t 65 n 74, t l ny l 150/100.000/nm [21Error! Reference source not found., 30] Ti Vit Nam, ung th i trc trng l loi ung th ng th nm trong cỏc loi ung th thng gp, sau ung th d dy, phi, vỳ, vũm hng v bnh ny cú xu hng ngy cng tng cao Theo thng kờ ca Bnh vin Ung Bu TPHCM, nm 2007, bnh vin cú 218 ca bnh ung. .. cao nht (250/100.000/nm) T l mc ung th i trc trng nam gii thng cao hn n gii v t l ny l 1,4 : 1,0 [16] Ch n ung nhiu cht bộo, tht, ung nhiu ru cú th lm tng nguy c mc ung th i trc trng Nhiu nghiờn cu ó ch ra rng nguy c mc ung th i trc trng tng lờn nhng ngi ung nhiu ru [13] Ngoi ra, nhng ngi mc bnh bộo phỡ cng cú nguy c mc ung th i trc trng cao hn nhng ngi khỏc Ch n ung nhiu rau, hoa qu, bỏnh m, ng...Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà Hin nay, mt trong nhng hng nghiờn cu ch th sinh hc cho ung th i trc trng ang c cỏc nh khoa hc quan tõm l s dng cụng c proteomics Bng vic phõn tớch s bin i trong thnh phn, s lng cỏc protein cú mt trong huyt thanh, dch c th, mụ ung th ca bnh nhõn ung th, cỏc nh khoa hc hi vng tỡm ra c cỏc ch th sinh hc mi, d nhn bit ng dng chn oỏn ung th i trc trng ... mt s protein biu hin khỏc bit c trng gia mụ ung th i trc trng v mụ i trc trng bỡnh thng ti c thc hin ti phũng Proteomics v Sinh hc Cu trỳc thuc phũng thớ nghim Trng im Cụng ngh Enzyme v Protein, Trng i hc Khoa hc T nhiờn, i hc Quc gia H Ni 2 Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà Chng 1 TNG QUAN 1.1 TNG QUAN V UNG TH I TRC TRNG 1.1.1 Ung th i trc trng l gỡ? Ung th l thut ng c s dng ch cỏc bnh liờn quan ... bnh ny Trong ú loi ung th l ung th phi, ung th vỳ, ung th d dy v ung th i trc trng chim 2/5 tng s ca mc ung th trờn th gii [45] Ung th i trc trng l loi ung th ph bin nht cỏc loi ung th ng tiờu húa... ngang, i trng xung v i trng sigma (Hỡnh 1) Trc trng nm trc hu mụn Ung th xy i trng gi l ung th i trng v ung th xy trc trng gi l Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà ung th trc trng Ung th i trng... huyt Ung th khụng ch l mt bnh m bao gm nhiu bnh Hin nay, cú hn 100 loi ung th khỏc Hu ht ung th c t tờn theo c quan hoc loi t bo, ni ung th phỏt sinh Vớ d ung th phỏt sinh t i trng c gi l ung