bài giảng phân loại vi sinh vật

bé gi¸o dôc vµ ®µo t¹o bé Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ PHÂN LOẠI VI SINH VẬT Người trình bày: TS.BS TRẦN ĐỖ HÙNG CHỦNHIỆM BM VI SINH CẦN THƠ- 2011 Những khó khăn phân loại vi sinh vật • Trong hệ thống phân loại loài đơn vị • Nhưng khái niệm loài phân loại vi sinh vật so với động vật thực vật có khác • Trong vi khuẩn học, loài quần thể sinh từ vi khuẩn ban đầu (clone) • Có thể dựa vào kiểu gen kiểu hình Các phương pháp phân loại - Phân loại theo số lượng tính chất sinh học - Phân loại theo phương pháp phân tử + Theo tỷ lệ base ADN + Lai ADN (DNA hybridisation) + Lai sinh học (biological hybridisation) + Phân loại dựa cấu trúc phân tử protein ĐƠN VỊ PHÂN LOẠI • • • • • • • • Giới (kingdom) Ngành (division phylum) Dưới ngành (subdivision) Lớp (class), lớp (subclass) Bộ (order) -ales Bộ phụ (suborder) hay bộ, -ineae Họ (family): -aceae Tộc (tribe): -eae Dưới tộc (subtribe) -inae Giống (genus genera): Ví dụ Staphylococcus Loài (species): Ví dụ Staphylococcus aureus • Các đơn vị loài: - Thứ (variety): Chỉ nhóm định loài Ví dụ Mycobacterium tuberculosis var hominis - vi khuẩn lao người - Dạng (type forma): Chỉ nhóm nhỏ thứ Ví dụ Streptococcus pneumoniae týp 14 - Chủng (strain): Chỉ vi sinh vật loài phân lập Nó mang theo ký hiệu giống, loài chủng Ví dụ Staphylococcus aureus ATCC 1259 ĐẠI CƯƠNG VỀVI KHUẨN Chia làm nhóm • Eukaryotic cell(parasitology): Helminth(giun, sán), fungi(nấm), protozoa (nguyên trùng) • Prokaryotic cell: Bacteriae (vi khuẩn), viruses Định nghĩa • Vi khuẩn vi sinh vật đơn bào nhỏ mà mắt thường không nhìn thấy được,muốn quan sát phải nhìn qua kính hiển vi điện tử thấy • Một số gây bệnh cho người, thực vật động vật ngược lại có ích cho người HÌNH THÁI & KÍCH THƯỚC - Kích thước µm - Hình thể: … +cầu khuẩn song cầu, phế cầu, tụ cầu, liên cầu, +Trực khuẩn dịch hạch, thương hàn,lỵ,E.coli,TK than,bạch hầu,… +Xoắn khuẩn XK sốt hồi quy, giang mai,… +Phẩy khuẩn tả, Helicobacter pylori,… CÁC KIỂU BIẾN DƯỠNG • Tự dưỡng(autotrophy):sử dụng chất vô để tổng hợp chất hữu • Dị dưỡng(heterotrophy):sử dụng chất hữu có sẳn • VK gây bệnh thuộc lọai dị dưỡng: họat động thủy phân đường theo kiểu lên men,hô hấp SINH LÝ CỦA VI KHUẨN DINH DƯỠNG CỦA VK NHU CẦU DINH DƯỠNG Chất dinh dưỡng sinh năng: hữu cơ(acid amin, đường, acid béo,…); chất vô (S04,N03, ),nước,muối khoáng dạng ion: Cl- , SO-, K + , Ca++ , Na+,… CƠ CHẾ Hấp thu đào thải chất qua màng, có hệ thống enzym phức tạp Năng lượng tạo theo chế: lên men vi khuẩn kỵ khí,hô hấp vi khuẩn hiếu khí quang tổng hợp HÔ HẤP CỦA VK • • • • Hiếu khí Kị khí Hiếu khí kị khí tùy ngộ Vi hiếu khí CHUYÊN HÓA CỦA VI KHUẨN • Nguồn lượng VK thu nhận từ carbon nitrogen → Energy (E) • Phosphor → TH acid nucleic phospholipid • Sulfur cho acid amin cysteine, methionin vitamin, coenzyme A • Potassium (K) sinh TH điều hòa bình ổn (homoeostasis) CHUYÊN HÓA CỦA VI KHUẨN(tt) • Sắt vai trò hô hấp TB vận chuyển điện tử • Magnesium(Mg) chức ổn định TB, ribosome, acid nucleic cho hoạt động enzym • Calcium (Ca) bền vững vách TB tính chịu nhiệt bào tử • Sodium (Na) vai trò điều hòa bình ổn • Và số kim loại khác cần cho cấu trúc enzym Môi trường nuôi cấy vi khuẩn • • • • • • • Phân biệt Môi trường phân biệt có chất ức chế Môi trường phân biệt có chất ức chế vừa Môi trường phân biệt có chất ức chế cao Môi trường phong phú Môi trường không ngăn chận Môi trường chuyên chở Yếu tố tăng trưởng • Là hợp chất hữu cần thiết cho tăng trưởng vi khuẩn • Mỗi loại vi khuẩn khác cần yếu tố tăng trưởng khác • Ví dụ: Heamophilus influenzae cần yếu tố X V, neisseria cần C02 • Ngoài chống lại độc tố peroxide,hyperoxide Những yếu tố cần đến tổng hợp • • • • Ph Nhiệt độ Độ ẩm Khí trường Sự phát triển vi khuẩn • Sự tồn vi khuẩn thiên nhiên • Định nghĩa phát triển vi khuẩn • Phương pháp khảo sát phát triển: phương pháp xác định tỷ trọng, xác định nồng độ tế bào (đếm khúm vk) THẾ HỆ CỦA VI KHUẨN N = N0 x 2n n=t/g Trong đó: N0 dân số vk lúc bắt đầu ng/cứu N d/s vk sau n hệ n số hệ vk g thời gian cho hệ t thời gian cho n hệ Sự sinh sản vi khuẩn theo song phân Sự phát triển vi khuẩn MT lỏng SỰ PHÁT TRIỂN CỦA VK TRÊN MÔI THẠCH ĐẶC Có dạng khuẩn lạc - Dạng S (smooth=nhẵn nhụi): khuẩn lạc xám nhạt trong, bờ đều, lồi bóng - Dạng M (mucus=nhầy): khuẩn lạc tròn, lồi hơn, dính - Dạng R (rough=xù xì):bờ ko nhăn nheo, mặt xù xì khô SINH SẢN • • • • • Sinh sản theo kiểu song phân Từ tế bào mẹ cho TB Bắt đầu từ NST VK Kế đến màng sinh chất,… Thời gian bình 20 – 30 phút