PHÂN LOẠI VI SINH VẬT doc

Người trình bày: TS.BS. TRẦN ĐỖ HÙNG CH NHI M BM VI SINHỦ Ệ CẦN THƠ - 2010 PHÂN LOẠI VI SINH VẬT BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y DƯỢC CẦN THƠ Nh ng khó khăn trong ữ Nh ng khó khăn trong ữ phân lo i vi sinh v tạ ậ phân lo i vi sinh v tạ ậ  Trong hệ thống phân loại thì loài là đơn vị cơ Trong hệ thống phân loại thì loài là đơn vị cơ bản. bản.  Nhưng khái niệm về loài trong phân loại vi Nhưng khái niệm về loài trong phân loại vi sinh vật so với động vật và thực vật thì có sự sinh vật so với động vật và thực vật thì có sự khác nhau. khác nhau.  Trong vi khuẩn học, loài là một quần thể được Trong vi khuẩn học, loài là một quần thể được sinh ra từ một vi khuẩn ban đầu (clone). sinh ra từ một vi khuẩn ban đầu (clone).  Có thể dựa vào kiểu gen và kiểu hình. Có thể dựa vào kiểu gen và kiểu hình. Các ph ng pháp phân ươ Các ph ng pháp phân ươ lo iạ lo iạ - Phân loại theo số lượng các tính chất sinh học - Phân loại theo số lượng các tính chất sinh học - Phân loại theo phương pháp phân tử - Phân loại theo phương pháp phân tử + Theo tỷ lệ các base của các ADN + Theo tỷ lệ các base của các ADN + Lai ADN + Lai ADN (DNA hybridisation) (DNA hybridisation) + Lai sinh học + Lai sinh học (biological hybridisation) (biological hybridisation) + Phân loại dựa trên cấu trúc phân tử protein + Phân loại dựa trên cấu trúc phân tử protein Đ N V PHÂN LO I Ơ Ị Ạ Đ N V PHÂN LO I Ơ Ị Ạ  Giới Giới ( ( kingdom kingdom ) )  Ngành Ngành ( ( division division hoặc hoặc phylum phylum ). Dưới ngành ). Dưới ngành ( ( subdivision subdivision ) )  Lớp Lớp ( ( class class ), dưới lớp ( ), dưới lớp ( subclass subclass ) )  Bộ Bộ ( ( order order ) - ) - ales ales . Bộ phụ ( . Bộ phụ ( suborder suborder ) hay dưới bộ, ) hay dưới bộ, - - ineae ineae . .  Họ Họ ( ( family family ): - ): - aceae aceae . .  Tộc Tộc ( ( tribe tribe ): - ): - eae eae . Dưới tộc ( . Dưới tộc ( subtribe subtribe ) - ) - inae inae . .  Giống Giống ( ( genus genus hoặc hoặc genera genera ): Ví dụ ): Ví dụ Staphylococcus Staphylococcus . .  Loài Loài ( ( species species ): Ví dụ ): Ví dụ Staphylococcus aureus. Staphylococcus aureus.  Các đơn vị dưới loài Các đơn vị dưới loài : : - - Thứ ( Thứ ( variety variety ): ): Chỉ một nhóm nhất định trong loài. Chỉ một nhóm nhất định trong loài. Ví dụ Ví dụ Mycobacterium Mycobacterium tuberculosis tuberculosis var. var. hominis hominis - vi - vi khuẩn lao người. khuẩn lao người. - - Dạng ( Dạng ( type type hoặc hoặc forma forma ): ): Chỉ nhóm nhỏ dưới thứ. Chỉ nhóm nhỏ dưới thứ. Ví dụ Ví dụ Streptococcus Streptococcus pneumoniae pneumoniae týp 14. týp 14. - Chủng ( - Chủng ( strain strain ): ): Chỉ một vi sinh vật của một loài Chỉ một vi sinh vật của một loài mới được phân lập. Nó mang theo ký hiệu của mới được phân lập. Nó mang theo ký hiệu của giống, loài và chủng. giống, loài và chủng. Ví dụ Ví dụ Staphylococcus Staphylococcus aureus aureus ATCC 1259. ATCC 1259. ĐẠI CƯƠNG VỀ VI KHUẨN Chia làm 2 nhóm Chia làm 2 nhóm  Eukaryotic cell(parasitology): Eukaryotic cell(parasitology): Helminth (giun, sán), fungi Helminth (giun, sán), fungi (nấm), protozoa (nguyên trùng). (nấm), protozoa (nguyên trùng).  Prokaryotic cell: Prokaryotic cell: Bacteriae (vi khuẩn), viruses Bacteriae (vi khuẩn), viruses Đ Đ ị ị nh nghĩa nh nghĩa  Vi khuẩn là những vi sinh vật đơn bào rất nhỏ mà Vi khuẩn là những vi sinh vật đơn bào rất nhỏ mà mắt thường không nhìn thấy được,muốn quan sát mắt thường không nhìn thấy được,muốn quan sát phải nhìn qua kính hiển vi điện tử mới thấy được phải nhìn qua kính hiển vi điện tử mới thấy được  Một số gây bệnh cho người, thực vật động vật và Một số gây bệnh cho người, thực vật động vật và ngược lại có ích cho con người ngược lại có ích cho con người HÌNH THÁI & KÍCH HÌNH THÁI & KÍCH TH C ƯỚ TH C ƯỚ - Kích thước µm - Kích thước µm - Hình thể: - Hình thể: +cầu khuẩn như song cầu, phế cầu, tụ cầu, liên cầu,… +cầu khuẩn như song cầu, phế cầu, tụ cầu, liên cầu,… +Trực khuẩn như dịch hạch, thương hàn,lỵ,E.coli,TK than,bạch +Trực khuẩn như dịch hạch, thương hàn,lỵ,E.coli,TK than,bạch hầu,… hầu,… +Xoắn khuẩn như XK sốt hồi quy, giang mai,… +Xoắn khuẩn như XK sốt hồi quy, giang mai,… +Phẩy khuẩn tả, Helicobacter pylori,… +Phẩy khuẩn tả, Helicobacter pylori,… [...]... trưởng của vi khuẩn  Mỗi một loại vi khuẩn khác nhau cần những yếu tố tăng trưởng khác nhau  Ví dụ: Heamophilus influenzae cần yếu tố X và V, neisseria cần C02  Ngoài ra còn chống lại độc tố như peroxide,hyperoxide Nh ững y ếu t ố c ần đ ến s ự t ổng h ợp     pH Nhiệt độ Độ ẩm Khí trường Môi tr ường nuôi c ấy vi khu ẩn       Phân biệt Môi trường phân biệt chọn lọc ít Môi trường phân biệt... gây bệnh thuộc lọai dị dưỡng: họat động thủy phân đường, lên men,hô hấp SINH LÍ CỦA VI KHUẨN DINH D ƯỠNG C ỦA VK NHU CẦU DINH DƯỠNG Chất dinh dưỡng sinh năng: hữu cơ(acid amin, đường, acid béo,…); chất vô cơ (S04,N03, ),nước,muối khoáng dạng ion: Cl- , SO-, K + , Ca++ , Na+,… CƠ CHẾ Năng lượng được tạo ra theo 3 cơ chế: lên men ở vi khuẩn kỵ khí,hô hấp ở vi khuẩn hiếu khí và quang tổng hợp HÔ H ẤP C... Polysaccharides Gram(-)  Peptidogycan chiếm 5-10% vật liệu cấu tạo vách  Lipoprotein liên kết chéo với màng ngoài và lớp peptidoglycan  Phospholipid và lipopolysaccharide  Lipopolysaccharide là nội độc tố của vi khuẩn gram(-) V Ỏ HO ẶC NANG (CAPSUL)  Một só vi khuẩn có nang, một số vi khuẩn không có nang  Cấu tạo nang thường là polysaccharide  Vi khuẩn có nang thường biến thành không nang  Nang... chống lại hiện tượng thực bào và sự tấn công của virus ký sinh trong vi khuẩn LÔNG (FLAGELLA)  Nhiệm vụ là di động  Có 3 vị trí lông: 1 đầu, 2 đầu và xung quanh thân  Cấu tạo lông: thường là protein  Là một kháng nguyên còn gọi là KN lông PILI  Cấu tạo:thường là protein  Có 2 loại pili + Pili thường làm nhiệm vụ gắn vào ký chủ trong hiện tượng cộng sinh + Pili phái tính làm nhiệm vụ giao phối ... NĂNG - Duy trì hình dạng của vi khuẩn, giử cho áp lực thẩm thấu bên trong cao hơn bên ngoài, màng nguyên sinh chất không bị căng phòng ra rồi tan vỡ - Quy định tính chất nhuộm Gram, sự khác biệt giữa Gr(+) & Gr(-) - Nơi tiếp nhận cho thể thực khuẩn - Sinh độc tố, KN - Nơi tác động của KS nhóm bete-lactam Vách t ế bào vi khu ẩn Gram(+)  Peptidoglycan: gồm 40 lớp, chiếm 50% vật liệu cấu tạo vách  Teichoic... hợp HÔ H ẤP C ỦA VK     Hô hấp hiếu khí Hô hấp kị khí Hô hấp hiếu khí hoặc kị khí tùy ngộ Vi hiếu khí PHÂN LO ẠI ENZYM THEO PH ẢN ỨNG  Tính chất phản ứng - Thủy phân - Oxy hóa - Khử hydro - Khử CO2 - Thêm CO2  Enzym - Hydrolase - Oxidase - Dehydrogenase - Decarboxylase - Carboxylase PHÂN LO ẠI ENZYM VI KHU ẨN THEO TÁC D ỤNG  Chất bị tác dụng - Protein - Glucid - lipid - Acid nucleic  Enzym... trọng lượng khô của tế bào  Polysaccharides Vách t ế bào vi khu ẩn Gram(-)  Peptidogycan chiếm 5-10% vật liệu cấu tạo vách  Lipoprotein liên kết chéo với màng ngoài và lớp peptidoglycan  Phospholipid và lipopolysaccharide  Lipopolysaccharide là nội độc tố của vi khuẩn gram(-) Vách t ế bào vi khu ẩn Gram(+)  Peptidoglycan: gồm 40 lớp, chiếm 50% vật liệu cấu tạo vách  Teichoic và teichoic acid chiếm... ẠO TB VI KHU ẨN NHÂN TB VI KHUẨN -Nhân là một chuỗi AND, cĩ khoảng 3000 gen mã các chức năng khác nhau -Không có màng nhân -Gồm 2 sợi AND xoắn kép -Tạo thành vòng tròn khép kín -Dài xấp xỉ 1mm TẾ BÀO CHẤT (CYTOPLASM) - Không có ti thể, không hạt lục lạp,không bộ golgi, không có bộ máy gián phân đẳng nhiểm … - Đồng nhất hoặc có hạt, có hạt vùi, enzyme, cytochrom, ribo thể tham gia vào quá trình sinh. .. MÀNG NGUYÊN SINH CH ẤT (CYTOPLASMIC MEMBRANE)  CẤU TẠO Gồm 2 lớp tối (2 lớp phospho) bị tách biệt giữa 1 lớp sáng (lớp lipid), 60% protein, 40% lipid mà phần lớn là phospholipid  NHIỆM VỤ Là màng bán thẩm thấu chọn lọc, vận chuyển các chất hoà tan, điện tử, tiết các enzyme thủy phân, mang những enzyme có nhiệm vụ sinh tổng hợp, VÁCH TB (CELL WALL)  CẤU TRÚC - Vách được cấu tạo bởi đại phân tử glycopeptid... trong các loại đại phân tử chủ yếu từ đường,acid béo,…  Nitrogen lấy từ N03,R-NH2,NH3,…  Lưu huỳnh và phospho: lưu huỳnh dưới dạng sulfur hữu cơ (R-SH, SH2) hoặc dạng muối phosphat  Nước là thành phần quan trọng  Kim loại và enzyme  Nguồn năng lượng VK thu nhận từ carbon và nitrogen → Energy (E)  Phosphor → TH acid nucleic và phospholipid  Sulfur cho acid amin như cysteine, methionin và vitamin, . trong phân loại vi sinh vật so với động vật và thực vật thì có sự sinh vật so với động vật và thực vật thì có sự khác nhau. khác nhau.  Trong vi khuẩn học, loài là một quần thể được Trong vi. pháp phân ươ lo iạ lo iạ - Phân loại theo số lượng các tính chất sinh học - Phân loại theo số lượng các tính chất sinh học - Phân loại theo phương pháp phân tử - Phân loại theo phương pháp phân. cell: Prokaryotic cell: Bacteriae (vi khuẩn), viruses Bacteriae (vi khuẩn), viruses Đ Đ ị ị nh nghĩa nh nghĩa  Vi khuẩn là những vi sinh vật đơn bào rất nhỏ mà Vi khuẩn là những vi sinh vật đơn bào rất nhỏ