Luận văn phân tích proteomics mô ung thư của bệnh nhân ung thư đại trực tràng

TRNG I HC KHOA HC T NHIấN - Nguyn Th Ngc H PHN TCH PROTEOMICS Mễ UNG TH CA BNH NHN UNG TH I TRC TRNG Chuyờn ngnh: Sinh hc thc nghim Mó s: 60 42 30 LUN VN THC S KHOA HC NGI HNG DN KHOA HC PGS.TS Trnh Hng Thỏi H Ni LI CM N Tụi xin by t lũng bit n sõu sc ti PGS TS Trnh Hng Thỏi, ngi thy ó tn tỡnh ch bo, hng dn tụi sut thi gian hc tp, nghiờn cu khoa hc v thc hin lun ny Tụi cng xin trõn trng cm n cỏc thy giỏo, cụ giỏo khoa Sinh hc, trng i hc Khoa hc T nhiờn ó tn tỡnh ging dy, dỡu dt tụi sut thi gian hc ti Trng Tụi xin gi li cm n chõn thnh ti cỏc anh, ch, cỏc bn sinh viờn lm vic ti Phũng Proteomics v Sinh hc Cu trỳc thuc Phũng thớ nghim Trng im Cụng ngh Enzyme v Protein ó tn tỡnh giỳp tụi sut quỏ trỡnh hc v thc hin lun ti Phũng Trong quỏ trỡnh thc hin lun vn, tụi ó nhn c rt nhiu s quan tõm, giỳp ca cỏc cỏn b nhõn viờn thuc khoa T bo v Gii phu bnh, Bnh vin K Tam Hip, H Ni v khoa Gii phu bnh, Bnh vin Vit c, H ni Tụi xin chõn thnh cm n Cui cựng, tụi vụ cựng bit n gia ỡnh, bn bố, ng nghip ó luụn khớch l ng viờn tụi sut thi gian qua MC LC M U Chng TNG QUAN 1.1 TNG QUAN V UNG TH I TRC TRNG 1.1.1 Ung th i trc trng l gỡ? 1.1.2 Nguyờn nhõn dn n ung th i trc trng .6 1.1.3 Cỏc h thng phõn loi giai on ung th i trc trng .8 1.2 NGHIấN CU CH TH SINH HC I VI UNG TH 13 1.2.1 Ch th sinh hc i vi ung th 13 1.2.2 Cỏc k thut sinh hc phõn t c ng dng nghiờn cu ch th sinh hc ung th 15 1.3 PROTEOMICS TRONG NGHIấN CU UNG TH I TRC TRNG 16 1.3.1 Proteomic l gỡ? 16 1.3.2 Cụng c nghiờn cu proteomics 18 1.3.3 ng dng ca proteomics nghiờn cu ung th i trc trng 20 Chng - NGUYấN LIU V PHNG PHP NGHIấN CU 29 2.1 NGUYấN LIU 29 2.1.1 i tng nghiờn cu 29 2.1.2 Húa cht .29 2.1.3 Thit b 30 2.2 PHNG PHP NGHIấN CU .30 2.2.1 X lý mu mụ i trc trng 30 2.2.2 nh lng protein bng phng phỏp Bradford 32 2.2.3 in di hai chiu 32 2.2.4 Phõn tớch hỡnh nh bn gel in di hai chiu 34 2.2.5 Ct v thy phõn spot 36 2.2.6 Phõn tớch ph v nhn dng protein 37 Chng - KT QU V BN LUN .39 3.1 TCH CHIT PROTEIN Mễ I TRC TRNG .39 3.2 PHN TCH PROTEIN Mễ I TRC TRNG TRấN BN GEL IN DI HAI CHIU 42 3.3 PHN TCH HèNH NH BN GEL IN DI HAI CHIU 44 Thng kờ cỏc spot protein biu hin khỏc bit gia bn gel mụ ung th i trc trng so vi bn gel mụ i trc trng bỡnh thng ca cỏc bnh nhõn, chỳng tụi nhn thy cú 43 spot biu hin khỏc chung bao gm 16 spot biu hin tng, 17 spot biu hin gim v 10 spot khụng xut hin bn gel mụ ung th i trc trng 48 3.4 XC NH PROTEIN BNG PHNG PHP MALDI-TOF MS 48 3.5 C IM, VAI TRề CA CC PROTEIN BIU HIN KHC BIT 52 3.5.1 Protein liờn quan n chu trỡnh t bo v apoptosis 56 3.5.2 Protein liờn quan n quỏ trỡnh dch v bo v c th .57 3.5.3 Protein tham gia cu trỳc t bo 60 3.5.4 Protein tham gia cỏc quỏ trỡnh trao i cht .62 3.5.5 Protein liờn quan n quỏ trỡnh phiờn mó, dch mó, ci bin sau phiờn mó, dch mó 62 KT LUN .65 KIN NGH 66 TI LIU THAM KHO 66 PH LC DANH SCH BNH NHN UNG TH I TRC TRNG C S DUNG TRONG NGHIấN CU i PH LC KT QU NHN DIN PROTEIN BNG C S D LIU NCBI S DNG PHN MM MASCOT ii Đ Mascot Search Results ii Mascot Score Histogram ii Concise Protein Summary Report ii ĐMASCOT Search Results v Protein View: gi|7512479 v heat shock protein 27 human .v Search parameters v Protein sequence coverage: 26% .v Đ Mascot Search Results vi Mascot Score Histogram vi Protein score is -10*Log(P), where P is the probability that the observed match is a random event Protein scores greater than 66 are significant (p[...]... nhõn mi n iu tr ung th i trc trng [54] Theo thng kờ ca Bnh vin K, t l mc ung th i trng 5 Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà l 9% tng s bnh nhõn ung th [55] Theo mt nghiờn cu c tin hnh ti Bnh vin Ung bu Cn Th, tui mc ung th i trng trung bỡnh ca cỏc bnh nhõn iu tr ung th i trc trng õy l 54 tui, t l mc bnh nam/n l 1,34 [3] 1.1.2 Nguyờn nhõn dn n ung th i trc trng Nguyờn nhõn chớnh xỏc dn n ung th i trc... phn: manh trng, i trng lờn, i trng ngang, i trng xung v i trng sigma (Hỡnh 1) Trc trng nm ngay trc hu mụn Ung th xy ra i trng gi l ung th i trng v ung th xy ra trc trng gi l ung th trc trng Ung th i trng xy ra thng xuyờn hn ung th trc 3 Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà trng [21Error: Reference source not found] Hỡnh 1 Hỡnh nh i trc trng [57] Ung th i trc trng xy ra khi mt s t bo lp lút trong... dng ung th i trc trng khỏc, ớt gp hn l ung th bt u t cỏc t bo lympho v cỏc t bo biu mụ vy Ung th i trc trng l ung th ph bin th ba trờn th gii ch sau ung th phi v ung th vỳ Nm 2008 c tớnh cú khong 1,24 triu ngi trờn th gii c chn oỏn l mc ung th i trc trng, chim khong 10% trong s cỏc loi ung th S ca t vong do ung th i trc trng trong nm 2008 l 610.000 ca trờn ton th gii, chim khong 8% s lng t vong do ung. .. soỏt v cú th xõm ln cỏc mụ khỏc Cỏc t bo ung th cú th di cn ti cỏc phn khỏc ca c th thụng qua mỏu hoc h bch huyt Ung th khụng ch l mt bnh m bao gm nhiu bnh Hin nay, cú hn 100 loi ung th khỏc nhau Hu ht ung th c t tờn theo c quan hoc loi t bo, ni ung th phỏt sinh Vớ d ung th phỏt sinh t i trng c gi l ung th i trng, ung th phỏt sinh t gan c gi l ung th gan [48] Ung th l mt trong 8 nguyờn nhõn gõy cht... ngi t vong do ung th cũn ln hn s lng t vong do nhim HIV, lao v st xut huyt cng li i vi cỏc nc cú nn kinh t phỏt trin, ung th l nguyờn nhõn gõy t vong hng u i vi cỏc nc ang phỏt trin, ung th l nguyờn nhõn gõy t vong th hai, sau bnh tim mch [45] Nm 2008, c tớnh cú khong 12,66 triu ngi mc ung th v 7,56 triu ngi cht do cn bnh ny Trong ú 4 loi ung th l ung th phi, ung th vỳ, ung th d dy v ung th i trc trng... bo ung th thng di cn n cỏc hch bch huyt Khi cỏc t bo ung th n c hch bch huyt, chỳng cú th phỏt tỏn n cỏc cỏc hch bch huyt khỏc hay cỏc c quan khỏc Cỏc t bo ung th i trc trng thng phỏt tỏn n gan [10] 4 Luận văn thạc sĩ Nguyễn Thị Ngọc Hà Hu ht cỏc trng hp ung th i trc trng l ung th biu mụ tuyn, chim 90 95% trong cỏc loi ung th i trc trng [21Error: Reference source not found] iu ny cú ngha l t bo ung. .. l mc ung th i trng l 20/100.000/nm Nhúm tui t 55 n 64, t l mc ung th i trng l 55/100.000/nm Nhúm tui t 65 n 74, t l ny l 150/100.000/nm [21Error: Reference source not found, 30] Ti Vit Nam, ung th i trc trng l loi ung th ng th nm trong cỏc loi ung th thng gp, sau ung th d dy, phi, vỳ, vũm hng v bnh ny cú xu hng ngy cng tng cao Theo thng kờ ca Bnh vin Ung Bu TPHCM, nm 2007, bnh vin cú 218 ca bnh ung. .. cao nht (250/100.000/nm) T l mc ung th i trc trng nam gii thng cao hn n gii v t l ny l 1,4 : 1,0 [16] Ch n ung nhiu cht bộo, tht, ung nhiu ru cú th lm tng nguy c mc ung th i trc trng Nhiu nghiờn cu ó ch ra rng nguy c mc ung th i trc trng tng lờn nhng ngi ung nhiu ru [13] Ngoi ra, nhng ngi mc bnh bộo phỡ cng cú nguy c mc ung th i trc trng cao hn nhng ngi khỏc Ch n ung nhiu rau, hoa qu, bỏnh m, ng... u vit, proteomics l cụng c c cỏc nh khoa hc la chn trong nghiờn cu ung th núi chung v ung th i trc trng núi riờng ó cú rt nhiu nghiờn cu s dng cụng c proteomics c thc hin trờn th gii nhm tỡm ra cỏc ch th sinh hc c trng cho ung th i trc trng H protein c phõn tớch trong cỏc nghiờn cu ny cú th l h protein mụ ung th i trc trng, h protein trong huyt tng, h protein t dch c th nh nc tiu Phõn tớch proteomics. .. do cn bnh ny Trong ú 4 loi ung th l ung th phi, ung th vỳ, ung th d dy v ung th i trc trng chim 2/5 tng s ca mc ung th trờn th gii [45] Ung th i trc trng l loi ung th ph bin nht trong cỏc loi ung th ng tiờu húa [28], bao gm ung th i trng v ung th trc trng c gi theo tờn ca mụ, ni phỏt sinh ung th i trng v trc trng l mt phn ca h tiờu húa i trc trng (hay cũn gi l rut gi) l phn cui ca ng tiờu húa ngi,