ĐÁNH GIÁ HIỆU QUẢ PHÁT HIỆN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS từ BỆNH PHẨM BẰNG kỹ THUẬT REAL TIME PCR của 2 bộ kít MTB REAL TM và ANAPURE MTB QPCR KIT tại BỆNH VIỆN BỆNH NHIỆT đới

B GIO DC V O TO B Y T TRNG I HC Y H NI NGUYN TH GIANG ĐáNH GIá HIệU QUả PHáT HIệN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS Từ BệNH PHẩM BằNG Kỹ THUậT REAL-TIME PCR CủA Bộ KíT MTB REAL-TM Và ANAPURE MTB QPCR KIT TạI BệNH VIệN BệNH NHIệT ĐớI TRUNG ƯƠNG KHểA LUN TT NGHIP BC S Y KHOA KHểA 2010 2016 H Ni - 2016 B GIO DC V O TO B Y T TRNG I HC Y H NI NGUYN TH GIANG ĐáNH GIá HIệU QUả PHáT HIệN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS Từ BệNH PHẩM BằNG Kỹ THUậT REAL-TIME PCR CủA Bộ KíT MTB REAL-TM Và ANAPURE MTB QPCR KIT TạI BệNH VIệN BệNH NHIệT ĐớI TRUNG ƯƠNG KHểA LUN TT NGHIP BC S Y KHOA KHểA 2010 2016 Ngi hng dn khoa hc: PGS.TS NGUYN V TRUNG H Ni - 2016 LI CM N Li u tiờn tụi xin chõn thnh cm n Ban giỏm hiu, Phũng Qun lý o to i hc, Trng i hc Y H Ni ó luụn to mi iu kin tt nht giỳp tụi hc v rốn luyn bn thõn sut sỏu nm hc qua Tụi xin gi li cm n tt c cỏc thy cụ giỏo - nhng ngi ó tn tõm ging dy khụng ch v mt chuyờn mụn m cũn l lũng yờu ngh v o c ngh nghip, ú l nhng hnh trang vụ cựng quý giỏ cho tụi Tụi xin chõn thnh cm n cỏc thy cụ B mụn Vi sinh, c bit xin by t lũng bit n chõn thnh v sõu sc ti thy giỏo PGS.TS Nguyn V Trung- ngi ó tn tỡnh hng dn v ch bo cho tụi sut quỏ trỡnh nghiờn cu v hon thin Khúa lun tt nghip ny Tụi cng xin cm n TS Lờ Vn Duyt cựng cỏc anh ch Phũng Sinh hc phõn t - Khoa Xột nghim Bnh vin Bnh Nhit i Trung ng v cỏc anh ch Phũng thớ nghim Trung tõm Trng i hc Khoa hc T nhiờn ng cm n Cụng ty TNHH thit b khoa hc k thut Vit Huy v Cụng ty c phn ANABIO Research & Development ó cung cp b kớt cho th nghim ny Tụi xin gi li cm n n tt c bn bố, gia ỡnh, ngi thõn ca tụi H Ni, ngy Sinh viờn Nguyn Th Giang LI CAM OAN Tụi xin cam oan cỏc s liu, kt qu nờu khoỏ lun ny c trỡnh by trung thc, chớnh xỏc v cha c cụng b cụng trỡnh nghiờn cu, ti liu no khỏc Nu cú gỡ sai sút tụi xin chu hon ton trỏch nhim H Ni, ngy thỏng nm 2016 Sinh viờn Nguyn Th Giang DANH MC CC CH VIT TT AFB AFR AMR DNA EMR EUR IC M tuberculosis PCR SEAR VMN VP VPQ WHO WPR Acid-fast bacillus (trc khun khỏng cn, khỏng acid) Africa Region (Khu vc chõu Phi) America Region (Khu vc chõu M) Deoxyribonucleic acid Middle East Region (Khu vc ụng a Trung Hi) Europe Region (Khu vc chõu u) Internal control (Chng ni) Mycobacterium tuberculosis Polymerase chain reaction (phn ng khuch i gen) South-East Asia Region (Khu vc ụng-Nam chõu ) Viờm mng nóo Viờm phi Viờm ph qun World Health Organization (T chc Y t Th gii) Western Pacific Region (Khu vc Tõy Thỏi Bỡnh Dng) MC LC DANH MC CC BNG DANH MC CC BIU T VN Lao l mt nhng bnh truyn nhim hng u gõy t l t vong cao trờn ton th gii Theo thng kờ ca T chc Y t Th gii (WHO), khong 1/3 dõn s th gii nhim lao Nm 2014, cú ti 9,6 triu ngi mc bnh lao mi v 1,5 triu ngi t vong lao Trong ú, 80% bnh nhõn ca 22 nc cú t l mc lao rt cao [1] Theo bỏo cỏo ca Chng trỡnh Chng lao quc gia (CTCLQG) nm 2014, Vit Nam xp th 12 s 22 quc gia cú s ngi mc bnh lao nhiu nht th gii [2] Trc õy, chn oỏn bnh lao ch yu da trờn triu chng lõm sng, mụ hc, phỏt hin AFB v phõn lp Mycobacterium tuberculosis t bnh phm lõm sng Trong ú, k thut nuụi cy phõn lp c coi l tiờu chun vng chn oỏn Tuy nhiờn, c im M tuberculosis phỏt trin khỏ chm trờn mụi trng nuụi cy (nuụi cy trờn mụi trng Lowenstein- Jensen cn n tun mi cho kt qu) Phng phỏp nhum Ziehl- Neelsen v soi di kớnh hin vi quang hc cú th cho kt qu 24 gi nhng bnh phm phi cú ti thiu 10 AFB/ml, ng thi, khú phõn bit c Mycobacterium tuberculosis vi cỏc Mycobacteria khỏc [3],[4] Nh ng dng nhng thnh tu ca cụng ngh sinh hc phõn t, k thut real-time PCR vi nhy v c hiu cao, thi gian xỏc nh vi khun rỳt ngn xung t 4-6 gi, ó tr thnh cụng c hu ớch phc v cho cụng vic xỏc nh nhanh, chớnh xỏc M tuberculosis [5] Xột nghim phỏt hin M tuberculosis bng k thut real-time PCR ó v ang c ỏp dng mt s c s Y t Cú nhiu b kớt xỏc nh M tuberculosis bng real-time PCR, ú cú MTB Real-TM v ANAPURE MTB qPCR KIT B kớt MTB Real-TM c dựng ti 10 Khoa Xột nghim Bnh vin Bnh Nhit i Trung ng t nm 2015 B kớt ANAPURE MTB qPCR KIT mi c a vo gii thiu ỏnh giỏ hiu qu phỏt hin Mycobacterium tuberculosis, chỳng tụi thc hin ti nghiờn cu ny nhm mc tiờu: ỏnh giỏ hiu qu phỏt hin Mycobacterium tuberculosis bng k thut real-time PCR ca b kớt thng mi MTB Real-TM v ANAPURE MTB qPCR KIT 33 KT Ct mu Bnh phm MTB RealTM Dch chc 26,095,61 hch Dch mng 30,886,93 phi Dch nóo ty 30,734,75 m 30,564,80 Dch ph 29,055,46 qun Khỏc 32,293,11 Trung bỡnh 30,035,29 p < 0,05 Ct ni kim ANAPURE MTB MTB Real- ANAPURE qPCR KIT TM MTB qPCR KIT 28,595,21 24,474,80 25,645,32 31,895,89 26,514,41 25,734,87 33,064,83 30,514,38 30,963,97 24,974,71 23,394,33 23,023,67 28,274,00 24,134,64 26,373,59 32,214,13 31,414,65 26,825,58 24,274,44 p < 0,05 29,622,41 26,424,41 Bng 3.7 cho thy: Ngng phỏt hin ca ANAPURE MTB qPCR KIT cao hn so vi b kớt MTB Real-TM S khỏc bit ny cú ý ngha thng kờ (p