bài tiểu luận NCBI và một số ứng dụng

Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn Cơ sở dữ liệu BioProject trước đây là Genome Project Một bộ sưu tập gen, gen chức năng, nghiên cứu di truyền học và các liên kết để tập hợp dữ

Trang 1

Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn

Bài tiểu luận:

NCBI VÀ MỘT SỐ ỨNG DỤNG

Người hướng dẫn: PGS.TS Chu Hoàng Mậu

Trang 2

Chào mừng bạn đến NCBI

Trung tâm Quốc gia Thông tin Công nghệ sinh học tiến bộ khoa học và sức khỏe bằng cách cung cấp truy cập vào thông tin

y sinh học và di truyền

Giới thiệu về các NCBI |

Sứ mệnh |

Tổ chức | Nghiên cứu | RSS Feeds

sở dữ liệu NCBI

NCBI Trang chủ

Trang 3

Sơ đồ trang web

Một B C D E F G H I J L M N O P R S T U V Các mục in đậm

BioProject (trước đây là Genome Project)

BioProject thông tin

BioSample

Biosystems

BLAST (Stand-alone)

Liên kết BLAST (nhấp nháy)

BLAST vi khuẩn Genome

BLAST RefSeqGene

Hướng dẫn BLAST

Trang 4

Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn Cơ sở dữ liệu

BioProject (trước đây là Genome Project)

Một bộ sưu tập gen, gen chức năng, nghiên cứu di truyền học và các liên kết

để tập hợp dữ liệu kết quả Tài liệu này

mô tả phương pháp để lấy các bộ dữ liệu thường rất khó để tìm thấy do chú thích không phù hợp, kiểu dữ liệu đa dạng thường được lưu trữ trong cơ sở

dữ liệu khác nhau

BioSample

BioSample cơ sở dữ liệu chứa các mô

tả về nguồn nguyên liệu sinh học được

sử dụng trong các xét nghiệm thử nghiệm

Biosystems

Cơ sở dữ liệu các nhóm y sinh học, các phân tử nhỏ, và dữ liệu trình tự trong các mối quan hệ sinh học

Kệ sách

Một bộ sưu tập các sách y sinh học có thể được tìm kiếm trực tiếp hoặc từ các

dữ liệu liên kết trong cơ sở dữ liệu

NCBI khác tài nguyên di truyền như

GeneReviews, và các hướng dẫn sử dụng giúp NCBI

Ung thư nhiễm sắc thể

Biên soạn các dữ liệu từ ba nguồn: SKY NCI / NCBI / M-FISH và CGH Cơ sở dữ liệu, NCI Mitelman Cơ sở dữ liệu sai lệch nhiễm sắc thể trong ung thư, và các quang sai NCI tái phát trong ung thư Giao diện hỗ trợ tìm kiếm thông qua di truyền tế bào, lâm sàng, và / hoặc thông tin tham khảo

Trang 5

Tài liệu chia sẻ tại: wWw.SinhHoc.edu.vn Dữ liệu và phần mềm Cơ sở dữ liệu

NCBI C + + Toolkit Hướng dẫn sử dụng

Một hướng dẫn toàn diện về các NCBI C + + bộ công cụ, C + + thư viện tham khảo, ví dụ phần mềm và trình diễn, câu hỏi thường gặp Hướng dẫn

sử dụng là tìm kiếm trực tuyến

và có thể được tải về như các tài liệu PDF

NCBI Trang Web Search

Một cơ sở dữ liệu của các trang web tĩnh NCBI, tài liệu,

và các công cụ trực tuyến Những trang này bao gồm nội dung như công cụ phân tích chuyên ngành trực tuyến trình

tự Tìm kiếm cơ sở dữ liệu này

là tương đương với một công

cụ tìm kiếm trang web cho toàn bộ trang web của NCBI,

Trang 6

Cơ sở dữ liệu

Kệ sách

Một bộ sưu tập các sách y sinh học có thể được tìm kiếm trực tiếp hoặc từ các dữ liệu liên kết trong cơ sở dữ liệu NCBI khác Bộ sưu tập bao gồm sách giáo khoa y sinh học, tài

nguyên di truyền như GeneReviews, và các

hướng dẫn sử dụng giúp NCBI

GeneReviews

mô tả bệnh, Bookshelf NCBI áp dụng thử nghiệm di truyền để chẩn đoán, quản lý, và tư vấn di truyền của bệnh nhân và gia đình với điều kiện kế thừa

Các tạp chí trong cơ sở dữ liệu NCBI

Tập hợp con của cơ sở dữ liệu Danh mục NLM cung cấp thông tin trên các tạp chí được tham chiếu trong hồ sơ cơ sở dữ liệu NCBI, bao gồm tóm tắt PubMed Tập hợp con này có thể được tìm kiếm bằng cách sử dụng tên tạp chí, MEDLINE hoặc viết tắt ISO, ISSN, hoặc ID Danh mục NLM

Trang 7

Trang 8

SO SÁNH GENEBANK

Trang 9

SO SÁNH GENEBANK

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

Trang 10

Trang 12

Cơ Sở Dữ Liệu PubMed

Trang 13

Cơ Sở Dữ Liệu PubMed

http://pubmed.org

• Thuộc thẩm quyền của Thư viện Y Khoa và Viện Nghiên Cứu Sức Khỏe Quốc gia Hoa Kỳ

• Chứa hơn 20 triệu bài trích dẫn từ các tạp chí thuộc lĩnh

vực Y khoa & khoa học Sự Sống, và sách điện tử

• Có thể liên kết trực tiếp đến bài viết toàn văn từ nhiều

nhà xuất bản và các trang web khác nhau

Trang 14

Trang 15

Trang Kết Quả

Tổng số bài toàn văn miễn phí

Trang 16

Chọn xem bài toàn văn

Trang 17

Xem bài toàn văn

Xem tóm tắt

Click vào logo của NXB

để xem toàn văn

Trang 18

Giới hạn kết quả (Limits)

Trang 19

Giới hạn kết quả

Chọn t.gian xuất bản

Giới hạn ngôn ngữ

Giới hạn giới tính Giới hạn nhóm tuổi

Trang 20

Tìm kiếm nâng Cao

• Cho phép tìm theo trường cụ thể (a specific field), sử

dụng chức năng Search Builder

• Chọn trường tìm kiếm (field)

• Gõ thuật ngữ/từ khóa

• Chọn AND, OR, NOT để nối các thuật ngữ/từ khóa lại với nhau

• Bấm chọn nút Search để thực hiện phép tìm

Trang 21

Kết quả

Trang 22

Tải bài toàn văn

Liên kết toàn văn

Trang 23

Sent to…

Trang 24

Sent to…

• File: danh mục kết quả được tải xuống và lưu

lại thành một file Notepad

• Collections: lưu các file đã chọn vào bộ sưu tập trong My NCBI (Folder cá nhân trong Pubmed)

• Clipboard: lưu tạm thời các thư mục đã chọn

• Email: gởi các file thư mục đã chọn qua email

Trang 25

My NCBI

My NCBI là gì?

gởi e-mail kết quả tìm được từ lần tìm đã lưu

Bấm vào liên kết này đăng ký dịch vụ NCBI

Trang 26

Chọn liên kết này để tạo account

Trang 27

My NCBI

Lưu các phép tìm trong My NCBI

1 Thực hiện phép tìm trong PubMed

2 Khi trang kết quả hiện ra, bấm chọn Save Search (A)

3. Đăng nhập (B) (nếu chưa) Ở màn hình Save Search, có thể đổi

tên của phép tìm Bấm vào nút Save

4 Chọn các kiểu cập nhật qua e-mail

5. Bấm chọn Save

Trang 28

Sách điện tử - NCBI Bookshelf

Trang 29

Sách điện tử - NCBI Bookshelf

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=Books

• Là một bộ sưu tập sách có chọn lọc, miễn phí về y, sinh

• Hiện có hơn 90 nhan đề về sinh học phân tử, hóa sinh, sinh học tế

bào, di truyền, vi sinh học…

• Có thể tìm sách bằng cách sử dụng từ khóa, có thể tải sách miễn

Trang 30

Trang 31

Cảm ơn sự chú ý của các bạn!

Định dạng
Số trang	31
Dung lượng	1,77 MB