Phân lập và xác định genotype của Porcine circovirus type 2 (PCV2) ở đàn lợn nuôi tại một số tỉnh miền Bắc Việt Nam

BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ TRƯỜNG ĐẠI HỌC NÔNG NGHIỆP HÀ NỘI CHƯƠNG TRÌNH KHCN TRỌNG ĐIỂM CẤP NHÀ NƯỚC KC.04/11-15 “Nghiên cứu phát triển ứng dụng công nghệ sinh học” BÁO CÁO TỔNG HỢP KẾT QUẢ KHOA HỌC CÔNG NGHỆ ĐỀ TÀI “PHÂN LẬP VÀ XÁC ĐỊNH GENOTYPE CỦA PORCINE CIRCOVIRUS TYPE (PCV2) Ở ĐÀN LỢN NUÔI TẠI MỘT SỐ TỈNH MIỀN BẮC VIỆT NAM” Mã số : KC.04.TN03/11-15 Chủ nhiệm đề tài/dự án: Cơ quan chủ trì đề tài/dự án: (ký tên) (ký tên đóng dấu) TS Huỳnh Thị Mỹ Lệ Ban chủ nhiệm chương trình (ký tên) Bộ Khoa học Cơng nghệ (ký tên đóng dấu gửi lưu trữ) Hà Nội - 2012 TRƯỜNG ĐẠI HỌC NƠNG NGHIỆP CỘNG HỒ XÃ HỘI CHỦ NGHĨA VIỆT NAM HÀ NỘI Độc lập - Tự - Hạnh phúc Hà Nội, ngày tháng 12 năm 2012 BÁO CÁO THỐNG KÊ KẾT QUẢ THỰC HIỆN ĐỀ TÀI I THÔNG TIN CHUNG Tên đề tài: “Phân lập xác định genotype Porcine circovirus type (PCV2) đàn lợn nuôi số tỉnh miền Bắc Việt Nam” Mã số đề tài: KC.04.TN03/11-15 Thuộc: Chương trình KH&CN trọng điểm cấp nhà nước KC.04/11-15 “Nghiên cứu phát triển ứng dụng công nghệ sinh học” Chủ nhiệm đề tài: Họ tên: Huỳnh Thị Mỹ Lệ Ngày, tháng, năm sinh: 06/06/1973 Nam/ Nữ: Nữ Học hàm, học vị: Tiến sĩ Chức danh khoa học: Chức vụ: phó Bộ mơn Điện thoại: Tổ chức: (04) 36 762 584 Nhà riêng: (04)38 767 575 Mobile: 0913081492 Fax: (04) 36 762 883 E-mail: huynhtmle@yahoo.com Tên tổ chức công tác: khoa Thú y, trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội Địa tổ chức: Thị trấn Trâu Quỳ, Gia Lâm, Hà Nội Địa nhà riêng: số ngõ 130 Ngô Xuân Quảng, Trâu Quỳ, Gia Lâm, Hà Nội Tổ chức chủ trì đề tài/dự án: Tên tổ chức chủ trì đề tài: trường Đại học Nông nghiệp Hà Nội Điện thoại: (04)38 276 653 Fax: (04) 38 276 554 E-mail : webmaster@hua.edu.vn Website: http://www.hua.edu.vn Địa chỉ: Trâu Quỳ, Gia Lâm, Hà Nội Họ tên thủ trưởng tổ chức: Số tài khoản: PGS.TS Trần Đức Viên 3711 90 012 (chủ tài khoản: PGS.TS Vũ Văn Liết - phó Hiệu trưởng) Ngân hàng: Kho bạc Nhà nước Gia Lâm, Hà Nội Tên quan chủ quản đề tài: Bộ Giáo dục Đào tạo II TÌNH HÌNH THỰC HIỆN Thời gian thực đề tài/dự án: - Theo Hợp đồng ký kết: từ tháng 1/ năm 2012 đến tháng 12/ năm 2012 - Thực tế thực hiện: từ tháng 1/năm 2012 đến tháng 12/năm 2012 - Được gia hạn (nếu có): khơng Kinh phí sử dụng kinh phí: a) Tổng số kinh phí thực hiện: 780 tr.đ, đó: + Kính phí hỗ trợ từ SNKH: 780 tr.đ + Kinh phí từ nguồn khác: tr.đ + Tỷ lệ kinh phí thu hồi dự án (nếu có): khơng b) Tình hình cấp sử dụng kinh phí từ nguồn SNKH: Số Theo kế hoạch Thực tế đạt Ghi Thời gian Kinh phí Thời gian Kinh phí (Số đề nghị (tháng, năm) (tr.đ) (tháng, năm) (tr.đ) toán) Tháng 03/2012 270.000.000 Tháng 05/2012 276.000.000 Tháng 11/2012 234.000.000 TT c) Kết sử dụng kinh phí theo khoản chi: Đối với đề tài: Đơn vị tính: triệu đồng Số Nội dung TT khoản chi Trả công lao động (khoa học, phổ Theo kế hoạch Tổng SNKH 180 180 450 Thực tế đạt Nguồn Tổng SNKH 180 180 450 449,4 449,4 80 80 80 80 0 0 70 70 70 70 780 780 779,4 779,4 khác Nguồn khác thông) Nguyên, vật liệu, lượng Thiết bị, máy móc Xây dựng, sửa chữa nhỏ Chi khác Tổng cộng - Lý thay đổi (nếu có): đấu thầu vật tư 600.000đ (sáu trăm nghìn đồng) so với dự trù định phê duyệt gói thầu; chuyển thành kinh phí tiết kiệm Các văn hành trình thực đề tài/dự án: (Liệt kê định, văn quan quản lý từ công đoạn xác định nhiệm vụ, xét chọn, phê duyệt kinh phí, hợp đồng, điều chỉnh (thời gian, nội dung, kinh phí thực có); văn tổ chức chủ trì đề tài, dự án (đơn, kiến nghị điều chỉnh có) Số Số, thời gian ban TT hành văn Tên văn Số 1877/QĐ- Quyết định việc thành lập BKHCN ngày Hội đồng khoa học công 27/6/2011 nghệ tư vấn xét chọn tổ chức cá nhân chủ trì đề tài nghiên cứu khoa học công nghệ tiềm thực năm 2011 thuộc lĩnh vực Công nghệ sinh học Số 3856/QĐ- Quyết định việc phê duyệt BKHCN ngày kinh phí, tổ chức cá nhân 15/12/2011 chủ trì nhiệm vụ KH&CN bắt đầu thực kế hoạch năm 2011 Thuộc chương trình: Nghiên cứu phát triển ứng dụng công nghệ sinh học (Mã số chương trình: KC.04/11-15) Số 691/QĐ- Quyết định việc phê duyệt BKHCN ngày kế hoạch đấu thầu mua sắm 17/4/2012 nguyên, nhiên vật liệu đề tài KC.04.TN03/11-15 Thuộc chương trình: Nghiên cứu phát triển ứng dụng cơng nghệ sinh học (Mã số chương trình: KC.04/11-15) Ghi Tổ chức phối hợp thực đề tài, dự án: Số TT Tên tổ chức Tên tổ chức đăng ký theo tham gia thực Thuyết minh Phòng virusTrung tâm Sản phẩm Nội dung tham gia chủ yếu chủ yếu đạt Phòng virus - - Giúp phân lập - Chủng Trung tâm virus PCV2 chẩn đoán thú chẩn đoán thú - Cung cấp số phân lập y Trung ương y Trung ương mẫu bệnh phẩm Giải trình tự gen Trình tự Phịng thí Phịng thí nghiệm virus nghiệm virus gen PCV2 học, trường học, trường đại đăng đại học Thú y, học Thú y, Đại ký Đại học Quốc học Quốc gia Genbank gia Seoul Ghi chú* Seoul - Lý thay đổi (nếu có): Cá nhân tham gia thực đề tài, dự án: (Người tham gia thực đề tài thuộc tổ chức chủ trì quan phối hợp, không 10 người kể chủ nhiệm) Số TT Tên cá nhân Tên cá nhân đăng ký theo tham gia Thuyết minh thực Nội dung tham Sản phẩm chủ Ghi gia yếu đạt chú* Huỳnh Thị Mỹ Lệ Huỳnh Thị Mỹ Lệ Chủ nhiệm đề tài Đặng Hữu Anh Đặng Hữu Anh - Thư ký - Mẫu - Thu thập mẫu - Chuyên đề giải - Giải trình tự gen trình tự hệ gen PCV2 đàn lợn nuôi số tỉnh miền Bắc Việt nam Mai Thị Ngân Mai Thị Ngân - Thu thập mẫu - Mẫu - Sử dụng phản - Chuyên đề xác ứng ELISA xác định tỷ lệ lưu định tỷ lệ lưu hành hành huyết huyết kháng kháng Lê Văn Trường Lê Văn Trường PCV2 PCV2 - Thu thập mẫu - Mẫu - Chuẩn hóa quy - Chun đề trình nested PCR Quy trình nested PCR xác định genotype PCV2 từ bệnh phẩm lợn Ngô Minh Hà Ngô Minh Hà Thu thập mẫu Mẫu Trần Thị Hương Trần Thị Hương - Thu thập mẫu - Mẫu Giang - Xác định - Chuyên đề genotype PCV2 Xác định Giang genotype PCV2 đàn lợn nuôi số tỉnh miền Bắc Việt Nam Vũ Thị Ngọc Vũ Thị Ngọc - Thu thập mẫu - Mẫu - Phân lập Xác - Chuyên đề xác định đặc tính sinh định số đặc học PCV2 tính sinh học phân lập PCV2 phân lập từ lợn Nguyễn Văn Giáp Nguyễn Văn Giáp Giải trình tự gen Trình tự gen Võ Văn Hiểu Võ Văn Hiểu - Thu thập mẫu - Mẫu - Phân lập PCV2 - Chuyên đề phân lập PCV2 từ lợn nuôi số tỉnh miền Bắc Việt Nam 10 Học viên cao học Học viên cao học Thu thập mẫu - Mẫu Đinh Đức Cảnh Đinh Đức Cảnh - Tham gia làm - Bảng kết nhóm sinh viên nhóm sinh viên phản ứng ELISA, ELISA, phân Thú y K52 Thú y K52 phân lập định lập định genotype PCV2 genotype PCV2 - Lý thay đổi ( có): Trong thời gian thực đề tài, BSTY Ngơ Minh Hà học nước ngồi nên việc phân lập PCV2 bàn giao lại cho KS Võ Văn Hiểu thực Tình hình hợp tác quốc tế: Theo kế hoạch Số TT Thực tế đạt (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa điểm, tên tổ chức hợp tác, số điểm, tên tổ chức hợp tác, số Ghi chú* đoàn, số lượng người tham gia ) đoàn, số lượng người tham gia ) Giáo sư giúp GS.TS Bong Kyun Park, Phịng thí nghiệm virus học, Phịng thí nghiệm virus học, trường đại học Thú y, Đại học đỡ chuyên trường đại học Thú y, Đại học Quốc gia Seoul cung cấp chủng môn, không Quốc gia Seoul giúp đỡ để giải PCV2 chuẩn giúp giải trình kinh phí trình tự gen PCV2 - Lý thay đổi (nếu có): tự gen PCV2 Tình hình tổ chức hội thảo, hội nghị: Số TT Theo kế hoạch Thực tế đạt (Nội dung, thời gian, kinh phí, địa (Nội dung, thời gian, kinh điểm ) Ghi chú* phí, địa điểm ) Porcine circovirus type Porcine circovirus type Có biên (PCV2) bệnh PCV2 (PCV2) bệnh kèm theo gây lợn, tổ chức PCV2 gây lợn, tổ (phụ lục) trường ĐHNN Hà Nội chức khoa Thú y, Kinh phí 10,5 triệu trường ĐHNN Hà Nội ngày 28/9/2012 Kinh phí 10,5 triệu - Lý thay đổi (nếu có): Tóm tắt nội dung, cơng việc chủ yếu: (Nêu mục 15 thuyết minh, không bao gồm: Hội thảo khoa học, điều tra khảo sát nước nước ngoài) Thời gian Số TT Các nội dung, công việc (Bắt đầu, kết thúc Người, chủ yếu - tháng … năm) quan (Các mốc đánh giá chủ yếu) Thu thập mẫu huyết Sử dụng phương pháp ELISA để xác định kháng thể kháng porcine circovirus type Theo kế Thực tế đạt hoạch 1/2012- 1/2012- Cán tham 2/2012 4/2012 gia đề tài 1/2012- 1/2012- 4/2012 4/2012 5/2012 5/2012 thực Mai Thị Ngân Viết chuyên đề: Sử dụng phản ứng ELISA đánh giá tỷ lệ lưu hành huyết kháng PCV2 đàn lợn nuôi tỉnh (Hà Nội, Hải Dương, Bắc Giang Hịa Bình) Mai Thị Ngân Thu mẫu bệnh phẩm phục vụ 1-2012- 1/2012- Cán tham chẩn đoán phân lập PCV2 4/2012 6/2012 gia đề tài 1/2012- 3/2012- 7/2012 9/2012 Nhân virus xác định số 2/2012- 3/2012- đặc tính sinh học virus 7/2012 10/2012 7/2012 9/2012 Võ Văn Hiểu 7/2012 10/2012 Vũ Thị Ngọc 1/2012 4/2012 Lê Văn Trường 2/2012 4/2012 Lê Văn Trường Phân lập porcine circovirus type đàn lợn nuôi Việt Nam môi trường tế bào Võ Văn Hiểu Vũ Thị Ngọc Viết chuyên đề: Phân lập Porcine circovirus type từ lợn nuôi số tỉnh miền Bắc Việt Nam Viết chuyên đề: Xác định số đặc tính sinh học Porcine circovirus type phân lập từ lợn nuôi số tỉnh miền Bắc Việt Nam Chuẩn hóa quy trình nested PCR để xác định genotype Porcine circovirus type 10 Viết chuyên đề: Quy trình nested PCR để xác định genotype PCV2 bệnh phẩm lợn Lê Văn Xác định genotype porcine 11 circovirus type đàn lợn nuôi 1/2012- 1/2012- Trường, Trần Việt Nam phương pháp 9/2012 5/2012 Thị Hương Giang nested PCR 12 Viết chuyên đề: Kết xác định genotype PCV2 đàn lợn nuôi số tỉnh miền Bắc Việt Nam 9/2012 5/2012 Trần Thị Hương Giang ... 3 /20 12- 7 /20 12 9 /20 12 Nhân virus xác định số 2/ 20 12- 3 /20 12- đặc tính sinh học virus 7 /20 12 10 /20 12 7 /20 12 9 /20 12 Võ Văn Hiểu 7 /20 12 10 /20 12 Vũ Thị Ngọc 1 /20 12 4 /20 12 Lê Văn Trường 2/ 20 12 4 /20 12 Lê... 3 /20 12- 3 /20 12- 10 /20 12 8 /20 12 10 /20 12 8 /20 12 11 /20 12- 11 /20 12- 12/ 20 12 12/ 20 12 Đặng Hữu Anh, Nguyễn Văn Giáp 14 Viết chuyên đề: Giải trình tự hệ gen PCV2 đàn lợn nuôi số tỉnh miền Bắc Việt Nam. .. nested PCR để xác định genotype PCV2 bệnh phẩm lợn Lê Văn Xác định genotype porcine 11 circovirus type đàn lợn nuôi 1 /20 12- 1 /20 12- Trường, Trần Việt Nam phương pháp 9 /20 12 5 /20 12 Thị Hương Giang