Các bước cơ bản trong liệu pháp gen

Các bước cơ bản trong liệu pháp gen

1 GIỚI THIỆU CHUNG

Vào ngày 14-9-1990, nhóm nghiên cứu tại học viện sức khỏe quốc gia Mỹ(U.S.National Instituse of Helth) đã tiến hành chuỗi thử nghiệm liệu pháp gen đầutiên cho bé Ashanti Desilva 4 tuổi Sinh ra với căn bệnh di truyền hiểm nghèo có tên

là severe combined immune deficiency SCDI, cô bé thiếu hệ thống miễn dịch và cóthể bị tổn thương khi mắc phải bất kỳ mầm bệnh nào Trẻ em mắc bệnh này thườngkhông chống lại được sự lây nhiễm của bệnh tật và rất khó sống đến tuổi trưởngthành, tuổi thơ của chúng luôn mắc bệnh tật Ashanti được lập một hành lang bảo vệxung quanh, không tiếp xúc với những người ngoài gia đình, trong môi trường vôtrùng tại nhà và được điều trị thường xuyên với kháng sinh liều cao

Trong thủ tục liệu pháp gen của Ashanti, bác sĩ đã tách các tế bào máu trắng rakhỏi cơ thể cô ta, cho chúng phát triển trong phòng thí nghiệm, gắn gen thiếu vàocác tế bào này và sau đó chuyển các tế bào đã được biến đổi di truyền trở lại máucủa bệnh nhân Những kiểm tra trong phòng thí nghiệm đã cho thấy liệu pháp này

đã làm tăng hệ thống miễn dịch của Ashanti, cô ta không bị cảm lạnh trở lại, có thểđến trường và đã miễn dịch với chứng ho Thủ tục này không phải là một phươngthuốc, những tế bào máu trắng được xử lý về mặt di truyền chỉ làm việc trong mộtvài tháng và quá trình này phải lặp lại

Mặc dù sự giải thích đơn giản về liệu pháp gen này dường như có kết quả khảquan, nhưng nó mở đầu cho một cuộc tranh luận kéo dài; con đường để liệu phápgen được chấp nhận chứa đầy những cuộc tranh luận Liệu pháp gen sinh học ởngười là rất phức tạp, một số công nghệ cần được phát triển và những căn bệnh cầnđược hiểu biết cặn kẽ hơn trước khi liệu pháp gen có thể được sử đụng một cáchthích đáng

Tuy nhiên, không thể phủ nhận rằng, ngày nay liệu pháp gen là một lĩnh vựckhổng lồ với cơ hội sinh lời lớn cho các nhà đầu tư có hiểu biết Bằng chứng là sựphát triển của các nghiên cứu về liệu pháp gen trong hơn một thập kỷ qua Lĩnh vựcnày có tiềm năng vô cùng to lớn, một số người đã so sánh tiềm năng đầu tư trongcông nghệ sinh học đặc biệt là liệu pháp gen với kinh nghiệm về công nghệ nhữngnăm 1980

2 LIỆU PHÁP GEN LÀ GÌ?

2.1 Định nghĩa liệu pháp gen.

Trong các ứng dụng của sinh học phân tử vào y học, liệu pháp gen đối với cácrối loạn di truyền mở ra nhiều triển vọng nhất, đồng thời cũng là hướng ứng dụngkhó thực hiện nhất Các định nghĩa về liệu pháp gen được thay đổi theo thời gian,ngày nay không có định nghĩa chung nào được chấp nhận cho khái niệm này Songđịnh nghĩa sau đây được sử dụng rộng rãi nhất trong các diễn đàn Quốc tế

Định nghĩa: liệu pháp gen là kỹ thuật đưa gen lành vào cơ thể thay thế cho gen bệnh hay đưa gen cần thiết nào đó thay vào vị trí gen bị sai hỏng để đạt được mục tiêu của liệu pháp

- Biện pháp thứ nhất là cách giải quyết triệt để, vì gen lành sẽ được đưa vàođúng vị trí của nó trên bộ gen và chịu tác động bình thường của các trình tự biểuhiện gen đó Cho đến nay, chưa có thành tựu đáng kể nào trong lĩnh vực này vìngười ta chưa biết cách sửa chữa gen một cách đặc hiệu Tuy vậy, kỹ thuật tái tổhợp đồng dạng cũng đem dến những hy vọng rất lớn và khả năng thành công là điềuhoàn toàn có thể hy vọng trong tương lai

- Biện pháp thứ hai dễ thực hiện hơn nhưng khi đưa thêm một gen cần thiết vào

bộ gen, người ta không làm chủ được vị trí gắn xen của đoạn mới đưa vào Điều nàydẫn đến một số kết quả không lường trước được:

 Gen mới đưa vào không nằm trong phức hợp điều hoà nên có thể đượcbiểu hịên một cách tuỳ tiện, không đúng nơi (đúng với loại tế bào, mô đặchiệu) và không đúng lúc (đúng với chu trình phát triển cá thể), hoặc thậmchí không được biểu hiện

 Gen mới đưa vào gây những hiệu quả không mong muốn

 Gen gắn vào một vị trí có khả năng hoạt hoá một gen tiền ung thư dẫndến sự biểu hiện quá độ của gen này gây ra ung thư

Hiện nay, mọi cố gắng đều nhằm giải quyết những vấn đề này Đặc biệt, liệupháp gen trong trường hợp này được giới hạn chặt chẽ trên tế bào sinh dưỡng Việctác động vào gen của tế bào sinh dục bị nghiêm cấm vì lý do đạo đức, con người từchối việc thay đổi gia sản di truyền có thể lưu lại cho con thế hệ sau

Liệu pháp gen có thể được tiến hành thông qua một số cách sau:

 Chuyển trực tiếp gen vào mô người bệnh

 Tạo véctơ virus để chuyển gen một cách hiệu quả tới tế bào (in vivo) Virus xâm nhiễm trực tiếp vào tế bào bằng cách gắn với chúng và “bơm” thông tin

di truyền của chúng vào tế bào Vì các virus tự nhiên tự sinh sản bên trong tế bàochủ nên gây hại với vật chủ mang chúng Tuy nhiên, có thể xoá hay làm mất cácphần có hại của virus, ngăn không cho chúng tái bản trong tế bào chủ Ngày nay cácvirus không có khả năng tái bản này được sử dụng chung cho các nghiên cứu liệupháp gen trên người và động vật

 Sử dụng các kỹ thuật khác nhau để chuyển gen vào tế bào bên ngoàingười bệnh, sau đó chuyển các tế bào đã được biến đổi này vào ngườibệnh (ex vivo) Phương pháp này được sử dụng chung để phân phối cácnhân tố phát triển và các phân tử khác tới các vùng đặc hiệu của cơ thể.Chúng cũng được sử dụng để tạo ra các dòng tế bào đã bị biến đổi hoàntoàn cho cấy ghép Giống như trong liệu pháp gen in vivo, các tế bàođược chuyển có thể gây biểu hiện các protein lạ gây sưng tấy hay đáp ứngmiễn dịch

 Các nhóm chuyên gia đã chia liệu pháp gen thành các mức khác nhau:

 Chuyển gen với sự hoà nhập (gen được kết hợp chặt chẽ với DNA củavật chủ)

 Chuyển gen không hoà nhập (gen không kết hợp chặt chẽ với DNA củavật chủ)

 Sử dụng các oligonucleotide tổng hợp nhân tạo gọi là các phân tửribozyme/antisense không có các thành phần điều hoà (sự biểu hiện gen

đã bị biến đổi)

2.2 Các bước cơ bản trong liệu pháp gen

Trong thực nghiệm, người ta dùng các vector virus để chuyển các gen vào tế bàođộng vật theo 2 bước:

Bước 1: Tạo vector tái tổ hợp mang gen cần chuyển Trước đó, các virus đãđược biến đổi để không còn khả năng sao chép, đồng thời lại có khả năng biểu hiệnmạnh gen cần đưa vào cơ thể Các biến đổi này bao gồm việc loại bỏ các trình tựcần cho sự sao chép của virus và gắn vào trước gen các trình tự promotor mạnh Sau

đó, vector tái tổ hợp được đưa vào tế bào nuôi cấy Loại tế bào được sử dụng nhiềunhất là tế bào tuỷ xương vì dễ nuôi cấy lại bao gồm nhiều tế bào nguồn đa thế (pluripotential)

Bước 2: Vector virus mang gen lành được đưa vào cơ thể mà từ đó người ta đãtách các tế bào tuỷ xương Như vậy, có thể xem đây là kỹ thuật ghép tự thân dù genghép vào là gen lạ đối với cơ thể Trở ngại lớn là protein do gen lạ tạo ra có thể kíchthích sản sinh kháng thể chống lại chính nó, hơn nữa, nếu việc chuyển gen vào tếbào nuôi cấy thường thành công thì việc đưa tế bào chuyển gen trở lại cơ thể lại ítkhi có hiệu quả do nhiều nguyên nhân

Gần đây nhất, một quy trình liệu pháp gen vừa được thông qua nhằm làm chậm

sự phát triển của bệnh AIDS Người ta chuyển các oligonucleotit đối (antisens) bổsung cho một số trình tự của virus HIV (trình tự TAR, REV) vào các tế bào của mộtngười lành là anh em sinh đôi của người bệnh Sau đó các tế bào này được tiêm vàobệnh nhân Các Oligonicliotit đối TAR sẽ ức chế sự sao chép của virus khi bắt cặp

và vô hiệu hóa trình tự TAR đóng vai trò trong sự sao chép Còn các Oligonucleotitđối REV, khi bắt cặp với trình tự REV sẽ ngăn sự vận chuyển mRNA từ nhân ra tếbào chất

2.3 Ứng dụng của liệu pháp gen trong điều trị bệnh

Đến nay có 533 thử nghiệm liệu pháp gen diễn ra trên thế giới Với 407 thửnghiệm diễn ra ở Mỹ, đây là nước dẫn đầu trong các thử nghệm của liệu pháp gen.Trong số 533 thử nghiệm, có 322 thử nghiệm trong điều trị bệnh ung thư, chiếm62,28%, 37 thử nghiệm trong điều trị HIV chiếm 6,94%, ngoài ra là các thử nghiệmvới các bệnh tim mạch, u xơ, SCID (severe combined immune deficiency), chứngmáu khó đông

3 CÁC YẾU TỐ KỸ THUẬT TRONG CHUYỂN GEN

“Không hệ thống véctơ nào là tối ưu cho tất cả các kỹ thuật của liệu pháp gen’

Kay, M., Glorioso, J., Naldini, L Nature Medicine 7 (1) 2001

3.1 Các cơ sở của sinh học phân tử:

Thông tin di truyền dưới dạng DNA tồn tại trong mỗi tế bào của cơ thể (trừ các

tế bào máu) Mỗi tế bào chứa đựng các thông tin để xây dựng bất cứ dạng tế bào

hay mô đặc hiệu nào của sinh vật Vì các tế bào và mô khác nhau quy định sự sảnxuất của các khối cấu trúc (building block) khác nhau nên DNA chứa đựng thôngtin liên quan đến khối các cấu trúc để sản xuất các mô đặc hiệu Sự tiến hoá đã cungcấp một giải pháp tuyệt vời cho vấn đề này DNA được tạo nên từ một chuỗi bốnphân tử khác nhau: adenine, guanine, cytosine và thymine Sự kết hợp của các phân

tử này tạo nên “ngôn ngữ” của DNA Gen, được tạo nên từ DNA mã hoá tất cả cácprotein, là khối cấu trúc của tế bào Các promoter cho phép hoạt hoá của các gen vàqua đó các protein đặc hiệu được biểu hiện Các vùng khác của DNA không mang

mã và là phần quan trọng để bảo tồn cấu trúc nhiễm sắc thể Thành phần này củacủa DNA vô cùng quan trọng trong các dự án về bộ gen, tính tuần hoàn đoạn củaDNA trong các vùng không mang mã có thể được kết hợp với các gen đã biểu hiện,cho chúng ta phương pháp tìm kiếm các gen chưa biết

Tự nhiên đã phát triển một cách thức rất thông minh mà qua đó các proteinđặc hiệu chỉ được biểu hiện trong các mô dặc hiệu DNA sắp thành các sợi dài gọi

là nhiễm sắc thể Có hai bản sao của mỗi gen tồn tại trong tế bào Tuy nhiên có một

số trường hợp ngoại lệ, các gen tồn tại trong các nhiễm sắc thể X và Y (nhân tốquyết định giới tính) có thể chỉ có duy nhất một bản sao

Thông tin được truyền từ DNA đến các cơ quan phức tạp hơn Quá trìnhphiên mã được bắt đầu bởi các phân tử nhận biết đặc hiệu có tên là các nhân tốphiên mã (nhân tố gắn với các chuỗi điều hoà của gen và cho phép sự sao chép đượctiến hành) Bản sao được tạo thành từ phân tử ban đầu gọi là RNA trong nhân tếbào Bản sao sau đó ra khỏi nhân tế bào, chuyển đến lưới nội chất, nơi mà nó sẽđược dịch mã tổng hợp thành protein

3.2 Cơ sở của liệu pháp gen

Để chuyển gen, cần hội đủ một số điều kiện sau đây:

 Đầu tiên, phải có bản sao đầy đủ của gen thích hợp với những trình tựđiều hoà thích hợp (trình tự khởi động), trình tự khởi động có thể là duynhất đối với gen đặc hiệu, bằng cách này cho phép gen chỉ biều hiệntrong các mô mà thông thường chúng được biểu hiện

Lần lượt, các gen có thể được kết nối với các trình tự khởi động, hoạt hoá trongtất cả các mô (phương pháp chung nhất được sử dụng ngày nay) hoặc có thể kết nối

với các trình tự có thể hoạt hoá hay bất hoạt như một công tắc Những thao tác nhưvậy có thể đạt được bằng công nghệ DNA tái tổ hợp.

 Thứ hai, phải lựa chọn kỹ thuật đích DNA cần kỹ thuật này để có thểtiếp cận với tế bào Ba kỹ thuật cơ bản được sử dụng để làm điều này:

 DNA có thể được gắn trực tiếp với các tế bào hoặc cấy vào mô Gọi làchuyển DNA trần (nacked DNA transfer)

 DNA có thể được sử dụng dể tạo nên con thoi dịch chuyển virus (viraltransfer shuttle) Đây là phương pháp chuyển DNA hầu như chắc chắnnhất DNA xâm nhập không hiệu quả vào tế bào vì nó khó có thể xuyênqua lớp màng lipit kép, nhưng vector virus dễ dàng làm việc này

 DNA cũng có thể phối hợp với các phức hệ hoá học khác nhau đểkhuếch đại khả năng chuyển dịch qua màng tế bào của nó

 Thứ ba, có hai phương pháp ứng dụng liệu pháp gen: liệu pháp gen cóthể ứng dụng trực tiếp với bệnh nhân hoặc trên các tế bào đã tách ra khỏingười bệnh (như tế bào tuỷ xương) sau đó cấy trở lại người bệnh Trongtương lai, các thao tác liệu pháp gen của tế bào gốc phát triển trên môitrường mô tế bào và sau đó cấy lên người bệnh sẽ là tiến triển tột cùng.Mỗi kỹ thuật trên đều có những thuận lợi và khó khăn riêng Khi chọn phươngpháp phân phối gen, một số nhân tố cần được cân nhắc:

 Hiệu quả của liệu pháp phải được đặt lên hàng đầu

 Sau đó, gen chuyển đổi phải được điều hoà đúng đắn Nó phải đượchoạt hoá đúng lúc, với độ dài thời gian chính xác và đúng số lượng Những vấn đề này là rào cản to lớn cho sự phát triển và phổ biến của liệu phápgen Hiện nay đích ứng dụng quan trọng nhất của liệu pháp gen là các bệnh hiểmnghèo, ở đó mô bệnh dễ dàng bị ảnh hưởng và những bệnh mà sự điều hoà chínhxác của gen được chuyển là không cần thiết Đúng như mong muốn, hiệu quả củaliệu pháp trong các trường hợp này dễ dàng quản lý

Sự tinh vi của chúng ta trong thiết kế vector và promotor ngày càng tăng, mở ranhiều triển vọng mới cho những ứng dụng điều trị các bệnh hiểm nghèo (như bệnhđái đường) thông qua sự tập hợp thông tin của các dự án về bộ gen người mà ở đó

sự điều hoà gen là phức tạp hơn

Để chuyển gen, trong các nghiên cứu sử dụng các vector có hoặc không có bảnchất virus nhằm đưa gen mục tiêu đến các tế bào Hiện nay, các nghiên cứu phânphối gen nhờ retrovirus diễn ra nhiều nhất sau đó đến adenovirus.

3.3 Vector chuyển gen có bản chất virus

3.3.1 Các bước quan trọng để hoạt hóa thành công virus và chức năng của nó

Sự sử dụng virus trong liệu pháp gen dựa trên các chức năng cơ bản của nó:

 Chuyển đặc hiệu vật chất di truyền đến tế bào Virus chứa vật chất di

truyền được bao quanh bởi lớp màng protein Đầu tiên, virus gắn tới các

tế bào riêng biệt bằng sự tương tác với thụ thể (hay một chuỗi các điểmthụ thể) trên bề mặt tế bào Tiếp đó, virus vào tế bào bởi sự tương tác vớicác phân tử bề mặt đặc hiệu trên tế bào, bằng cách này nó dễ dàng đixuyên qua lớp rào chắn màng tế bào

 Sự phụ thuộc vào dạng của vector virus được sử dụng, những gen đượcmang bởi virus hoặc được nhân bản sử dụng nguyên liệu của chính các tếbào hoặc được tiếp hợp tới nhân của tế bào, nơi mà các nhiễm sắc thể vàDNA nhân tồn tại Các gen đặc hiệu được mang và được tiếp hợp bởivirus sẽ phiên mã thổng hợp RNA và dịch mã tạo thành protein để tạonên chức năng mong muốn hay sản phẩm của liệu pháp

 Các virus khác nhau có mức độ khác nhau trên phương diện chuyển gencủa chúng tới các tế bào và tạo ra các sản phẩm gen Hơn nữa, hiệu quảcuối cùng của chúng đối với các gen chức năng trong tế bào không giốngnhau và có thể khác nhau từ tế bào này đến tế bào khác hoặc mô của cơquan này đên mô cơ quan khác

Những vấn đề này hưởng lớn tới thuận lợi y học và thành công của chiến lượcliệu pháp gen dựa trên vector virus

Tất cả các vector được sản xuất từ các virus tái tổ hợp kiểu hoang dại đãđược xác định Nói chung, các gen có vai trò trong tái bản virus được loại bỏ đểngăn cản sự truyền đi không mong muốn của vector virus và để ngăn cản các vectorvirus gây bệnh

Hiện tại, có 4 dạng chính của vector virus đang được sử dụng trong nghiêncứu và ứng dụng: adenovirus, adeno-associate virus (AAV), retrovirus và herpesSimplex.

Bảng 2: So sánh đặc điểm của các hệ thống chuyển gen virus

3.3.2 Vector Adenovirus:

Một trong những vector liệu pháp gen chung nhất hiện đang sử dụng là vector có

cơ sở adenovirus Adenovirus gây bệnh khó thở ở người (cảm lạnh, nhiễm trùng dạdày) và có 47 dạng khác nhau (gọi là kiểu huyết thanh) được tìm thấy ở người Kiểu

2 và 5 được sử dụng chung nhất cho các ứng dụng liệu pháp gen

Hình 1: Adenovirus có cấu trúc chung chứa capsid hai mươi mặt bao quanh bộ

gen dsDNA dài xấp xỉ 36kbp Vỏ capsid của virus chứa ba protein: hexon, fiber và

base penton Hexon là thành phần cấu trúc quan trọng, tạo thành bề mặt hai mươimặt, trong khi các penton tạo thành phức hệ với fiber cho kết quả là 12 “chóp”ngoài vỏ virus đóng vai trò quan trọng trong việc gắn với các phối tử

Điểm đầu tiên trong sản xuất vector liệu pháp gen là lấy đi gen điều khiển táibản (sự phát triển) của virus trong mô Sự sinh sản và phát triển của một lượng nhỏvirus mới là nguyên nhân chung cho những hiệu ứng độc do nhiễm virus

Bộ gen của adenovirus đã được nghiên cứu khá kỹ, chứa DNA xoắn kép gồm 50gen, dài 36 kilobase (KB) Gen E1 điều hoà phiên mã trong khi gen E2 và E3 điềuhoà quá trình dịch mã của bộ gen Các vector đã tách gen này cho phép mang gendài 8kb Trước đây, sự phát triển của các vector này dựa trên việc sử dụng virusgiúp đỡ (helper virus) để cung cấp các chức năng của gen bị huỷ Tuy nhiên, ngàynay một dòng tế bào có giá trị thương mại đã được tạo ra để mang các gen bị xoádạng vector Sự phát triển của các dòng tế bào này có thể làm adenovirus có giá trịthương mại và an toàn hơn Khi đó rủi ro của việc sử dụng virus kiểu hoang dạiđược giảm bớt

Trên hết, sản phẩm vector này có hiệu quả, với nồng độ 1x1012 đoạn virus/mlđang được sản xuất Phép đo hoạt tính vector thực tế rất quan trọng trong liệu phápgen Việc đo các phần tử vector đơn độc không bao hàm rằng tất cả các đoạn lànhiễm và do đó, có hoạt tính Hiện nay, có những cố gắng tiêu chuẩn hóa liều lượng

và hoạt tính của các vector virus

Thật không may, hệ thống vector adenovirus đã xuất hiện một vài bất cập Sựsản xuất của liệu pháp gen là giới hạn cho một chu kỳ thời gian ngắn và DNA đãđược chuyển không trở thành một phần của DNA trên tế bào chủ Các tác động trởlại của vector adenovirus cũng có thể gây ra đáp ứng miễn dịch mạnh trên vật chủ,

có nguy cơ dẫn tới các biến chứng nghiêm trọng Trọng tâm nghiên cứu hiện naynhằm cải tiến vector adenovirus đích và giảm các phản ứng miễn dịch do virus gây

ra, mang tới thành công đầy hứa hẹn trong việc sự sử dụng các vector phá huỷ bêntrong (gutted vector) chỉ sử dụng vỏ ngoài của adenovirus

Sự phát triển thú vị khác là khả năng điều khiển vector adenovirus đích tới cácnhóm tế bào đặc hiệu Công nghệ “retargeting” bao gồm việc sản xuất kháng thểcho protein thụ thể có vỏ adenovirus, nhân tố được sử dụng để gắn kết và gia nhập

tế bào Kháng thể này được hợp nhất với kháng thể đơn dòng (monoclonal) chốnglại protein đặc hiệu tồn tại trên bề mặt của tế bào Vector sau đó hoà trộn với khángthể dung hợp Khi được sử dụng, chỉ những tế bào biểu hiện protein đặc hiệu đượcchữa trị bằng vector này Một số công ty (ví dụ: GenVec) sản xuất vectoradenovirus đã biến đổi bề mặt điểm thụ cảm, điểm sẽ kết hợp với các tế bào khácnhau Việc phân loại của các vector khác nhau này cho phép adenovirus đích tớinhững mô khác nhau khi sử dụng các kháng thể.

Hình 2: Sơ đồ cấu trúc của vector adenovirus hiệu năng cao (high-capacity

adenoviral) HC-Ad Tất cả các gen của virus HC-Ad bị xoá, chỉ còn đầu bên trái vàphải của Ad5 và DNA thêm vào (stuffer DNA) thu được từ gen C346 và HPRT.AdSTK109 chứa bộ gen hAAT bao gồm liver và promoter macrophage đặc hiệu,trong AdGS85, hAAT cDNA được biểu hiện từ promoter cytomegalovirus củangười ((hCMV promoter) AdSTK129 chỉ chứa DNA thêm vào và không biểu hiệnbất cứ gen chuyển nào

3.3.3 Vector Adeno-associated Virus (AAV):

AAV là một parvovirus không xuất hiện trong các bệnh do vi sinh vật ở người.Virus này có thể chuyển DNA tới các tế bào không phân chia và hoà nhập với DNAcủa tế bào chủ Điều này mở ra khả năng ứng dụng của một vector chống lại cácbệnh kinh niên Trong dài hạn, sự biểu hiện của liệu pháp gen đã được chứng minh

Virus này nhỏ do đó chỉ có thể mang những gen có kích thước giới hạn Nó cũngkhó sản xuất hơn các vector khác nên tính thương mại hiện nay bị hạn chế.

Có 6 kiểu huyết thanh (serotype) của AAV, kiểu 2 thường được sử dụng trongcác ứng dụng của liệu pháp gen Do kích thước nhỏ, vector này chỉ mang được gen

có kích thước lớn nhất là 5 kB Như vậy, không thể chuyển được các gen phức tạpvới kích thước lớn Một số phương thức được đề ra để giải quyết vấn đề này

Một trong số đó là kỹ thuật liên kết bộ gen vector để phân cắt một số gen hợpnhất (cooperating gene) và phân phối chúng tới đích, sử dụng hai vector phân cắt Một cách trung gian là sự nhân bản của các vector dung hợp sử dụng lớp vỏ củaadenovirus kết hợp với bộ gen của vector AAV Điều không thuận lợi của phươngpháp là vector này đòi hỏi sự giứp đỡ của adenovirus để được tổng hợp Điều này

có thể dẫn đến sự hợp tác mạo hiểm với vector adenovirus (phản ứng miễn dịch).Gần đây, 3 plasmid, hệ thống virus giúp đỡ đa năng (helper virus free system) đãphát triển cho phép sản xuất các thể giúp đỡ đa năng của vector này

Hình 3: cấu trúc bộ gen của kiểu hoang dại (wild-type) và của vectorAAV.

 (A) bản đồ bộ gen của AAV hoang dại chứa các khung đọc (readingframes) Rep và Cap, các promoter (p5, p19, và p40), polyadenylation site(pA), và inverted terminal repeats (ITR) Quá trình phiên mã của virus

mã hoá các protein Rep và Cap (VP1-3) khác nhau được vẽ dưới bộ gen.Các protein Rep nhỏ hơn được dịch mã từ các điểm khởi đầu nội tại(internal initiation sites)

 (B) bản đồ của vector AAV, cho thấy sự thay thế các gen Rep và Cap củavirus với băng chuyển gen (promoter, transgene cDNA vàpolyadenylation site)

 (C) Cấu trúc bậc hai của AAV ITR, với các vùng gắn Rep (RBS) và vùngtiêu tan cuối cùng (TRS) (terminal resolution site)

Thuận lợi chính của hệ thống vector AAV là nó hoà nhập với nhiễm sắc thể của

tế bào chủ Điều này cho phép các vector được chuyển biểu hiện một cách ổn định

và lâu hơn Nhưng thật không may, nếu AAV kiểu hoang dại hoà nhập tại điểm đặchiệu trong nhiễm sắc thể 19 thì các vector tái tổ hợp lại mất tính đặc hiệu này và hoànhập tuỳ tiện Cho dù vậy, một vài thành công trong nghiên cứu trên động vật vàngười đã cho thấy rằng, sụ biểu hiện ổn định có thể đạt được với vector này

Hình 4: Quá trình phiên mã của vector AAV Các bước khác nhau cần cho quá

trình phiên mã của vector AAV bao gồm: đầu tiên AAV tương tác với các receptor

đa dạng và các phân tử coreceptor trên bền mặt tế bào, sự tiếp thu virion, nhân vàotrong tế bào và giải phóng bộ gen mạch đơn vủa vector, sự lai của bộ gen đưa vào

bổ sung (complementary input genomes) và sự hoà nhập nhiễm sắc thể trước biểuhiện gen có thể xảy ra từ khuôn xoắn kép DNA Cấu trúc bậc hai tiềm tàng của bộgen vector bổ sung (episomal) xuất hịên như các phân tử vector RNA đã được mãhoá

Hình 5: Chiến lược sản xuất rAAV Plasmid tái tổ hợp chứa gen cần thiết, được

tách dòng cùng lúc, ITRs của AAV được chuyển với plasmid giúp đỡ tái tổ hợp cóchứa wtAAV và các gen adenovirus cần thiết cho sự giải phóng, tái bản, và đónggói rAAV trong 293 tế bào Khoảng 48 đến 60 giờ sau, các tế bào bị dung giải vàphần chiết thô chứa rAAV và các protein của tế bào bị tách ra lệ thuộc vào sự tinhchế sau này (qua ly tâm gradient mật độ và sắc kí cột) Các mẩu nhỏ rAAV sau tinhchế được xác định chính xác và các virus đã tinh chế sau đó được sử dụng cho các

nghiên cứu in vitro và in vivo.

3.3.4 Vector Retrovirus

Retrovirus nằm trong số các vector virus được phát triển đầu tiên Vector này

đã được sử dụng trong gần 60% dự án liệu pháp gen y học Virus này có chứa vậtchất di truyền là RNA và có kích thước 7 đến 11 kB Khi vào tế bào, RNA virus cầntrở thành DNA trước khi nó có chức năng trên tế bào chủ Điều này được thực hiệnbởi enzim phiên mã ngược, RT (reversse transcriptase) Retrovirus có chứa enzimphiên mã ngược (enzim xúc tác tạo thành bản sao DNA của vật liệu di truyền RNAqua phiên mã ngược) và enzim hoà nhập (integrase) cần cho sự hoà nhập củaretrovirus virus vào tế bào chủ

Bộ gen của tất cả các virus này nhỏ và đã được nghiên cứu đầy đủ.Retrovirus dễ dàng biến đổi về mặt di truyền do đó được sử dụng rộng rãi như mộtvector của liệu pháp gen Virus murina leukaemia đã biến đổi di truyền (MuLV)được sử dụng phổ biến nhất Các retrovirus cổ điển chỉ nhiễm vào tế bào đang phânchia (dividing cell) và vật chất di truyền của chúng sau khi chuyển thành DNA, hoà

nhập với vật chất di truyền của tế bào chủ như một “provirus” Điều này giúp nóthích ứng với bệnh ung thư, bệnh mà ở đó các tế bào phân chia rất nhanh, cũng nhưcác bệnh cần thời gian dài để gen được ổn định vững chắc Điều bất lợi của vectornày là nó hoà nhập tuỳ tiện với DNA của tế bào chủ Do đó, các rủi ro khi vectorxâm nhập sẽ phá vỡ chức năng sinh lí bình thường của tế bào chủ Các retrovirus cơbản cũng cần sự phân chia của tế bào chủ để làm việc Hiện nay tồn tại những longại lớn hơn, đó là khả năng các vector retrovirus sẽ nhiễm vào tế bào mầm củangười bệnh và sản xuất tinh trùng hoặc trứng Do vậy, tiềm tàng sự ảnh hưởng đếnsinh sản sau này Tới nay, điều này đã được quan sát trên các động vật mẫu.

Các vector retrovirus cơ sở có thể trở thành vector được lựa chọn để thay đổi

tế bào gốc (stem sell) Khi đó, liệu pháp gen sẽ được sử dụng để sản xuất các genchữa bệnh Tuy nhiên, khi ứng dụng dạng vector này để tách dòng, rủi ro do độtbiến sẽ tăng

Một trong các phát triển thú vị gần đây là sự biến đổi của các lentivirus,dạng thay thế (sub-type) của retrovirus, trong các ứng dụng của liệu pháp gen Dạngvirus này gồm có HIV và SIV Các retrovirus này hoà nhập với DNA của tế bàochủ, do đó cung cấp sự biểu hiện gen ổn định trong một thời gian dài Tuy nhiên,chúng có thể vào các tế bào không phân chia, do đó mở rộng khả năng ứng dụngcủa vector này

Hình 6: Bộ gen của retrovirus (oncogenic retrovirus) gây bệnh ung thư MLV

(murine leukemia virus) DNA của axit nucleic của virus (hình thái của bộ gen virus

trong các tế bào bị nhiễm) xuất hiện Hai virus có cùng có các gen cấu trúc gag, pol,

và env Gav mã hoá lõi virus và pol mã hoá các enzim tái bản Gav và pol được biểu hiện ngay lập tức từ promoter trong LTR (long terminal repeat) Gen env được biểu

hiện từ từng chỗ nối mRNA (singly spliced mRNA), mã hoá màng glycoprotein.Gen của HIV được biểu hiện từ mRNA xuất hiện thêm vùng đa nối Dù các vai tròkhông được biết đầy đủ song chúng quan trọng trong quá trình điều hoà biểu hiệngen của virus và trong sự điều chỉnh lây nhiễm

Hình 7: Chu trình tái bản của retrovirus Sự nhiễm bắt đầu khi lớp màng

glycoprotein của virus nhận ra các vị trí thụ thể đặc hiệu trên bề mặt tế bào, sau đómàng virus và màng tế bào dung hợp giải phóng lõi virus (virus core) vào tế bàochất RNA của virus, được sao chép thành phân tử DNA mạch kép, và xâm nhậpvào nhân Thời gian chính xác và cơ chế của việc này chưa được xác định rõ ràng.DNA hoà nhập vào nhiễm sắc thể, bộ gen virus (từ bây giờ gọi là provirus) đượcgiữ ổn định Sản xuất RNA của virus và sau đó là các protein và enzim của chúng.RNA của virus cũng kết hợp với protein của virus để tạo thành các phần lõi (core)mới Các virion con đã trưởng thành có khả năng nhiễm vào các tế bào mới khichúng được giải phóng ra ngoài tế bào và được bao bởi vỏ của chúng (gồm cómàng tế bào và vỏ glycoprotein)

Hình 8: Các yếu tố đóng vai trò trong vector retrovirus đặc trưng Các chuỗi cần

thiết cho sự lan truyền retroviral được thể hiện Tất cả các chuỗi protein của virus bịxoá và thay bằng gen ngoại lai (gen cần cho các mục đích nhất định) Gen ngoại lai

có thể được biểu hiện từ promoter trong LTR của retrovirus (như được thấy trong hình trên), hoặc từ bên trong, promoter của virus khác loại, như trường hợp xảy ra với vector lentivirus Vai trò của các vùng khác nhau được đánh dấu

Hình 9: sản xuất vector retrovirus Các gen của virus biểu hiện từ các promoter

không có bản chất retrovirus (nonretroviral) và đưa tới các tế bào, nơi chúng bảotồn được sự ổn định và sản xuất các protein enzim cũng như cấu trúc virus Khivector retrovirus được đưa tới tế bào, vector virus RNA cần được bao gói, kết quả

từ quá trình sản xuất của các phần tử virus chứa bộ gen vector Virus này có thểđược thu lại và sử dụng để tiêm vào các tế bào đích nhằm đưa gen ngoại lai trongvector tới tế bào Vì các tế bào đích này không biểu hiện các protein của virus,vector sẽ không truyền bá xa hơn Các gen của virus trong các tế bào bao gói không

mang cấu trúc đi xa hơn vì chúng mất chuỗi cis-acting cần thiết cho sự nhân bản.

3.3.5 Các vector có cơ sở là herpes simplex

Vector herpes simplex là các vector có bản chất virus DNA Chúng không hoànhập vào DNA chủ nhưng giữ nguyên sự ổn định như một thể bổ sung (lantency),

có khả năng cho phép các gen được chuyển ổn định trong một thời gian dài Ngàynay, chúng được sử dụng trong các ứng dụng đặc biệt của liệu pháp gen với cáckhối u thần kinh Herpes simplex virus (HSV) có hiệu quả cao đối với các nơronthần kinh Vector này đủ lớn để chuyển DNA lớn (tới 30 kB) nhưng khó thực hiệnhơn adenovirus

Khả năng to lớn này cho phép phân phối 5 gen khác nhau được điều khiểnbằng các promoter khác nhau Do đó, nếu quá trình trị bệnh cần đa gen, đây có thể

là vector được lựa chọn

Hình 10: A Sơ đồ thể hiện các thành phần chính của virion HSV B Bộ gen của

HSV được tổ chức thành các đoạn dài và ngắn chỉ xuất hiện một lần (UL, Us) gầncác trình tự lặp lại 84 khung đọc mở của virus có thể được chia thành các gen cầncho sự tái bản trong mô thích hợp

Hiện có rất ít kinh nghiệm trị bệnh với các vector này, nhưng khả nằng sử dụngcủa vector này cho việc phân phối gen trong một thời gian dài tới hệ thống thầnkinh trung ương ngày càng tăng

3.3.6 Các vector virus khác: