Nghiên cứu mức độ phiên mã gen activation induced cytidine deaminase (AID) và tỉ lệ đột biến gen p53 trong ung thư dạ dày và ung thư gan nguyên phát

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ TRƯỜNG ĐẠI HỌC Y HÀ NỘI LÊ THỊ THÚY NGHIÊN CỨU MỨC ĐỘ PHIÊN MÃ GEN ACTIVATION INDUCED CYTIDINE DEAMINASE (AID) VÀ TỈ LỆ ĐỘT BIẾN GEN P53 TRONG UNG THƯ DẠ DÀY VÀ UNG THƯ GAN NGUYÊN PHÁT LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC HÀ NỘI -2012 M CL C ĐẶT VẤN ĐỀ Chương : TỔNG QUAN TÀI LIỆU 1.1 UNG TH DẠ DÀY 1.1.1 Dịch t học 1.1.2 Yếu tố nguy 1.1.3 Giải phẫu bệnh phân loại 1.1.4 Ch n đoán ung thư dày 1.2 UNG TH GAN 1.2.1 Dịch t học 1.2.2 Yếu tố nguy 11 1.2.3 Hình ảnh giải phẫu bệnh 12 1.2.4 Ch n đoán ung thư gan 13 1.3 CÁC BIẾN ỔI PHÂN T TRONG UNG TH GAN VÀ UNG TH DẠ DÀY 16 1.3.1 Gen gây ung thư (oncogene) 16 1.3.2 Gen áp chế ung thư 16 1.3.3 MicroRNA 16 1.4 VAI TR GEN p53 TRONG UNG TH 17 1.4.1 Cấu trúc gen p53 17 1.4.2 Chức p53 18 1.4.3 Gen p53 đột biến 21 1.5 VAI TR GEN AID TRONG UNG TH 23 1.5.1 Cấu trúc gen AID 23 1.5.2 Vai trò sinh học gen AID 24 1.5.3 Cơ chế hoạt động gen AID trình tái tổ hợp gen kháng thể 25 1.5.4 ột biến gen AID gây hội chứng tăng IgM b m sinh người 27 1.5.5 Vai trò gen AID ung thư 27 Chương : ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 34 2.1 ối tượng nghiên cứu 34 2.2 Dụng cụ, trang thiết bị hoá chất nghiên cứu 34 2.3 Phương pháp nghiên cứu 36 2.3.1 Lấy mẫu 38 2.3.2 Quy trình tách chiết DNA 38 2.3.3 Quy trình tách chiết RNA tổng hợp cDNA 41 2.3.4 Quy trình xác định đột biến gen p53 44 2.3.5 ánh giá mức độ phiên mã gen AID kỹ thuật Real-time PCR 49 2.3.6 ác định HBV DNA kỹ thuật Real time PCR 54 2.4 lý số liệu 55 Chương 3: 3.1 ẾT QUẢ NGHIÊN CỨU 56 C I M NH M NGHI N C U 56 3.1.1 Nhóm bệnh nhân gan 56 3.1.2 Nhóm bệnh nhân dày 57 3.2 KẾT QU TÁCH CHIẾT DNA, RNA VÀ TỔNG H P cDNA 58 3.2.1 Kết tách chiết DNA 58 3.2.2 Kết tách chiết RNA tổng hợp cDNA 61 3.3 ÁC NH T BIẾN GEN P53 65 3.3.1 Nhóm mơ gan 68 3.3.2 Nhóm mơ dày 69 3.4 ÁC NH M C PHI N M GEN AID 69 3.4.1 Nhóm mơ gan 71 3.4.2 Nhóm mơ dày 77 3.5 M I T NG QUAN GI A M C PHI N M GEN AID VÀ T BIẾN GEN P53 86 3.5.1 Nhóm mơ gan 86 3.5.2 Nhóm mô dày 86 Chương : BÀN LUẬN 87 4.1 C I M NH M NGHI N C U 90 4.1.1 Nhóm bệnh nhân gan 90 4.1.2 Nhóm bệnh nhân dày 91 4.2 KẾT QU V TÁCH CHIẾT DNA, RNA VÀ TỔNG H P cDNA 91 4.2.1 Kết tách chiết DNA 91 4.2.2 Kết tách chiết RNA tổng hợp cDNA 92 4.3 T L T BIẾN GEN P53 93 4.3.1 Nhóm mơ gan 94 4.3.2 Nhóm mơ dày 95 4.4 M C PHI N M GEN AID TR N M GAN VÀ M DẠ DÀY 96 4.4.1 Nhóm mơ gan 98 4.4.2 Nhóm mơ dày 100 4.5 M I T NG QUAN GI A M C PHI N M GEN AID VÀ T BIẾN GEN P53 101 4.5.1 Nhóm mơ gan 101 4.5.2 Nhóm mô dày 102 ẾT LUẬN 105 IẾN NGH 106 CÁC CÔNG TR NH Đ CÔNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN TÀI LIỆU THAM HẢO DANH SÁCH LẤY MẪU BỆNH NHÂN DANH M C BẢNG Bảng 1.1 Phân loại mô bệnh học theo WHO năm 2000 Bảng 3.1 ặc điểm tuổi nhóm bệnh nhân gan 56 Bảng 3.2 ặc điểm tuổi nhóm bệnh nhân dày 57 Bảng 3.3 Kết đo nồng độ độ tinh mẫu DNA sau tách chiết từ mô gan 59 Bảng 3.4 Kết đo nồng độ độ tinh mẫu DNA tách chiết từ mô dày 60 Bảng 3.5 Kết đo nồng độ độ tinh mẫu RNA tách chiết từ mô gan 61 Bảng 3.6 Kết đo nồng độ độ tinh mẫu RNA tách chiết từ mô dày 62 Bảng 3.7 Kết đo nồng độ độ tinh mẫu cDNA mô gan 63 Bảng 3.8 Kết đo nồng độ, độ tinh mẫu cDNA mô dày 64 Bảng 3.9 Liên quan nhi m HBV đột biến gen p53 mô gan 69 Bảng 3.10 Mức độ phiên mã gen AID mô gan viêm 71 Bảng 3.11 Mức độ phiên mã gen AID mô gan xơ 72 Bảng 3.12 Mức độ phiên mã gen AID mô gan ung thư 73 Bảng 3.13 Mức độ phiên mã gen AID mô gan ung thư, gan viêm gan xơ 75 Bảng 3.14 Mức độ phiên mã gen AID mô dày viêm 77 Bảng 3.15 Mức độ phiên mã gen AID mô dày ung thư 78 Bảng 3.16 Mức độ phiên mã gen AID mô dày viêm ung thư 84 Bảng 3.17 Mức độ phiên mã gen AID mô dày ung thư theo phân loại mô bệnh học 85 Bảng 3.18 So sánh mức độ phiên mã gen AID mô gan ung thư có đột biến gen p53 so với mô gan ung thư không đột biến gen p53 86 DANH M C BI U ĐỒ Biểu đồ 3.1 Phân bố bệnh theo giới nhóm bệnh nhân gan 56 Biểu đồ 3.2 T lệ nhi m HBV mô gan nghiên cứu 57 Biểu đồ 3.3 Phân bố giới theo bệnh nhóm bệnh nhân dày 58 Biểu đồ 3.4 T lệ đột biến gen p53 mô gan nghiên cứu 68 Biểu đồ 3.5 T lệ đột biến gen p53 nhóm mơ gan ung thư nhóm mơ gan khơng ung thư 68 Biểu đồ 3.6 So sánh mức đô phiên mã gen AID mơ gan nhóm nghiên cứu 76 Biểu đồ 3.7 So sánh mức độ phiên mã gen AID mô gan nhi m HBV không nhi m HBV 76 Biểu đồ 3.8 So sánh mức độ phiên mã gen AID mô dày ung thư mô dày viêm 84 Biểu đồ 3.9 So sánh mức độ phiên mã gen AID theo phân loại mô bệnh học ung thư dày 85 DANH M C H NH Hình 1.1 Hình 1.2 Hình 1.3 Hình 1.4 Hình 1.5 Hình 1.6 Hình 1.7 Hình 1.8 Hình 1.9 Hình 1.10 Hình 1.11 Hình 2.1 Hình 2.2 Hình 2.3 Hình 2.4 Hình 2.5 Hình 2.6 Hình 3.1 Hình 3.2 Hình 3.3 Hình 3.4 Hình 3.5 Hình 3.6 T lệ mắc tử vong UTDD giới T lệ mắc tử vong UTDD Việt Nam T lệ mắc tử vong ung thư gan giới 10 T lệ mắc tử vong ung thư gan Việt Nam 11 Cấu trúc protein p53 18 Cơ chế kiểm soát chu kỳ tế bào p53 qua trung gian p21 19 Các đường gây apoptosis gen p53 20 Cấu trúc gen AID 24 Quá trình tái tổ hợp gen chuỗi nặng kháng thể 26 Vai trò gen AID phát sinh ung thư 28 AID thúc đ y q trình phát triển UTDD thơng qua tích lũy đột biến AID tăng cường biểu tế bào niêm mạc dày 30 Sơ đồ thiết kế nghiên cứu 37 Quy trình tách DNA từ mơ tươi 40 Quy trình tách RNA tổng số từ mô tươi 42 Hình ảnh minh họa kết khuếch đại exon gen p53 46 Hình ảnh minh họa kết điện di sản ph m PCR exon gen p53 sau xử lý với enzym HaeIII 48 Nguyên lý phản ứng Real-time PCR sử dụng TaqMan probe 52 Hình ảnh điện di sản ph m PCR gen GAPDH 65 Hình ảnh điện di sản ph m PCR gel agarose 2% 65 Hình ảnh điện di sản ph m PCR sau cắt với enzym HaeIII gel agarose 3% 66 Kết giải trình tự gen 67 Hình ảnh giải trình tự gen AID 70 Kết Real time-PCR gen AID mô gan 71 DANH M C CÁC CH VIẾT TẮT AFB1 Aflatoxin β1 AFP Alpha Feto Protein CA 19-9 Carbohydrate Antigen 19-9 CEA Carcino Embryonic Antigen CT Computed Tomography (Chụp cắt lớp vi tính) H.pylori Helicobacter pylori HBV Hepatitis B Virus (Virus viêm gan B) HCV Hepatitis C Virus (Virus viêm gan C) IARC International Agency Reseach Cancer MiRNA MicroRNA NES Nuclear Export Signal (Tín hiệu ngồi nhân) PET/CT Positron Emission Tomography/ Computed Tomography (Chụp cắt lớp xạ positron kết hợp với chụp cắt lớp vi tính) Rb Retinoblastoma protein SPECT Single Photon Emission Computed Tomography (Chụp cắt lớp đơn photon) UTDD Ung thư dày UTG Ung thư gan UTGNP Ung thư gan nguyên phát WHO World Health Organization (Tổ chức y tế giới) L I CAM ĐOAN Tơi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tôi, tất số liệu tơi thu thập với hỗ trợ đồng nghiệp Kết luận án trung thực chưa cơng bố cơng trình nghiên cứu khác Tác giả Lê Th Thúy Lời cảm ơn Trước tiên, xin bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc tới S.TS Tạ Thành Văn, người thầy tận tình, nghiêm khắc hướng dẫn thực đề tài, động viên giúp tơi giải uyết nhiều khó khăn vướng mắc trình thực luận án, đóng góp tạo điều kiện thuận lợi để giúp tơi hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến TS Trần Vân hánh, phó iám đốc Trung tâm nghiên cứu en-Protein trường ại học Hà nội, người kính u hết lịng dìu dắt từ nh ng bước nghiên cứu khoa học, góp , truyền đạt kiến thức nh ng kinh nghiệm u báu để tơi hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lời cảm ơn chân thành tới: - P S.TS guy n Thị Hà, nguyên Phó Hiệu trưởng Trường ại học Hà ội, Cố vấn Trung tâm nghiên cứu en-Protein tận tình giúp đỡ, dạy bảo động viên tơi trình nghiên cứu hồn thành luận án - P S TS Trần Thiện Trung, Trường ại học Dược Thành phố Hồ Chí Minh giúp đỡ việc thu thập mẫu nghiên cứu - P S.TS Phạm Thiện gọc, Trưởng Bộ mơn Hóa sinh tạo điều kiện, giúp đỡ uá trình thực luận án - Tơi xin chân thành g i lời cảm ơn đến: - ảng uỷ, Ban giám hiệu, phòng Sinh, Trung tâm nghiên cứu tạo sau đại học, Bộ mơn Hóa en-Protein Trường ại học Hà ội, giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi để tơi học tập, nghiên cứu hồn thành luận án - ảng ủy, Ban iám hiệu, Bộ môn t nghiệm Trường Cao đ ng kỹ thuật tế II giúp đỡ tạo điều kiện thuận lợi để tơi học tập, nghiên cứu hồn thành luận án 106 IẾN NGH  Cần tiến hành xác định mức độ phiên mã gen AID số lượng mô gan dày lớn hơn, để từ đưa số cut off mức độ phiên mã gen AID mô bệnh nhân UTDD UTGNP  Tiến hành triển khai mẫu máu bệnh nhân UTDD để đánh giá mức độ phiên mã gen AID từ đưa số cut off bệnh nhân UTDD UTGNP CÁC CÔNG TR NH Đ CÔNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN Lê Th Thúy, Trần Vân hánh, Lê H u Song Tạ Th nh Văn (2011), “Khảo sát t lệ đột biến gen p53 bệnh nhân ung thư tế bào gan nguyên phát”, học Việt am, 2(1), tr 64-68 Lê Th Thúy Trần Vân hánh Tạ Th nh Văn (2011), “Sao chép gen Activation Induced cytidine Deaminase (AID) mơ ung thư dày”, Tạp chí ghiên cứu học, 72(1), tr 16-21 Lê Th Thúy Trần Huy Th nh Ôn Quang Ph ng Trần Vân hánh Tạ Th nh Văn (2012), “Mối liên quan mức độ phiên mã gen Activation Induced cytidine Deaminase (AID) t lệ đột biến gen p53 mô ung thư gan”, Tạp chí ghiên cứu học, 80 (3), tr 1-6 TÀI LIỆU THAM HẢO Ti ng Vi Phạ Ho ng Anh Nguyễn Ho i Nga Trần H ng Trường Tr nh Th Hoa Chu Ho ng Hạnh Bùi H i Đường ( 00 ) “Tình hình ung thư người Hà Nội giai đoạn 1996-1999”, Tạp chí học thực hành, số 10/2002, chuyên đề ung thư học, tr 431-4 Nguyễn Đại B nh (1997) “Ung thư gan nguyên phát”, Bài giảng ung thư học, hà uất Bản B ôn Gi i hẫu học, tr 205-209 nh rường ại h c Y H N i (2000) “Giải phẫu bệnh học”, hà xuất học Ho ng Đ nh Cầu (2003) “Môi trường sức khỏe Việt am ( năm sau chiến dịch Ranch Hand ”, Nguyễn Thanh Đạ B ghệ n, tr 18-20 Dương Th Cương H Văn Mạo cs ( 99 ) “ ịnh lượng Alpha-Fetoprotein bệnh nhân ung thư gan phương pháp mi n dịch phóng xạ (RIA)”, học Việt am, 8, tr13-16 H Hu nh Thùy Dương ( 998) “Sinh học phân tử”, hà xuất iáo dục Hà ội Nguyễn La H a Lê Trung D ng Trần Quang Hưng (2006) “Ch n đoán điều trị phẫu thuật ung thư dày bệnh viện Việt Tiệp Hải Phòng (từ 01/2004-12/2005) học thực hành, tr 541:441-449 Trần Qu nh Hoa Nguyễn Thúy Vinh Nguyễn Th h ng Hạnh (2002) “Vi khu n Helicobacter pylori thủ phạm chủ yếu hầu hết bệnh dày-tá tràng” Thuốc sức khỏe, 131(1297) Trần ăn Hợ ( 998) “Bệnh dày”, iải phẫu bệnh học, NXB Y học, tr 318-346 10 Tạ Long (2003) “Bệnh lý dày tá tràng Helicobacter Pylori”, hà xuất y học 11 H Văn Mạo Ho ng Phạ Ho ng Phi ( 00 ) “UTG nguyên phát Ch n đoán điều trị bệnh ung thư”, hà xuất y học, tr 13-40 12 H Văn Mạo Ho ng Phạ Ho ng Phi (2006) “UT nguyên phát”, hà xuất hể ác gi học, tr 13-404 13 Đo n H u Ngh (2007) “UTG nguyên phát, ch n đoán điều trị bệnh ung thư”, hà xuất học, tr 238 14 Tr nh Văn Quang ( 00 ) “Những khối u gan”, Bách khoa thư bệnh học 15 Tr nh Văn Quang ( 00 ) “Ung thư dày” Bách khoa thư ung thư học, hà xuất học, tr 160-168 16 Ho ng Văn Sơn Đỗ Đức Vân Đ o i Chi Ho ng Hạnh Phúc (2002), “Các dấu ấn ung thư ch n đoán ung thư đường tiêu hóa”, Tạp chí thơng tin dược, tr 88-91 17 Tr nh H ng Sơn Phạ Văn B nh Cao Đ c L Đỗ Đức Vân ( 999) “Ch n đoán điều trị phẫu thuật ung thư dày tái phát”, học thực hành 5, tr 8-10 18 Ho ng Tr ng Th n ( 00 ) “Bệnh tiêu hóa gan mật”, hà xuất học, tr 332 19 Nguyễn hánh Trạch Phạ Th Thu H (1997) “Ung thư gan nguyên phát”, Bài giảng bệnh học nội khoa tập II, tr 167-174 20 Nguyễn S o Trung cs (1998) “UTGNP viêm gan virut B: Khảo sát bệnh học hóa mơ mi n dịch”, học TP Hồ Chí Minh, Phụ chuyên đề ung bướu học, tập 2-số 3:37-41 21 Trần Thi n Trung ( 008) “Bệnh dày-tá tràng nhi m Helicobacter pylori” hà xuất 22 Trường ại h c y H N i B học ôn gi i hẫu nh (2007) “Giải phẫu bệnh học”, Nhà xuất y học, tr 318-346 23 Phạ Hùng Vân ( 009) “PCR Real-time PCR Các vấn đề áp dụng thường gặp” hà xuất y học 24 Tạ Th nh Văn ( 00 ) “Activation-Induced Cytidine Deaminase (AID)Phát minh chế phân tử trình tổng hợp kháng thể”, Tạp chí nghiên cứu học 28 (2), tr 116-119 25 Tạ Th nh Văn ( 00 ) “Nghiên cứu thể đột biến bất hoạt activation induced cytidine deaminase (AID) người”, Tạp chí học Việt am 5, tr 48-53 26 Tạ Th nh Văn ( 0) “Con đường tín hiệu tế bào dấu ấn sinh học ch n đoán”, hà xuất khoa học kỹ thuật tr72-74 Ti ng Anh 27 Adams PD, Sellers WR, Sharma SK, Wu AD, Nalin CM, Kaelin WG Jr (1996) Identification of a cyclin-cdk2 recognition motif present in substrates and p21-like cyclin-dependent kinase inhibitors Mol Cell Biol 16: 6623-6633 28 AhmedinJemal, DVM, PhD; FreddieBray, PhD; MelissaM Center, MPH; JacquesFerlay, ME; ElizabethWard, PhD5; DavidForman, PhD6 (2011), Global cancer statistics CA: a cancer journal for clinicians 61 (2): 69–90 29 Aoi, T., Marusawa, H., Sato, T., Chiba, T., & Maruyama, M (2006), Risk of subsequent development of gastric cancer in patients with previous gastric epithelial neoplasia Gut, 55: 588–589 30 Appella E, Anderson, CW (2001), Post-translational modifications and activation of p53 by genotoxic stresses Eur J Biochem 268: 2764-2772 31 Blaser M.J., Perez-Pezer G.I., Kleanthous H et al (1995), Infection with HP strains prossessing CagA is associated with an increased risk of developing adenocarcinoma of the stomach Cancer Res, 15, 55 (10): 2111-2115 32 Carlo, M; Croce, M.D (2008), Oncogenes and Cancer N Engl J Med; 358: 502-11 33 Conticello, S G., Thomas, C J., Petersen-Mahrt, S K., & Neuberger, M S (2005), Evolution of the AID/APOBEC family of polynucleotide (deoxy) cytidine deaminases Mol Biol Evol., 22: 367–377 34 Chen X, Ko LJ, Jayaraman L, Prives C (1996), p53 levels, functional domains, and DNA damage determine the extent of the apoptotic response of tumor cells Genes Dev 10: 2438-2451 35 Chia, M.C (2005), Carcinogennosis of Hepatocellular Carcinoma APASL Bali Conference, 19-21 36 Choi Seok Reyol, Jin Seok Jang, Jong Hun Lee, Myung Hwan Roh, Min Chan Kim, Won Sup Lee, Waqar Qureshi (2008), Role of serum tumor markers in monitoring for recurrence of gastric cancer following radical Gastrectomy Dig Dis Sci, 51:2081-2086 37 Dickerson, S K., Market, E., Besmer, E & Papavasiliou, F N (2003), AID mediates hypermutation by deaminating single stranded DNA J Exp Med 197:1291-1296 38 Dippold WG, Jay G, DeLeo AB, Khoury G, Old LJ (1981), p53 transformation-related protein: detection by monoclonal antibody in mouse and human cells Proc Natl Acad Sci USA 78: 1695-1699 39 Doi, T., Kinoshita, K., Ikegawa, M., Muramatsu, M., & Honjo, T (2003), De novo protein synthesis is required for the activation-induced cytidine deaminase function in class-switch recombiantion Proc Natl Acad Sci USA 100: 2634:2638 40 Ebert MPA, Malfertheiner P (2002), Pathogenesis of sporadic and familial gastric cancer-implications for clinical management and cancer prevention Aliment Pharmacol Ther; 16(6): 1059-1066 41 Endo, Y., Marusawa, H., Kinoshita, K., Morisawa, T., Sakurai, T., Okazaki, I.M., et al (2007), Expression of activation-induced cytidine deaminase in human hepatocytes via NF-kappaB signaling Oncogene, 26, 5587–5595 42 Endo, Y.; Marusawa, H.; Kou, T.; Nakase, H.; Fujii, S.; Fujimori, T.; Kinoshita, K.; Honjo, T.; Chiba, T (2008), Activation-induced cytidine deaminase links between inflammation and the development of colitisassociated colorectal cancers Gastroenterology, 135:889-898 43 Fenoglio Preiser C.M, Wang.J, Stemmermann G.N and Noffsinger A 2003, TP53 and gastric carcinoma: A review Wiley Liss.INC 21:258-270 44 Figura N (1997), Helicobacter pylori factors involved in the development of gastroduodenal mucosa damage and ulceration J Clin Gastroenterl; 25 sup:149-163 45 Finlay CA, Hinds PW, Levine AJ (1989), The p53 proto-oncogene can act as a suppressor of transformation Cell 57: 1083-1093 46 Gaspar MI, Arribas I, Coca MC, Diez-Alonso M (2001), Prognostic value of carcinoembryonic antigen, CA 19-9 and CA 72-4 in gastric carcinoma, Tumor Biol, 22(5): 318-322 47 GLOBOCAN 2008 (IARC), Section of Cancer Information 48 Goff S.P (2003), Death by deamination: a novel host restriction system for HIV-1 Cell, 114:281-283 49 Gouas DA, Shi H, Hautefeuille AH, Ortiz-Cuaran SL, Legros PC, Szymanska KJ, Galy O, Egevad LA, Abedi-Ardekani B, Wiman KG, Hantz O, Caron de Fromentel C, Chemin IA, Hainaut PL (2010), Effects of the TP53 p.R249S mutant on proliferation and clonogenic properties in human hepatocellular carcinoma cell lines: interaction with hepatitis B virus X protein Carcinogenesis; 31(8):1475-82 50 Heintges, T Wands, J.R (1997), Hepatitis C Virus: Epidemiology and Transmission Hepathology, 26:516-521 51 Hermeking H, Lengauer C, Polyak K, He TC, Zhang L, Thiagalingam S, Kinzler KW, Vogelstein B (1997), 14-3-3 sigma is a p53-regulated inhibitor of G2/M progression Mol Cell 1: 3-11 52 Hiroyuki Marusawa and Tsutomu Chiba (2010), Helicobacter pyloriinduced activation-induced cytidine deaminase expression carcinogenesis Current Opinion in Immunology, 22:442-447 and 53 Hollstein M.C (1993), p53 mutations and AFB1 exposure in HCC patients from Thailand Int.J.Cancer, 51-53 54 Honjo, T., Kinoshita, K., Muramatsu, M (2002), “Molecular mechanism of class switch recombination: linkage with somatic hypermutation” Ann Rev Immunol 20:165-196 55 Honjo, T., M Maramatsu, and S fagarasan (2004), AID: how does it aid antibody diversity? Immunity 20:659-668 56 Houghton J, Fox JG, Wang TC (2002), Gastric cancer: laboratory bench to clinic J Gastroenterol Hepatol; 17(4):495-502 57 Houghton M., Choo Q.L., Kuo G., Ralston R., Selby M et al (1993), The hepatitis C virus: Genetic organization, persistence and vaccine strategies, in: Viral hepatitis and liver disease, Molecules Today, More Gures Tomorrow, Tokyo, pp 29-33 58 Iwatani Y, Chan D.S, Wang F, Maynard K, Sugiura W, Gronenborn A M, et al (2007), Deaminase-independent inhibition of HIV-1 reverse transcription by APOBEC3G Nucleic Acids Res, 35:7096-7108 59 Jemal A, Siegel R, Ward.E, Murray T, Xu J and Thun M.J (2007), Cancer statistics CA: a cancer journal for clinicians 57:43-66 60 Kalso E, and Paice J (2008), “Global year on cancer pain” Pain 61 Kamoto T, Satomura S, Yoshiki T, Okada Y, Henmi F, Nishiyama H, et al (2002), Lectin-reactive alpha-fetoprotein (AFP-L3%) curability and prediction of clinical course after treatment of non-seminomatous germ cell tumors Jpn J Clin Oncol; 32:472-476 62 Kastan MB, Bartek J (2004), Cell-cycle checkpoints and cancer Nature 432 316-323 63 ir GD L si OA M ndy M S y añs a Whi H Go d r JJ Hainaut P, Montesano R (2005), 249(ser) TP53 mutation in plasma DNA, hepatitis B viral infection, and risk of hepatocellular carcinoma Oncogene; 24(38):5858-67 64 Komori, J.; Marusawa, H.; Machimoto, T.; Endo, Y.; Kinoshita, K.; Kou, T.; Haga, H.; Ikai, I.; Uemoto, S.; Chiba, T (2008), Activationinduced cytidine deaminase links bile duct inflammation to human cholangiocarcinoma Hepatology, 47:888-896 65 Konati A, Kakazu N, Tsuruyama T, Okazaki I.M, Muramatsu M, Kinoshita H, Nagaoka H, Yabe D, and Honjo T (2007), Activationinduced cytidine deaminase (AID) promotes B cell lymphomagenesis in Emucmyc transgenic mice Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 104:1616-1620 66 Kou T, Marusawa H, Kinoshita K, Endo Y, Okazki I, Ueda Y, Kodama Y, Haga H, Ikai I and Chiba T (2006), Expression of activation induced cytidine deaminase in human hepatocytes during hepatocarcinogenesis Int J Cancer 120:469-476 67 Lightdale CJ, Botet JF, Kelsen DP, Turnbull AD, Brennan MF (1989), Diagnosis of recurrent upper gastrointestinal cancer at the surgical anastomosis by endoscopic ultrasound Gastrointest Endosc; 35(5): 407-12 68 Ling Bai and Wei-Guo Zhu (2006), p53: Structure, Function and Therapeutic Applications Journal of Cancer Molecules 4: 141-153 69 Livak KJ, Schmittgen TD (2001), Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta C(T)) method Method; 25: 402-8 70 London WT, McGlynn KA (2006), Liver cancer In: Schottenfeld D, Fraumeni FJ Jr, eds Cancer Epidemiology and Prevention 3rd ed New York: Oxford University Press; 763-786 71 Longerich, S., U Basu, F Alt, and U Storb (2006), AID in somatic hypermutation and class switch recombination Current opinion in immunology 18:164-174 72 Lynch RG (1995), Differentiation and cancer: The conditional autonomy of phenotype Proe Natl Acad Sci USA 92 (3):647-648 73 Malcolm G Smith, Georgina L Hold, Eiichi Tahara, Emad M ElOmar (2006), Cellular and molecular aspects of gastric cancer World J Gastroenterol, 12(19): 2979-2990 74 Marusawa, H.; Hijikata, M.; Chiba, T.; Shimotohno, K (1999), Hepatitis C virus core protein inhibits Fas- and tumor necrosis factor alpha-mediated apoptosis via NF-kappaB activation J Virol, 73:47134720 75 Matsuda K, Yoshida K, Taya Y, Nakamura K, Nakamura Y, Arakawa H (2002), p53AIP1 regulates the mitochondrial apoptotic pathway Cancer Res 62: 2883-2889 76 Matsumoto, Y., Marusawa, H., Kinoshita, K., Endo, Y., Kou, T., Morisawa, T., et al (2007), Helicobacter pylori infection triggers aberrant expression of activation-induced cytidine deaminase in gastric epithelium Nat Med., 13:470–476 77 Matsumoto Y, Marusawa H, Kinoshita K, Niwa Y, Sakai Y, Chiba.T (2010), Up-regulation of Activation-Induced Cytidine Deaminase Causes Genetic Aberrations at the CDKN2b-CDKN2a in Gastric Cancer Gastroenterology 78 Morisawa T, Marusawa H, Ueda Y, Iwai A, Okazaki I.M, Honjo T and Chiba T (2008), Organ-specific profiles of genetic changes in cancers caused by activation-induced cytidine deaminase expression International journal of cancer 123:2735-2740 79 Muramatsu, M., K kinoshita, S Fagarasan, S Yamada, Y Shinkai, and T Honjo (2000), Class switch recombination and hypermutation require activation-induced cytidine deaminase (AID), a potential RNA editing enzyme Cell 102:553-563 80 Muramatsu, M; Sankaranand, V.S; Anant, S; Sugai, M; Kinoshita, K; Davidson, N.O; Honjo (1999), Specific expression of activation-induced cytidine deaminase (AID), a novel member of the RNA-editing deaminase family in germinal center B cells J Biol Chem, 274: 18470-18476 81 Muto, T., I.M Okazaki, S Yamada, Y Tanaka, K Kinoshita, M Muramatsu, H Nagaoka, and T Honjo (2006), Negative regulation of activation-induced cytidine deaminase in B cells Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 103:2752-2757 82 Muto, T., M Muramatsu, M Taniwaki, K Kinoshita, and T Honjo (2000), Isolation, tissue distribution, and chromosomal localization of the human activation-induced cytidine deaminase (AID) gene Genomics 68:85-88 83 Nakano K, Vousden KH (2001), PUMA, a novel proapoptotic gene, is induced by p53 Mol Cell 7: 683-694 84 Noffsinger AE, Stemmermann GN, Kim OJ et al (1995), Gastric cancer: pathology Gastrointestinal oncology: principles and practice Edited by David P Kelson Lippincott Williams and Wilkins: 325-340 85 Oda E, Ohki R, Murasawa H, Nemoto J, Shibue T, Yamashita T, Tokino T, Taniguchi T, Tanaka N (2000), Noxa, a BH3-only member of the Bcl-2 family and candidate mediator of p53-induced apoptosis Science 288: 1053-1058 86 Okazaki, I.M., H Hiai, N Kakazu, S Yamada, M Muramatsu, K Kinoshita, and T Honjo (2003), Constitutive expression of AID leads to tumorigenesis The Journal of experimental medicine 197:1173-1181 87 Okuda K (1997), Epidemiology in: Diagnosis and Treatment of Hepatocellular Carcinoma Greenwich Medical Media, :3-15 88 Parkin D.M, Laara E, Muir CS (1998), Estimates of the worldwide frequency of sixteen major cancers in 1980 Int J Cancer, 41:184-197 89 Parkin DM (2006), The global health burden of infection-associated cancers in the year 2002 Int J Cancer; 118:3030-304 90 Pasqualucci L, Bhagat G, Jankovic M, Compagno M, Smith P, Muramatsu M, Honjo T, Morse H.C, Nussenzweig, and DallaFavera R (2008), AID is required for germinal center-derived lymphomagenesis Nature genetics 40: 108-112 91 Peek, R.M., Jr IV (2001), Helicobacter pylori strain-specific activation of signal transduction cascades related to gastric inflammation Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 280:525-530 92 Perz JF, Armstrong GL, Farrington LA, et al (2006), The contributions of hepatitis B virus and hepatitis C virus infections to cirrhosis and primary liver cancer worldwide J Hepatol; 45:529-538 93 Petersen-Mahrt, S., Harris, R S& Neuberger, M S (2002), AID mutates E coli suggesting a DNA deamination mechanism for antibody diversification Nature 418: 99-103 94 Rajagopal N Aravalli, Clifford J Steer, ErikN K Cressman (2008), Molecular Mechanisms of Hepatocellular Carcinoma Hepatology; 48:2047-2063 95 Ramiro A.R, Jankovic M, Callen E, Difilippantonio S, Chen H.T, McBride K.M, Eisenreich, Chen J, Dickins S, Lowe.W, Nussenzweig A, and Nussenzweig M.C (2006), Role of genomic instability and p53 in AID-induced c-myc-Igh translocations Nature 440:105-109 96 Ronnie, T.P.Poon (2005), Epidemiology of Hepatocellular Carcinoma: Comparison of East and West Data, in update in HCC, APASL Bali Conference, August, 13-15 97 Schmale H, Bamberger C (1997), A novel protein with strong homology to the tumor suppressor p53 Oncogene 15:1363-1367 98 Seung Lee H, Im Choi S, Kook Lee, et al (2002), Distinct clinical features and outcomes of Gastric cancers with microsatellite instability Mod Pathol; 15 (6):632-640 99 Shigeo Takaishi & Timothy C Wang (2007), Activation induced cytidine deaminase (AID), which mediates antibody diversification, is now imolicated as an inducer of p53 mutagenesis in cancer cells Nature Medicine 4:470-476 100 Sigal A, Rotter V (2000), Oncogenic mutations of the p53 tumor suppressor: the demons of the guardian of the genome Cancer Res 60: 6788-6793 101 Slee EA, O'Connor DJ, Lu X (2004), To die or not to die: how does p53 decide? Oncogene 23: 2809-2818 102 Soussi T, Beroud C (2001), Assessing TP53 status in human tumours to evaluate clinical outcome Nat Rev Cancer 1: 233-240 103 Soussi T, Lozano G (2005), p53 mutation heterogeneity in cancer Biochem Biophys Res Commun 331: 834-842 104 Sue Ling HM (1996), Screening and detection of early gastric cancer, Lecture in gastric diseases, Kuala Lumpur, Jul 105 Takai, A.; Toyoshima, T.; Uemura, M.; Kitawaki, Y.; Marusawa, H.; Hiai, H.; Yamada, S.; Okazaki, I.M.; Honjo, T.; Chiba, T.; Kinoshita, K (2009), A novel mouse model of hepatocarcinogenesis triggered by AID causing deleterious p53 mutations Oncogene, 28:469-478 106 Taniai, M.; Higuchi, H.; Burgart, L.J.; Gores, G.J (2002), p16INK4a promoter mutations are frequent in primary sclerosing cholangitis (PSC) and PSC-associated cholangiocarcinoma Gastroenterology, 123:1090-1098 107 Tarek Abbas and Anindya Dutta 2009, p21 in cancer: intricate networks and multiple activities Nat Rev Cancer 9(6): 400–414 108 Tasuku Honjo, Kozuo Kinoshita, and Masamichi Muramatsu (2002), Molecular mechanism of class switch recombiantion: linkage with somatic hypermutation Annu Rev Immunol, 20:165-96 109 Toshinori Ozaki, Akira Nakagawara (2011), Role of p53 in Cell Death and Human Cancers” Cancers 3: 994-1013 110 Tse, L.F., Schoenfied, M., Leslie, J (2007), Hepatocellular Carcinoma, Liver Cancer: 2-13 111 Van-Thanh, T., Nagaoka, H., Honjo, T et al (2003), AID mutant analyses imply requirement of class switch specific cofactor (s) Nature Immunology :843:848 112 Van-Thanh, Ta and Honjo, T (2003), Domain organization of activation-induced cytidine deaminase Nature Immunology, 4(12):1154 113 Vogelstein B, Lane D, Levine AJ (2000) Surfing the p53 network Nature 408: 307-310 114 Vousden KH, Lu X (2002), Live or let die: the cell's response to p53 Nat Rev Cancer 2: 594-604 115 WKK Wu, CW Lee, CH Cho, D Fan, K Wu, J Yu and JJY Sung (2010), MicroRNA dysregulation in gastric cancer: a new player enters the game Oncogene; 29:5761–5771 116 Wong CM, and I.O Ng (2008), Molecular pathogenesis of hepatocellular carcinoma Liver Int 28:160-174 117 World Health Organization (2008), The Global Burden of Disease: 2004 Update Geneva: World Health Organization 118 Wu W, Yao DF, Gu LH, Fan JW, Lu XF, Li XH, et al (2006), Determination of hepatoma-specific alpha-fetoprotein by a mini-column affinity chromatography method Chin J Clin Lab Sci; 24:10-12 119 Yang Y, Sowden M.P, Smith H.C (2000), Induction of cytidine to uridine editing on cytoplasmic apolipoprotein B mRNA overexpressing APOBEC-1 J Biol Chem 275: 22663-22669 by ... exon gen p53 mô ung thư dày mơ ung thư gan ngun phát Bước đầu tìm hiểu mối tương quan mức độ phiên mã gen AID với đột biến vị trí S249R exon gen p53 mô ung thư dày mô ung thư gan nguyên phát. .. phiên mã gen AID mô gan xơ 72 Bảng 3.12 Mức độ phiên mã gen AID mô gan ung thư 73 Bảng 3.13 Mức độ phiên mã gen AID mô gan ung thư, gan viêm gan xơ 75 Bảng 3.14 Mức độ phiên mã gen AID... chế khối u số p53 đột biến xem oncogen [113] Có 18.000 dạng đột biến gen p53 phát ung thư người khoảng 50% trường hợp ung thư người có đột biến gen p53 gen p53 [102] Trong số ung thư khác, khoảng