Hóa Sinh Dược - Chương 7 - Cấu trúc aa và Protein

Hóa Sinh Dược là giáo án bài giảng, giúp bạn có thể tự học môn Hóa Sinh Dược tốt nhất Hóa Sinh Dược là giáo án bài giảng, giúp bạn có thể tự học môn Hóa Sinh Dược tốt nhất

Figure 13-2 Discover Biology 3/e

© 2006 W W Norton & Company, Inc

Amino acids are linked to one another

at the ribosome to form the protein encoded by the mRNA

nguyên liệu cần thiết đề tổng hợp những

thành phần cấu trúc của co’ thé

s*Là enzym giữ nhiệm vụ xúc tác các quá

trình chuyển hóa

Được cầu tạo bởi nhiều acid amin kết hợp

với nhau bằng liên kết peptide

»Protein: là phân tử gồm từ 50 tới cả ngàn

acid amine nối với nhau bằng liên kết

peptide

s20 acid amin “chuẩn”

»có 8 aa thiết yếu + 2 aa bán thiết yếu

hree letter code alo gly ile feu pro val

1 own I ae l Il ‘rym

PHENYLALANINE @ TRYPT0PHAN 7Ð TYROSINE @ ASPARTIC ACID oO GLUTAMIC ACID @ ARGININE @) HISTIDINE đồ

phe trp yr asp glu org his

LYSINE ( SERINE () THREONINE (|) CYSTEINE @ METHIONINE oO ASPARAGINE oO GLUTAMINE @

ys ser thr ys met asn gin

With Aliphatic Side Chains

Glycine Gly [G] H+ CH—COO

t6

i

M

CH, Methionine (Met/M)

Hh

SH

Cysteine (Cys/C)

SƠN 3⁄/2:2),

CH

Proline (Pro / P)

(Phe /F)

(Ser/S) (Thr / T) (Tyr/Y) (Asn/N)

AS

NH, O Glutamine (Gin /Q)

Tan cae cH Cent

Aspartic Acid Glutamic Acid _ NH,

(Asp /D) (Glu/E) k len

Lysine Arginine (Lys/K) (Arg/R)

HạN'—C— C

Lễ,

Histidine (His / H)

s* öelenocysteine là acid s* Pyrrolysine là acid amin

a Acid amin hiém gap trong protein

y-Aminobutyric acid (GABA)

Beta-alanine

12

+ Dùng serin làm tiêu chuẩn so sánh

s» aa dạng L khi -NH; ở bên trái

a Tinh chat vat ly

+ Dễ tan trong nước, tùy thuộc vào cau trúc gốc R

s» Thường có vị ngọt kiểu đường, leucine không vị,

isoleucine va arginine co vi dang

+» Tính quang hoạt (trù glycin) do có C bắt đối xứng

13

“Cac acid amine

khac hap thu

“Phan tng vdi acid Nitro (HNO.)

= định lượng N; của acid amin

- trong mt kiềm yêu, DNFB + nhóm amin tự do tạo

dan xuat 2,4 dinitrophenyl acid amin (DNP-aa)

I

|

|

I

+ 8 R Purify and recycle

HN = =C=N -¿ ` Shortened remaining peptide

Phenylthiocarbamyl H Ï HH Ï peptide fragment though

+ gốc R có những nhóm chức khác nhau, cho PƯHH

khác nhau > quyết định các phản ứng đặc hiệu

của acid amin

= —COOH và -NH„ cho PƯ tạo muối

= —SH cua Cysteine cho PU oxi héa khw

= nhan thom cua phenylalanine va tyrosine cho PU’ nitro

hoa va halogen hoa

= —OH cutia serine va threonine có thé tham gia PU’ ester

hoa

» —OH phenol cua tyrosine cho phan tng dac hiệu với

thudc the Millon (HgNO./HNO, dd) cho mau do cam

“hop chat gồm 2 đến vài chục aa nồi với

nhau bang Ik peptide

“strong luong phan tu < 6000

sstrong tự nhiên

= dưới dạng tự do có hoạt tính sinh học nhất định

(peptide hormone như insuline, peptide kháng

Dipeptide

21

Figure 3-3c

Molecular Cell Biology, Sixth Edition

© 2008 W.H Freeman and Company

= [An lwot dén aa cudi c6é -COOH tu do

-_nguyên tắc: giữ nguyên tên aa cuối và thay đồi tên các

aa kia băng gôc -—yl

| H;N-seryl-glycyl-tyrosyl-alanyl-leucine-COOH |

| Ala-Ser-Phe-Leu hay A-S-F-L |

= Néu trong chuỗi peptide có đoạn nào đó chưa xác định

được thứ tự của các aa thì đề trong ngoặc

= tinh chat lw@ng tinh Ala ot CH;

= 3 dang ion trong dung thu

“Tinh chat héa hoc

= a-NH, cia aa N cudi cho PU’ giéng nhu a-NH,

cua aa

= q-COOH của aa C cuối cũng cho PƯ aa (khử,

khử carboxyl hóa)

: gốc R của các aa trong chuỗi peptide cho PƯ

màu đặc trưng của các aa tự do tương ứng

(Tyrosine cho màu đỏ cam với thuốc thử Millon)

= Peptide cho phản ứng với đồng sulfat trong môi

trường kiềm (PƯ Biuret)

s màu xanh tím (ít aa)

- màu tím hồng (nhiều aa)

23

The primary protein structure

is the chain of amino acids that makes up the protein

Secondary structure

Hydrogen bond

6B strand, shown as a flat

arrow pointing toward the carboxyl end

The Overall

3-Dimensional Shape

fa Protei

the R-groups (sidechains) are not shown in the

= secondary and tertiary

+ Theo cấu trúc: cau, soi

+» Theo thành phân hóa học:

chỉ gồm các aa

còn có các nhóm ngoại

+ Theo nguôn gốc: động vật hay thực vật

+ Theo chức năng: enzyme, hormone, cau tao, dinh

dưỡng, dự trữ, vận động, bảo vệ, điêu hòa

= Protein thuan hay protein don gian (holoprotein):

= Protein phuwc tap hay protein tap (heteroprotein):

28

- phân tử keo có kích thước lớn (> 0,001 um)

= khuếch tán rat cham trong dung dịch

= không qua được các màng thẩm tích

= Trọng lượng phân tử của protein thiên nhiên tìm

thây vào khoảng > 6000 - hàng triệu

29

» Biến tính của protein

= chịu những thay đổi về tính chất như độ hòa tan

bị giảm —› mật đi một sô tính chât đặc hiệu

= cầu trúc không gian của phân tử protein bị phá

vỡ (trừ liên kêt peptide)

= Hai loại:

* Bién tinh thuận nghịch: khi câu trúc phân tử của

protein có thê trở lại dạng ban đâu

- Biến tính không thuận nghịch: khi protein không trở

lại trạng thái ban đâu

= Tác nhân:

- Vật lý: nhiệt độ, tia tử ngoại, siêu âm, áp suất cao

- Hóa học: acid, base, muối kim loại nặng

= hoàn toàn thành các acid amine

»PƯ với thuốc thử Biuret > định lượng

protein bằng phương pháp so màu

+» Các gốc aa trong phân tử protein cũng cho

+» Vận chuyền: như Hemoglobin, myoglobin

ss Sự vận động và phối hợp: actin và myosin

s* Sự chỗng đỡ cơ học: collagen, elastin