Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.Đa hình một số gen ứng viên và mối liên hệ với tính năng sản xuất của lợn Ỉ.
HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM PHAN THỊ TƯƠI ĐA HÌNH MỘT SỐ GEN ỨNG VIÊN VÀ MỐI LIÊN HỆ VỚI TÍNH NĂNG SẢN XUẤT CỦA LỢN Ỉ Ngành: Chăn ni Mã số: 62 01 05 TĨM TẮT LUẬN ÁN TIẾN SĨ NHÀ XUẤT BẢN HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP - 2023 Cơng trình hồn thành tại: HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAM Người hướng dẫn: PGS.TS Đỗ Đức Lực PGS.TS Nguyễn Hoàng Thịnh Phản biện 1: PGS.TS Trần Thị Bích Ngọc Viện chăn ni Phản biện 2: PGS.TS Võ Thị Bích Thuỷ Viện nghiên cứu Hệ gen Phản biện 3: TS Nguyễn Thị Diệu Thuý Viện Công nghệ sinh học Luận án bảo vệ trước hội đồng đánh giá luận án cấp Học viện, họp tại: Học viện Nông nghiệp Việt Nam Vào hồi , ngày tháng năm 2023 Có thể tìm hiểu luận án tại: Thư viện Quốc gia Việt Nam Trung tâm Thông tin - Thư viện Lương Định Của, Học viện Nông nghiệp Việt Nam PHẦN MỞ ĐẦU 1.1 TÍNH CẤP THIẾT CỦA ĐỀ TÀI Việt Nam trung tâm đa đạng sinh học phong phú giới Cũng nhiều quốc gia khác, Việt Nam phải đối mặt với tình trạng suy thối đa dạng sinh học, có suy giảm nguồn gen vật nuôi Trong số 27 giống lợn địa Việt Nam, có giống lợn tuyệt chủng giống có nguy tuyệt chủng (Luc, 2013) Lợn Ỉ đánh giá giống lợn địa có nguy tuyệt chủng cao (Lê Viết Ly, 1999) Mặc dù đưa vào chương trình bảo tồn từ năm 1990, số lượng lợn Ỉ bị suy giảm nhanh chóng cịn số cá thể ni cơng ty TNHH Lợn giống Dabaco (Chu Minh Khôi, 2019) Phục tráng giống lợn Ỉ nhiệm vụ cấp thiết nhằm bảo tồn nguồn gen vật nuôi quý ngăn ngừa suy giảm đa dạng sinh học Đã có nhiều nghiên cứu khả sản xuất lợn Ỉ, hầu hết nghiên cứu thực cách tương đối lâu (Phạm Hữu Doanh, 1985; Đặng Vũ Bình, 1993; Lê Viết Ly, 1999; Võ Văn Sự & cs., 2004) Nhằm phục vụ cho công tác bảo tồn phát triển giống lợn Ỉ, cần thực nghiên cứu đánh giá khả sản xuất đàn có, chọn tạo nhân đàn để gia tăng số lượng cá thể, cải thiện suất sinh sản sinh trưởng, suất thân thịt chất lượng thịt giống lợn Trong thập kỷ gần đây, việc ứng dụng thành tựu di truyền phân tử kết hợp với phương pháp chọn lọc truyền thống góp phần nâng cao tính xác, rút ngắn thời gian làm tăng tốc độ cải thiện di truyền tính trạng mong muốn công tác chọn lọc giống vật nuôi (Lê Thị Thu Huệ, 2021) Các locus tính trạng số lượng gen chức liên quan chặt chẽ với tính trạng sản xuất lợn khám phá (Hoàng Thị Thuý & cs., 2021; Nguyen Huu Tinh & cs., 2021) Trên giới, nhiều gen ứng viên chứng minh có mối liên hệ với tính sản xuất lợn Đối với tính trạng sinh sản lợn, nhiều gen phát có ảnh hưởng đến số tiêu kích thước khối lượng ổ đẻ gen Oestrogen receptor (ESR), Folicle stimulate hormone beta sub-unit (FSHB), Prolactin receptor (PRLR), Retinol binding protein (RBP4); Leptin receptor (LEPR), Retinoic acid receptor gamma (RARG); Prostaglandin-endoperoxide synthase (COX2), Epidermal growth factor (EGF) (Rohrer & cs., 1994; Messer & cs., 1996; Ollivier & cs., 1997; Vincent & cs., 1997; Stratil & cs., 1998; Rothschild & cs., 2000; Linville & cs., 2001; Matoušek & cs., 2003; Mikhaĭlov & cs., 2014) Một số gen cho có mối liên quan đến tiêu sinh trưởng bao gồm gen pituitary-specific transcription factor (PIT1) (Yu & cs., 1995; Franco & Lorenzo, 2005; Nguyen Huu Tinh & cs., 2021), Melanocortin receptor (MC4R), growth hormone releasing hormone (GHRH), growth hormone (GH) Insulin-like growth factor (IGF2) (Kim & cs., 2000; Van Laere & cs., 2003; Wenjun & cs., 2003; Ologbose & cs., 2020) Một số gen chứng minh có mối liên hệ với tính trạng suất, chất lượng thịt lợn bao gồm Heart fatty acid-binding protein (H-FABP) (Jankowiak & cs., 2010; Lee & cs., 2010), Porcine phosphoinositide-3kinase, class (PIK3C3) (Kim & cs., 2005; Hirose & cs., 2011), Calpastatin (CAST) (Đurkin & cs., 2009; Nguyen Trong Ngu & cs., 2012; Ropka-Molik & cs., 2014), Myogen (MYOG) (Đỗ Võ Anh Khoa, 2012), protein kinase AMP-activated non-catalytic subunit gamma (PRKAG3) (Đặng Hồng Biên, 2016) Đa hình gen ESR, PRLR, FSHB, RBP4, PIT1, MC4R, GHRH, FUT1, H-FABP, CAST, PIK3C3 MYOG chứng minh có mối liên hệ với tính trạng sinh sản, sinh trưởng, suất chất lượng thịt nhiều giống lợn giới Tuy nhiên, chưa có nghiên cứu đa hình gen ứng viên mối liên quan gen đến khả sinh sản, khả sinh trưởng, suất chất lượng thịt giống lợn Ỉ Để có sở đề xuất ứng dụng thị phân tử chọn lọc nâng cao suất sinh sản, sinh trưởng, suất thịt chất lượng thịt giống lợn Ỉ, nghiên cứu đánh giá mối liên hệ đa hình gen ứng viên với tính sản xuất giống lợn cần thiết 1.2 MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU 1.2.1 Mục tiêu chung Trên sở đánh giá đa hình gen ứng viên mối liên hệ đa hình gen với tính trạng sinh sản, sinh trưởng, suất chất lượng thịt lợn Ỉ, đề xuất thị phân tử hỗ trợ chọn lọc nhằm cải thiện khả sản xuất chất lượng thịt lợn Ỉ, góp phần bảo tồn nguồn gen vật quý hiếm, phát triển giống lợn Ỉ theo hướng chăn ni bền vững, có hiệu 1.2.2 Mục tiêu cụ thể (1) Xác định đặc điểm lợn Ỉ thơng qua kích thước số chiều đo lợn Ỉ đực điều kiện chăn nuôi công nghiệp (2) Đánh giá đa hình gen ESR, PRLR, FSHB, RBP4, PIT1, MC4R, GHRH, FUT1, H-FABP, CAST, PIK3C3 MYOG quần thể lợn Ỉ nuôi bảo tồn Công ty CP tập đoàn Dabaco, Việt Nam (3) Đánh giá mối liên hệ đa hình gen ứng viên với tính sản xuất lợn Ỉ, đánh giá mối liên hệ đa hình gen ESR, PRLR, FSHB với suất sinh sản, đa hình gen PIT1, H-FABP, CAST, PIK3C3 GHRH với khả sinh trưởng đa hình gen PIT1, H-FABP, PIK3C3, CAST với suất thân thịt chất lượng thịt lợn Ỉ 1.3 PHẠM VI NGHIÊN CỨU Đề tài tập trung vào nội dung: Đánh giá đặc điểm sinh học lợn Ỉ điều kiện chăn nuôi cơng nghiệp thơng qua kích thước số chiều đo cá thể đực cái; Đánh giá đa hình số gen ứng viên quần thể lợn Ỉ mối liên hệ đa hình gen với tính sản xuất lợn Ỉ ni bảo tồn Cơng ty CP tập đồn Dabaco, Việt Nam Các thí nghiệm suất sinh sản, khả sinh trưởng, suất thân thịt, chất lượng thịt mẫu mô tai lợn Ỉ thực Công ty TNHH lợn giống Dabaco Lương Tài (xã Lai Hạ, huyện Lương Tài, tỉnh Bắc Ninh) từ 2019 đến 2020 Công ty TNHH lợn giống Dabaco Phú Thọ (Xã Tề Lễ, huyện Tam Nông, tỉnh Phú Thọ) từ 20212022 Phân tích đa hình gen, chất lượng thịt tiến hành phịng thí nghiệm Di truyền, phịng thí nghiệm Trung Tâm, Khoa Chăn nuôi, Học viện Nông nghiệp Việt Nam, phịng thí nghiệm Thức ăn sản phẩm chăn nuôi, Viện Chăn nuôi Trung tâm Công nghệ sinh học, Công ty TNHH lợn giống hạt nhân Dabaco (xã Tân Chi, huyện Tiên Du, tỉnh Bắc Ninh) 1.4 ĐÓNG GÓP MỚI CỦA ĐỀ TÀI Đề tài xác định đa hình 12 gen (ESR, PRLR, FSHB, RBP4, PIT1, MC4R, GHRH, FUT1, H-FABP, CAST, PIK3C3 MYOG) quần thể lợn Ỉ mối liên hệ đa hình gen với tiêu suất sinh sản, khả sinh trưởng, suất chất lượng thịt Kiểu gen AA gen FSHB có tác động tích cực đến số tiêu suất sinh sản (SCSS, SCSSS, SCCN, SCCS, KLSSO, KLCSO, KLCSC) kiểu gen AB gen GHRH cải thiện khối lượng thể lúc tháng tuổi 1.5 Ý NGHĨA KHOA HỌC VÀ THỰC TIỄN CỦA ĐỀ TÀI 1.5.1 Ý nghĩa khoa học Luận án cơng trình nghiên cứu khoa học cung cấp nguồn thông tin số đa hình gen (ESR, PRLR, FSHB, RBP4, PIT1, MC4R, GHRH, FUT1, H-FABP, CAST, PIK3C3 MYOG) lợn Ỉ mối liên hệ đa hình với suất sinh sản, khả sinh trưởng suất chất lượng thịt, cung cấp nguồn tư liệu có giá trị chọn lọc giống lợn theo kiểu gen nhằm cải thiện khả sản xuất lợn 1.5.2 Ý nghĩa thực tiễn Giúp cho sở sản xuất giống có sở để chọn lọc lợn Ỉ theo kiểu gen AA (gen FSHB) nhằm nâng cao suất sinh sản mang alen B (gen GHRH) để nâng cao khả sinh trưởng PHẦN TỔNG QUAN TÀI LIỆU 2.1 Vai trò thị di truyền chọn lọc giống vật nuôi Phương pháp chọn lọc dựa giá trị kiểu hình cần thời gian đánh giá dài hiệu chọn lọc thấp số tính trạng khó quan sát khơng thể quan sát thân vật tính trạng có hệ số di truyền thấp Nhằm nâng cao hiệu chương trình giống vật nuôi, kết hợp phương pháp chọn lọc truyền thống với kỹ thuật di truyền phân tử cần thiết Với thành tựu lĩnh vực sinh học phân tử công nghệ gen, số lượng lớn đa hình gen mức độ ADN khám phá ứng dụng thị để xác định sở di truyền cho biến dị kiểu hình (Beuzen & cs., 2000) Việc kết hợp thị di truyền với chọn lọc truyền thống đem lại nhiều hiệu nâng cao tính xác, rút ngắn thời gian chọn giống đồng thời làm tăng tốc độ cải thiện di truyền tính trạng mong muốn (Lê Thị Thu Huệ, 2021) Chọn lọc dựa vào hỗ trợ thị di truyền cho thấy ưu so với chọn lọc theo phương pháp truyền thống, đặc biệt tính trạng có khả di truyền thấp, di truyền liên kết với giới tính tính trạng biểu muộn q trình phát triển vật ni, khó khăn tốn để đánh giá (Đặng Vũ Bình, 2019) 2.2 Đặc điểm ngoại hình, trạng cơng tác bảo tồn giống lợn địa Việt Nam Theo báo cáo Tạ Thị Bích Dun & Đặng Hồng Biên (2016), Việt Nam có khoảng 30 giống lợn địa Các giống lợn địa Việt Nam có đặc điểm ngoại hình đa dạng, chia thành nhóm bao gồm: (1) nhóm lợn đen tồn thân lợn đen có vệt trắng đầu, chân, chót bao gồm 19 giống lợn; (2) nhóm lợn lang gồm giống; (3) nhóm lợn Hung bao gồm lợn có màu nâu tồn thân nhạt gồm giống; (4) nhóm lợn có da lơng tồn thân màu trắng gồm giống Trong số 30 giống lợn này, có giống khơng cịn tìm thấy cá thể mang đặc điểm ngoại hình đặc trưng giống (Tạ Thị Bích Dun & Đặng Hồng Biên, 2016) Bảo tồn nguồn gen vật nuôi vấn đề cấp bách có tính chất tồn cầu (Hoffmann & Scherf, 2010) Công tác bảo tồn nguồn gen vật nuôi Việt Nam bắt đầu thực từ năm 1990 Cho đến nay, có nhiều dự án khai thác, bảo tồn, đánh giá, khai thác phát triển nguồn gen giống lợn địa phương Việt Nam Nhà nước đầu tư nghiên cứu Chương trình bảo tồn động vật địa quý Việt Nam thành cơng việc áp dụng chương trình bảo tồn in-situ phục hồi số loài động vật có nguy gà Hồ, Đơng Tảo, Ri, vịt Cỏ, vịt Bầu đặc biệt lợn Móng Cái Dự án “Thành lập hệ thống ngân hàng gen đông lạnh cho giống lợn địa Việt Nam phát triển hệ thống chăn nuôi bền vững để bảo vệ đa dạng sinh học” Viện Chăn nuôi chủ trì nguồn tài trợ từ Chính phủ Nhật Bản thực khảo sát 33 quần thể lợn địa Việt Nam 22 tỉnh Tổng số 7.121 tinh cọng rạ lấy từ giống lợn (Mường Tè, Hung Hà Giang, Mường Khương, Cỏ Bình Thuận, Kiềng Sắt Móng Cái) địa bàn tỉnh (Lai Châu, Hà Giang, Lào Cai, Bình Thuận, Quảng Ngãi Quảng Ninh) lưu trữ hệ thống ngân hàng gen Viện Chăn ni Chương trình bảo tồn nguồn gen lợn Ỉ năm 1990 đến năm 1994 kết thúc hạn chế tài Năm 2005, lợn Ỉ Bộ Nơng nghiệp phát triển nông thôn đưa vào danh sách giống vật nuôi quý cần bảo tồn Từ năm 2016, Bộ Nông nghiệp PTNT giao cho Công ty Cổ phần tập đoàn Dabaco lưu giữ, phục tráng bảo tồn giống lợn Ỉ Theo thông tin Nghị định số 46 NĐ46/2022/NĐ-CP, lợn Ỉ giống lợn thuộc danh mục giống vật nuôi bị đe doạ tuyệt chủng cần bảo tồn 2.3 Tình hình nghiên cứu suất sinh sản giống lợn địa Tổng hợp kết nghiên cứu cho thấy đa số giống lợn địa Việt Nam có tuổi động dục lần đầu tương đối sớm Nhiều giống bắt đầu động dục 3-4 tháng tuổi, chí lợn Lũng Pù 2-3 tháng động dục Số sơ sinh sống/ổ lợn địa tương đối thấp, nhiều giống đạt 5-8 Ngoại trừ số giống có khả sinh sản tốt Mường Lay 14 vú, Móng Cái, Lang Hồng, Hạ Lang, lại đa số giống lợn địa có khả sinh sản thấp nhiều so với giống lợn ngoại Khả sinh sản yếu tố định đến hiệu kinh tế hệ thống chăn nuôi lợn Tuy nhiên, hệ số di truyền tính trạng thường mức thấp biểu giai đoạn cuối trình phát triển thể, nên việc chọn lọc, cải thiện suất sinh sản biện pháp truyền thống thường không mang lại hiệu cao Do đó, việc nhận biết gen ảnh hưởng đến khả sinh sản lợn nái cần thiết Ảnh hưởng số gen khác đến kích thước ổ đẻ lợn nái chứng minh bao gồm gen ESR (Rothschild & cs., 1996; Chen & cs., 2011), FSHB (Rohrer & cs., 1994), PRLR (Vincent & cs., 1997), leptin receptor (LEPR) (Stratil & cs., 1998), RBP4 (Rothschild & cs., 2000), retinoic acid receptor gamma (RARG) melanin receptor 1A (MTNRIA) (Messer & cs., 1996, 1997; Ollivier & cs., 1997), prostoglandin endoperoxide synthase (COX2) epidermal growth factor (EGF) (Linville & cs., 2001) Mặc dù đa hình số gen ứng viên liên quan đến suất sinh sản lợn nái nghiên cứu giống lợn ngoại số giống lợn địa nhiều nơi giới, nhiên thông tin công bố giống lợn địa Việt Nam hạn chế gen, chưa đầy đủ tiêu Đặc biệt, mối liên hệ đa hình gen ứng viên với suất sinh sản giống lợn địa chưa đánh giá đầy đủ 2.4 Tình hình nghiên cứu suất sinh trưởng giống lợn địa Các giống lợn địa đa số có tầm vóc nhỏ trung bình, có giống trưởng thành có khối lượng thể đạt 30 kg Bên cạnh đó, lợn địa thường ni theo hình thức chăn thả bán chăn thả, tận dụng nguồn thức ăn nghèo chất dinh dưỡng nên tốc độ sinh trưởng chậm Tăng khối lượng trung bình/ngày giai đoạn từ đến tháng tuổi đa số giống lợn địa mức 200g/con/ngày Một số giống sinh trưởng chậm lợn Bản, lợn Kiềng Sắt, lợn Khùa, Hung Hà Giang… Các nghiên cứu gen liên quan đến sinh trưởng giống lợn địa Việt Nam trọng năm gần Con lai lợn đực rừng Thái Lan lợn nái địa phương Pác Nặm mang gen GHRH dạng đồng hợp tử AA có tốc độ tăng trọng hàng ngày giai đoạn tháng thứ đến cao so với lợn mang kiểu gen AB BB (Nguyễn Văn Nơi & cs., 2010) Đa hình gen GH ảnh hưởng đến khối lượng lợn Hung lúc tháng tuổi, khối lượng lợn Mẹo thời điểm 4, tháng tuổi (Nguyễn Văn Trung, 2022) Đỗ Võ Anh Khoa (2012) cho biết khác biệt có ý nghĩa thống kê tỷ lệ thịt xẻ tìm thấy kiểu gen MYOG, lợn mang kiểu gen AB có tỷ lệ thịt xẻ cao lợn mang kiểu gen BB AA Kết nghiên cứu lợn Duroc Hoàng Thị Thuý & cs (2021) cho thấy mối liên kết đa hình gen MC4R, PIT1, GH LEP với tăng khối lượng Nguyen Huu Tinh & cs (2021) ghi nhận mối liên hệ đa hình gen PIT1 gen MC4R với tiêu tăng khối lượng trung bình/ngày giai đoạn 25-100kg lợn Duroc 2.5 Tình hình nghiên cứu suất, chất lượng thịt giống lợn địa Các kết nghiên cứu suất chất lượng thịt giống lợn địa Việt Nam cho thấy khối lượng giết mổ lợn địa đa phần thấp, chủ yếu mức 50kg lúc tháng tuổi Các giống lợn địa có tỷ lệ thịt móc hàm, tỷ lệ thịt xẻ tỷ lệ nạc thấp so với giống lợn ngoại Thịt lợn địa có giá trị pH nằm mức giới hạn bình thường, màu sắc thăn số giống sẫm màu độ đỏ cao so với giống lợn ngoại Thịt giống lợn địa nước thường có tỷ lệ nước bảo quản thấp, độ dai cao tỷ lệ nước chế biến tương đương với thịt giống lợn ngoại Mặc dù đánh giá chung có chất lượng thơm ngon, ngấy phù hợp với thị hiếu người tiêu dùng, nghiên cứu chất lượng thịt giống lợn địa chủ yếu thực tiêu kỹ thuật cảm quan, công bố thành phần hố học, hàm lượng axít amin, tỷ lệ mỡ dắt chất lượng mỡ thông qua thành phần axit béo nhiều hạn chế PHẦN PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 3.1 ĐỊA ĐIỂM NGHIÊN CỨU 3.1.1 Địa điểm bố trí thí nghiệm Các thí nghiệm theo dõi suất sinh sản, khả sinh trưởng, mổ khảo sát suất, chất lượng thịt mẫu mô tai lợn Ỉ thực Công ty TNHH lợn giống Dabaco Lương Tài (xã Lai Hạ, huyện Lương Tài, tỉnh Bắc Ninh) từ 2019 đến 2020 Công ty TNHH lợn giống Dabaco Phú Thọ (Xã Tề Lễ, huyện Tam Nông, tỉnh Phú Thọ) từ 2021 đến 2022 3.1.2 Địa điểm phân tích mẫu - Phân tích đa hình gen thực phịng thí nghiệm Di truyền, Khoa Chăn nuôi, Học viện Nông nghiệp Việt Nam Trung tâm Công nghệ sinh học, Công ty TNHH lợn giống hạt nhân Dabaco (xã Tân Chi, huyện Tiên Du, tỉnh Bắc Ninh) - Các tiêu chất lượng thịt (pH, màu sắc, tỷ lệ nước bảo quản, tỷ lệ nước chế biến, độ dai) lợn Ỉ tiến hành phịng thí nghiệm Di truyền, Khoa Chăn nuôi, Học viện Nông nghiệp Việt Nam - Phân tích thành phần hố học thịt lợn tiến hành phịng thí nghiệm Trung tâm, Khoa Chăn nuôi, Học viện Nông nghiệp Việt Nam - Phân tích hàm lượng axit amin thịt lợn Ỉ tiến hành Phịng Phân tích thức ăn sản phẩm chăn nuôi, Viện Chăn nuôi 3.2 THỜI GIAN NGHIÊN CỨU Thí nghiệm tiến hành từ tháng năm 2019 đến tháng 12 năm 2022 Bao gồm nội dung: (1) Đặc điểm lợn Ỉ nuôi bảo tồn: tiến hành từ tháng năm 2022 đến tháng năm 2022; (2) Xác định đa hình gen gen ứng viên quần thể lợn Ỉ: tiến hành từ tháng năm 2019 đến tháng năm 2021; (3) Đánh giá mối liên hệ đa hình gen ứng viên với khả sản xuất lợn Ỉ: - Mối liên hệ với suất sinh sản: tiến hành từ tháng năm 2019 đến tháng năm 2022; - Mối liên hệ với khả sinh trưởng: tiến hành từ tháng năm 2019 đến tháng 12 năm 2022; - Mối liên hệ với suất chất lượng thịt: tiến hành từ tháng 10 năm 2020 đến tháng 12 năm 2021 3.3 NỘI DUNG, ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 3.3.1 Đặc điểm lợn Ỉ ni bảo tồn Kích thước số chiều đo (cm) lợn Ỉ xác định theo phương pháp Ritchil & cs (2014), chiều đo bao gồm: rộng đầu, dài đầu, dài tai, dài thân, dài lưng, dài đuôi, cao vai, cao lưng 3.3.2 Xác định đa hình gen gen ứng viên quần thể lợn Ỉ Kiểu gen gen ESR, PRLR, FSHB, RBP4, MC4R, PIT1, GHRH, FUT1, H-FABP, CAST, PIK3C3, MYOG xác định kỹ thuật đa hình chiều dài đoạn cắt giới hạn (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism: PCR-RFLP) 3.3.3 Đánh giá mối liên hệ đa hình gen ứng viên với tính sản xuất lợn Ỉ 3.3.3.1 Đánh giá mối liên hệ đa hình gen ESR, PRLR, FSHB với suất sinh sản lợn nái Ỉ Mẫu mô tai số liệu sinh sản thu thập từ 126 lợn nái giống Ỉ, tổng số 269 ổ đẻ Các tiêu theo dõi khả sinh sản bao gồm: tuổi phối giống lần đầu (TPLĐ, ngày), tuổi đẻ lứa đầu (TĐLĐ, ngày), khoảng cách lứa đẻ (KCLĐ, ngày), thời gian cai sữa (TGCS, ngày), số sơ sinh/ổ (SCSS, con), số sơ sinh sống/ổ (SCSSS, con), số để nuôi/ổ (SCĐN, con), số cai sữa/ổ (SCCS, con), khối lượng sơ sinh/ổ (KLSSO, kg), khối lượng sơ sinh/con (KLSSC, kg), khối lượng cai sữa/ổ (KLCSO, kg), khối lượng cai sữa/con) (KLCSC, kg) 3.3.3.2 Đánh giá mối liên hệ đa hình gen PIT1, H-FABP, CAST/HinfI, PIK3C3 GHRH với khả sinh trưởng lợn Ỉ Mẫu mô tai số liệu sinh trưởng thu thập từ 111 cá thể tháng tuổi 109 cá thể tháng tuổi Các tiêu theo dõi khả sinh trưởng bao gồm: Khối lượng tháng tuổi (KL2, kg/con), khối lượng tháng tuổi (KL8, kg/ con), tăng khối lượng trung bình/ngày giai đoạn từ sơ sinh đến tháng tuổi (TKL2, g/con/ngày), tăng khối lượng trung bình/ngày giai đoạn từ sơ sinh đến tháng tuổi (TKL8, g/con/ngày), số ngày tuổi trung bình tháng tuổi (NT2TT, ngày), số ngày tuổi trung bình tháng tuổi (NT8TT, ngày) 3.3.3.3 Mối liên hệ đa hình gen PIT1, H-FABP, PIK3C3 CAST với suất thân thịt chất lượng thịt lợn Ỉ Mẫu mô tai số liệu suất, chất lượng thịt thu thập từ 23 lợn Ỉ (12 11 đực thiến) tháng tuổi Năng suất thân thịt đánh giá theo quy trình mổ khảo sát phẩm chất thịt lợn nuôi béo TCVN 3899-84 (Uỷ Ban Khoa học Kỹ thuật Nhà nước, 1984) Các tiêu suất thân thịt bao gồm: khối lượng giết mổ (kg), khối lượng móc hàm (kg), tỉ lệ móc hàm (TLMH) (%), khối lượng thịt xẻ (kg), tỉ lệ thịt xẻ (TLTX) (%), dày mỡ lưng (DML1) (mm), dày mỡ lưng (DML2) (mm), dài thân thịt (DTT) (cm), tỉ lệ nạc khối lượng giết mổ (%), tỉ lệ nạc khối lượng móc hàm (%) tỉ lệ nạc khối lượng thịt xẻ (%) Các tiêu chất lượng thịt bao gồm giá trị pH sau 45 phút (pH45) 24 (pH24) từ thời điểm giết thịt, màu sắc (L*, a* b*), độ dai, tỷ lệ nước bảo quản (TLMNBQ) tỷ lệ nước chế biến (TLMNCB) Hàm lượng vật chất khơ (VCK), protein thơ, lipit khống tổng số (g/100g mẫu thịt tươi) phân tích theo TCVN 8135:2009; TCVN 8134:2009; TCVN 8136:2009 TCVN 7142:2002 (tương đương với phương pháp ISO 1442: 1997; ISO 937: 1978; ISO 1443: 1973 ISO 936: 1998) Hàm lượng 17 loại axit amin (g/100 g mẫu khô), bao gồm Aspartic, Glutamic, Serine, Histidine, Glycine, Threonine, Alanine, Arginine, Tyrosine, Valine, Methionine, Phenylalanine, Isoleucine, Leucine, Lysine, Proline, Cystine xác định phương pháp sắc ký lỏng cao áp (high-performance liquid chromatography - HPLC) 3.4 PHƯƠNG PHÁP XỬ LÝ SỐ LIỆU Số liệu xử lý phần mềm SAS 9.1 (SAS, 2002) Các tham số thống kê bao gồm dung lượng mẫu (n), trung bình cộng (Mean), độ lệch chuẩn (SD), trung bình bình phương bé (LSM) sai số chuẩn (SE) PHẦN KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 4.1 ĐẶC ĐIỂM CỦA LỢN Ỉ NI BẢO TỒN Kích thước số chiều đo lợn Ỉ nuôi bảo tồn trình bày Bảng 4.1 Chiều dài thân lợn Ỉ nghiên cứu dài so với kết nghiên cứu lợn Ỉ Bùi Anh Tuấn (2020) Lợn Ỉ có chiều dài thân dài so với lợn Hung, lợn Mẹo (Nguyễn Văn Trung, 2022); lợn Móng Cái, lợn Mường Khương, lợn Hạ Lang, lợn Hương, lợn Mường Lay (Bùi Anh Tuấn, 2020) ngắn so với lợn Rừng Tây Nguyên (Nguyễn Thị Phương Mai, 2017) Dài lưng Ỉ dài so với lợn địa Nigeria (Adeola & cs., 2013) lợn địa Nam Phi (Kutwana & cs., 2015) Dài đầu lợn Ỉ thấp so với lợn Hung lợn Mẹo (Nguyễn Văn Trung, 2022), lợn địa Nam Phi (Kutwana & cs., 2015) ngắn lợn địa Bangldesh (Ritchil & cs., 2014) Rộng đầu lợn Ỉ rộng so với lợn Hung, lợn Mẹo (Nguyễn Văn Trung, 2022) lợn địa Nigeria (Adeola & cs., 2013), nhiên lại hẹp lợn địa Bangladesh (Ritchil & cs., 2014) Bảng 4.1 Kích thước chiều đo (cm) lợn Ỉ 12 đến 16 tháng tuổi (n=40) Chỉ tiêu Rộng đầu Dài đầu Dài tai Dài thân Dài lưng Dài đuôi Cao vai Cao lưng Mean±SD 11,33±2,54 24,23±3,65 12,71±1,89 111,93±18,18 80,13±12,43 26,81±3,68 56,79±7,21 55,98±6,12 Min 7,50 18,00 9,50 73,00 45,00 20,00 43,00 43,00 Max 23,00 33,00 17,50 139,00 103,00 37,00 68,00 66,00 Tai lợn Ỉ dài so với lợn Hung lợn Mẹo (Nguyễn Văn Trung, 2022), lợn Rừng Tây Nguyên (Nguyễn Thị Phương Mai, 2017) ngắn so với lợn địa Nigeria (Adeola & cs., 2013) lợn địa Ấn Độ (Kalita & cs., 2018) Dài đuôi lợn Ỉ tương đương với lợn Mẹo ngắn so với đuôi lợn Hung (Nguyễn Văn Trung, 2022) Đuôi lợn Ỉ dài lợn đực rừng Tây Nguyên (Nguyễn Thị Phương Mai, 2017), lợn địa Ấn Độ (Kalita & cs., 2018), ngắn đuôi lợn địa Bangladesh (Ritchil & cs., 2014) Cao vai lợn Ỉ cao so với cao lưng, thể đặc điểm ngoại hình giống lợn Ỉ lưng võng Các tiêu rộng đầu, dài đầu, dài thân, dài lưng, dài đuôi, cao vai cao đuôi lợn Ỉ đực cao lợn Riêng tiêu dài tai lợn Ỉ đực Lợn Ỉ nghiên cứu có chiều dài chiều cao tương đối lớn so với giống lợn địa khác lợn Hung, Mẹo, Móng Cái, Hạ Lang, Mường Khương, Mường Lay, Hương lại ngắn thấp so với lợn rừng lợn địa Tây Nguyên So với giống lợn địa nước ngoài, lợn Ỉ có tầm vóc trung bình 4.2 ĐA HÌNH CÁC GEN ỨNG VIÊN TRÊN QUẦN THỂ LỢN Ỉ Kết tần số alen kiểu gen gen ứng viên quần thể lợn Ỉ trình bày Bảng 4.2 4.2.1 Đa hình gen ESR Sản phẩm PCR gen ESR cắt enzyme PvuII tạo nên ba kiểu gen AA (1 băng kích thước 120 bp), AB (3 băng tương ứng với kích thước 120 bp, 65 bp 55 bp) BB (2 băng tương ứng với kích thước 65 55 bp) Bảng 4.2 Kiểu gen tần số alen gen ESR, PRLR, FSHB RBP4 Gen n ESR 133 PRLR 151 FSHB 120 RBP4 151 MC4R 206 PIT1 196 GHRH 210 FUT1 210 H-FABP 167 CAST/ MspI 220 CAST/ HinfI 227 CAST/ RsaI 163 PIK3C3 172 MYOG 151 AA *1 **0,008 AA 0 AA 77 0,642 AA 151 AA 0 AA 85 0,434 AA 175 0,833 AA 0 HH 40 0,240 CC 52 0,236 AA 65 0,286 EE 58 0,356 CC 24 0,140 AA 148 0,980 Kiểu gen AB 35 0,263 AB 69 0,457 AB 42 0,35 AB 0 AG 0,005 AB 102 0,520 AB 35 0,167 AG 0 Hh 64 0,383 CD 93 0,423 AB 95 0,419 EF 66 0,405 CT 101 0,587 AB 0,020 BB 97 0,729 BB 82 0,543 BB 0,008 BB 0 GG 205 0,995 BB 0,046 BB 0 GG 210 hh 63 0,377 DD 75 0,341 BB 67 0,295 FF 39 0,239 TT 47 0,237 BB 0 Allele A 37 0,139 A 69 0,228 A 196 0,817 A 302 1,000 A 0,002 A 272 0,694 A 385 0,917 A 0,000 H 144 0,431 C 197 0,448 A 225 0,496 E 182 0,558 C 149 0,433 A 299 0,990 χ² B 229 0,861 B 233 0,772 B 44 0,183 B 0,000 G 411 0,998 B 120 0,306 B 35 0,083 G 420 1,000 h 190 0,569 D 243 0,552 B 229 0,504 F 144 0,442 T 195 0,567 B 0,010 1,298 0,255 13,242 0,000 3,420 0,064 NA - 9,923 0,002 - 0,424 NA 7,989 0,005 4,638 0,031 6,026 0,014 5,224 0,022 6,594 0,010 - 1,000 NA: Không sử dụng phép thử, * Tần suất quan sát, ** Tần số kiểu gen alen P 4.2.10 Đa hình gen CAST Sản phẩm PCR gen CAST cắt enzyme MspI tạo nên alen tương ứng C (3 băng ADN với kích thước 646, 502 275 bp) alen D (3 băng ADN với kích thước 502, 370 275 bp) Sản phẩm PCR gen CAST cắt enzyme HinfI tạo nên alen tương ứng alen A (4 băng ADN với kích thước 646, 372, 200 174 bp) alen B (4 băng ADN với kích thước 503, 372, 200 174 bp) Sản phẩm PCR gen CAST cắt enzyme RsaI tạo nên alen tương ứng alen E (5 băng ADN với kích thước 649, 240, 183, 162 89 bp) alen F (5 băng ADN với kích thước 649, 370, 183, 162 89 bp) Kết phân tích đa hình gen CAST/HinfI, CAST/RsaI CAST/MspI nghiên cứu phù hợp với kết công bố Ernst & cs (1998) Tần số kiểu gen alen đa hình gen CAST/MspI, CAST/HinfI CAST/RsaI lợn Ỉ cho thấy điểm đa hình xuất đầy đủ kiểu gen mong đợi, kiểu gen dị hợp tử có tần số cao so với kiểu gen đồng hợp tử Tương ứng, điểm đa hình, hai alen xuất với tần số tương đồng (từ 0,442 đến 0,558) Xu hướng kết tương tự ghi nhận quần thể lợn đực Tần số kiểu gen đa hình CAST/MspI, CAST/HinfI CAST/RsaI quần thể lợn đực Ỉ đạt trạng tỷ lệ cân theo định luật HWE (P>0,05) Tuy nhiên quần thể lợn Ỉ, tần số kiểu gen đa hình khơng trì trạng thái cân HWE (P